Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GMU4

Protein Details
Accession C1GMU4    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-479LTPPAEQPQKPKKQKLNVMEAHydrophilic
537-565CSARYDERWNGRKNFKKFRRKGHGTVGLHHydrophilic
616-638APKSPTPPLRIGKRPRDTEKSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-458RGK
468-471KPKK
548-558RKNFKKFRRKG
643-652RFRFRRRKER
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000253  FHA_dom  
IPR040227  Nibrin-rel  
IPR032429  Nibrin_BRCT2  
IPR043014  Nibrin_BRCT2_sf  
IPR008984  SMAD_FHA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030870  C:Mre11 complex  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0007095  P:mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling  
KEGG pbn:PADG_08588  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16508  NIBRIN_BRCT_II  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50006  FHA_DOMAIN  
Amino Acid Sequences MAVWNGSRYPESLIQPYVRHAIDNATISRHHLVIEVGHVRPGDGMHVEARSRLLVTDQKTTCGTVVDGESINGSSKELKGDEHLIRIGKYPHPLKIKWHPIVLSFSFPCKAKDPLKHALSSLEDLDVKTIIPYIVDRTTHVVQSKRNTTKGLHALINGKYIVYKSYIQAIVYATTPGDLEREESLCPLEEDYDAAWPDPTQHLPPRGKEPTQSPDTSYQPNPNRINVFDGCTFIFCERTRFEDLQGPITNGHGKALLFEINRGQTTPDDVVAFMKQTAGNKRLGQIDGGGGVGLVQFRKASELDSWDIRIEHQIACKTGQKLIDPSQFLDAILANEASLLFRPHQREELPVSGSNQPLRFPVVDMQAVTQTMRRSRARLFINRFKSFDDGFDMDSIPAYTLEQGDRREETPQAMIPDSASAQPQTDLPLHGEEDAMAELLPGAAAMKLHISRCRKRGKLTPPAEQPQKPKKQKLNVMEAARQRRQAVDEAIMQEQEKDIASFREMTESVDVERMRNLAIIEEMDIPVISWGQNVPSCSARYDERWNGRKNFKKFRRKGHGTVGLHKVQSVIVPLEEAKRKHFSLGETYWTINKSLPTRRYSQSQETPIVQQTFDTAPKSPTPPLRIGKRPRDTEKSDSEDGLRFRFRRRKER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.4
4 0.4
5 0.34
6 0.31
7 0.27
8 0.26
9 0.27
10 0.3
11 0.28
12 0.25
13 0.25
14 0.28
15 0.3
16 0.26
17 0.22
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.22
28 0.2
29 0.16
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.17
41 0.2
42 0.23
43 0.32
44 0.31
45 0.33
46 0.34
47 0.35
48 0.31
49 0.26
50 0.23
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.15
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.26
68 0.27
69 0.28
70 0.31
71 0.29
72 0.29
73 0.32
74 0.32
75 0.29
76 0.35
77 0.35
78 0.39
79 0.45
80 0.46
81 0.5
82 0.56
83 0.63
84 0.59
85 0.6
86 0.53
87 0.5
88 0.55
89 0.49
90 0.44
91 0.35
92 0.34
93 0.33
94 0.32
95 0.32
96 0.28
97 0.33
98 0.35
99 0.42
100 0.46
101 0.52
102 0.55
103 0.54
104 0.51
105 0.48
106 0.43
107 0.37
108 0.31
109 0.23
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.15
114 0.12
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.11
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.21
125 0.23
126 0.26
127 0.29
128 0.29
129 0.32
130 0.39
131 0.48
132 0.49
133 0.5
134 0.49
135 0.47
136 0.52
137 0.53
138 0.49
139 0.41
140 0.38
141 0.4
142 0.39
143 0.39
144 0.3
145 0.23
146 0.19
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.12
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.18
158 0.17
159 0.16
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.2
189 0.28
190 0.32
191 0.35
192 0.42
193 0.45
194 0.45
195 0.44
196 0.45
197 0.44
198 0.46
199 0.44
200 0.39
201 0.38
202 0.4
203 0.41
204 0.38
205 0.4
206 0.4
207 0.48
208 0.47
209 0.46
210 0.45
211 0.41
212 0.44
213 0.36
214 0.34
215 0.25
216 0.25
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.14
221 0.16
222 0.13
223 0.16
224 0.15
225 0.2
226 0.25
227 0.24
228 0.26
229 0.29
230 0.3
231 0.32
232 0.32
233 0.28
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.17
238 0.16
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.14
244 0.11
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.12
264 0.17
265 0.18
266 0.21
267 0.21
268 0.24
269 0.26
270 0.25
271 0.22
272 0.17
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.08
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.2
304 0.19
305 0.2
306 0.2
307 0.19
308 0.21
309 0.26
310 0.28
311 0.25
312 0.25
313 0.24
314 0.22
315 0.21
316 0.18
317 0.12
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.04
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.09
329 0.13
330 0.14
331 0.17
332 0.17
333 0.2
334 0.23
335 0.25
336 0.24
337 0.22
338 0.24
339 0.24
340 0.24
341 0.24
342 0.21
343 0.18
344 0.16
345 0.17
346 0.14
347 0.13
348 0.15
349 0.14
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.19
360 0.2
361 0.22
362 0.24
363 0.32
364 0.36
365 0.43
366 0.49
367 0.52
368 0.6
369 0.6
370 0.58
371 0.52
372 0.49
373 0.4
374 0.33
375 0.29
376 0.21
377 0.19
378 0.18
379 0.17
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.17
400 0.16
401 0.15
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.11
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.02
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.06
434 0.08
435 0.1
436 0.17
437 0.25
438 0.32
439 0.4
440 0.5
441 0.52
442 0.56
443 0.64
444 0.67
445 0.7
446 0.7
447 0.71
448 0.7
449 0.74
450 0.75
451 0.71
452 0.7
453 0.7
454 0.75
455 0.74
456 0.75
457 0.76
458 0.78
459 0.82
460 0.8
461 0.8
462 0.77
463 0.73
464 0.7
465 0.69
466 0.68
467 0.62
468 0.56
469 0.47
470 0.41
471 0.39
472 0.36
473 0.32
474 0.26
475 0.27
476 0.27
477 0.27
478 0.25
479 0.23
480 0.19
481 0.16
482 0.13
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.12
489 0.12
490 0.15
491 0.15
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.17
496 0.2
497 0.2
498 0.16
499 0.17
500 0.16
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.09
519 0.11
520 0.12
521 0.14
522 0.17
523 0.18
524 0.19
525 0.21
526 0.22
527 0.24
528 0.32
529 0.39
530 0.46
531 0.53
532 0.6
533 0.66
534 0.73
535 0.78
536 0.78
537 0.81
538 0.81
539 0.84
540 0.85
541 0.88
542 0.89
543 0.88
544 0.86
545 0.85
546 0.85
547 0.78
548 0.78
549 0.74
550 0.68
551 0.59
552 0.52
553 0.41
554 0.31
555 0.28
556 0.22
557 0.16
558 0.11
559 0.12
560 0.14
561 0.2
562 0.25
563 0.26
564 0.28
565 0.33
566 0.33
567 0.36
568 0.38
569 0.35
570 0.38
571 0.4
572 0.41
573 0.38
574 0.39
575 0.38
576 0.36
577 0.33
578 0.27
579 0.28
580 0.29
581 0.36
582 0.42
583 0.43
584 0.48
585 0.52
586 0.57
587 0.6
588 0.63
589 0.63
590 0.62
591 0.63
592 0.6
593 0.6
594 0.58
595 0.52
596 0.42
597 0.33
598 0.3
599 0.29
600 0.29
601 0.27
602 0.22
603 0.24
604 0.28
605 0.32
606 0.36
607 0.4
608 0.43
609 0.49
610 0.56
611 0.62
612 0.67
613 0.74
614 0.78
615 0.8
616 0.83
617 0.83
618 0.83
619 0.81
620 0.8
621 0.78
622 0.75
623 0.68
624 0.61
625 0.56
626 0.52
627 0.48
628 0.46
629 0.45
630 0.4
631 0.47
632 0.54