Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7N189

Protein Details
Accession A0A1C7N189    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-431RRAQGAKRRRLENERRA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAFFRWLSDKFPKVVSTVIEEHPKEINGTRLPVDTTKPNPNGQEFDNLYLDMNGIIHPCCHPENKPAPSSEDEMMIAIFEYTDRIVDMIRPRKLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQLAQVEKDAADRVFQELDAIGQAHQLPEKKKHFDSNCITPGTPFMAHLAACLRYHIAAKQNSDPLWKNLKVILSDATVPGEGEHKVMEFIRVQRMRPEHNPNTTHVMYGLDADLIMLALATHEPHFKVLREDVFEDKRKKKGVCFKCNQPGHAITQCQASDEAIEAMRQQEQNTDTPPKPYVFLHVNVLREYLEHALKFNIPGLVWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAISTLSLLWKQTMPQMGGYMTQNGDVDLKRVQVLVTELGKMEDNIFSERKQSEERRAQGAKRRRLENERRARETKMFDPNGNFGDMTAAPVNQPHAGMSNSDVIANRAQIRMANINAAAALRAELSGGHEESKKRKLDDTEIEQEQKEEEEQQPEEDVQEEEEEEEMDESDSAPESAEAVGQAILKRVADEKKEKEEAARKREPDDEVRLWEAGWKERYYKTKFNLTLTDRDEIRHIVKSYCEGLIWVFKYYYLGCVSWSWYYPYHYAPMASDFVHIDSFDIQFEQSAPLKPFEQLMGVLPAASKDHIPKPFHHLMTDADSPIIDYYPTQFEVDMDGKKWEWQGVVKLPFIDSARLLEAMSAVYDQLNEEETQRNSTGQSVLYVSESHKAYNAISTVYTKRNEDALKLDARLTDGLTGRVDRDQDCIPRSTLYTPLPDFDLPDIANDKSISVVYALPEFPEGFKFSTQLLKGVKLNTALGYEDVQLATFEKVDPRQRYSGNRGWTAQVNHLEDYRQYNNPRHRTGGRNNGYYQQQQQQGYGAGYNHGFDDGSYFPNNNYGYRPQHQQQRGHHSNNGGYQGGYQQGGYNNGYSNGYNNNGGGYRRGYNQNNNQGYHNGNNYNNNGGGYGNGNGGGYGNNNGGGYGNGGGYGNQNYHHRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.37
4 0.38
5 0.33
6 0.31
7 0.31
8 0.33
9 0.39
10 0.38
11 0.38
12 0.38
13 0.36
14 0.33
15 0.3
16 0.33
17 0.28
18 0.31
19 0.31
20 0.3
21 0.33
22 0.33
23 0.35
24 0.35
25 0.38
26 0.44
27 0.46
28 0.5
29 0.52
30 0.54
31 0.53
32 0.47
33 0.5
34 0.43
35 0.43
36 0.39
37 0.34
38 0.3
39 0.26
40 0.24
41 0.15
42 0.13
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.15
49 0.18
50 0.22
51 0.24
52 0.33
53 0.42
54 0.48
55 0.52
56 0.5
57 0.52
58 0.52
59 0.53
60 0.44
61 0.36
62 0.29
63 0.25
64 0.22
65 0.17
66 0.13
67 0.08
68 0.07
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.12
77 0.22
78 0.3
79 0.33
80 0.35
81 0.36
82 0.39
83 0.4
84 0.39
85 0.34
86 0.32
87 0.3
88 0.28
89 0.28
90 0.24
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.12
95 0.15
96 0.21
97 0.28
98 0.39
99 0.46
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.79
104 0.81
105 0.76
106 0.73
107 0.74
108 0.7
109 0.66
110 0.66
111 0.62
112 0.55
113 0.52
114 0.45
115 0.34
116 0.29
117 0.24
118 0.17
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.14
134 0.18
135 0.22
136 0.31
137 0.39
138 0.43
139 0.47
140 0.56
141 0.57
142 0.62
143 0.64
144 0.64
145 0.63
146 0.59
147 0.55
148 0.45
149 0.43
150 0.37
151 0.3
152 0.2
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.18
165 0.23
166 0.26
167 0.3
168 0.34
169 0.39
170 0.38
171 0.43
172 0.43
173 0.41
174 0.45
175 0.42
176 0.38
177 0.36
178 0.38
179 0.33
180 0.31
181 0.27
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.17
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.16
199 0.26
200 0.28
201 0.29
202 0.35
203 0.39
204 0.44
205 0.48
206 0.56
207 0.53
208 0.59
209 0.61
210 0.57
211 0.6
212 0.53
213 0.45
214 0.35
215 0.29
216 0.21
217 0.19
218 0.16
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.03
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.11
234 0.13
235 0.14
236 0.18
237 0.21
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.32
242 0.37
243 0.44
244 0.49
245 0.5
246 0.52
247 0.56
248 0.56
249 0.58
250 0.61
251 0.64
252 0.67
253 0.69
254 0.73
255 0.76
256 0.78
257 0.7
258 0.65
259 0.57
260 0.51
261 0.49
262 0.4
263 0.31
264 0.32
265 0.31
266 0.26
267 0.24
268 0.18
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.17
281 0.19
282 0.24
283 0.29
284 0.26
285 0.29
286 0.31
287 0.27
288 0.27
289 0.25
290 0.26
291 0.23
292 0.24
293 0.28
294 0.29
295 0.3
296 0.28
297 0.29
298 0.23
299 0.19
300 0.19
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.16
365 0.16
366 0.14
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.12
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.08
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.23
398 0.25
399 0.32
400 0.39
401 0.42
402 0.45
403 0.49
404 0.51
405 0.54
406 0.6
407 0.59
408 0.58
409 0.59
410 0.58
411 0.65
412 0.71
413 0.72
414 0.73
415 0.72
416 0.72
417 0.7
418 0.67
419 0.62
420 0.56
421 0.52
422 0.5
423 0.45
424 0.4
425 0.39
426 0.39
427 0.34
428 0.3
429 0.24
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.09
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.1
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.09
455 0.1
456 0.09
457 0.11
458 0.13
459 0.12
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.07
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.1
477 0.12
478 0.17
479 0.24
480 0.25
481 0.24
482 0.28
483 0.29
484 0.34
485 0.38
486 0.4
487 0.39
488 0.39
489 0.39
490 0.36
491 0.33
492 0.26
493 0.2
494 0.14
495 0.11
496 0.1
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.12
502 0.12
503 0.1
504 0.09
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.1
535 0.13
536 0.16
537 0.23
538 0.26
539 0.31
540 0.34
541 0.33
542 0.35
543 0.41
544 0.44
545 0.47
546 0.49
547 0.44
548 0.45
549 0.48
550 0.46
551 0.43
552 0.42
553 0.35
554 0.32
555 0.32
556 0.29
557 0.25
558 0.25
559 0.21
560 0.18
561 0.19
562 0.17
563 0.19
564 0.24
565 0.32
566 0.35
567 0.41
568 0.4
569 0.47
570 0.48
571 0.48
572 0.51
573 0.47
574 0.47
575 0.43
576 0.42
577 0.33
578 0.31
579 0.3
580 0.24
581 0.23
582 0.2
583 0.19
584 0.17
585 0.17
586 0.19
587 0.19
588 0.17
589 0.15
590 0.11
591 0.1
592 0.14
593 0.14
594 0.12
595 0.11
596 0.1
597 0.12
598 0.12
599 0.13
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.13
609 0.16
610 0.17
611 0.18
612 0.17
613 0.17
614 0.16
615 0.15
616 0.16
617 0.15
618 0.13
619 0.13
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.1
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.09
633 0.1
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.16
638 0.16
639 0.16
640 0.14
641 0.13
642 0.1
643 0.1
644 0.11
645 0.1
646 0.09
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.16
654 0.23
655 0.25
656 0.27
657 0.35
658 0.42
659 0.42
660 0.38
661 0.34
662 0.3
663 0.33
664 0.33
665 0.24
666 0.17
667 0.16
668 0.15
669 0.14
670 0.12
671 0.06
672 0.05
673 0.07
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.14
680 0.17
681 0.16
682 0.15
683 0.16
684 0.16
685 0.18
686 0.18
687 0.15
688 0.13
689 0.15
690 0.19
691 0.24
692 0.27
693 0.26
694 0.26
695 0.25
696 0.26
697 0.25
698 0.21
699 0.14
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.1
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.06
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.07
715 0.07
716 0.09
717 0.13
718 0.14
719 0.17
720 0.18
721 0.18
722 0.17
723 0.18
724 0.18
725 0.13
726 0.14
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.12
732 0.16
733 0.16
734 0.15
735 0.15
736 0.16
737 0.15
738 0.17
739 0.16
740 0.12
741 0.12
742 0.16
743 0.18
744 0.23
745 0.25
746 0.23
747 0.24
748 0.29
749 0.29
750 0.27
751 0.27
752 0.27
753 0.27
754 0.27
755 0.27
756 0.21
757 0.22
758 0.21
759 0.17
760 0.17
761 0.14
762 0.15
763 0.15
764 0.15
765 0.15
766 0.17
767 0.18
768 0.15
769 0.17
770 0.2
771 0.24
772 0.26
773 0.27
774 0.26
775 0.25
776 0.27
777 0.25
778 0.27
779 0.24
780 0.27
781 0.26
782 0.26
783 0.27
784 0.25
785 0.25
786 0.2
787 0.21
788 0.15
789 0.16
790 0.18
791 0.15
792 0.16
793 0.15
794 0.14
795 0.12
796 0.12
797 0.1
798 0.08
799 0.09
800 0.09
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.12
805 0.12
806 0.11
807 0.13
808 0.14
809 0.14
810 0.14
811 0.15
812 0.15
813 0.21
814 0.21
815 0.25
816 0.24
817 0.26
818 0.29
819 0.3
820 0.31
821 0.26
822 0.26
823 0.22
824 0.21
825 0.18
826 0.16
827 0.15
828 0.13
829 0.13
830 0.11
831 0.11
832 0.1
833 0.1
834 0.1
835 0.09
836 0.09
837 0.12
838 0.18
839 0.27
840 0.31
841 0.36
842 0.41
843 0.45
844 0.53
845 0.57
846 0.58
847 0.57
848 0.56
849 0.53
850 0.5
851 0.51
852 0.46
853 0.45
854 0.45
855 0.4
856 0.37
857 0.36
858 0.34
859 0.3
860 0.34
861 0.32
862 0.32
863 0.34
864 0.42
865 0.51
866 0.58
867 0.6
868 0.6
869 0.62
870 0.64
871 0.69
872 0.71
873 0.69
874 0.66
875 0.64
876 0.64
877 0.63
878 0.58
879 0.54
880 0.5
881 0.5
882 0.45
883 0.44
884 0.4
885 0.37
886 0.33
887 0.3
888 0.23
889 0.18
890 0.17
891 0.17
892 0.15
893 0.13
894 0.12
895 0.09
896 0.12
897 0.11
898 0.14
899 0.15
900 0.16
901 0.15
902 0.22
903 0.23
904 0.21
905 0.24
906 0.28
907 0.34
908 0.38
909 0.46
910 0.47
911 0.56
912 0.62
913 0.66
914 0.68
915 0.72
916 0.77
917 0.74
918 0.72
919 0.67
920 0.64
921 0.6
922 0.55
923 0.44
924 0.35
925 0.31
926 0.29
927 0.26
928 0.22
929 0.17
930 0.16
931 0.18
932 0.22
933 0.22
934 0.21
935 0.2
936 0.21
937 0.22
938 0.19
939 0.19
940 0.2
941 0.21
942 0.21
943 0.2
944 0.2
945 0.21
946 0.22
947 0.23
948 0.22
949 0.23
950 0.27
951 0.36
952 0.41
953 0.48
954 0.58
955 0.65
956 0.67
957 0.66
958 0.63
959 0.58
960 0.56
961 0.52
962 0.48
963 0.44
964 0.42
965 0.47
966 0.47
967 0.47
968 0.43
969 0.38
970 0.31
971 0.25
972 0.22
973 0.17
974 0.16
975 0.12
976 0.12
977 0.11
978 0.11
979 0.11
980 0.1
981 0.1
982 0.11
983 0.11
984 0.12
985 0.12
986 0.12
987 0.12
988 0.11
989 0.11
990 0.1
991 0.09
992 0.09
993 0.09
994 0.1
995 0.12
996 0.14
997 0.14
998 0.16
999 0.25