Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7NS13

Protein Details
Accession A0A1C7NS13    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSDKRSKEFDRRRDRRKNDSTNTPSFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, plas 2, cyto 1, pero 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR039177  SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Amino Acid Sequences MSDKRSKEFDRRRDRRKNDSTNTPSFLQAPIILDRRECSEPGSTSHEPEKPKKSFAQISDIDAHCSYIPFMRRPNKFNTDAILKMLTDYPGHFAIGVIGKQGVGKSTILSHFAPNSKQVFPIQEVNQYLYQGHKTEGIDIHVTPERAILLDTEPILDWTVLDKALRTGNLGGLHPDLWLEMENLYNIIFIMSVCNVVLVLADGPEYDIDLLRLLQRAAMLKFNIPDFPLLESQQDMNYYPDIVFVSNKCRKEEFTLEKYSRLDAILGSFFQESQLRTKGLTRFSEVLPLFESDNNSNLFFLPDWSEKTQVESFDVLVCALRNQVFTAPRRSGRKGQVSEKDWYRNAVRVYELVRKSEYILEYLQVLRKLKDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.91
3 0.91
4 0.91
5 0.89
6 0.9
7 0.87
8 0.83
9 0.79
10 0.7
11 0.6
12 0.51
13 0.43
14 0.34
15 0.27
16 0.22
17 0.24
18 0.27
19 0.26
20 0.26
21 0.26
22 0.29
23 0.3
24 0.27
25 0.24
26 0.26
27 0.27
28 0.29
29 0.37
30 0.33
31 0.34
32 0.4
33 0.42
34 0.43
35 0.49
36 0.55
37 0.51
38 0.54
39 0.56
40 0.58
41 0.6
42 0.57
43 0.58
44 0.5
45 0.51
46 0.53
47 0.48
48 0.43
49 0.36
50 0.33
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.16
55 0.2
56 0.2
57 0.29
58 0.37
59 0.43
60 0.47
61 0.55
62 0.58
63 0.57
64 0.55
65 0.52
66 0.49
67 0.44
68 0.41
69 0.34
70 0.26
71 0.23
72 0.23
73 0.18
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.13
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.22
100 0.22
101 0.24
102 0.27
103 0.24
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.3
109 0.26
110 0.28
111 0.28
112 0.29
113 0.28
114 0.25
115 0.23
116 0.18
117 0.19
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.14
131 0.13
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.05
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.19
233 0.25
234 0.27
235 0.29
236 0.3
237 0.31
238 0.36
239 0.45
240 0.44
241 0.44
242 0.51
243 0.5
244 0.52
245 0.5
246 0.45
247 0.36
248 0.28
249 0.22
250 0.13
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.12
260 0.15
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.24
265 0.27
266 0.31
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.33
271 0.4
272 0.35
273 0.32
274 0.27
275 0.25
276 0.22
277 0.2
278 0.23
279 0.16
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.13
287 0.13
288 0.15
289 0.16
290 0.21
291 0.23
292 0.26
293 0.25
294 0.3
295 0.31
296 0.27
297 0.27
298 0.23
299 0.22
300 0.2
301 0.2
302 0.15
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.18
311 0.23
312 0.27
313 0.34
314 0.38
315 0.44
316 0.5
317 0.56
318 0.6
319 0.63
320 0.7
321 0.69
322 0.73
323 0.75
324 0.72
325 0.74
326 0.72
327 0.7
328 0.61
329 0.59
330 0.53
331 0.49
332 0.47
333 0.42
334 0.37
335 0.33
336 0.36
337 0.4
338 0.4
339 0.38
340 0.37
341 0.35
342 0.35
343 0.37
344 0.34
345 0.27
346 0.26
347 0.23
348 0.24
349 0.27
350 0.29
351 0.28
352 0.29