FuNGI

C1GBD3

Protein Details

Accession

C1GBD3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-52	MANYLQRERSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSRSPVSG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-47	RSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSR

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 8, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbn:PADG_04934 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MANYLQRERSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSRSPVSGAAGAPGGHSASGYSGRNPSTRSYEDRSFAKEQMMQAVRESSQQDRRVYVGNLSYDVKWHHLKDFMRQAGEVLFADVLLLPNGMSKVGVNVIVEYATREQAQNAVATLSNQNLMGRLVYVREDREAEPRFTGAPSRGDFGGPGRGGYGGGYGSGSGAGGSRQIYVSNLPFSVGWQDLKDLFRQAAQQGAVVRADVHVDPSGRPKGSGIVAFESADDARNAIQQFNGYDWQGRTLEVREDRFAGLGPGFSGRGGFGGVGGRGGYVGGRGSFGGGRGGGFGGGFGGRGGGFGGSYGGGPGGGAADGGASVPPNPFTDFATSGGERSAIIFVRNLPWSTCNEDLVDLFSTIGKVERAEIQYEPNGRSRGTGVVEFDSVENAETAINKFTGYQYGGRPLGLTFVKYLNNGSSDAMEGTEATGGLTQDQIM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.87
3	0.92
4	0.92
5	0.92
6	0.93
7	0.94
8	0.93
9	0.95
10	0.92
11	0.92
12	0.91
13	0.91
14	0.91
15	0.9
16	0.89
17	0.87
18	0.88
19	0.86
20	0.85
21	0.84
22	0.82
23	0.83
24	0.84
25	0.86
26	0.88
27	0.9
28	0.89
29	0.87
30	0.87
31	0.86
32	0.84
33	0.81
34	0.76
35	0.72
36	0.68
37	0.63
38	0.59
39	0.48
40	0.41
41	0.35
42	0.28
43	0.22
44	0.18
45	0.13
46	0.08
47	0.08
48	0.07
49	0.08
50	0.12
51	0.13
52	0.15
53	0.19
54	0.22
55	0.25
56	0.27
57	0.29
58	0.32
59	0.35
60	0.39
61	0.42
62	0.45
63	0.47
64	0.48
65	0.51
66	0.47
67	0.44
68	0.42
69	0.38
70	0.33
71	0.38
72	0.38
73	0.32
74	0.29
75	0.3
76	0.27
77	0.27
78	0.29
79	0.26
80	0.32
81	0.37
82	0.38
83	0.37
84	0.38
85	0.39
86	0.37
87	0.34
88	0.3
89	0.25
90	0.26
91	0.26
92	0.24
93	0.22
94	0.23
95	0.23
96	0.23
97	0.24
98	0.24
99	0.29
100	0.3
101	0.36
102	0.45
103	0.44
104	0.4
105	0.39
106	0.37
107	0.31
108	0.31
109	0.22
110	0.14
111	0.1
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.07
116	0.05
117	0.05
118	0.04
119	0.05
120	0.06
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.07
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.12
139	0.13
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.09
157	0.11
158	0.11
159	0.12
160	0.15
161	0.16
162	0.24
163	0.26
164	0.25
165	0.24
166	0.23
167	0.23
168	0.2
169	0.22
170	0.16
171	0.17
172	0.17
173	0.18
174	0.18
175	0.17
176	0.17
177	0.16
178	0.19
179	0.15
180	0.14
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.11
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.11
218	0.1
219	0.11
220	0.12
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.13
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.07
231	0.08
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.14
238	0.17
239	0.15
240	0.16
241	0.15
242	0.16
243	0.17
244	0.18
245	0.15
246	0.13
247	0.14
248	0.14
249	0.13
250	0.12
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.06
255	0.06
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.12
264	0.1
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.14
272	0.19
273	0.2
274	0.22
275	0.2
276	0.21
277	0.21
278	0.2
279	0.18
280	0.14
281	0.1
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.04
346	0.05
347	0.06
348	0.08
349	0.1
350	0.11
351	0.12
352	0.17
353	0.17
354	0.19
355	0.22
356	0.21
357	0.2
358	0.19
359	0.18
360	0.13
361	0.13
362	0.14
363	0.09
364	0.1
365	0.11
366	0.12
367	0.16
368	0.19
369	0.18
370	0.17
371	0.19
372	0.22
373	0.27
374	0.27
375	0.24
376	0.22
377	0.22
378	0.21
379	0.22
380	0.2
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.09
388	0.08
389	0.09
390	0.15
391	0.17
392	0.19
393	0.2
394	0.23
395	0.28
396	0.32
397	0.32
398	0.32
399	0.32
400	0.3
401	0.3
402	0.28
403	0.27
404	0.27
405	0.27
406	0.23
407	0.24
408	0.24
409	0.24
410	0.22
411	0.18
412	0.15
413	0.13
414	0.1
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.17
425	0.18
426	0.21
427	0.22
428	0.3
429	0.3
430	0.29
431	0.29
432	0.24
433	0.28
434	0.25
435	0.23
436	0.17
437	0.2
438	0.22
439	0.23
440	0.25
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.22
445	0.19
446	0.18
447	0.17
448	0.15
449	0.12
450	0.11
451	0.1
452	0.09
453	0.08
454	0.07
455	0.09
456	0.08
457	0.09

C1GBD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer