Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7N100

Protein Details
Accession A0A1C7N100    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-142VAPPLKTKKLRAPPRKLPVPKREIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-138KTKKLRAPPRKLPVPK
182-192PTRRKDKGKGK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, nucl 12, cyto 9.5, mito_nucl 8.499, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13975  gag-asp_proteas  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MDKISSQKHNNNPVVNCFVKVAPNTLVNAVEVNNVGKRNRNNNSETTQEGVTHNASKRQTRQQFAPPVTLPSPGAATLPVIAPQGTTYMPMSHPIATTSGQPVGPPGGFVVQPQVTPVAPPLKTKKLRAPPRKLPVPKREIDTWEKLDSIMAPISFKDWMVNDKNARKQLKDGLRFLDARNPTRRKDKGKGKEATAGQVNLVEATTSDSDDYSTTETDSTKSTYDDTEDYTSDVYDSDDDTIYDYPYRKEALLQSSPFYVMGTIHDRQVQVVIDSGSAVSVISKSFAKTLGLTGVGERVPITTLDTTKKDQKRGNQKGDCEVTVAVPIRIGGKLRIEHMIMKDDSNRSKGDPIVLLGMTWLKQHVIKIHSKETIIEIPIKNGASSILIQGFLTDHFSDDTPKQVFSVSVQAPVKKNIKYQVELVDIESWAAGMSDEDPSVEVYHTILSSSNGSKDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.59
3 0.5
4 0.42
5 0.37
6 0.35
7 0.32
8 0.3
9 0.26
10 0.28
11 0.28
12 0.28
13 0.26
14 0.21
15 0.21
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.19
22 0.21
23 0.27
24 0.34
25 0.42
26 0.5
27 0.55
28 0.57
29 0.6
30 0.63
31 0.6
32 0.55
33 0.48
34 0.4
35 0.35
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.28
40 0.27
41 0.31
42 0.34
43 0.39
44 0.46
45 0.54
46 0.59
47 0.59
48 0.63
49 0.66
50 0.72
51 0.67
52 0.67
53 0.57
54 0.54
55 0.49
56 0.45
57 0.35
58 0.26
59 0.24
60 0.18
61 0.17
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.15
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.23
108 0.29
109 0.37
110 0.42
111 0.47
112 0.53
113 0.57
114 0.68
115 0.73
116 0.77
117 0.77
118 0.82
119 0.87
120 0.87
121 0.86
122 0.85
123 0.82
124 0.76
125 0.71
126 0.65
127 0.62
128 0.59
129 0.56
130 0.5
131 0.43
132 0.39
133 0.34
134 0.3
135 0.24
136 0.2
137 0.14
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.14
147 0.18
148 0.23
149 0.29
150 0.35
151 0.41
152 0.47
153 0.49
154 0.44
155 0.44
156 0.47
157 0.5
158 0.5
159 0.47
160 0.42
161 0.44
162 0.44
163 0.41
164 0.39
165 0.34
166 0.34
167 0.4
168 0.41
169 0.41
170 0.49
171 0.55
172 0.55
173 0.61
174 0.66
175 0.67
176 0.73
177 0.74
178 0.68
179 0.68
180 0.61
181 0.55
182 0.46
183 0.36
184 0.26
185 0.22
186 0.19
187 0.12
188 0.11
189 0.07
190 0.04
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.11
234 0.12
235 0.1
236 0.12
237 0.16
238 0.2
239 0.24
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.24
244 0.21
245 0.18
246 0.11
247 0.07
248 0.09
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.14
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.12
291 0.16
292 0.19
293 0.22
294 0.31
295 0.36
296 0.41
297 0.44
298 0.51
299 0.59
300 0.66
301 0.74
302 0.7
303 0.68
304 0.68
305 0.67
306 0.58
307 0.48
308 0.38
309 0.27
310 0.25
311 0.23
312 0.15
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.11
319 0.14
320 0.16
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.23
325 0.23
326 0.27
327 0.24
328 0.24
329 0.27
330 0.3
331 0.32
332 0.31
333 0.31
334 0.26
335 0.29
336 0.29
337 0.27
338 0.23
339 0.2
340 0.21
341 0.19
342 0.17
343 0.15
344 0.15
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.13
351 0.18
352 0.22
353 0.3
354 0.35
355 0.4
356 0.42
357 0.41
358 0.4
359 0.39
360 0.37
361 0.32
362 0.34
363 0.28
364 0.27
365 0.3
366 0.29
367 0.24
368 0.2
369 0.18
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.14
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.17
385 0.17
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.2
390 0.2
391 0.2
392 0.18
393 0.26
394 0.21
395 0.27
396 0.3
397 0.35
398 0.37
399 0.44
400 0.48
401 0.43
402 0.48
403 0.49
404 0.52
405 0.5
406 0.52
407 0.51
408 0.5
409 0.47
410 0.44
411 0.37
412 0.3
413 0.27
414 0.22
415 0.15
416 0.1
417 0.09
418 0.06
419 0.05
420 0.06
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.15
436 0.18