FuNGI

A0A1C7NMQ1

Protein Details

Accession

A0A1C7NMQ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
247-268	KGLKNSKKTTDHQQKKKHVTLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-184	HRSEFKKRLEAQKLKKA

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 4, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSKFTRPTFNVDDDDLERLQKEFFDTEQAPSAKVYRKAAPPSVGEKKRSLFAERLASSCQDSNTINMPSLEDSNNTMPPLEDTSMPSLEDGADQQDQETAYEPVIDPHPEPHVPVSKKMIDLTSMLGQVLGEIKEHNVESVTAPKFPDTISENKPARGQHNGFPKPVHRSEFKKRLEAQKLKKAAPPSQRLAAPPQVEESQPKQLDPVIDENENDQRIRAMSEAELEEARQEIMSTLSPESVALLMKGLKNSKKTTDHQQKKKHVTLEVAEDRSETKMKDEDEDVGDDLLKMKAKYFANVPLENEKLAWMDNRFMTSELKQQQQQQVEEDKKSVPTEAEKVYRQVRFDLQGNIIDPSVDLPRHKGLHHHGDEPDKAGYTLAELFYLTRSQVPSQRAMVLNIITRIIYAAKKNQDGSWPIVWTIFTGKEHAASIYLRSALDDRHLVVMVSTIKALSALVLDDNNNEAWENNLIHQVDSFNKFLGHVARPVLSQGATEFKRKGLNDKLTELVDRVRQQSGSEQDLEDDAALAERDLARGLVKMNILPRIRYLFASSDRNNSELIHSDSASVERLVRLLVHMAQSGQDICELIEEEELLDPVVQWGIQDTQWPMTSDTPQGNYPSVASVRLLTVMAQGSKKVAETIVDKAIGTLRFVLTSPEIATTANLKQRAYALQLETLKLVRILACYGFIVPTLEDLQEPVMDWLRASLRSADDENDVYASVRAATAIGLLEVLLHAAADPHKTTPAHAIDWHQPTAYLPAVLAVLRANRKQLHQVLYESALGYLGTWASYASLFPPPADMIREVWKAVFEEQDRDQIVSALTTNHGLLRYIQWLVAYASQTVCTDLSEAAQKALLSTPLMNLLQERCTQDLHSRYALWIWASHTSEQKWRSDDTLVQMSELQSGIRSKVQAAADLVETWLAQNLLQLCLSDQLPNDLKPFYFSAQPAQLTISKALFDHDGRPLKSLMYLCQPSQAEQDTSAFILSPIDALYHLDKSTLAQKSQASAVSIVSQTLNFADKSVKIDPNMAIVSLMKVFLIGDREGRQADMMSEREIFWDVPEVDDWLNKYCSYSTTLSCLENAWQASSQYIRQAKVPFYQFYQGFVAQYAAVSLGHHGFARLLVYLLSQIDVVDYRHLVLADYRDILPTLKVRQDELPSLTHSQLQALSDAGLYLLPVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.34
3	0.29
4	0.24
5	0.21
6	0.2
7	0.16
8	0.18
9	0.17
10	0.17
11	0.23
12	0.24
13	0.26
14	0.33
15	0.33
16	0.3
17	0.3
18	0.34
19	0.34
20	0.38
21	0.4
22	0.4
23	0.47
24	0.54
25	0.59
26	0.58
27	0.56
28	0.59
29	0.65
30	0.65
31	0.61
32	0.6
33	0.56
34	0.57
35	0.56
36	0.52
37	0.46
38	0.45
39	0.51
40	0.47
41	0.46
42	0.43
43	0.41
44	0.39
45	0.37
46	0.31
47	0.25
48	0.23
49	0.24
50	0.27
51	0.27
52	0.25
53	0.23
54	0.24
55	0.22
56	0.25
57	0.23
58	0.19
59	0.22
60	0.24
61	0.26
62	0.24
63	0.22
64	0.19
65	0.2
66	0.24
67	0.21
68	0.19
69	0.2
70	0.24
71	0.24
72	0.24
73	0.22
74	0.17
75	0.16
76	0.15
77	0.13
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.15
83	0.15
84	0.14
85	0.16
86	0.12
87	0.11
88	0.13
89	0.12
90	0.13
91	0.16
92	0.17
93	0.16
94	0.18
95	0.23
96	0.22
97	0.24
98	0.27
99	0.34
100	0.35
101	0.39
102	0.43
103	0.41
104	0.43
105	0.43
106	0.38
107	0.31
108	0.29
109	0.28
110	0.25
111	0.22
112	0.19
113	0.17
114	0.15
115	0.14
116	0.16
117	0.12
118	0.09
119	0.09
120	0.1
121	0.13
122	0.13
123	0.13
124	0.11
125	0.12
126	0.13
127	0.21
128	0.21
129	0.21
130	0.21
131	0.21
132	0.21
133	0.2
134	0.23
135	0.2
136	0.25
137	0.29
138	0.38
139	0.39
140	0.41
141	0.45
142	0.44
143	0.43
144	0.46
145	0.44
146	0.41
147	0.5
148	0.52
149	0.51
150	0.51
151	0.52
152	0.51
153	0.53
154	0.52
155	0.48
156	0.52
157	0.6
158	0.67
159	0.66
160	0.67
161	0.68
162	0.73
163	0.77
164	0.79
165	0.78
166	0.77
167	0.79
168	0.74
169	0.71
170	0.67
171	0.65
172	0.64
173	0.63
174	0.58
175	0.56
176	0.56
177	0.54
178	0.54
179	0.52
180	0.44
181	0.37
182	0.36
183	0.32
184	0.31
185	0.33
186	0.31
187	0.33
188	0.32
189	0.31
190	0.28
191	0.29
192	0.3
193	0.28
194	0.3
195	0.24
196	0.25
197	0.25
198	0.27
199	0.3
200	0.3
201	0.27
202	0.2
203	0.18
204	0.17
205	0.18
206	0.16
207	0.12
208	0.11
209	0.14
210	0.15
211	0.15
212	0.15
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.11
217	0.08
218	0.07
219	0.06
220	0.07
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.07
231	0.07
232	0.1
233	0.11
234	0.15
235	0.21
236	0.24
237	0.3
238	0.34
239	0.4
240	0.45
241	0.48
242	0.56
243	0.61
244	0.67
245	0.72
246	0.78
247	0.81
248	0.83
249	0.85
250	0.79
251	0.71
252	0.66
253	0.59
254	0.58
255	0.55
256	0.47
257	0.41
258	0.36
259	0.33
260	0.3
261	0.29
262	0.2
263	0.15
264	0.18
265	0.19
266	0.21
267	0.22
268	0.22
269	0.22
270	0.24
271	0.21
272	0.17
273	0.16
274	0.14
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.18
281	0.18
282	0.2
283	0.22
284	0.29
285	0.33
286	0.34
287	0.36
288	0.35
289	0.35
290	0.34
291	0.31
292	0.23
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.12
297	0.14
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.17
302	0.19
303	0.18
304	0.25
305	0.27
306	0.3
307	0.32
308	0.38
309	0.43
310	0.45
311	0.45
312	0.41
313	0.45
314	0.46
315	0.44
316	0.4
317	0.34
318	0.31
319	0.3
320	0.27
321	0.19
322	0.18
323	0.21
324	0.24
325	0.27
326	0.27
327	0.3
328	0.36
329	0.37
330	0.34
331	0.33
332	0.31
333	0.3
334	0.32
335	0.31
336	0.27
337	0.26
338	0.26
339	0.24
340	0.2
341	0.17
342	0.13
343	0.11
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.13
348	0.18
349	0.2
350	0.2
351	0.24
352	0.29
353	0.38
354	0.4
355	0.42
356	0.4
357	0.43
358	0.43
359	0.4
360	0.34
361	0.24
362	0.21
363	0.16
364	0.13
365	0.1
366	0.11
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.18
378	0.21
379	0.23
380	0.24
381	0.28
382	0.27
383	0.26
384	0.26
385	0.21
386	0.2
387	0.18
388	0.16
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.18
396	0.22
397	0.24
398	0.26
399	0.27
400	0.29
401	0.3
402	0.32
403	0.29
404	0.25
405	0.23
406	0.22
407	0.21
408	0.17
409	0.16
410	0.13
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.11
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.09
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.09
433	0.11
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.12
458	0.13
459	0.12
460	0.13
461	0.13
462	0.14
463	0.17
464	0.17
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.14
469	0.17
470	0.15
471	0.14
472	0.14
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.14
477	0.1
478	0.09
479	0.08
480	0.13
481	0.14
482	0.16
483	0.17
484	0.17
485	0.22
486	0.23
487	0.29
488	0.31
489	0.38
490	0.38
491	0.39
492	0.4
493	0.36
494	0.36
495	0.3
496	0.23
497	0.19
498	0.19
499	0.18
500	0.18
501	0.17
502	0.17
503	0.21
504	0.23
505	0.21
506	0.2
507	0.18
508	0.17
509	0.17
510	0.16
511	0.11
512	0.08
513	0.05
514	0.04
515	0.04
516	0.03
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.08
527	0.09
528	0.11
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.19
536	0.19
537	0.16
538	0.19
539	0.25
540	0.25
541	0.27
542	0.27
543	0.28
544	0.26
545	0.23
546	0.21
547	0.17
548	0.18
549	0.14
550	0.13
551	0.13
552	0.13
553	0.13
554	0.13
555	0.1
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.05
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.09
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.12
599	0.14
600	0.15
601	0.15
602	0.15
603	0.16
604	0.16
605	0.15
606	0.14
607	0.13
608	0.12
609	0.11
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.07
614	0.08
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.09
629	0.11
630	0.13
631	0.13
632	0.12
633	0.12
634	0.15
635	0.14
636	0.12
637	0.1
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.09
650	0.12
651	0.15
652	0.16
653	0.15
654	0.16
655	0.17
656	0.18
657	0.19
658	0.18
659	0.16
660	0.19
661	0.2
662	0.2
663	0.19
664	0.18
665	0.15
666	0.12
667	0.11
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.05
679	0.06
680	0.07
681	0.07
682	0.06
683	0.07
684	0.07
685	0.06
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.08
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.1
697	0.13
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.13
703	0.11
704	0.11
705	0.09
706	0.08
707	0.07
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.02
722	0.02
723	0.02
724	0.03
725	0.04
726	0.05
727	0.06
728	0.07
729	0.1
730	0.11
731	0.12
732	0.18
733	0.2
734	0.2
735	0.21
736	0.24
737	0.28
738	0.32
739	0.31
740	0.24
741	0.22
742	0.21
743	0.23
744	0.19
745	0.12
746	0.08
747	0.08
748	0.09
749	0.08
750	0.08
751	0.06
752	0.09
753	0.13
754	0.14
755	0.17
756	0.19
757	0.21
758	0.28
759	0.32
760	0.33
761	0.33
762	0.34
763	0.32
764	0.32
765	0.31
766	0.23
767	0.18
768	0.13
769	0.1
770	0.08
771	0.07
772	0.05
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.06
780	0.09
781	0.09
782	0.09
783	0.1
784	0.11
785	0.12
786	0.13
787	0.13
788	0.12
789	0.18
790	0.19
791	0.18
792	0.17
793	0.17
794	0.17
795	0.17
796	0.2
797	0.15
798	0.18
799	0.19
800	0.24
801	0.24
802	0.23
803	0.22
804	0.17
805	0.16
806	0.13
807	0.12
808	0.08
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.09
814	0.09
815	0.1
816	0.11
817	0.13
818	0.12
819	0.12
820	0.11
821	0.12
822	0.13
823	0.14
824	0.13
825	0.12
826	0.11
827	0.12
828	0.12
829	0.12
830	0.11
831	0.09
832	0.09
833	0.08
834	0.09
835	0.12
836	0.12
837	0.11
838	0.12
839	0.12
840	0.12
841	0.12
842	0.12
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.12
847	0.12
848	0.11
849	0.12
850	0.13
851	0.15
852	0.18
853	0.19
854	0.17
855	0.18
856	0.2
857	0.25
858	0.28
859	0.29
860	0.28
861	0.26
862	0.25
863	0.25
864	0.25
865	0.19
866	0.16
867	0.14
868	0.18
869	0.2
870	0.22
871	0.25
872	0.26
873	0.32
874	0.33
875	0.35
876	0.32
877	0.32
878	0.32
879	0.31
880	0.31
881	0.3
882	0.34
883	0.3
884	0.28
885	0.28
886	0.25
887	0.23
888	0.21
889	0.15
890	0.1
891	0.11
892	0.12
893	0.13
894	0.13
895	0.13
896	0.19
897	0.19
898	0.2
899	0.2
900	0.19
901	0.18
902	0.17
903	0.17
904	0.11
905	0.11
906	0.08
907	0.08
908	0.07
909	0.06
910	0.08
911	0.09
912	0.1
913	0.1
914	0.1
915	0.1
916	0.12
917	0.13
918	0.12
919	0.11
920	0.16
921	0.19
922	0.2
923	0.22
924	0.2
925	0.19
926	0.2
927	0.23
928	0.18
929	0.2
930	0.2
931	0.24
932	0.27
933	0.28
934	0.25
935	0.26
936	0.27
937	0.24
938	0.26
939	0.21
940	0.17
941	0.16
942	0.17
943	0.18
944	0.17
945	0.18
946	0.24
947	0.3
948	0.3
949	0.32
950	0.31
951	0.28
952	0.31
953	0.29
954	0.24
955	0.26
956	0.28
957	0.26
958	0.33
959	0.33
960	0.3
961	0.33
962	0.33
963	0.26
964	0.24
965	0.25
966	0.2
967	0.2
968	0.18
969	0.13
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.07
974	0.06
975	0.06
976	0.06
977	0.08
978	0.1
979	0.12
980	0.12
981	0.12
982	0.12
983	0.13
984	0.21
985	0.23
986	0.22
987	0.24
988	0.25
989	0.27
990	0.3
991	0.3
992	0.23
993	0.2
994	0.2
995	0.19
996	0.18
997	0.17
998	0.14
999	0.12
1000	0.11
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.1
1004	0.11
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.19
1008	0.24
1009	0.27
1010	0.26
1011	0.3
1012	0.29
1013	0.31
1014	0.3
1015	0.25
1016	0.2
1017	0.17
1018	0.17
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.08
1022	0.08
1023	0.07
1024	0.09
1025	0.12
1026	0.11
1027	0.14
1028	0.17
1029	0.2
1030	0.2
1031	0.21
1032	0.2
1033	0.17
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.19
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.18
1043	0.14
1044	0.19
1045	0.17
1046	0.18
1047	0.18
1048	0.19
1049	0.18
1050	0.2
1051	0.21
1052	0.18
1053	0.19
1054	0.18
1055	0.19
1056	0.18
1057	0.19
1058	0.22
1059	0.24
1060	0.22
1061	0.26
1062	0.28
1063	0.28
1064	0.27
1065	0.26
1066	0.23
1067	0.24
1068	0.23
1069	0.2
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.21
1073	0.22
1074	0.22
1075	0.26
1076	0.29
1077	0.28
1078	0.32
1079	0.36
1080	0.37
1081	0.42
1082	0.46
1083	0.4
1084	0.4
1085	0.47
1086	0.42
1087	0.41
1088	0.42
1089	0.35
1090	0.3
1091	0.28
1092	0.25
1093	0.17
1094	0.17
1095	0.13
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.09
1100	0.09
1101	0.1
1102	0.11
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.11
1106	0.12
1107	0.1
1108	0.09
1109	0.08
1110	0.09
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.09
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.13
1122	0.14
1123	0.15
1124	0.14
1125	0.16
1126	0.19
1127	0.19
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.2
1131	0.21
1132	0.21
1133	0.21
1134	0.22
1135	0.26
1136	0.28
1137	0.29
1138	0.31
1139	0.37
1140	0.41
1141	0.43
1142	0.41
1143	0.39
1144	0.38
1145	0.4
1146	0.39
1147	0.36
1148	0.31
1149	0.28
1150	0.27
1151	0.25
1152	0.21
1153	0.18
1154	0.17
1155	0.13
1156	0.13
1157	0.1
1158	0.08

A0A1C7NMQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer