Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7N7W2

Protein Details
Accession A0A1C7N7W2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-319QKLLEEKRAKREQKIKKASKYNHHRRGKINSQFSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-312KAQKLLEEKRAKREQKIKKASKYNHHRRGK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004649  RNase_H2_suA  
IPR001352  RNase_HII/HIII  
IPR024567  RNase_HII/HIII_dom  
IPR023160  RNase_HII_hlx-loop-hlx_cap_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01351  RNase_HII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51975  RNASE_H_2  
CDD cd07181  RNase_HII_eukaryota_like  
Amino Acid Sequences MTQTLPEAKMLPSVQFPVTKSYTYQSPVPTLLIENKPNQINEPCVLGVDEAGRGPCLGPMVYAVSYCPLSKHQELKKLGFDDSKKLTEEKRADLAKAVEKNKDWIGWAVYVISPQDISTGMFRRPVYNLNEMAHDATIKLIRQVLDQNVNLTEIYVDPVGPSSSYRSKLQSHFPGIHITVEPKADSLYPIVSTASICAKVTRDQIVQNWVWTETGLDLTKKFGSGYPSDPNTVAWMNNNEDAFFGFPSIMRFSWKTISSRMEKTRTIEWSEDEDDDPNPATKKAQKLLEEKRAKREQKIKKASKYNHHRRGKINSQFSLDTTSSLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.28
4 0.29
5 0.31
6 0.3
7 0.29
8 0.29
9 0.32
10 0.32
11 0.35
12 0.32
13 0.32
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.27
18 0.31
19 0.32
20 0.34
21 0.33
22 0.38
23 0.4
24 0.4
25 0.42
26 0.37
27 0.35
28 0.32
29 0.31
30 0.26
31 0.23
32 0.23
33 0.18
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.19
57 0.24
58 0.33
59 0.37
60 0.45
61 0.5
62 0.53
63 0.56
64 0.52
65 0.5
66 0.47
67 0.43
68 0.4
69 0.4
70 0.39
71 0.34
72 0.34
73 0.34
74 0.36
75 0.38
76 0.35
77 0.38
78 0.37
79 0.36
80 0.36
81 0.37
82 0.35
83 0.38
84 0.36
85 0.33
86 0.32
87 0.35
88 0.33
89 0.31
90 0.25
91 0.2
92 0.2
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.09
106 0.11
107 0.12
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.24
113 0.25
114 0.27
115 0.29
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.25
120 0.19
121 0.14
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.15
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.13
139 0.1
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.08
150 0.12
151 0.15
152 0.16
153 0.19
154 0.24
155 0.26
156 0.33
157 0.35
158 0.36
159 0.35
160 0.35
161 0.34
162 0.3
163 0.28
164 0.22
165 0.17
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.2
191 0.22
192 0.27
193 0.26
194 0.24
195 0.22
196 0.19
197 0.17
198 0.15
199 0.13
200 0.07
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.15
211 0.17
212 0.21
213 0.25
214 0.27
215 0.28
216 0.28
217 0.26
218 0.25
219 0.23
220 0.19
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.22
225 0.21
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.15
230 0.12
231 0.1
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.18
240 0.23
241 0.26
242 0.26
243 0.29
244 0.35
245 0.38
246 0.45
247 0.5
248 0.5
249 0.5
250 0.51
251 0.52
252 0.5
253 0.49
254 0.42
255 0.38
256 0.38
257 0.38
258 0.36
259 0.3
260 0.27
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.17
265 0.16
266 0.15
267 0.19
268 0.23
269 0.31
270 0.36
271 0.42
272 0.46
273 0.55
274 0.64
275 0.7
276 0.75
277 0.72
278 0.75
279 0.79
280 0.77
281 0.77
282 0.77
283 0.77
284 0.78
285 0.85
286 0.85
287 0.84
288 0.9
289 0.89
290 0.9
291 0.9
292 0.9
293 0.9
294 0.89
295 0.87
296 0.84
297 0.85
298 0.85
299 0.84
300 0.82
301 0.76
302 0.72
303 0.66
304 0.59
305 0.56
306 0.45