Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7NR04

Protein Details
Accession A0A1C7NR04    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-49SFSSSNKQGKKQEGGHNQNKSRTNHNHNHNQHHGHSKKWPNNGTNRNHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MSFSSSNKQGKKQEGGHNQNKSRTNHNHNHNQHHGHSKKWPNNGTNRNHASQEWTQDSSAAKQMHDRMLFLLASLTGTVVEVTVKDGSKFKGILHGASTEGDLGIALKLAQKIHDPSAPLEADKTNPNPIKNTLLIFSKDLIEINAADVDLNLADTASSANRNTFKTDTDISGKLDIKERELHKWAPSTEDEENALGLLEEDRSSGGSWDQFAANEKLFGLKTDFDEEIYTTPLDRSAPGYKDREKRAIKMANEIQKSTTDNVHMLEERGMAIDDSGMDEEDLYGAVVRDSNPNKYVPPALRSKKKETPINKLISPDKSTINHLTRRESGEKTTEGGAPKRIEAEIANTFKHFAMMEKDKLHAKKQALQKKEKDGRLAELKAFHQSFKLNVPIPADLVPLLSKGKKPTESETVKVTDKKKIPKKPTTPTSPASDSHRSVEAYPANKVDRRASTDNALTTKSDFNTSTTTVTATTTATTNIADTAATTATTNTTATTNTAATTNTAATTNTAATTNTAATTNTAATTNTSSFKFNVKASSFKPNPTAAVFVPSSNTASNSSHSDTHKHIKKPLGPTEHLTITEAFAPSFLSRDDKASSVGPIWPFGHKSYRVQFSQFVTYEDDIFTGYPSPNYTYGYPQYRYPQYVPGMPQMAAVQQGPYISPQFVQNVPISAPMPPNGAPPPPSVGYSPQMTNVSPHGSPFPQSFPSPQRSPMVPQAMPPQIYQYQGGPMMMRYPPDMMQANGGPHVMMQRPVMVESMQYSPHLQHELPATDSGTDTPPSIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.81
3 0.82
4 0.84
5 0.82
6 0.81
7 0.8
8 0.73
9 0.72
10 0.72
11 0.72
12 0.71
13 0.75
14 0.78
15 0.79
16 0.85
17 0.84
18 0.8
19 0.76
20 0.77
21 0.7
22 0.64
23 0.66
24 0.67
25 0.65
26 0.68
27 0.71
28 0.69
29 0.77
30 0.82
31 0.79
32 0.79
33 0.78
34 0.72
35 0.66
36 0.58
37 0.55
38 0.5
39 0.5
40 0.45
41 0.41
42 0.37
43 0.37
44 0.38
45 0.33
46 0.36
47 0.29
48 0.25
49 0.28
50 0.33
51 0.39
52 0.38
53 0.36
54 0.3
55 0.31
56 0.31
57 0.25
58 0.2
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.08
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.17
74 0.19
75 0.23
76 0.24
77 0.22
78 0.27
79 0.28
80 0.29
81 0.27
82 0.27
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.14
87 0.12
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.08
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.16
99 0.2
100 0.24
101 0.26
102 0.25
103 0.25
104 0.31
105 0.3
106 0.26
107 0.25
108 0.22
109 0.22
110 0.26
111 0.27
112 0.3
113 0.33
114 0.35
115 0.36
116 0.38
117 0.41
118 0.38
119 0.37
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.29
124 0.27
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.17
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.09
147 0.13
148 0.17
149 0.19
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.27
154 0.29
155 0.29
156 0.3
157 0.3
158 0.28
159 0.32
160 0.33
161 0.29
162 0.34
163 0.31
164 0.29
165 0.34
166 0.35
167 0.36
168 0.38
169 0.4
170 0.37
171 0.42
172 0.39
173 0.37
174 0.36
175 0.35
176 0.31
177 0.3
178 0.27
179 0.22
180 0.21
181 0.16
182 0.14
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.14
210 0.17
211 0.17
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.13
224 0.17
225 0.2
226 0.25
227 0.3
228 0.37
229 0.45
230 0.49
231 0.55
232 0.52
233 0.53
234 0.57
235 0.59
236 0.52
237 0.53
238 0.55
239 0.54
240 0.52
241 0.49
242 0.4
243 0.35
244 0.36
245 0.29
246 0.24
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.12
277 0.14
278 0.17
279 0.19
280 0.2
281 0.2
282 0.21
283 0.26
284 0.22
285 0.25
286 0.31
287 0.38
288 0.46
289 0.51
290 0.57
291 0.59
292 0.64
293 0.69
294 0.65
295 0.67
296 0.67
297 0.66
298 0.59
299 0.56
300 0.53
301 0.48
302 0.45
303 0.37
304 0.32
305 0.29
306 0.31
307 0.34
308 0.35
309 0.37
310 0.36
311 0.38
312 0.38
313 0.42
314 0.42
315 0.36
316 0.33
317 0.31
318 0.3
319 0.27
320 0.26
321 0.23
322 0.21
323 0.21
324 0.23
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.17
329 0.15
330 0.13
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.18
336 0.19
337 0.18
338 0.19
339 0.14
340 0.09
341 0.13
342 0.17
343 0.21
344 0.2
345 0.22
346 0.27
347 0.28
348 0.3
349 0.3
350 0.28
351 0.31
352 0.39
353 0.45
354 0.47
355 0.53
356 0.56
357 0.6
358 0.66
359 0.62
360 0.58
361 0.52
362 0.49
363 0.47
364 0.44
365 0.34
366 0.29
367 0.27
368 0.27
369 0.27
370 0.22
371 0.17
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.19
376 0.15
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.13
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.13
391 0.16
392 0.2
393 0.22
394 0.26
395 0.34
396 0.36
397 0.36
398 0.36
399 0.35
400 0.34
401 0.37
402 0.35
403 0.33
404 0.35
405 0.43
406 0.49
407 0.55
408 0.61
409 0.66
410 0.73
411 0.75
412 0.78
413 0.77
414 0.74
415 0.67
416 0.63
417 0.56
418 0.49
419 0.46
420 0.43
421 0.36
422 0.32
423 0.31
424 0.26
425 0.23
426 0.27
427 0.24
428 0.21
429 0.21
430 0.21
431 0.22
432 0.23
433 0.25
434 0.24
435 0.23
436 0.28
437 0.3
438 0.3
439 0.31
440 0.31
441 0.31
442 0.28
443 0.26
444 0.2
445 0.18
446 0.18
447 0.15
448 0.16
449 0.14
450 0.15
451 0.17
452 0.17
453 0.17
454 0.15
455 0.15
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.11
513 0.12
514 0.14
515 0.14
516 0.15
517 0.16
518 0.2
519 0.21
520 0.2
521 0.26
522 0.25
523 0.29
524 0.3
525 0.4
526 0.38
527 0.38
528 0.4
529 0.35
530 0.34
531 0.31
532 0.31
533 0.21
534 0.23
535 0.21
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.17
540 0.14
541 0.15
542 0.14
543 0.14
544 0.16
545 0.19
546 0.2
547 0.23
548 0.25
549 0.27
550 0.29
551 0.38
552 0.43
553 0.44
554 0.47
555 0.5
556 0.55
557 0.6
558 0.64
559 0.61
560 0.56
561 0.56
562 0.55
563 0.5
564 0.43
565 0.36
566 0.28
567 0.21
568 0.21
569 0.18
570 0.12
571 0.1
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.15
579 0.16
580 0.16
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.16
585 0.19
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.2
591 0.22
592 0.27
593 0.27
594 0.33
595 0.37
596 0.43
597 0.42
598 0.43
599 0.45
600 0.41
601 0.46
602 0.4
603 0.35
604 0.32
605 0.31
606 0.29
607 0.25
608 0.21
609 0.14
610 0.14
611 0.12
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.11
616 0.14
617 0.15
618 0.18
619 0.19
620 0.22
621 0.29
622 0.34
623 0.34
624 0.35
625 0.41
626 0.44
627 0.47
628 0.44
629 0.44
630 0.4
631 0.44
632 0.43
633 0.41
634 0.38
635 0.33
636 0.32
637 0.26
638 0.23
639 0.2
640 0.17
641 0.12
642 0.1
643 0.1
644 0.1
645 0.11
646 0.12
647 0.11
648 0.12
649 0.14
650 0.17
651 0.17
652 0.2
653 0.19
654 0.19
655 0.19
656 0.21
657 0.19
658 0.18
659 0.19
660 0.17
661 0.19
662 0.18
663 0.21
664 0.21
665 0.24
666 0.23
667 0.24
668 0.28
669 0.26
670 0.27
671 0.26
672 0.27
673 0.28
674 0.29
675 0.28
676 0.27
677 0.28
678 0.26
679 0.27
680 0.26
681 0.26
682 0.23
683 0.23
684 0.23
685 0.22
686 0.25
687 0.25
688 0.27
689 0.26
690 0.28
691 0.33
692 0.36
693 0.43
694 0.43
695 0.45
696 0.46
697 0.45
698 0.49
699 0.51
700 0.52
701 0.44
702 0.44
703 0.48
704 0.49
705 0.47
706 0.42
707 0.39
708 0.34
709 0.35
710 0.33
711 0.26
712 0.25
713 0.25
714 0.25
715 0.2
716 0.18
717 0.2
718 0.2
719 0.2
720 0.17
721 0.18
722 0.19
723 0.23
724 0.25
725 0.21
726 0.25
727 0.26
728 0.27
729 0.25
730 0.24
731 0.18
732 0.17
733 0.21
734 0.18
735 0.17
736 0.17
737 0.19
738 0.2
739 0.21
740 0.21
741 0.17
742 0.16
743 0.17
744 0.19
745 0.17
746 0.17
747 0.18
748 0.18
749 0.22
750 0.25
751 0.22
752 0.23
753 0.28
754 0.3
755 0.3
756 0.31
757 0.27
758 0.24
759 0.25
760 0.23
761 0.19
762 0.18