FuNGI

A0A1C7N279

Protein Details

Accession

A0A1C7N279

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	ASDKSSPTTRNKKPSCWNCMSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

ASDKSSPTTRNKKPSCWNCMSQDHTTKDCSQPCKLCNQNGHKHYECTLYKKNKPGSSNNAQSESMLIEEVYLCEKRKMSEADLDDYEQSKNVRLSRSGKTVNTPGLKRNISQKSDPNLRRLTSLESQTSLPSENLNNPILSLPRSTNKSQPIKAKITQIVDKLVSDSVHTLSLDEIAELSPVVRSQSTPHTSIALLGETVSTVPKGKSTPRANGWVNGEPCEVILDGGCTSFIISLSFARSLVIREMEPVNTSVMFGDDKYRFIVGREGLHILKIGTDRATHFWYIKRDDGTIPLDTYYTSVITRESDETDEEIDHGEFPNEEEDYMDQDDVEEGYLIIEASDDEDTSESKPDVHHGDRFGQPIERIVKQDSMTESEKKFLIEILHAYADCFGTSYEHLTQTNLLKFHVDTGNAKPIYKRPYSFLSFSEKQELKEELETMVKNGVLTPSMHVPGNGTHSGWSFPCRYVPKKTGDKRSIINFRKLNAVTVRDTWPLPNLVDVLESLANSKWFSVLDLLKAFQQIAVEDESIPKLTIATPWGSYSYRCIPFGVLNGPVAFSRCVFLAIQPFLGEFATNYLDDVTIFSKVMEDHLLNIEKFLTRMREVNLKINANKCKFYQQEITLLGFVVSNRISHHLHLRRHIPGFADLSSPLNELLKKKNHFIWSEECEYAFESMKRTLINATTLVIPDVNTKYKLYCDASEVGIGACLATDIKDGEKPVLCLSGKLQPAETRYPTFKIVHLPSSKNSVADALSRFPPKINKDNEDGDDCMEALYDHLIIEENQQNQFKSWLHDLILYFRFPGHNRNSQKTKRLSLKYVFENDTLYRKVGNDILTEIHDEHGHFGINASWARLYQTYWWPDCYADLRYHIRTCHPCQIFSTTEPNPASQRVSVNYIFEQFFLDFVGPLPKSKHGNVHILVAVESFTQWPIALAAPNTEAKTVANFLYKYIFCQFGPPTHILSDNGSGFDNEIINNFTSLINVHYKFTSPYRSSTNGRTEQMNGTIVKDRKKLCVSNPLNWDEHIDAVLYAYRTKANSVLKVSHYEYMCGIAPNSSKMDPLQFLGRALDMERLVELSDRNVQIDDYNVLNEEYDVKPTFGRKYFEPGASVVRVRHNKFSKLDTHFKLEVLRVISCFANGTCQLADQMGRLLKRRVNVHSLRKIHSRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.84
3	0.82
4	0.79
5	0.76
6	0.78
7	0.75
8	0.73
9	0.72
10	0.67
11	0.62
12	0.6
13	0.57
14	0.57
15	0.58
16	0.55
17	0.55
18	0.57
19	0.57
20	0.62
21	0.65
22	0.65
23	0.68
24	0.72
25	0.74
26	0.72
27	0.78
28	0.72
29	0.67
30	0.62
31	0.61
32	0.56
33	0.54
34	0.57
35	0.59
36	0.62
37	0.68
38	0.74
39	0.72
40	0.74
41	0.75
42	0.74
43	0.75
44	0.77
45	0.73
46	0.69
47	0.62
48	0.55
49	0.47
50	0.38
51	0.28
52	0.19
53	0.13
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.12
58	0.14
59	0.15
60	0.19
61	0.21
62	0.22
63	0.29
64	0.32
65	0.33
66	0.39
67	0.41
68	0.42
69	0.43
70	0.44
71	0.38
72	0.35
73	0.32
74	0.26
75	0.23
76	0.22
77	0.24
78	0.27
79	0.29
80	0.34
81	0.4
82	0.44
83	0.52
84	0.54
85	0.52
86	0.54
87	0.56
88	0.58
89	0.6
90	0.55
91	0.53
92	0.55
93	0.55
94	0.51
95	0.55
96	0.56
97	0.54
98	0.58
99	0.6
100	0.6
101	0.69
102	0.7
103	0.68
104	0.65
105	0.61
106	0.57
107	0.5
108	0.48
109	0.44
110	0.46
111	0.4
112	0.36
113	0.36
114	0.34
115	0.34
116	0.28
117	0.22
118	0.19
119	0.19
120	0.22
121	0.25
122	0.26
123	0.24
124	0.23
125	0.24
126	0.23
127	0.22
128	0.2
129	0.2
130	0.25
131	0.3
132	0.33
133	0.38
134	0.46
135	0.53
136	0.57
137	0.62
138	0.64
139	0.65
140	0.67
141	0.68
142	0.64
143	0.61
144	0.6
145	0.53
146	0.5
147	0.44
148	0.4
149	0.33
150	0.29
151	0.23
152	0.18
153	0.18
154	0.14
155	0.15
156	0.14
157	0.13
158	0.11
159	0.13
160	0.12
161	0.1
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.12
173	0.21
174	0.25
175	0.27
176	0.28
177	0.28
178	0.27
179	0.29
180	0.27
181	0.18
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.08
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.11
192	0.14
193	0.2
194	0.29
195	0.35
196	0.43
197	0.46
198	0.55
199	0.55
200	0.57
201	0.57
202	0.55
203	0.5
204	0.44
205	0.39
206	0.3
207	0.28
208	0.24
209	0.18
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.08
223	0.1
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.12
229	0.14
230	0.15
231	0.12
232	0.15
233	0.16
234	0.17
235	0.17
236	0.16
237	0.15
238	0.13
239	0.13
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.15
245	0.14
246	0.15
247	0.17
248	0.18
249	0.16
250	0.17
251	0.22
252	0.18
253	0.2
254	0.21
255	0.23
256	0.22
257	0.22
258	0.22
259	0.16
260	0.16
261	0.14
262	0.13
263	0.11
264	0.13
265	0.14
266	0.17
267	0.21
268	0.2
269	0.21
270	0.25
271	0.3
272	0.33
273	0.35
274	0.33
275	0.32
276	0.31
277	0.34
278	0.32
279	0.28
280	0.24
281	0.2
282	0.18
283	0.16
284	0.16
285	0.12
286	0.1
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.12
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.13
300	0.12
301	0.11
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.11
313	0.12
314	0.11
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.03
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.12
340	0.18
341	0.2
342	0.23
343	0.24
344	0.28
345	0.3
346	0.32
347	0.3
348	0.26
349	0.23
350	0.25
351	0.27
352	0.24
353	0.23
354	0.24
355	0.26
356	0.24
357	0.27
358	0.23
359	0.25
360	0.26
361	0.29
362	0.28
363	0.26
364	0.26
365	0.23
366	0.21
367	0.18
368	0.16
369	0.12
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.11
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.14
387	0.17
388	0.2
389	0.23
390	0.2
391	0.18
392	0.17
393	0.17
394	0.2
395	0.19
396	0.17
397	0.16
398	0.19
399	0.28
400	0.27
401	0.27
402	0.25
403	0.28
404	0.33
405	0.35
406	0.32
407	0.28
408	0.34
409	0.37
410	0.38
411	0.35
412	0.37
413	0.36
414	0.36
415	0.42
416	0.36
417	0.33
418	0.35
419	0.34
420	0.27
421	0.25
422	0.24
423	0.17
424	0.19
425	0.18
426	0.15
427	0.14
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.16
442	0.15
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.15
447	0.14
448	0.16
449	0.13
450	0.13
451	0.18
452	0.23
453	0.26
454	0.32
455	0.37
456	0.43
457	0.51
458	0.59
459	0.63
460	0.63
461	0.63
462	0.6
463	0.63
464	0.65
465	0.59
466	0.6
467	0.51
468	0.47
469	0.51
470	0.47
471	0.42
472	0.35
473	0.33
474	0.27
475	0.28
476	0.29
477	0.23
478	0.24
479	0.2
480	0.19
481	0.17
482	0.15
483	0.12
484	0.1
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.09
500	0.09
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.13
506	0.12
507	0.09
508	0.08
509	0.06
510	0.07
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.06
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.14
530	0.2
531	0.2
532	0.2
533	0.2
534	0.19
535	0.19
536	0.21
537	0.19
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.11
552	0.11
553	0.11
554	0.11
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.08
559	0.04
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.06
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.1
587	0.09
588	0.12
589	0.13
590	0.2
591	0.21
592	0.28
593	0.31
594	0.31
595	0.33
596	0.38
597	0.44
598	0.39
599	0.39
600	0.33
601	0.36
602	0.35
603	0.36
604	0.36
605	0.3
606	0.33
607	0.33
608	0.33
609	0.25
610	0.24
611	0.19
612	0.14
613	0.12
614	0.08
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.11
619	0.11
620	0.12
621	0.22
622	0.27
623	0.3
624	0.34
625	0.38
626	0.38
627	0.39
628	0.39
629	0.31
630	0.27
631	0.25
632	0.22
633	0.18
634	0.14
635	0.14
636	0.14
637	0.13
638	0.1
639	0.1
640	0.11
641	0.12
642	0.18
643	0.24
644	0.26
645	0.28
646	0.34
647	0.38
648	0.38
649	0.39
650	0.39
651	0.37
652	0.39
653	0.36
654	0.31
655	0.26
656	0.25
657	0.22
658	0.17
659	0.13
660	0.11
661	0.11
662	0.13
663	0.12
664	0.12
665	0.12
666	0.12
667	0.13
668	0.11
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.1
673	0.09
674	0.08
675	0.1
676	0.12
677	0.13
678	0.14
679	0.14
680	0.14
681	0.15
682	0.19
683	0.19
684	0.17
685	0.18
686	0.18
687	0.19
688	0.18
689	0.17
690	0.13
691	0.1
692	0.09
693	0.06
694	0.04
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.04
699	0.04
700	0.05
701	0.07
702	0.07
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.12
707	0.16
708	0.15
709	0.15
710	0.16
711	0.2
712	0.21
713	0.21
714	0.21
715	0.19
716	0.23
717	0.27
718	0.28
719	0.25
720	0.25
721	0.27
722	0.29
723	0.28
724	0.26
725	0.28
726	0.28
727	0.32
728	0.34
729	0.35
730	0.33
731	0.38
732	0.37
733	0.3
734	0.27
735	0.22
736	0.18
737	0.19
738	0.19
739	0.15
740	0.18
741	0.19
742	0.19
743	0.2
744	0.25
745	0.28
746	0.35
747	0.38
748	0.38
749	0.41
750	0.45
751	0.46
752	0.43
753	0.38
754	0.3
755	0.24
756	0.21
757	0.16
758	0.11
759	0.08
760	0.05
761	0.05
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.05
766	0.05
767	0.1
768	0.14
769	0.15
770	0.18
771	0.2
772	0.2
773	0.2
774	0.24
775	0.2
776	0.2
777	0.21
778	0.2
779	0.19
780	0.22
781	0.22
782	0.24
783	0.25
784	0.21
785	0.18
786	0.17
787	0.19
788	0.17
789	0.25
790	0.25
791	0.33
792	0.38
793	0.46
794	0.55
795	0.59
796	0.67
797	0.65
798	0.67
799	0.67
800	0.68
801	0.67
802	0.63
803	0.64
804	0.61
805	0.61
806	0.55
807	0.46
808	0.43
809	0.38
810	0.36
811	0.3
812	0.24
813	0.19
814	0.17
815	0.19
816	0.19
817	0.19
818	0.15
819	0.15
820	0.16
821	0.16
822	0.17
823	0.15
824	0.13
825	0.12
826	0.11
827	0.12
828	0.11
829	0.11
830	0.09
831	0.09
832	0.09
833	0.12
834	0.12
835	0.11
836	0.1
837	0.1
838	0.12
839	0.13
840	0.13
841	0.14
842	0.21
843	0.27
844	0.28
845	0.3
846	0.29
847	0.28
848	0.29
849	0.27
850	0.23
851	0.19
852	0.22
853	0.25
854	0.29
855	0.31
856	0.31
857	0.36
858	0.4
859	0.44
860	0.49
861	0.46
862	0.43
863	0.43
864	0.47
865	0.42
866	0.37
867	0.39
868	0.31
869	0.36
870	0.36
871	0.35
872	0.32
873	0.31
874	0.3
875	0.25
876	0.26
877	0.21
878	0.26
879	0.25
880	0.26
881	0.25
882	0.26
883	0.24
884	0.21
885	0.21
886	0.15
887	0.14
888	0.12
889	0.11
890	0.08
891	0.08
892	0.14
893	0.12
894	0.14
895	0.17
896	0.21
897	0.25
898	0.28
899	0.35
900	0.34
901	0.41
902	0.4
903	0.42
904	0.38
905	0.35
906	0.32
907	0.24
908	0.2
909	0.12
910	0.11
911	0.08
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.08
918	0.09
919	0.09
920	0.1
921	0.12
922	0.15
923	0.15
924	0.15
925	0.14
926	0.13
927	0.14
928	0.15
929	0.14
930	0.17
931	0.16
932	0.17
933	0.23
934	0.22
935	0.24
936	0.24
937	0.25
938	0.2
939	0.26
940	0.27
941	0.25
942	0.3
943	0.29
944	0.28
945	0.27
946	0.29
947	0.24
948	0.25
949	0.26
950	0.21
951	0.21
952	0.19
953	0.17
954	0.16
955	0.16
956	0.14
957	0.1
958	0.1
959	0.11
960	0.11
961	0.11
962	0.11
963	0.1
964	0.1
965	0.1
966	0.12
967	0.17
968	0.18
969	0.19
970	0.19
971	0.2
972	0.23
973	0.27
974	0.33
975	0.28
976	0.31
977	0.36
978	0.41
979	0.44
980	0.49
981	0.54
982	0.51
983	0.51
984	0.49
985	0.47
986	0.44
987	0.43
988	0.39
989	0.3
990	0.27
991	0.33
992	0.34
993	0.37
994	0.4
995	0.4
996	0.44
997	0.51
998	0.53
999	0.51
1000	0.58
1001	0.57
1002	0.59
1003	0.64
1004	0.61
1005	0.55
1006	0.5
1007	0.48
1008	0.38
1009	0.33
1010	0.25
1011	0.18
1012	0.13
1013	0.12
1014	0.14
1015	0.11
1016	0.1
1017	0.11
1018	0.13
1019	0.13
1020	0.15
1021	0.21
1022	0.24
1023	0.3
1024	0.34
1025	0.38
1026	0.38
1027	0.43
1028	0.44
1029	0.44
1030	0.38
1031	0.34
1032	0.29
1033	0.27
1034	0.26
1035	0.21
1036	0.19
1037	0.17
1038	0.17
1039	0.19
1040	0.22
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.2
1044	0.25
1045	0.22
1046	0.23
1047	0.26
1048	0.23
1049	0.24
1050	0.24
1051	0.23
1052	0.19
1053	0.19
1054	0.2
1055	0.15
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.13
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.13
1062	0.12
1063	0.19
1064	0.19
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.2
1068	0.19
1069	0.21
1070	0.2
1071	0.14
1072	0.14
1073	0.14
1074	0.14
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.14
1078	0.13
1079	0.17
1080	0.17
1081	0.17
1082	0.2
1083	0.24
1084	0.31
1085	0.33
1086	0.36
1087	0.33
1088	0.41
1089	0.46
1090	0.46
1091	0.45
1092	0.39
1093	0.39
1094	0.39
1095	0.4
1096	0.34
1097	0.38
1098	0.44
1099	0.46
1100	0.54
1101	0.55
1102	0.58
1103	0.6
1104	0.63
1105	0.62
1106	0.62
1107	0.68
1108	0.62
1109	0.63
1110	0.57
1111	0.54
1112	0.52
1113	0.45
1114	0.42
1115	0.35
1116	0.32
1117	0.25
1118	0.26
1119	0.25
1120	0.21
1121	0.21
1122	0.16
1123	0.19
1124	0.17
1125	0.2
1126	0.18
1127	0.18
1128	0.19
1129	0.18
1130	0.19
1131	0.14
1132	0.19
1133	0.21
1134	0.24
1135	0.28
1136	0.33
1137	0.34
1138	0.4
1139	0.46
1140	0.47
1141	0.53
1142	0.59
1143	0.65
1144	0.69
1145	0.73
1146	0.72

A0A1C7N279

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer