Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7N6X5

Protein Details
Accession A0A1C7N6X5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-102HIMKYPGYKYRPKRNPKPKRAYKKHPENELIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-96KYPGYKYRPKRNPKPKRAYKKH
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.5, mito 9.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MKCSKVDKDSKIPRPLNSFMIFRLEKQREITQLCPGANHRDMSKIISKWWHELPAEEKQVYIDQAAKTKKEHIMKYPGYKYRPKRNPKPKRAYKKHPENELIARDSDSAQILLTLYNLGNSYNPFDQPSQRMSLPEDLPAEQAFSTVFDEKPSVPLKPEYMLKFQQELFSSYYLPMPLDMVQRVSTNPFASSGYPFQTVPSTIFTTPAYMPFNPYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.68
3 0.64
4 0.58
5 0.5
6 0.41
7 0.45
8 0.39
9 0.35
10 0.42
11 0.38
12 0.37
13 0.41
14 0.44
15 0.42
16 0.46
17 0.45
18 0.43
19 0.44
20 0.41
21 0.39
22 0.37
23 0.37
24 0.36
25 0.35
26 0.28
27 0.27
28 0.28
29 0.3
30 0.34
31 0.28
32 0.28
33 0.33
34 0.35
35 0.35
36 0.37
37 0.37
38 0.31
39 0.32
40 0.33
41 0.35
42 0.37
43 0.33
44 0.3
45 0.26
46 0.27
47 0.25
48 0.21
49 0.17
50 0.14
51 0.2
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.27
56 0.33
57 0.36
58 0.38
59 0.38
60 0.45
61 0.49
62 0.55
63 0.58
64 0.58
65 0.56
66 0.61
67 0.63
68 0.65
69 0.7
70 0.72
71 0.75
72 0.8
73 0.86
74 0.89
75 0.92
76 0.92
77 0.93
78 0.93
79 0.93
80 0.92
81 0.92
82 0.88
83 0.85
84 0.77
85 0.7
86 0.65
87 0.58
88 0.48
89 0.37
90 0.3
91 0.23
92 0.2
93 0.16
94 0.11
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.24
121 0.22
122 0.22
123 0.21
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.17
128 0.11
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.17
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.27
146 0.26
147 0.3
148 0.34
149 0.34
150 0.34
151 0.34
152 0.34
153 0.3
154 0.29
155 0.25
156 0.22
157 0.21
158 0.19
159 0.19
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.22
179 0.22
180 0.22
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.23
186 0.2
187 0.22
188 0.23
189 0.21
190 0.23
191 0.22
192 0.23
193 0.23
194 0.26
195 0.26
196 0.22