Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7NPD2

Protein Details
Accession A0A1C7NPD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-358LDDPKKRKPDISRAKKHLGWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
343-354KKRKPDISRAKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, nucl 10, cyto_pero 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016040  NAD(P)-bd_dom  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR044516  UXS  
Gene Ontology GO:0070403  F:NAD+ binding  
GO:0048040  F:UDP-glucuronate decarboxylase activity  
GO:0042732  P:D-xylose metabolic process  
GO:0033320  P:UDP-D-xylose biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF16363  GDP_Man_Dehyd  
CDD cd05230  UGD_SDR_e  
Amino Acid Sequences MTSPQKEWVSAVGHQNVGSDVELSYLRNLYLPPELNDREVDEQKGLVVYKTVHSFPPVRQLKPSERKRILVTGGAGFVGSHLVDRLMWMGHEVIVLDNFFTGSKRNVEHWVGHPHFELVRHDVVDPFMIEVSQIYHLACPASPPHYQYNPTKTVKTSVMGTINMLGLAKRTKARFLLTSTSEIYGDPEEHPQKETYWGHVNPIGPRACYDEGKRIAETLTYAYMRQNDVDVRVARIFNTFGPRMSPADGRVVSNFIMQAIKGESLTLYGDGEQTRSFQYVHDLVDGLILLMNKNYSEPVNLGNPEEFTIRDFADTIREMVLQPPLSPDNVDIKILPAALDDPKKRKPDISRAKKHLGWEPAFSVKQGLQETVDWFKLQVKEGAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.29
4 0.26
5 0.21
6 0.14
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.2
18 0.22
19 0.23
20 0.3
21 0.32
22 0.33
23 0.33
24 0.34
25 0.34
26 0.34
27 0.33
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.21
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.2
38 0.21
39 0.2
40 0.23
41 0.26
42 0.26
43 0.36
44 0.38
45 0.36
46 0.41
47 0.47
48 0.54
49 0.61
50 0.69
51 0.69
52 0.68
53 0.7
54 0.68
55 0.67
56 0.6
57 0.53
58 0.46
59 0.37
60 0.32
61 0.28
62 0.23
63 0.17
64 0.13
65 0.1
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.08
89 0.09
90 0.13
91 0.15
92 0.18
93 0.23
94 0.26
95 0.29
96 0.32
97 0.4
98 0.38
99 0.38
100 0.36
101 0.32
102 0.3
103 0.28
104 0.26
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.12
129 0.13
130 0.16
131 0.22
132 0.25
133 0.29
134 0.34
135 0.39
136 0.43
137 0.45
138 0.43
139 0.38
140 0.39
141 0.36
142 0.32
143 0.26
144 0.22
145 0.22
146 0.2
147 0.19
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.23
163 0.26
164 0.25
165 0.27
166 0.26
167 0.24
168 0.22
169 0.19
170 0.17
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.22
181 0.22
182 0.2
183 0.25
184 0.25
185 0.25
186 0.27
187 0.28
188 0.23
189 0.28
190 0.25
191 0.18
192 0.19
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.25
198 0.27
199 0.29
200 0.28
201 0.24
202 0.22
203 0.2
204 0.19
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.11
215 0.13
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.19
226 0.17
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.19
233 0.15
234 0.21
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.17
241 0.16
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.15
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.09
284 0.1
285 0.13
286 0.17
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.16
294 0.12
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.16
307 0.21
308 0.17
309 0.16
310 0.19
311 0.19
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.17
323 0.11
324 0.12
325 0.17
326 0.24
327 0.29
328 0.35
329 0.42
330 0.48
331 0.5
332 0.55
333 0.59
334 0.63
335 0.68
336 0.72
337 0.75
338 0.79
339 0.85
340 0.8
341 0.76
342 0.73
343 0.71
344 0.63
345 0.57
346 0.53
347 0.52
348 0.49
349 0.44
350 0.39
351 0.31
352 0.33
353 0.31
354 0.28
355 0.23
356 0.24
357 0.28
358 0.3
359 0.3
360 0.24
361 0.23
362 0.27
363 0.29
364 0.29