Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7NSC3

Protein Details
Accession A0A1C7NSC3    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-140VQLAKPREPKQERAEKKKKKNNKKSRKSSESKAKEVBasic
283-314TEEEKNSKPVKKRSHRRRKPSNKKKLKEGAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-154KPREPKQERAEKKKKKNNKKSRKSSESKAKEVEENKEKSNEDKKEE
287-310KNSKPVKKRSHRRRKPSNKKKLKE
353-439AKEAKKAVKELKKEDGVEAAKEAKEAVKELKKEDGAKAAKEAKEAVKELKKEDGVEAAKEAKEAVKELKKEDGAKAAASANKEAEKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR041909  Sbi_C3_db_domIV  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSASTTPTEEKKVVASPSTEEESHKVFVGNLSYSTTTETLKGFFESAEKDKTRFSMTNYSVDTIVVKQKSRSKGYGFVAFATLPEAEKAIKILDKKELDGREISVQLAKPREPKQERAEKKKKKNNKKSRKSSESKAKEVEENKEKSNEDKKEEKKDATRDEKLPVDPVSSVEISKENITEEPKPKTTVFVANLPRNYKVKQLTELFKDYEVESALVAIKRNGASKCYGFVELKTVEEMKRVLTEFVDIEVGDRVIHVSAATSEKNTTRRSRKPSSPAATSETEEEKNSKPVKKRSHRRRKPSNKKKLKEGAEAANEAQQAVKELKKQDGVEAAREAQDAVKELKKEDGVEAAKEAKKAVKELKKEDGVEAAKEAKEAVKELKKEDGAKAAKEAKEAVKELKKEDGVEAAKEAKEAVKELKKEDGAKAAASANKEAEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.28
4 0.33
5 0.36
6 0.33
7 0.31
8 0.31
9 0.31
10 0.3
11 0.28
12 0.23
13 0.19
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.18
18 0.2
19 0.2
20 0.2
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.17
27 0.17
28 0.18
29 0.15
30 0.14
31 0.16
32 0.19
33 0.23
34 0.3
35 0.3
36 0.3
37 0.32
38 0.34
39 0.38
40 0.35
41 0.37
42 0.39
43 0.4
44 0.46
45 0.46
46 0.45
47 0.38
48 0.36
49 0.31
50 0.24
51 0.28
52 0.25
53 0.24
54 0.29
55 0.36
56 0.44
57 0.49
58 0.52
59 0.49
60 0.53
61 0.56
62 0.58
63 0.52
64 0.45
65 0.4
66 0.34
67 0.29
68 0.23
69 0.18
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.14
79 0.17
80 0.24
81 0.25
82 0.27
83 0.34
84 0.33
85 0.33
86 0.32
87 0.32
88 0.27
89 0.26
90 0.25
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.26
95 0.26
96 0.3
97 0.35
98 0.45
99 0.47
100 0.53
101 0.58
102 0.65
103 0.72
104 0.76
105 0.81
106 0.81
107 0.87
108 0.9
109 0.91
110 0.92
111 0.94
112 0.94
113 0.94
114 0.95
115 0.95
116 0.95
117 0.95
118 0.9
119 0.89
120 0.89
121 0.85
122 0.8
123 0.73
124 0.64
125 0.6
126 0.57
127 0.56
128 0.53
129 0.49
130 0.45
131 0.44
132 0.43
133 0.43
134 0.48
135 0.44
136 0.42
137 0.48
138 0.52
139 0.58
140 0.62
141 0.61
142 0.59
143 0.61
144 0.65
145 0.63
146 0.62
147 0.55
148 0.54
149 0.52
150 0.46
151 0.41
152 0.32
153 0.25
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.18
168 0.22
169 0.25
170 0.26
171 0.29
172 0.28
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.29
178 0.34
179 0.36
180 0.39
181 0.38
182 0.39
183 0.35
184 0.34
185 0.32
186 0.31
187 0.29
188 0.31
189 0.35
190 0.36
191 0.38
192 0.4
193 0.35
194 0.3
195 0.28
196 0.23
197 0.19
198 0.15
199 0.11
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.15
217 0.15
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.13
252 0.19
253 0.23
254 0.3
255 0.37
256 0.46
257 0.54
258 0.6
259 0.65
260 0.68
261 0.74
262 0.71
263 0.67
264 0.61
265 0.57
266 0.51
267 0.44
268 0.39
269 0.32
270 0.27
271 0.23
272 0.23
273 0.2
274 0.25
275 0.3
276 0.33
277 0.38
278 0.46
279 0.56
280 0.64
281 0.74
282 0.78
283 0.84
284 0.89
285 0.92
286 0.94
287 0.95
288 0.95
289 0.96
290 0.95
291 0.95
292 0.9
293 0.9
294 0.88
295 0.83
296 0.8
297 0.74
298 0.7
299 0.63
300 0.59
301 0.49
302 0.42
303 0.35
304 0.27
305 0.22
306 0.14
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.16
311 0.19
312 0.23
313 0.28
314 0.28
315 0.29
316 0.34
317 0.34
318 0.32
319 0.32
320 0.29
321 0.25
322 0.25
323 0.22
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.22
332 0.22
333 0.23
334 0.21
335 0.25
336 0.23
337 0.23
338 0.25
339 0.28
340 0.28
341 0.27
342 0.28
343 0.24
344 0.24
345 0.28
346 0.36
347 0.37
348 0.43
349 0.49
350 0.56
351 0.59
352 0.58
353 0.54
354 0.52
355 0.45
356 0.38
357 0.34
358 0.29
359 0.23
360 0.22
361 0.22
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.24
366 0.27
367 0.3
368 0.32
369 0.39
370 0.41
371 0.43
372 0.44
373 0.45
374 0.42
375 0.41
376 0.45
377 0.45
378 0.42
379 0.41
380 0.42
381 0.37
382 0.39
383 0.4
384 0.42
385 0.41
386 0.43
387 0.44
388 0.47
389 0.44
390 0.39
391 0.38
392 0.37
393 0.32
394 0.3
395 0.29
396 0.25
397 0.23
398 0.22
399 0.22
400 0.16
401 0.16
402 0.17
403 0.24
404 0.27
405 0.3
406 0.32
407 0.39
408 0.41
409 0.43
410 0.44
411 0.43
412 0.38
413 0.36
414 0.36
415 0.33
416 0.32
417 0.31
418 0.31
419 0.27