Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GKA4

Protein Details
Accession C1GKA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-53LLSASKRRSSNPRTPRPQPKSLKATEGVNQSTKSEPPPKKRRYIPGGPGGGHydrophilic
99-125AQPTTPPASTRPRRQKNQSRRFSSAAAHydrophilic
369-390ALEKRIPKPNPKPPQTQRPRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-18PR
38-44PPPKKRR
877-878RK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019542  Enhancer_polycomb-like_N  
IPR034732  EPHD  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_07690  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10513  EPL1  
PF13831  PHD_2  
PF13832  zf-HC5HC2H_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51805  EPHD  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15670  ePHD_BRPF  
cd15492  PHD_BRPF_JADE_like  
Amino Acid Sequences MALLSASKRRSSNPRTPRPQPKSLKATEGVNQSTKSEPPPKKRRYIPGGPGGGGRYVEVDGTATPARTITDAVSPNHTAPRVRSVREPSNNNNIMRRAAQPTTPPASTRPRRQKNQSRRFSSAAAAALAVAQGDGYKPREERGWEEFHPDLDIDAKIAVFSSDEVDGIKPSSTLPNGTTTNGTDESWNNSTLKPLTNGSTPVKRRPGRPRLSESLLIDLGTPTALKIVPPPGPNPRERLTLPKPSFVLKDPFLPFERKGVGQQNYVDRTMASVGYQESDIFLRHERRLIRMAEGAAEGDLDLSPQPVVDGDVNAALGNIGVGRVEYDMDEQDAKWLETYNAQRREEQFEPIKPAVFEITMTKIEKEWHALEKRIPKPNPKPPQTQRPRSSSAAAVNGEHASSGEEQDSKCAVCDDGDCENSNAIVFCDGCDLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRKCQLIGRGSPSCIFCPNTEGAFKQTNTSKWSHLLCAVWIPEVSIGNLSLMEPVNEVEKVPRNRWKLTCYICRQKMGACIQCSNKNCFVAFHVTCARRARLYLKMKLIPGAPAVMESNGLKAFCDKHVPPDWRREHNTDAATAEALEYYRNTMQGRRWGDSQAAALALGPESQAGMDPAEDDNRAINQRITLTVGGNKRKRATAPKTIWKLPSGAPVIPQIVLNNVIASLQRFTVRQRKQYAEDACKYWTLKRESRRGAALLKRLQLQLETFSSMEMTRRNFAGMGVAGAVRLQRRIGFADKLYLDLDRVRMLCDEVKKREREKLKDAEILRSIIDLVYFPIPPMLWPILDKAFALDGKGIFRRGLLSIRSKLVQRVYTSVSSFSRDLANVFTSEIGVESVGDTAELQMQISGRAPELSLEQREKRKLAKRIIKAIQPALEDSLKKESELNGKPFEKELKDLDVLLESSVLSRRASLVASSGEATHDLGGPVQRPLVNGIKNDVEDDRKEVSEVDATLLVQQLATIDNAEHTNGDNDITMVDVNGEMDDGHHDTKEASVSKSSVTPAADLTANSPSTPSMEGQARHEHSAPPSHEIQMANLASPSDTQESKNLPPLSQGGIQWYMQPFDPVRDHYIRGEMDWSGDLRERRKAPHEMPEADFRLRSGKSPSNLFRTTLMGWWRLEQKRFWRGPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.77
3 0.85
4 0.9
5 0.87
6 0.89
7 0.88
8 0.87
9 0.86
10 0.81
11 0.78
12 0.7
13 0.66
14 0.62
15 0.6
16 0.55
17 0.5
18 0.46
19 0.41
20 0.41
21 0.38
22 0.4
23 0.42
24 0.47
25 0.53
26 0.63
27 0.7
28 0.77
29 0.83
30 0.86
31 0.85
32 0.86
33 0.85
34 0.84
35 0.8
36 0.71
37 0.64
38 0.55
39 0.48
40 0.37
41 0.28
42 0.19
43 0.15
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.12
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.12
57 0.17
58 0.21
59 0.23
60 0.28
61 0.3
62 0.31
63 0.35
64 0.35
65 0.31
66 0.3
67 0.38
68 0.39
69 0.4
70 0.46
71 0.5
72 0.58
73 0.65
74 0.69
75 0.66
76 0.7
77 0.74
78 0.69
79 0.66
80 0.58
81 0.53
82 0.48
83 0.46
84 0.41
85 0.37
86 0.37
87 0.37
88 0.41
89 0.43
90 0.42
91 0.39
92 0.38
93 0.47
94 0.52
95 0.58
96 0.62
97 0.67
98 0.75
99 0.85
100 0.9
101 0.91
102 0.93
103 0.93
104 0.9
105 0.86
106 0.8
107 0.72
108 0.64
109 0.57
110 0.47
111 0.37
112 0.28
113 0.21
114 0.17
115 0.14
116 0.11
117 0.06
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.08
122 0.11
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.23
127 0.27
128 0.32
129 0.35
130 0.4
131 0.37
132 0.42
133 0.41
134 0.37
135 0.35
136 0.29
137 0.22
138 0.18
139 0.16
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.1
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.22
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.23
170 0.2
171 0.2
172 0.25
173 0.25
174 0.26
175 0.22
176 0.21
177 0.24
178 0.24
179 0.26
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.3
185 0.32
186 0.39
187 0.41
188 0.46
189 0.54
190 0.56
191 0.62
192 0.68
193 0.73
194 0.74
195 0.78
196 0.78
197 0.75
198 0.77
199 0.73
200 0.63
201 0.57
202 0.48
203 0.39
204 0.31
205 0.24
206 0.17
207 0.12
208 0.1
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.14
215 0.19
216 0.21
217 0.26
218 0.34
219 0.39
220 0.42
221 0.45
222 0.43
223 0.44
224 0.43
225 0.49
226 0.46
227 0.52
228 0.51
229 0.5
230 0.48
231 0.46
232 0.47
233 0.41
234 0.41
235 0.31
236 0.37
237 0.34
238 0.37
239 0.36
240 0.38
241 0.34
242 0.33
243 0.34
244 0.28
245 0.31
246 0.36
247 0.36
248 0.36
249 0.39
250 0.42
251 0.42
252 0.42
253 0.36
254 0.27
255 0.25
256 0.23
257 0.19
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.14
269 0.18
270 0.19
271 0.24
272 0.25
273 0.29
274 0.34
275 0.34
276 0.32
277 0.3
278 0.29
279 0.25
280 0.24
281 0.2
282 0.14
283 0.12
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.05
293 0.04
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.16
325 0.25
326 0.31
327 0.38
328 0.39
329 0.43
330 0.45
331 0.52
332 0.47
333 0.46
334 0.42
335 0.37
336 0.43
337 0.39
338 0.38
339 0.3
340 0.29
341 0.24
342 0.18
343 0.16
344 0.11
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.19
354 0.24
355 0.27
356 0.29
357 0.33
358 0.41
359 0.48
360 0.53
361 0.54
362 0.56
363 0.63
364 0.71
365 0.76
366 0.73
367 0.76
368 0.74
369 0.82
370 0.82
371 0.83
372 0.79
373 0.76
374 0.75
375 0.67
376 0.62
377 0.54
378 0.47
379 0.42
380 0.36
381 0.29
382 0.25
383 0.22
384 0.19
385 0.15
386 0.12
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.1
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.09
428 0.07
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.13
433 0.12
434 0.14
435 0.21
436 0.22
437 0.24
438 0.27
439 0.28
440 0.26
441 0.3
442 0.33
443 0.33
444 0.36
445 0.4
446 0.37
447 0.37
448 0.38
449 0.34
450 0.29
451 0.26
452 0.23
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.21
461 0.2
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.26
466 0.28
467 0.25
468 0.25
469 0.26
470 0.24
471 0.23
472 0.21
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.13
477 0.11
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.16
497 0.18
498 0.23
499 0.3
500 0.34
501 0.39
502 0.42
503 0.42
504 0.43
505 0.47
506 0.51
507 0.52
508 0.57
509 0.55
510 0.54
511 0.52
512 0.46
513 0.46
514 0.44
515 0.41
516 0.33
517 0.34
518 0.35
519 0.41
520 0.41
521 0.39
522 0.35
523 0.31
524 0.29
525 0.26
526 0.25
527 0.26
528 0.23
529 0.22
530 0.26
531 0.25
532 0.29
533 0.31
534 0.29
535 0.22
536 0.24
537 0.24
538 0.27
539 0.33
540 0.35
541 0.37
542 0.39
543 0.39
544 0.39
545 0.36
546 0.27
547 0.21
548 0.16
549 0.11
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.13
563 0.12
564 0.18
565 0.25
566 0.31
567 0.33
568 0.42
569 0.46
570 0.48
571 0.53
572 0.51
573 0.47
574 0.47
575 0.45
576 0.36
577 0.3
578 0.24
579 0.19
580 0.15
581 0.11
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.06
587 0.06
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.14
592 0.22
593 0.25
594 0.25
595 0.26
596 0.26
597 0.26
598 0.24
599 0.22
600 0.14
601 0.11
602 0.09
603 0.07
604 0.06
605 0.05
606 0.04
607 0.04
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.1
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.15
632 0.21
633 0.28
634 0.31
635 0.33
636 0.33
637 0.35
638 0.38
639 0.43
640 0.44
641 0.46
642 0.51
643 0.57
644 0.6
645 0.63
646 0.6
647 0.51
648 0.46
649 0.37
650 0.36
651 0.29
652 0.24
653 0.21
654 0.21
655 0.21
656 0.19
657 0.18
658 0.11
659 0.09
660 0.1
661 0.09
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.13
672 0.22
673 0.27
674 0.34
675 0.39
676 0.43
677 0.46
678 0.54
679 0.57
680 0.55
681 0.53
682 0.47
683 0.43
684 0.41
685 0.38
686 0.33
687 0.32
688 0.31
689 0.35
690 0.4
691 0.49
692 0.51
693 0.54
694 0.53
695 0.49
696 0.48
697 0.48
698 0.48
699 0.43
700 0.4
701 0.4
702 0.37
703 0.35
704 0.29
705 0.24
706 0.2
707 0.17
708 0.16
709 0.13
710 0.12
711 0.13
712 0.12
713 0.13
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.14
722 0.11
723 0.09
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.1
734 0.13
735 0.17
736 0.18
737 0.18
738 0.23
739 0.22
740 0.22
741 0.21
742 0.18
743 0.16
744 0.14
745 0.15
746 0.12
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.13
751 0.16
752 0.22
753 0.28
754 0.34
755 0.41
756 0.46
757 0.49
758 0.55
759 0.6
760 0.61
761 0.62
762 0.62
763 0.61
764 0.62
765 0.6
766 0.57
767 0.5
768 0.44
769 0.35
770 0.27
771 0.21
772 0.14
773 0.13
774 0.08
775 0.07
776 0.08
777 0.08
778 0.07
779 0.08
780 0.08
781 0.08
782 0.11
783 0.11
784 0.1
785 0.1
786 0.13
787 0.14
788 0.14
789 0.14
790 0.11
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.11
795 0.1
796 0.13
797 0.15
798 0.15
799 0.13
800 0.13
801 0.14
802 0.14
803 0.17
804 0.19
805 0.24
806 0.26
807 0.28
808 0.3
809 0.3
810 0.32
811 0.33
812 0.33
813 0.28
814 0.29
815 0.31
816 0.32
817 0.31
818 0.3
819 0.26
820 0.26
821 0.24
822 0.21
823 0.19
824 0.17
825 0.17
826 0.15
827 0.15
828 0.12
829 0.12
830 0.11
831 0.09
832 0.09
833 0.09
834 0.07
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.04
840 0.04
841 0.04
842 0.04
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.07
847 0.07
848 0.08
849 0.1
850 0.1
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.12
856 0.16
857 0.19
858 0.25
859 0.3
860 0.37
861 0.42
862 0.44
863 0.49
864 0.54
865 0.58
866 0.63
867 0.67
868 0.67
869 0.73
870 0.76
871 0.73
872 0.69
873 0.64
874 0.57
875 0.49
876 0.42
877 0.35
878 0.32
879 0.27
880 0.24
881 0.27
882 0.23
883 0.22
884 0.23
885 0.24
886 0.3
887 0.37
888 0.4
889 0.41
890 0.42
891 0.43
892 0.44
893 0.45
894 0.38
895 0.35
896 0.32
897 0.3
898 0.29
899 0.28
900 0.26
901 0.22
902 0.2
903 0.16
904 0.14
905 0.09
906 0.09
907 0.11
908 0.11
909 0.1
910 0.1
911 0.11
912 0.12
913 0.12
914 0.12
915 0.12
916 0.12
917 0.13
918 0.13
919 0.12
920 0.12
921 0.12
922 0.12
923 0.1
924 0.09
925 0.08
926 0.09
927 0.11
928 0.11
929 0.12
930 0.14
931 0.14
932 0.14
933 0.18
934 0.24
935 0.26
936 0.25
937 0.28
938 0.29
939 0.28
940 0.29
941 0.28
942 0.25
943 0.23
944 0.26
945 0.25
946 0.23
947 0.23
948 0.21
949 0.2
950 0.19
951 0.18
952 0.16
953 0.14
954 0.13
955 0.14
956 0.14
957 0.12
958 0.09
959 0.08
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.07
964 0.06
965 0.08
966 0.09
967 0.09
968 0.09
969 0.09
970 0.11
971 0.1
972 0.11
973 0.09
974 0.09
975 0.08
976 0.08
977 0.07
978 0.06
979 0.06
980 0.05
981 0.05
982 0.05
983 0.05
984 0.04
985 0.05
986 0.08
987 0.11
988 0.12
989 0.11
990 0.12
991 0.12
992 0.14
993 0.19
994 0.18
995 0.18
996 0.19
997 0.2
998 0.22
999 0.24
1000 0.24
1001 0.22
1002 0.2
1003 0.19
1004 0.17
1005 0.18
1006 0.18
1007 0.16
1008 0.17
1009 0.18
1010 0.18
1011 0.17
1012 0.16
1013 0.14
1014 0.15
1015 0.17
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.21
1019 0.23
1020 0.27
1021 0.36
1022 0.37
1023 0.39
1024 0.4
1025 0.38
1026 0.36
1027 0.43
1028 0.41
1029 0.37
1030 0.36
1031 0.34
1032 0.37
1033 0.34
1034 0.31
1035 0.31
1036 0.29
1037 0.24
1038 0.22
1039 0.21
1040 0.17
1041 0.17
1042 0.19
1043 0.15
1044 0.16
1045 0.17
1046 0.23
1047 0.27
1048 0.3
1049 0.39
1050 0.37
1051 0.33
1052 0.35
1053 0.36
1054 0.35
1055 0.34
1056 0.31
1057 0.27
1058 0.28
1059 0.28
1060 0.3
1061 0.29
1062 0.26
1063 0.22
1064 0.26
1065 0.22
1066 0.25
1067 0.29
1068 0.28
1069 0.34
1070 0.36
1071 0.38
1072 0.36
1073 0.41
1074 0.36
1075 0.33
1076 0.32
1077 0.25
1078 0.24
1079 0.23
1080 0.21
1081 0.17
1082 0.22
1083 0.26
1084 0.27
1085 0.35
1086 0.37
1087 0.42
1088 0.48
1089 0.55
1090 0.56
1091 0.61
1092 0.66
1093 0.63
1094 0.63
1095 0.66
1096 0.63
1097 0.56
1098 0.5
1099 0.41
1100 0.39
1101 0.34
1102 0.33
1103 0.33
1104 0.36
1105 0.39
1106 0.48
1107 0.54
1108 0.56
1109 0.57
1110 0.56
1111 0.49
1112 0.46
1113 0.43
1114 0.39
1115 0.37
1116 0.33
1117 0.32
1118 0.35
1119 0.43
1120 0.45
1121 0.48
1122 0.5
1123 0.54
1124 0.61