Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G4K1

Protein Details
Accession C1G4K1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-134TAKNPSRKTVKKSTKAKPKTKSKVKRSRKPNKQLTEKQMETHydrophilic
221-249ANMARQRLRKLFKKPRRFMKIRDDRQIKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-142KAGSKPVKKKAATAKNPSRKTVKKSTKAKPKTKSKVKRSRKPNKQLTEKQMETLRKRKARE
226-242QRLRKLFKKPRRFMKIR
Subcellular Location(s) mito 21.5, mito_nucl 14, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pbn:PADG_01867  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MTLVLSRRGRVLLACAKLVEAKPARARVLLGNSLALCSSIGSVRTLSASRNSRLFRHPLPILLKKTYATATGTAKADTAASKAGSKPVKKKAATAKNPSRKTVKKSTKAKPKTKSKVKRSRKPNKQLTEKQMETLRKRKAREMIKNLKAVALVPPKGLPETPIMLLQKQMKQFGGATEAYKNLSPAERESLNQTAQLNRASNKTMFQDWVKSHTPLQIKQANMARQRLRKLFKKPRRFMKIRDDRQIKRPVNAYLFFLKEAFASGGIFDKESMSKTAAAWRGMTAGEKEELQQKYQQMALENKNKYLQQHKSIYGMEAPSQSKSPSPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.29
4 0.33
5 0.32
6 0.33
7 0.29
8 0.33
9 0.38
10 0.43
11 0.44
12 0.4
13 0.41
14 0.38
15 0.41
16 0.38
17 0.32
18 0.3
19 0.28
20 0.27
21 0.25
22 0.19
23 0.13
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.21
35 0.26
36 0.28
37 0.35
38 0.37
39 0.39
40 0.44
41 0.49
42 0.44
43 0.46
44 0.44
45 0.44
46 0.49
47 0.53
48 0.52
49 0.48
50 0.46
51 0.39
52 0.4
53 0.34
54 0.29
55 0.23
56 0.22
57 0.22
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.22
62 0.2
63 0.19
64 0.15
65 0.13
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.13
70 0.19
71 0.25
72 0.3
73 0.37
74 0.45
75 0.53
76 0.52
77 0.59
78 0.62
79 0.67
80 0.71
81 0.73
82 0.74
83 0.75
84 0.78
85 0.75
86 0.74
87 0.69
88 0.68
89 0.68
90 0.68
91 0.68
92 0.74
93 0.8
94 0.82
95 0.86
96 0.87
97 0.86
98 0.87
99 0.88
100 0.89
101 0.9
102 0.9
103 0.9
104 0.92
105 0.91
106 0.92
107 0.92
108 0.92
109 0.92
110 0.91
111 0.9
112 0.89
113 0.89
114 0.86
115 0.84
116 0.73
117 0.66
118 0.62
119 0.59
120 0.54
121 0.53
122 0.54
123 0.5
124 0.51
125 0.54
126 0.56
127 0.59
128 0.63
129 0.66
130 0.67
131 0.68
132 0.68
133 0.62
134 0.55
135 0.45
136 0.35
137 0.31
138 0.25
139 0.2
140 0.17
141 0.18
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.12
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.16
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.21
157 0.18
158 0.18
159 0.19
160 0.16
161 0.17
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.17
177 0.19
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.19
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.2
190 0.21
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.24
195 0.22
196 0.27
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.3
201 0.33
202 0.29
203 0.36
204 0.35
205 0.32
206 0.36
207 0.41
208 0.42
209 0.42
210 0.47
211 0.47
212 0.48
213 0.54
214 0.56
215 0.58
216 0.59
217 0.65
218 0.69
219 0.73
220 0.79
221 0.81
222 0.84
223 0.87
224 0.85
225 0.82
226 0.82
227 0.83
228 0.8
229 0.82
230 0.8
231 0.74
232 0.77
233 0.8
234 0.71
235 0.64
236 0.6
237 0.55
238 0.52
239 0.49
240 0.44
241 0.38
242 0.37
243 0.33
244 0.28
245 0.23
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.22
264 0.25
265 0.26
266 0.25
267 0.23
268 0.23
269 0.22
270 0.23
271 0.17
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.28
280 0.28
281 0.29
282 0.31
283 0.32
284 0.3
285 0.36
286 0.43
287 0.48
288 0.47
289 0.48
290 0.5
291 0.5
292 0.5
293 0.51
294 0.51
295 0.51
296 0.56
297 0.55
298 0.56
299 0.55
300 0.52
301 0.47
302 0.41
303 0.35
304 0.33
305 0.32
306 0.29
307 0.3
308 0.29