FuNGI

A0A1C7NAV1

Protein Details

Accession

A0A1C7NAV1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
495-516	DSPPPPSSPTNQKKRRSDDIVE	Hydrophilic
543-568	TTKDFLYNFRKRIRRNNRNREIITQL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
438-487	KEKKPTPIPPKKKATLLNKAVKKAKKEGLSKPIGRPGSPSIKKEVKPSSP

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSIYNTSRTIKGRNTTARPSPVNRLGRPGVGPQRVLQQHQLQQQQLQQQQQQLQDNSYNEFALFSTAQRGKNHVMDFKSSKRVEPKEFARPIKLHRKETNFVPYRQYIQNLNAQNAAAAAANAQQTDKNPGSQVEDLSANSDAPAQQQQQQQQHGPRTGADISLIAPMGGATHNKKMLFKKRTKQIYMAKEDTRELKEQEHRPWILEDYDGQNSFTGTYEGGQRSDYMFFVLTDHGFQVMPVERWYKFQPKRNVKTLSLEEAEEQIKKQQKRENNRWMMLKRERDATEEDEEGGKGEGAGRAQRRLKLVDTEERRAGSDDENRQDSDIDDLDFDDVFQDDEEDQGEHEVEDEDVKDSKDRVKKEIKDFAITGREQDEEMDEDMIKLTSEGKQMRKLVRDLEKNRAYESDEEEADPYASSAEELETDQEEEESQSEAEKEKKPTPIPPKKKATLLNKAVKKAKKEGLSKPIGRPGSPSIKKEVKPSSPLAPQRPNDSPPPPSSPTNQKKRRSDDIVEAKPRKSEEEDLITEKEVIDTLRGKTMTTKDFLYNFRKRIRRNNRNREIITQLLKKVARSSKGSTDPNTRMLELKPEFQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.66
3	0.71
4	0.72
5	0.71
6	0.7
7	0.69
8	0.69
9	0.71
10	0.64
11	0.64
12	0.59
13	0.56
14	0.53
15	0.52
16	0.52
17	0.48
18	0.48
19	0.42
20	0.48
21	0.49
22	0.49
23	0.48
24	0.47
25	0.49
26	0.55
27	0.6
28	0.53
29	0.53
30	0.55
31	0.57
32	0.54
33	0.54
34	0.51
35	0.51
36	0.53
37	0.56
38	0.58
39	0.51
40	0.49
41	0.48
42	0.45
43	0.42
44	0.38
45	0.31
46	0.23
47	0.22
48	0.18
49	0.16
50	0.15
51	0.12
52	0.2
53	0.24
54	0.29
55	0.31
56	0.36
57	0.37
58	0.43
59	0.47
60	0.44
61	0.42
62	0.45
63	0.49
64	0.5
65	0.55
66	0.49
67	0.51
68	0.54
69	0.59
70	0.58
71	0.61
72	0.61
73	0.62
74	0.69
75	0.67
76	0.66
77	0.62
78	0.64
79	0.66
80	0.68
81	0.67
82	0.67
83	0.71
84	0.67
85	0.7
86	0.72
87	0.67
88	0.61
89	0.59
90	0.53
91	0.5
92	0.5
93	0.46
94	0.39
95	0.36
96	0.41
97	0.38
98	0.37
99	0.33
100	0.29
101	0.26
102	0.22
103	0.19
104	0.11
105	0.08
106	0.07
107	0.08
108	0.09
109	0.09
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.19
117	0.21
118	0.25
119	0.25
120	0.25
121	0.2
122	0.2
123	0.18
124	0.19
125	0.18
126	0.13
127	0.11
128	0.12
129	0.1
130	0.11
131	0.16
132	0.15
133	0.21
134	0.26
135	0.33
136	0.39
137	0.43
138	0.47
139	0.49
140	0.54
141	0.51
142	0.47
143	0.4
144	0.38
145	0.34
146	0.28
147	0.21
148	0.15
149	0.12
150	0.13
151	0.12
152	0.08
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.09
158	0.1
159	0.14
160	0.18
161	0.19
162	0.24
163	0.32
164	0.42
165	0.49
166	0.55
167	0.61
168	0.67
169	0.76
170	0.75
171	0.75
172	0.74
173	0.73
174	0.72
175	0.69
176	0.62
177	0.54
178	0.53
179	0.49
180	0.43
181	0.36
182	0.29
183	0.3
184	0.36
185	0.4
186	0.44
187	0.47
188	0.44
189	0.42
190	0.42
191	0.37
192	0.3
193	0.25
194	0.21
195	0.17
196	0.2
197	0.19
198	0.17
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.13
203	0.1
204	0.06
205	0.07
206	0.11
207	0.12
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.1
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.14
230	0.14
231	0.17
232	0.21
233	0.29
234	0.33
235	0.41
236	0.5
237	0.58
238	0.65
239	0.71
240	0.72
241	0.64
242	0.64
243	0.58
244	0.53
245	0.43
246	0.36
247	0.28
248	0.25
249	0.24
250	0.18
251	0.15
252	0.15
253	0.21
254	0.22
255	0.27
256	0.31
257	0.38
258	0.48
259	0.58
260	0.64
261	0.65
262	0.67
263	0.68
264	0.64
265	0.65
266	0.62
267	0.57
268	0.47
269	0.46
270	0.42
271	0.38
272	0.39
273	0.34
274	0.29
275	0.24
276	0.23
277	0.18
278	0.17
279	0.14
280	0.12
281	0.08
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.09
287	0.1
288	0.15
289	0.18
290	0.2
291	0.22
292	0.23
293	0.24
294	0.25
295	0.27
296	0.31
297	0.33
298	0.34
299	0.34
300	0.32
301	0.31
302	0.28
303	0.26
304	0.21
305	0.23
306	0.24
307	0.26
308	0.27
309	0.27
310	0.26
311	0.25
312	0.22
313	0.17
314	0.12
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.16
345	0.21
346	0.23
347	0.29
348	0.37
349	0.44
350	0.51
351	0.59
352	0.54
353	0.52
354	0.51
355	0.47
356	0.43
357	0.36
358	0.3
359	0.22
360	0.2
361	0.17
362	0.17
363	0.14
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.08
375	0.13
376	0.18
377	0.21
378	0.27
379	0.33
380	0.38
381	0.41
382	0.4
383	0.42
384	0.46
385	0.53
386	0.51
387	0.56
388	0.57
389	0.54
390	0.53
391	0.47
392	0.41
393	0.33
394	0.34
395	0.27
396	0.22
397	0.21
398	0.21
399	0.19
400	0.17
401	0.14
402	0.1
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.1
423	0.16
424	0.2
425	0.25
426	0.29
427	0.35
428	0.38
429	0.46
430	0.55
431	0.61
432	0.66
433	0.7
434	0.75
435	0.73
436	0.77
437	0.77
438	0.75
439	0.75
440	0.75
441	0.74
442	0.71
443	0.74
444	0.75
445	0.71
446	0.66
447	0.64
448	0.61
449	0.6
450	0.62
451	0.64
452	0.65
453	0.7
454	0.69
455	0.66
456	0.67
457	0.6
458	0.53
459	0.48
460	0.46
461	0.47
462	0.48
463	0.45
464	0.45
465	0.52
466	0.54
467	0.58
468	0.59
469	0.55
470	0.55
471	0.56
472	0.55
473	0.55
474	0.61
475	0.61
476	0.61
477	0.57
478	0.59
479	0.6
480	0.57
481	0.56
482	0.53
483	0.5
484	0.46
485	0.51
486	0.48
487	0.47
488	0.49
489	0.53
490	0.58
491	0.64
492	0.69
493	0.71
494	0.76
495	0.81
496	0.85
497	0.82
498	0.77
499	0.76
500	0.77
501	0.77
502	0.78
503	0.74
504	0.66
505	0.61
506	0.57
507	0.51
508	0.46
509	0.42
510	0.38
511	0.41
512	0.44
513	0.44
514	0.44
515	0.41
516	0.36
517	0.3
518	0.24
519	0.17
520	0.13
521	0.13
522	0.15
523	0.16
524	0.22
525	0.22
526	0.22
527	0.27
528	0.34
529	0.35
530	0.34
531	0.35
532	0.34
533	0.39
534	0.46
535	0.49
536	0.51
537	0.54
538	0.6
539	0.66
540	0.68
541	0.75
542	0.79
543	0.81
544	0.84
545	0.88
546	0.89
547	0.91
548	0.88
549	0.82
550	0.78
551	0.74
552	0.72
553	0.66
554	0.58
555	0.56
556	0.53
557	0.49
558	0.5
559	0.5
560	0.48
561	0.47
562	0.51
563	0.53
564	0.6
565	0.65
566	0.62
567	0.65
568	0.63
569	0.64
570	0.61
571	0.53
572	0.47
573	0.43
574	0.46
575	0.4

A0A1C7NAV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer