Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G3J9

Protein Details
Accession C1G3J9    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-55QGTFPIRSADKRRSRKNHTLDSRETQDHydrophilic
380-399ESRFCPSWRRCQRCRERGHDHydrophilic
530-549RPDNWKPLTRSPPRSRIRFSHydrophilic
616-647SRNRSHSLSPPRSPPRPRRPPPQQTDGRGKGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
625-664PPRSPPRPRRPPPQQTDGRGKGRGGGGPRSRERGVKGGSN
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbn:PADG_01515  -  
Amino Acid Sequences MSDEDVACDSRTASVGLRARNKDTSSGSQGTFPIRSADKRRSRKNHTLDSRETQDFVPKGTLFTSTSLAVYSASSSSPDTNTENSCDTASADRVSSPISRPLSRGGAPSMNWNKLSKGTVRTALRGRRQTEASSTAATSSFETSFETVNGKYWRNRSTSASSRGSGGDQSHLMRNQDQNDSENSASWNKLQAETSRGQTTYSAEFSDMESGEDTHEDNDIVLNLSGPVKEEAAQETRGWTSDVQGNDLPREDSSVLGARYPSGEGFGETIGSEINVKVGDRILVTPLHAEAREEKLLSEAPKAEAIRLFRARYHSDPITLADLTRNDLEIQARYIFFDMPPEDLDLRLPVRCTECMKEGHLADICPSKECEHCGAWSVHESRFCPSWRRCQRCRERGHDAVYCHSPLKGSATEQPCDFCSSKEHTEDDCDLLWKLPKRTPTSGRIFISISCGYCTSNRHLIGDCPMRDYPMDSSSFSLKHYDPSMFSNLNSFHDVIYGKGNKNQGSSGHKVRGRADGRLPSPESDGAFGRPDNWKPLTRSPPRSRIRFSNGIGRGRNLDDDKRCPQVSENGSYNTNDYRRGYRDRDQYHDSSTRQRSLSPNRSLPRQMCRSSNWHSRNRSHSLSPPRSPPRPRRPPPQQTDGRGKGRGGGGPRSRERGVKGGSNRETYRHVPSAAKKAWEQHRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.25
3 0.32
4 0.41
5 0.44
6 0.48
7 0.53
8 0.53
9 0.51
10 0.53
11 0.52
12 0.51
13 0.51
14 0.47
15 0.43
16 0.44
17 0.42
18 0.37
19 0.3
20 0.28
21 0.27
22 0.34
23 0.39
24 0.47
25 0.53
26 0.62
27 0.73
28 0.78
29 0.84
30 0.87
31 0.89
32 0.89
33 0.89
34 0.88
35 0.85
36 0.82
37 0.79
38 0.7
39 0.62
40 0.52
41 0.5
42 0.42
43 0.36
44 0.33
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.26
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.17
66 0.18
67 0.21
68 0.23
69 0.25
70 0.26
71 0.25
72 0.24
73 0.21
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.23
85 0.27
86 0.28
87 0.29
88 0.34
89 0.37
90 0.36
91 0.36
92 0.32
93 0.32
94 0.3
95 0.39
96 0.41
97 0.4
98 0.41
99 0.39
100 0.36
101 0.36
102 0.39
103 0.34
104 0.33
105 0.33
106 0.39
107 0.41
108 0.45
109 0.49
110 0.54
111 0.58
112 0.6
113 0.58
114 0.55
115 0.56
116 0.53
117 0.5
118 0.46
119 0.39
120 0.33
121 0.3
122 0.25
123 0.23
124 0.21
125 0.17
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.18
136 0.22
137 0.24
138 0.28
139 0.34
140 0.38
141 0.4
142 0.43
143 0.43
144 0.48
145 0.52
146 0.55
147 0.53
148 0.48
149 0.46
150 0.43
151 0.38
152 0.33
153 0.25
154 0.2
155 0.18
156 0.19
157 0.22
158 0.24
159 0.25
160 0.26
161 0.29
162 0.3
163 0.33
164 0.32
165 0.3
166 0.3
167 0.33
168 0.29
169 0.25
170 0.24
171 0.21
172 0.2
173 0.19
174 0.22
175 0.19
176 0.2
177 0.22
178 0.21
179 0.25
180 0.26
181 0.29
182 0.27
183 0.26
184 0.24
185 0.23
186 0.24
187 0.21
188 0.2
189 0.17
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.14
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.12
227 0.12
228 0.14
229 0.15
230 0.16
231 0.17
232 0.18
233 0.17
234 0.18
235 0.16
236 0.12
237 0.15
238 0.12
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.2
294 0.22
295 0.22
296 0.21
297 0.25
298 0.28
299 0.29
300 0.32
301 0.27
302 0.25
303 0.25
304 0.25
305 0.22
306 0.18
307 0.16
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.15
340 0.15
341 0.18
342 0.19
343 0.2
344 0.22
345 0.2
346 0.21
347 0.19
348 0.17
349 0.15
350 0.18
351 0.17
352 0.14
353 0.15
354 0.14
355 0.14
356 0.16
357 0.18
358 0.15
359 0.15
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.2
364 0.2
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.19
369 0.22
370 0.23
371 0.27
372 0.28
373 0.37
374 0.45
375 0.53
376 0.58
377 0.65
378 0.74
379 0.76
380 0.8
381 0.77
382 0.75
383 0.72
384 0.71
385 0.65
386 0.55
387 0.49
388 0.43
389 0.37
390 0.28
391 0.23
392 0.17
393 0.13
394 0.16
395 0.13
396 0.13
397 0.19
398 0.22
399 0.23
400 0.24
401 0.24
402 0.21
403 0.25
404 0.24
405 0.17
406 0.18
407 0.22
408 0.25
409 0.27
410 0.28
411 0.25
412 0.28
413 0.29
414 0.26
415 0.21
416 0.19
417 0.16
418 0.15
419 0.19
420 0.19
421 0.21
422 0.22
423 0.29
424 0.34
425 0.41
426 0.45
427 0.49
428 0.53
429 0.57
430 0.55
431 0.5
432 0.45
433 0.38
434 0.37
435 0.3
436 0.23
437 0.17
438 0.16
439 0.15
440 0.17
441 0.19
442 0.19
443 0.24
444 0.25
445 0.25
446 0.26
447 0.26
448 0.31
449 0.36
450 0.31
451 0.28
452 0.28
453 0.27
454 0.26
455 0.27
456 0.22
457 0.18
458 0.2
459 0.16
460 0.18
461 0.2
462 0.2
463 0.19
464 0.2
465 0.17
466 0.18
467 0.2
468 0.19
469 0.18
470 0.21
471 0.26
472 0.23
473 0.22
474 0.24
475 0.23
476 0.24
477 0.25
478 0.21
479 0.16
480 0.18
481 0.18
482 0.14
483 0.2
484 0.23
485 0.22
486 0.26
487 0.3
488 0.29
489 0.31
490 0.32
491 0.3
492 0.32
493 0.37
494 0.39
495 0.43
496 0.43
497 0.45
498 0.46
499 0.5
500 0.45
501 0.44
502 0.44
503 0.44
504 0.44
505 0.47
506 0.46
507 0.38
508 0.38
509 0.35
510 0.29
511 0.24
512 0.23
513 0.18
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.2
518 0.21
519 0.25
520 0.28
521 0.32
522 0.35
523 0.45
524 0.52
525 0.57
526 0.66
527 0.68
528 0.75
529 0.78
530 0.8
531 0.77
532 0.75
533 0.74
534 0.72
535 0.65
536 0.65
537 0.64
538 0.63
539 0.59
540 0.52
541 0.47
542 0.4
543 0.43
544 0.37
545 0.39
546 0.37
547 0.42
548 0.45
549 0.48
550 0.47
551 0.42
552 0.41
553 0.42
554 0.42
555 0.42
556 0.41
557 0.38
558 0.39
559 0.39
560 0.38
561 0.35
562 0.31
563 0.3
564 0.28
565 0.31
566 0.36
567 0.43
568 0.47
569 0.5
570 0.58
571 0.59
572 0.63
573 0.64
574 0.61
575 0.61
576 0.61
577 0.55
578 0.55
579 0.56
580 0.55
581 0.49
582 0.5
583 0.52
584 0.56
585 0.63
586 0.62
587 0.65
588 0.63
589 0.69
590 0.72
591 0.69
592 0.68
593 0.67
594 0.63
595 0.58
596 0.59
597 0.6
598 0.61
599 0.66
600 0.65
601 0.65
602 0.69
603 0.72
604 0.75
605 0.75
606 0.72
607 0.67
608 0.67
609 0.69
610 0.7
611 0.68
612 0.7
613 0.71
614 0.75
615 0.79
616 0.81
617 0.81
618 0.84
619 0.86
620 0.87
621 0.9
622 0.91
623 0.9
624 0.89
625 0.87
626 0.84
627 0.86
628 0.84
629 0.8
630 0.72
631 0.64
632 0.59
633 0.53
634 0.49
635 0.44
636 0.45
637 0.45
638 0.51
639 0.55
640 0.56
641 0.55
642 0.56
643 0.55
644 0.54
645 0.51
646 0.51
647 0.54
648 0.58
649 0.61
650 0.64
651 0.62
652 0.57
653 0.58
654 0.53
655 0.54
656 0.48
657 0.46
658 0.45
659 0.51
660 0.58
661 0.57
662 0.57
663 0.52
664 0.57