FuNGI

C1G238

Protein Details

Accession

C1G238

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-61	SSNITVPRSRRPSRSRGSTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003150 DNA-bd_RFX IPR039779 RFX-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003700 F:DNA-binding transcription factor activity
KEGG	pbn:PADG_02204 -
Pfam	View protein in Pfam PF02257 RFX_DNA_binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS51526 RFX_DBD

Amino Acid Sequences

MDHPDVAPDIGRHPLQTSNILPQNPQHQSRIRPKAAEPLRSSSNITVPRSRRPSRSRGSTASIHSNTTQSQYHPDHYVPTTYPSYMQPDNGTNQQMYPSNPEEMIIRFGAQLANTSSSHHGTALDPIVIDPNLQAYAAAAEALVFETNFAYQGPDLQLHGLPIHGPSAELPPNGVTGDVHPDHSHYPPLYDGVENQIPDHLMPDNDVSESGPRKRRSSTTTLANDNELRRLLRQYDGYSLRQMAAEVQKHDGAGGKAEKVKQVFAMIWLRENCQKSTKSVRRDRVYCSYAEQCGTERVSVLNPASFGKLVRIIFPNVQTRRLGVRGESKYHYVDMSLREQDRRPAVDILGNNAGATSVAQQNVSNGNINGAQDRSTNPPHSNSTTSSEPNIQGNITTNTSSNLVTMSSEDNSLVETHQVIDNLLHFNHPNEPVPVESALFKLPSIHGYLPSHADSANAEALEALYRSHCISVIDSFRFCKEKNFLRHFSSFQGTLTVPVHKVLTLPEVAPWIRECDWLMYKKMIAFVAPLTTQVVPEPVLNAFKSISKGLVTYVQKSMKSHPDHVAEARLSPARVFCHLLKRMLDVNQSAIAASAWLSHADNRTRMWQDFVSYIDPVEIAAKAKIPSCSLAGVVSLMKHQIKALVAPVEDNDESPDDVQLYDEQLGFQKFSYSSSDEGKYSQFPDRWIAFILNLPLLFPNHRPQCIIDKADAVWTLLLHGLTLGGAQSFSAWWMTKVFFLEMMWWQAERAGFMSSTSQALLELSFVQGVSYATAPAPAPAPSAQRSHTAQPGTGSANSASNSSAQGGGEGSAQLTNISPIAQANETPSSMSPAASSGNEESSITVENANGNANVNPSISPSGGANLNSNHDDSAIDLDDDPASVTESKYGDITASDPADEEGQVVVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.26
3	0.3
4	0.31
5	0.35
6	0.4
7	0.41
8	0.4
9	0.4
10	0.47
11	0.48
12	0.49
13	0.48
14	0.48
15	0.57
16	0.66
17	0.72
18	0.68
19	0.65
20	0.63
21	0.67
22	0.68
23	0.67
24	0.62
25	0.57
26	0.56
27	0.54
28	0.56
29	0.48
30	0.48
31	0.46
32	0.46
33	0.49
34	0.48
35	0.56
36	0.62
37	0.66
38	0.68
39	0.69
40	0.74
41	0.75
42	0.81
43	0.79
44	0.75
45	0.75
46	0.71
47	0.68
48	0.68
49	0.59
50	0.52
51	0.46
52	0.42
53	0.38
54	0.36
55	0.32
56	0.24
57	0.31
58	0.32
59	0.35
60	0.36
61	0.35
62	0.36
63	0.36
64	0.38
65	0.31
66	0.32
67	0.31
68	0.28
69	0.29
70	0.27
71	0.31
72	0.29
73	0.3
74	0.28
75	0.29
76	0.33
77	0.36
78	0.36
79	0.3
80	0.29
81	0.3
82	0.3
83	0.28
84	0.3
85	0.28
86	0.27
87	0.26
88	0.26
89	0.24
90	0.23
91	0.24
92	0.18
93	0.16
94	0.13
95	0.14
96	0.15
97	0.13
98	0.15
99	0.14
100	0.17
101	0.16
102	0.19
103	0.21
104	0.22
105	0.22
106	0.2
107	0.18
108	0.16
109	0.2
110	0.19
111	0.17
112	0.15
113	0.14
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.1
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.06
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.05
133	0.05
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.1
140	0.12
141	0.12
142	0.13
143	0.15
144	0.15
145	0.14
146	0.15
147	0.12
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.14
155	0.17
156	0.16
157	0.16
158	0.16
159	0.17
160	0.17
161	0.16
162	0.1
163	0.09
164	0.16
165	0.16
166	0.17
167	0.17
168	0.19
169	0.21
170	0.22
171	0.26
172	0.19
173	0.19
174	0.18
175	0.2
176	0.19
177	0.17
178	0.17
179	0.18
180	0.21
181	0.2
182	0.19
183	0.18
184	0.17
185	0.16
186	0.17
187	0.12
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.14
196	0.19
197	0.25
198	0.32
199	0.35
200	0.38
201	0.43
202	0.48
203	0.51
204	0.54
205	0.53
206	0.55
207	0.57
208	0.59
209	0.55
210	0.52
211	0.5
212	0.42
213	0.39
214	0.3
215	0.25
216	0.22
217	0.24
218	0.23
219	0.22
220	0.25
221	0.24
222	0.3
223	0.34
224	0.34
225	0.33
226	0.32
227	0.28
228	0.25
229	0.23
230	0.2
231	0.22
232	0.24
233	0.23
234	0.24
235	0.24
236	0.24
237	0.24
238	0.22
239	0.16
240	0.17
241	0.17
242	0.17
243	0.2
244	0.22
245	0.25
246	0.23
247	0.23
248	0.2
249	0.2
250	0.17
251	0.19
252	0.23
253	0.2
254	0.25
255	0.25
256	0.26
257	0.3
258	0.33
259	0.3
260	0.3
261	0.31
262	0.31
263	0.41
264	0.47
265	0.51
266	0.59
267	0.66
268	0.69
269	0.71
270	0.72
271	0.7
272	0.64
273	0.54
274	0.5
275	0.44
276	0.37
277	0.34
278	0.28
279	0.21
280	0.22
281	0.22
282	0.17
283	0.14
284	0.13
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.11
294	0.1
295	0.14
296	0.14
297	0.16
298	0.18
299	0.19
300	0.21
301	0.25
302	0.33
303	0.3
304	0.32
305	0.29
306	0.29
307	0.3
308	0.3
309	0.26
310	0.21
311	0.28
312	0.29
313	0.33
314	0.33
315	0.32
316	0.31
317	0.31
318	0.28
319	0.2
320	0.19
321	0.18
322	0.2
323	0.22
324	0.23
325	0.25
326	0.26
327	0.29
328	0.3
329	0.29
330	0.27
331	0.24
332	0.23
333	0.24
334	0.24
335	0.22
336	0.21
337	0.19
338	0.15
339	0.14
340	0.13
341	0.09
342	0.09
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.11
361	0.15
362	0.18
363	0.21
364	0.21
365	0.24
366	0.27
367	0.3
368	0.3
369	0.28
370	0.29
371	0.29
372	0.28
373	0.27
374	0.26
375	0.24
376	0.22
377	0.2
378	0.15
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.13
383	0.12
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.13
388	0.1
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.12
420	0.13
421	0.13
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.12
440	0.12
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.04
451	0.03
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.1
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.17
464	0.19
465	0.18
466	0.19
467	0.22
468	0.29
469	0.38
470	0.45
471	0.47
472	0.5
473	0.52
474	0.49
475	0.46
476	0.4
477	0.31
478	0.24
479	0.22
480	0.17
481	0.16
482	0.15
483	0.14
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.1
488	0.1
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.11
495	0.1
496	0.11
497	0.1
498	0.12
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.14
503	0.19
504	0.2
505	0.22
506	0.19
507	0.19
508	0.19
509	0.21
510	0.17
511	0.13
512	0.11
513	0.1
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.08
521	0.09
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.07
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.12
532	0.11
533	0.11
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.17
538	0.17
539	0.18
540	0.23
541	0.26
542	0.26
543	0.28
544	0.32
545	0.33
546	0.36
547	0.37
548	0.38
549	0.38
550	0.39
551	0.38
552	0.38
553	0.29
554	0.26
555	0.24
556	0.19
557	0.16
558	0.14
559	0.15
560	0.13
561	0.14
562	0.18
563	0.18
564	0.26
565	0.29
566	0.32
567	0.3
568	0.32
569	0.33
570	0.32
571	0.32
572	0.24
573	0.22
574	0.2
575	0.19
576	0.16
577	0.13
578	0.1
579	0.07
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.06
584	0.06
585	0.08
586	0.13
587	0.15
588	0.17
589	0.18
590	0.24
591	0.26
592	0.26
593	0.28
594	0.24
595	0.23
596	0.23
597	0.24
598	0.19
599	0.16
600	0.15
601	0.12
602	0.11
603	0.09
604	0.09
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.09
609	0.1
610	0.12
611	0.14
612	0.14
613	0.15
614	0.15
615	0.15
616	0.13
617	0.12
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.11
627	0.13
628	0.13
629	0.13
630	0.16
631	0.15
632	0.15
633	0.15
634	0.15
635	0.17
636	0.16
637	0.15
638	0.14
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.12
643	0.08
644	0.08
645	0.09
646	0.08
647	0.09
648	0.1
649	0.09
650	0.09
651	0.12
652	0.13
653	0.12
654	0.12
655	0.13
656	0.12
657	0.13
658	0.17
659	0.16
660	0.18
661	0.22
662	0.24
663	0.22
664	0.23
665	0.24
666	0.22
667	0.23
668	0.27
669	0.24
670	0.24
671	0.3
672	0.3
673	0.29
674	0.28
675	0.26
676	0.2
677	0.21
678	0.2
679	0.15
680	0.14
681	0.13
682	0.12
683	0.13
684	0.14
685	0.15
686	0.23
687	0.27
688	0.28
689	0.29
690	0.31
691	0.38
692	0.42
693	0.42
694	0.34
695	0.31
696	0.3
697	0.32
698	0.29
699	0.22
700	0.15
701	0.12
702	0.12
703	0.11
704	0.1
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.03
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.11
722	0.13
723	0.15
724	0.15
725	0.13
726	0.13
727	0.15
728	0.15
729	0.17
730	0.16
731	0.14
732	0.14
733	0.15
734	0.15
735	0.13
736	0.12
737	0.11
738	0.1
739	0.11
740	0.13
741	0.12
742	0.13
743	0.12
744	0.11
745	0.09
746	0.1
747	0.09
748	0.08
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.06
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.08
759	0.07
760	0.09
761	0.09
762	0.09
763	0.1
764	0.09
765	0.12
766	0.13
767	0.18
768	0.19
769	0.23
770	0.24
771	0.28
772	0.31
773	0.34
774	0.38
775	0.35
776	0.33
777	0.32
778	0.33
779	0.31
780	0.28
781	0.26
782	0.2
783	0.21
784	0.2
785	0.19
786	0.17
787	0.14
788	0.15
789	0.14
790	0.14
791	0.11
792	0.11
793	0.11
794	0.11
795	0.1
796	0.09
797	0.09
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.07
802	0.08
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.08
807	0.11
808	0.12
809	0.12
810	0.15
811	0.18
812	0.18
813	0.19
814	0.18
815	0.21
816	0.2
817	0.2
818	0.16
819	0.15
820	0.17
821	0.16
822	0.19
823	0.15
824	0.16
825	0.17
826	0.17
827	0.16
828	0.15
829	0.16
830	0.14
831	0.12
832	0.11
833	0.12
834	0.13
835	0.15
836	0.14
837	0.13
838	0.14
839	0.15
840	0.15
841	0.15
842	0.14
843	0.15
844	0.17
845	0.16
846	0.16
847	0.14
848	0.16
849	0.19
850	0.2
851	0.2
852	0.2
853	0.24
854	0.25
855	0.26
856	0.23
857	0.2
858	0.19
859	0.16
860	0.18
861	0.15
862	0.14
863	0.13
864	0.14
865	0.14
866	0.14
867	0.14
868	0.09
869	0.11
870	0.11
871	0.11
872	0.14
873	0.15
874	0.16
875	0.15
876	0.15
877	0.13
878	0.13
879	0.14
880	0.15
881	0.16
882	0.15
883	0.15
884	0.16
885	0.16
886	0.15
887	0.15

C1G238

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer