Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163JMS9

Protein Details
Accession A0A163JMS9    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-153QQEQPATKPKQKKRRARKNKAAQQAGSHydrophilic
177-201ATDSTPKTKKAPRRPKKELTEPSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-146KPKQKKRRARKNK
183-193KTKKAPRRPKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSTDPKPTPAEQAPAQAPIQADTATPEEVGHKVFVGNLSFKTKEEGLVSFFEASGKVLEAKIITVRPHYRKRSAGYGFVTFATLEETTKAANDLNKKELDGREINVEVARPKPVVVKAPEQEQQEQQQEQPATKPKQKKRRARKNKAAQQAGSETAEDVKKTMTPRTTDDSEEEGSATDSTPKTKKAPRRPKKELTEPSATSLFVGNLPYVSTDDTLKDLFKDLKVVSAHIARMRNGRSKGYGFVDLESHEEQTKALETIKDVQVEGRTLYLSVALAEAPQPEQADDASN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.33
4 0.29
5 0.24
6 0.23
7 0.17
8 0.15
9 0.14
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.26
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.23
33 0.2
34 0.21
35 0.22
36 0.18
37 0.17
38 0.15
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.45
55 0.51
56 0.55
57 0.59
58 0.62
59 0.65
60 0.61
61 0.59
62 0.53
63 0.48
64 0.43
65 0.37
66 0.33
67 0.23
68 0.19
69 0.15
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.12
79 0.18
80 0.2
81 0.24
82 0.24
83 0.25
84 0.29
85 0.28
86 0.3
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.23
92 0.18
93 0.18
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.15
101 0.2
102 0.22
103 0.27
104 0.27
105 0.32
106 0.36
107 0.35
108 0.35
109 0.32
110 0.33
111 0.31
112 0.3
113 0.26
114 0.27
115 0.25
116 0.23
117 0.24
118 0.28
119 0.29
120 0.35
121 0.44
122 0.47
123 0.58
124 0.67
125 0.74
126 0.77
127 0.84
128 0.89
129 0.9
130 0.92
131 0.93
132 0.92
133 0.91
134 0.84
135 0.73
136 0.64
137 0.55
138 0.46
139 0.35
140 0.26
141 0.17
142 0.14
143 0.14
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.09
148 0.11
149 0.15
150 0.16
151 0.18
152 0.22
153 0.27
154 0.29
155 0.28
156 0.29
157 0.28
158 0.25
159 0.23
160 0.2
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.14
169 0.17
170 0.22
171 0.29
172 0.39
173 0.47
174 0.58
175 0.65
176 0.74
177 0.81
178 0.85
179 0.87
180 0.88
181 0.85
182 0.8
183 0.78
184 0.68
185 0.62
186 0.53
187 0.44
188 0.34
189 0.26
190 0.2
191 0.12
192 0.12
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.18
210 0.16
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.23
216 0.25
217 0.26
218 0.28
219 0.25
220 0.31
221 0.35
222 0.39
223 0.4
224 0.41
225 0.41
226 0.4
227 0.43
228 0.41
229 0.41
230 0.34
231 0.32
232 0.3
233 0.26
234 0.28
235 0.24
236 0.22
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.15
246 0.22
247 0.25
248 0.25
249 0.23
250 0.25
251 0.25
252 0.26
253 0.24
254 0.18
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13