Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GKA4

Protein Details
Accession C1GKA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-53LLSASKRRSSNPRTPRPQPKSLKATEGVNQSTKSEPPPKKRRYIPGGPGGGHydrophilic
99-125AQPTTPPASTRPRRQKNQSRRFSSAAAHydrophilic
369-390ALEKRIPKPNPKPPQTQRPRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-18PR
38-44PPPKKRR
877-878RK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019542  Enhancer_polycomb-like_N  
IPR034732  EPHD  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_07690  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10513  EPL1  
PF13831  PHD_2  
PF13832  zf-HC5HC2H_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51805  EPHD  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15670  ePHD_BRPF  
cd15492  PHD_BRPF_JADE_like  
Amino Acid Sequences MALLSASKRRSSNPRTPRPQPKSLKATEGVNQSTKSEPPPKKRRYIPGGPGGGGRYVEVDGTATPARTITDAVSPNHTAPRVRSVREPSNNNNIMRRAAQPTTPPASTRPRRQKNQSRRFSSAAAAALAVAQGDGYKPREERGWEEFHPDLDIDAKIAVFSSDEVDGIKPSSTLPNGTTTNGTDESWNNSTLKPLTNGSTPVKRRPGRPRLSESLLIDLGTPTALKIVPPPGPNPRERLTLPKPSFVLKDPFLPFERKGVGQQNYVDRTMASVGYQESDIFLRHERRLIRMAEGAAEGDLDLSPQPVVDGDVNAALGNIGVGRVEYDMDEQDAKWLETYNAQRREEQFEPIKPAVFEITMTKIEKEWHALEKRIPKPNPKPPQTQRPRSSSAAAVNGEHASSGEEQDSKCAVCDDGDCENSNAIVFCDGCDLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRKCQLIGRGSPSCIFCPNTEGAFKQTNTSKWSHLLCAVWIPEVSIGNLSLMEPVNEVEKVPRNRWKLTCYICRQKMGACIQCSNKNCFVAFHVTCARRARLYLKMKLIPGAPAVMESNGLKAFCDKHVPPDWRREHNTDAATAEALEYYRNTMQGRRWGDSQAAALALGPESQAGMDPAEDDNRAINQRITLTVGGNKRKRATAPKTIWKLPSGAPVIPQIVLNNVIASLQRFTVRQRKQYAEDACKYWTLKRESRRGAALLKRLQLQLETFSSMEMTRRNFAGMGVAGAVRLQRRIGFADKLYLDLDRVRMLCDEVKKREREKLKDAEILRSIIDLVYFPIPPMLWPILDKAFALDGKGIFRRGLLSIRSKLVQRVYTSVSSFSRDLANVFTSEIGVESVGDTAELQMQISGRAPELSLEQREKRKLAKRIIKAIQPALEDSLKKESELNGKPFEKELKDLDVLLESSVLSRRASLVASSGEATHDLGGPVQRPLVNGIKNDVEDDRKEVSEVDATLLVQQLATIDNAEHTNGDNDITMVDVNGEMDDGHHDTKEASVSKSSVTPAADLTANSPSTPSMEGQARHEHSAPPSHEIQMANLASPSDTQESKNLPPLSQGGIQWYMQPFDPVRDHYIRGEMDWSGDLRERRKAPHEMPEADFRLRSGKSPSNLFRTTLMGWWRLEQKRFWRGPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.77
3 0.85
4 0.9
5 0.87
6 0.89
7 0.88
8 0.87
9 0.86
10 0.81
11 0.78
12 0.7
13 0.66
14 0.62
15 0.6
16 0.55
17 0.5
18 0.46
19 0.41
20 0.41
21 0.38
22 0.4
23 0.42
24 0.47
25 0.53
26 0.63
27 0.7
28 0.77
29 0.83
30 0.86
31 0.85
32 0.86
33 0.85
34 0.84
35 0.8
36 0.71
37 0.64
38 0.55
39 0.48
40 0.37
41 0.28
42 0.19
43 0.15
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.12
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.12
57 0.17
58 0.21
59 0.23
60 0.28
61 0.3
62 0.31
63 0.35
64 0.35
65 0.31
66 0.3
67 0.38
68 0.39
69 0.4
70 0.46
71 0.5
72 0.58
73 0.65
74 0.69
75 0.66
76 0.7
77 0.74
78 0.69
79 0.66
80 0.58
81 0.53
82 0.48
83 0.46
84 0.41
85 0.37
86 0.37
87 0.37
88 0.41
89 0.43
90 0.42
91 0.39
92 0.38
93 0.47
94 0.52
95 0.58
96 0.62
97 0.67
98 0.75
99 0.85
100 0.9
101 0.91
102 0.93
103 0.93
104 0.9
105 0.86
106 0.8
107 0.72
108 0.64
109 0.57
110 0.47
111 0.37
112 0.28
113 0.21
114 0.17
115 0.14
116 0.11
117 0.06
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.08
122 0.11
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.23
127 0.27
128 0.32
129 0.35
130 0.4
131 0.37
132 0.42
133 0.41
134 0.37
135 0.35
136 0.29
137 0.22
138 0.18
139 0.16
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.1
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.22
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.23
170 0.2
171 0.2
172 0.25
173 0.25
174 0.26
175 0.22
176 0.21
177 0.24
178 0.24
179 0.26
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.3
185 0.32
186 0.39
187 0.41
188 0.46
189 0.54
190 0.56
191 0.62
192 0.68
193 0.73
194 0.74
195 0.78
196 0.78
197 0.75
198 0.77
199 0.73
200 0.63
201 0.57
202 0.48
203 0.39
204 0.31
205 0.24
206 0.17
207 0.12
208 0.1
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.14
215 0.19
216 0.21
217 0.26
218 0.34
219 0.39
220 0.42
221 0.45
222 0.43
223 0.44
224 0.43
225 0.49
226 0.46
227 0.52
228 0.51
229 0.5
230 0.48
231 0.46
232 0.47
233 0.41
234 0.41
235 0.31
236 0.37
237 0.34
238 0.37
239 0.36
240 0.38
241 0.34
242 0.33
243 0.34
244 0.28
245 0.31
246 0.36
247 0.36
248 0.36
249 0.39
250 0.42
251 0.42
252 0.42
253 0.36
254 0.27
255 0.25
256 0.23
257 0.19
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.14
269 0.18
270 0.19
271 0.24
272 0.25
273 0.29
274 0.34
275 0.34
276 0.32
277 0.3
278 0.29
279 0.25
280 0.24
281 0.2
282 0.14
283 0.12
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.05
293 0.04
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.16
325 0.25
326 0.31
327 0.38
328 0.39
329 0.43
330 0.45
331 0.52
332 0.47
333 0.46
334 0.42
335 0.37
336 0.43
337 0.39
338 0.38
339 0.3
340 0.29
341 0.24
342 0.18
343 0.16
344 0.11
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.19
354 0.24
355 0.27
356 0.29
357 0.33
358 0.41
359 0.48
360 0.53
361 0.54
362 0.56
363 0.63
364 0.71
365 0.76
366 0.73
367 0.76
368 0.74
369 0.82
370 0.82
371 0.83
372 0.79
373 0.76
374 0.75
375 0.67
376 0.62
377 0.54
378 0.47
379 0.42
380 0.36
381 0.29
382 0.25
383 0.22
384 0.19
385 0.15
386 0.12
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.1
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.09
428 0.07
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.13
433 0.12
434 0.14
435 0.21
436 0.22
437 0.24
438 0.27
439 0.28
440 0.26
441 0.3
442 0.33
443 0.33
444 0.36
445 0.4
446 0.37
447 0.37
448 0.38
449 0.34
450 0.29
451 0.26
452 0.23
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.21
461 0.2
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.26
466 0.28
467 0.25
468 0.25
469 0.26
470 0.24
471 0.23
472 0.21
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.13
477 0.11
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.16
497 0.18
498 0.23
499 0.3
500 0.34
501 0.39
502 0.42
503 0.42
504 0.43
505 0.47
506 0.51
507 0.52
508 0.57
509 0.55
510 0.54
511 0.52
512 0.46
513 0.46
514 0.44
515 0.41
516 0.33
517 0.34
518 0.35
519 0.41
520 0.41
521 0.39
522 0.35
523 0.31
524 0.29
525 0.26
526 0.25
527 0.26
528 0.23
529 0.22
530 0.26
531 0.25
532 0.29
533 0.31
534 0.29
535 0.22
536 0.24
537 0.24
538 0.27
539 0.33
540 0.35
541 0.37
542 0.39
543 0.39
544 0.39
545 0.36
546 0.27
547 0.21
548 0.16
549 0.11
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.13
563 0.12
564 0.18
565 0.25
566 0.31
567 0.33
568 0.42
569 0.46
570 0.48
571 0.53
572 0.51
573 0.47
574 0.47
575 0.45
576 0.36
577 0.3
578 0.24
579 0.19
580 0.15
581 0.11
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.06
587 0.06
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.14
592 0.22
593 0.25
594 0.25
595 0.26
596 0.26
597 0.26
598 0.24
599 0.22
600 0.14
601 0.11
602 0.09
603 0.07
604 0.06
605 0.05
606 0.04
607 0.04
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.1
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.15
632 0.21
633 0.28
634 0.31
635 0.33
636 0.33
637 0.35
638 0.38
639 0.43
640 0.44
641 0.46
642 0.51
643 0.57
644 0.6
645 0.63
646 0.6
647 0.51
648 0.46
649 0.37
650 0.36
651 0.29
652 0.24
653 0.21
654 0.21
655 0.21
656 0.19
657 0.18
658 0.11
659 0.09
660 0.1
661 0.09
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.13
672 0.22
673 0.27
674 0.34
675 0.39
676 0.43
677 0.46
678 0.54
679 0.57
680 0.55
681 0.53
682 0.47
683 0.43
684 0.41
685 0.38
686 0.33
687 0.32
688 0.31
689 0.35
690 0.4
691 0.49
692 0.51
693 0.54
694 0.53
695 0.49
696 0.48
697 0.48
698 0.48
699 0.43
700 0.4
701 0.4
702 0.37
703 0.35
704 0.29
705 0.24
706 0.2
707 0.17
708 0.16
709 0.13
710 0.12
711 0.13
712 0.12
713 0.13
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.14
722 0.11
723 0.09
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.1
734 0.13
735 0.17
736 0.18
737 0.18
738 0.23
739 0.22
740 0.22
741 0.21
742 0.18
743 0.16
744 0.14
745 0.15
746 0.12
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.13
751 0.16
752 0.22
753 0.28
754 0.34
755 0.41
756 0.46
757 0.49
758 0.55
759 0.6
760 0.61
761 0.62
762 0.62
763 0.61
764 0.62
765 0.6
766 0.57
767 0.5
768 0.44
769 0.35
770 0.27
771 0.21
772 0.14
773 0.13
774 0.08
775 0.07
776 0.08
777 0.08
778 0.07
779 0.08
780 0.08
781 0.08
782 0.11
783 0.11
784 0.1
785 0.1
786 0.13
787 0.14
788 0.14
789 0.14
790 0.11
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.11
795 0.1
796 0.13
797 0.15
798 0.15
799 0.13
800 0.13
801 0.14
802 0.14
803 0.17
804 0.19
805 0.24
806 0.26
807 0.28
808 0.3
809 0.3
810 0.32
811 0.33
812 0.33
813 0.28
814 0.29
815 0.31
816 0.32
817 0.31
818 0.3
819 0.26
820 0.26
821 0.24
822 0.21
823 0.19
824 0.17
825 0.17
826 0.15
827 0.15
828 0.12
829 0.12
830 0.11
831 0.09
832 0.09
833 0.09
834 0.07
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.04
840 0.04
841 0.04
842 0.04
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.07
847 0.07
848 0.08
849 0.1
850 0.1
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.12
856 0.16
857 0.19
858 0.25
859 0.3
860 0.37
861 0.42
862 0.44
863 0.49
864 0.54
865 0.58
866 0.63
867 0.67
868 0.67
869 0.73
870 0.76
871 0.73
872 0.69
873 0.64
874 0.57
875 0.49
876 0.42
877 0.35
878 0.32
879 0.27
880 0.24
881 0.27
882 0.23
883 0.22
884 0.23
885 0.24
886 0.3
887 0.37
888 0.4
889 0.41
890 0.42
891 0.43
892 0.44
893 0.45
894 0.38
895 0.35
896 0.32
897 0.3
898 0.29
899 0.28
900 0.26
901 0.22
902 0.2
903 0.16
904 0.14
905 0.09
906 0.09
907 0.11
908 0.11
909 0.1
910 0.1
911 0.11
912 0.12
913 0.12
914 0.12
915 0.12
916 0.12
917 0.13
918 0.13
919 0.12
920 0.12
921 0.12
922 0.12
923 0.1
924 0.09
925 0.08
926 0.09
927 0.11
928 0.11
929 0.12
930 0.14
931 0.14
932 0.14
933 0.18
934 0.24
935 0.26
936 0.25
937 0.28
938 0.29
939 0.28
940 0.29
941 0.28
942 0.25
943 0.23
944 0.26
945 0.25
946 0.23
947 0.23
948 0.21
949 0.2
950 0.19
951 0.18
952 0.16
953 0.14
954 0.13
955 0.14
956 0.14
957 0.12
958 0.09
959 0.08
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.07
964 0.06
965 0.08
966 0.09
967 0.09
968 0.09
969 0.09
970 0.11
971 0.1
972 0.11
973 0.09
974 0.09
975 0.08
976 0.08
977 0.07
978 0.06
979 0.06
980 0.05
981 0.05
982 0.05
983 0.05
984 0.04
985 0.05
986 0.08
987 0.11
988 0.12
989 0.11
990 0.12
991 0.12
992 0.14
993 0.19
994 0.18
995 0.18
996 0.19
997 0.2
998 0.22
999 0.24
1000 0.24
1001 0.22
1002 0.2
1003 0.19
1004 0.17
1005 0.18
1006 0.18
1007 0.16
1008 0.17
1009 0.18
1010 0.18
1011 0.17
1012 0.16
1013 0.14
1014 0.15
1015 0.17
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.21
1019 0.23
1020 0.27
1021 0.36
1022 0.37
1023 0.39
1024 0.4
1025 0.38
1026 0.36
1027 0.43
1028 0.41
1029 0.37
1030 0.36
1031 0.34
1032 0.37
1033 0.34
1034 0.31
1035 0.31
1036 0.29
1037 0.24
1038 0.22
1039 0.21
1040 0.17
1041 0.17
1042 0.19
1043 0.15
1044 0.16
1045 0.17
1046 0.23
1047 0.27
1048 0.3
1049 0.39
1050 0.37
1051 0.33
1052 0.35
1053 0.36
1054 0.35
1055 0.34
1056 0.31
1057 0.27
1058 0.28
1059 0.28
1060 0.3
1061 0.29
1062 0.26
1063 0.22
1064 0.26
1065 0.22
1066 0.25
1067 0.29
1068 0.28
1069 0.34
1070 0.36
1071 0.38
1072 0.36
1073 0.41
1074 0.36
1075 0.33
1076 0.32
1077 0.25
1078 0.24
1079 0.23
1080 0.21
1081 0.17
1082 0.22
1083 0.26
1084 0.27
1085 0.35
1086 0.37
1087 0.42
1088 0.48
1089 0.55
1090 0.56
1091 0.61
1092 0.66
1093 0.63
1094 0.63
1095 0.66
1096 0.63
1097 0.56
1098 0.5
1099 0.41
1100 0.39
1101 0.34
1102 0.33
1103 0.33
1104 0.36
1105 0.39
1106 0.48
1107 0.54
1108 0.56
1109 0.57
1110 0.56
1111 0.49
1112 0.46
1113 0.43
1114 0.39
1115 0.37
1116 0.33
1117 0.32
1118 0.35
1119 0.43
1120 0.45
1121 0.48
1122 0.5
1123 0.54
1124 0.61