Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GKU4

Protein Details
Accession C1GKU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84EFIVGFGERWRKKKKKEEKMKSGAGAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-100RWRKKKKKEEKMKSGAGAGEGENGGGAGKMRKPPP
377-382GKGRGR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbn:PADG_07951  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSTLDPALKSWALPRLSALLLLDDDSLTQLLEYTCSLDHDQGAEHLRNILGDSAKALEFIVGFGERWRKKKKKEEKMKSGAGAGEGENGGGAGKMRKPPPSAAGPLISEFMPNVRSKPAKASSAAKRQQQQYLATSSPSRNRSRKSPSGSGSATPTSTDNIADLSAAIAQLELTTNPTLSSSSNSTHSKPRKCNCLATLHPLFTPAPNCLNCGKIICSLEGLQPCSFCQQPLLTPEQVQGMIHELRAERGSEKMRAHNRGYQRHGGRNEELLLPSSADGNGNAGGVVSGLDAAKAHRDKLLQFQAQNARRTKVVDEVAEFETPDVHGQSTLWMTPGQRALALKRQQKVLREMEEKGKEEWERQGRRIVVSLSLEGKGKGRGRGFIRRVERWEEAEKDVEGQGGGDVEGDADEEVEVGGAGEEMKGAFGNNPLLVDGGLVRPIWKPKGKGTADRNGDGNADEGGVGRRGREQRQMWRRVQDDEGDNERWILDGNMYGYGNGSREGSMEVEGDGTDCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.26
4 0.26
5 0.22
6 0.17
7 0.16
8 0.17
9 0.15
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.13
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.23
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.22
52 0.27
53 0.35
54 0.46
55 0.53
56 0.63
57 0.74
58 0.81
59 0.82
60 0.89
61 0.92
62 0.92
63 0.92
64 0.9
65 0.81
66 0.73
67 0.62
68 0.52
69 0.42
70 0.31
71 0.24
72 0.17
73 0.14
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.12
81 0.18
82 0.22
83 0.28
84 0.31
85 0.34
86 0.39
87 0.42
88 0.43
89 0.4
90 0.39
91 0.35
92 0.33
93 0.31
94 0.25
95 0.18
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.18
102 0.21
103 0.22
104 0.3
105 0.34
106 0.34
107 0.37
108 0.44
109 0.47
110 0.55
111 0.6
112 0.58
113 0.6
114 0.61
115 0.63
116 0.6
117 0.54
118 0.47
119 0.46
120 0.4
121 0.35
122 0.35
123 0.33
124 0.35
125 0.38
126 0.43
127 0.45
128 0.49
129 0.56
130 0.61
131 0.66
132 0.67
133 0.68
134 0.63
135 0.63
136 0.61
137 0.54
138 0.48
139 0.41
140 0.33
141 0.25
142 0.23
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.18
171 0.21
172 0.23
173 0.32
174 0.4
175 0.46
176 0.52
177 0.56
178 0.61
179 0.62
180 0.66
181 0.6
182 0.61
183 0.55
184 0.54
185 0.51
186 0.42
187 0.38
188 0.34
189 0.3
190 0.23
191 0.22
192 0.16
193 0.18
194 0.17
195 0.19
196 0.18
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.12
218 0.15
219 0.19
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.08
236 0.11
237 0.14
238 0.17
239 0.19
240 0.26
241 0.31
242 0.36
243 0.38
244 0.4
245 0.45
246 0.48
247 0.51
248 0.51
249 0.49
250 0.51
251 0.51
252 0.49
253 0.43
254 0.37
255 0.34
256 0.28
257 0.24
258 0.18
259 0.16
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.23
287 0.31
288 0.29
289 0.29
290 0.34
291 0.41
292 0.46
293 0.51
294 0.46
295 0.39
296 0.37
297 0.38
298 0.33
299 0.3
300 0.27
301 0.22
302 0.21
303 0.23
304 0.24
305 0.22
306 0.21
307 0.15
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.17
327 0.24
328 0.32
329 0.35
330 0.36
331 0.43
332 0.45
333 0.49
334 0.53
335 0.51
336 0.51
337 0.48
338 0.48
339 0.5
340 0.52
341 0.49
342 0.42
343 0.4
344 0.34
345 0.33
346 0.38
347 0.39
348 0.39
349 0.39
350 0.44
351 0.41
352 0.42
353 0.42
354 0.34
355 0.28
356 0.25
357 0.25
358 0.21
359 0.2
360 0.2
361 0.17
362 0.18
363 0.2
364 0.22
365 0.26
366 0.25
367 0.31
368 0.36
369 0.46
370 0.48
371 0.51
372 0.55
373 0.54
374 0.57
375 0.57
376 0.54
377 0.49
378 0.51
379 0.45
380 0.41
381 0.38
382 0.33
383 0.29
384 0.26
385 0.21
386 0.15
387 0.11
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.12
428 0.18
429 0.25
430 0.3
431 0.33
432 0.39
433 0.49
434 0.54
435 0.6
436 0.62
437 0.65
438 0.65
439 0.64
440 0.58
441 0.49
442 0.44
443 0.35
444 0.28
445 0.19
446 0.13
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.2
454 0.26
455 0.31
456 0.4
457 0.45
458 0.53
459 0.63
460 0.72
461 0.72
462 0.74
463 0.72
464 0.68
465 0.64
466 0.6
467 0.55
468 0.52
469 0.51
470 0.44
471 0.42
472 0.37
473 0.33
474 0.26
475 0.22
476 0.15
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.14
481 0.15
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.11
489 0.12
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.11