Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GM25

Protein Details
Accession C1GM25    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MASVHKSLSKRSRKKNQSAVRGNAEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-293KKLKAKPKRAD
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_08416  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MASVHKSLSKRSRKKNQSAVRGNAEDSDVSMNDLLDDPDETSDSDDYEQEEEGQDEQENTADGEIANSISQTQSLGYMRKTRVLMLTSRGVTHRHRHLLSDLTSLLPHTHKENKLDTKKKTAGYNFLLNSLADLHSCNMIFFLEAKKRGHDLYLWLSRPPNGPTIKFSVSSLHTMGEMGVGFAGNCLKGGRGVVVFDKSFDEPTVMRSGNEYRGLVREMLRGVFSVPKRGVRGMKPFVDRIIGVFGVDGKIWIRVFEIRESEGTVGAKAKDDGEATDANEDEKKLKAKPKRADKGGPLDIISLVEIGPRFVLTPIVILEGSFGGPVIYENKEFVSPNQVRREIRLRKASRFVARHVGQSDRMVKRSGLGLTTEGKGNRRSDPLETKAVFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.92
4 0.92
5 0.91
6 0.88
7 0.86
8 0.78
9 0.68
10 0.58
11 0.5
12 0.39
13 0.3
14 0.25
15 0.17
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.12
20 0.13
21 0.12
22 0.09
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.09
61 0.12
62 0.15
63 0.18
64 0.25
65 0.27
66 0.32
67 0.32
68 0.31
69 0.33
70 0.33
71 0.32
72 0.29
73 0.34
74 0.3
75 0.31
76 0.3
77 0.3
78 0.32
79 0.37
80 0.41
81 0.42
82 0.42
83 0.43
84 0.45
85 0.47
86 0.44
87 0.4
88 0.32
89 0.25
90 0.24
91 0.22
92 0.2
93 0.15
94 0.14
95 0.16
96 0.24
97 0.26
98 0.31
99 0.39
100 0.47
101 0.57
102 0.64
103 0.63
104 0.64
105 0.66
106 0.66
107 0.65
108 0.58
109 0.56
110 0.52
111 0.55
112 0.45
113 0.41
114 0.38
115 0.3
116 0.27
117 0.2
118 0.16
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.12
130 0.16
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.24
136 0.24
137 0.2
138 0.2
139 0.23
140 0.29
141 0.28
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.28
147 0.27
148 0.22
149 0.23
150 0.24
151 0.29
152 0.29
153 0.27
154 0.26
155 0.23
156 0.22
157 0.23
158 0.2
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.09
164 0.07
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.1
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.18
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.15
211 0.14
212 0.18
213 0.19
214 0.21
215 0.22
216 0.26
217 0.3
218 0.3
219 0.38
220 0.38
221 0.42
222 0.42
223 0.41
224 0.38
225 0.35
226 0.3
227 0.22
228 0.19
229 0.13
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.05
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.14
270 0.16
271 0.2
272 0.29
273 0.36
274 0.45
275 0.54
276 0.64
277 0.7
278 0.75
279 0.77
280 0.76
281 0.77
282 0.73
283 0.65
284 0.54
285 0.45
286 0.37
287 0.3
288 0.23
289 0.13
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.08
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.24
322 0.28
323 0.35
324 0.43
325 0.48
326 0.47
327 0.53
328 0.62
329 0.61
330 0.65
331 0.68
332 0.65
333 0.67
334 0.74
335 0.76
336 0.75
337 0.7
338 0.66
339 0.65
340 0.61
341 0.6
342 0.54
343 0.5
344 0.44
345 0.47
346 0.51
347 0.46
348 0.47
349 0.43
350 0.4
351 0.37
352 0.39
353 0.34
354 0.26
355 0.23
356 0.23
357 0.24
358 0.26
359 0.29
360 0.27
361 0.29
362 0.33
363 0.35
364 0.37
365 0.4
366 0.41
367 0.45
368 0.51
369 0.53
370 0.56