FuNGI

A0A168Q8Y0

Protein Details

Accession

A0A168Q8Y0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-36	EVTYHRRHYHQPQPRLHPHHNDRTTNH	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006595 CTLH_C IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR006594 LisH IPR045184 SMU1 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0016607 C:nuclear speck GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50897 CTLH PS50896 LISH PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSRAKAPSLEVTYHRRHYHQPQPRLHPHHNDRTTNHDCGIAAGSLRVSQPDDDEGKQTMSPQDSTMLNSIFPYDTTSLATYNQNMGVHTSVIRPTEDIFNANDPRLKDDILAIIMQYLSDEGYTAAQSVLYDEANVKWKEREERTMEVKRLKKAILDGDWQEAEKLCAKPLVKNHRSFLYSVYKQQYLEYIDRREIQKAFTFLNKRLKPLEHLQTKPNEFRDMCYLLTTKSITEVASFNNWEGIMAARENLVDQLQNMLDFETADRSGMISLSLLLGKTTSIHSSLLPLGSRYIPPNRLLTLLRQSVAYQIEFSRYHPKIAPTVNTLLEDYTSFVIPNAVGATLTGHKGNVKCVEFIGEEGRTAVSGSSDNTLRIWDVETAECLDVLEGHQSRIWDVSSTRSGDHIASASGDGMVKIWSLKESKACCVNTLSGHSGDVYSVKYHPNEDHVVSGGYDKIVRMFDVNTGAIVKTFPGHQLAVTKTIINPLGNLVISGSKDNTIKFWDIVSGLCIRTISSHLGEVTSVEMNSSGTLLLSSSKDNSNRLWDVRMVRPIRKLKGHQNTSKNFVRSSFADNNLIVGGSEDGIVYIWDQDTGEVLQKLRGHHGVVYEANWNSKQGMLASCSDDQTVKIWKYDDTIPMDVQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.52
3	0.56
4	0.61
5	0.66
6	0.69
7	0.71
8	0.73
9	0.79
10	0.86
11	0.87
12	0.85
13	0.85
14	0.85
15	0.86
16	0.85
17	0.81
18	0.74
19	0.74
20	0.72
21	0.65
22	0.56
23	0.47
24	0.38
25	0.33
26	0.32
27	0.24
28	0.18
29	0.15
30	0.14
31	0.14
32	0.14
33	0.14
34	0.13
35	0.13
36	0.15
37	0.2
38	0.23
39	0.23
40	0.26
41	0.26
42	0.26
43	0.26
44	0.26
45	0.25
46	0.25
47	0.24
48	0.22
49	0.24
50	0.23
51	0.26
52	0.27
53	0.22
54	0.19
55	0.18
56	0.19
57	0.16
58	0.15
59	0.17
60	0.14
61	0.14
62	0.16
63	0.17
64	0.16
65	0.18
66	0.2
67	0.18
68	0.19
69	0.22
70	0.2
71	0.19
72	0.21
73	0.19
74	0.18
75	0.17
76	0.17
77	0.17
78	0.18
79	0.18
80	0.16
81	0.17
82	0.21
83	0.21
84	0.21
85	0.2
86	0.25
87	0.28
88	0.28
89	0.3
90	0.25
91	0.29
92	0.29
93	0.27
94	0.21
95	0.2
96	0.21
97	0.19
98	0.18
99	0.13
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.08
104	0.06
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.04
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.08
117	0.07
118	0.08
119	0.08
120	0.1
121	0.18
122	0.19
123	0.19
124	0.21
125	0.26
126	0.34
127	0.38
128	0.44
129	0.42
130	0.48
131	0.55
132	0.61
133	0.62
134	0.62
135	0.63
136	0.59
137	0.58
138	0.52
139	0.45
140	0.42
141	0.43
142	0.38
143	0.38
144	0.35
145	0.35
146	0.34
147	0.32
148	0.28
149	0.21
150	0.19
151	0.19
152	0.18
153	0.15
154	0.18
155	0.19
156	0.23
157	0.32
158	0.42
159	0.44
160	0.48
161	0.51
162	0.52
163	0.52
164	0.49
165	0.45
166	0.44
167	0.39
168	0.41
169	0.42
170	0.39
171	0.37
172	0.37
173	0.35
174	0.3
175	0.33
176	0.31
177	0.3
178	0.31
179	0.34
180	0.35
181	0.36
182	0.32
183	0.29
184	0.28
185	0.27
186	0.26
187	0.3
188	0.32
189	0.35
190	0.44
191	0.43
192	0.42
193	0.44
194	0.44
195	0.42
196	0.46
197	0.49
198	0.47
199	0.48
200	0.5
201	0.54
202	0.56
203	0.56
204	0.5
205	0.47
206	0.39
207	0.38
208	0.39
209	0.33
210	0.29
211	0.26
212	0.24
213	0.18
214	0.2
215	0.19
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.1
220	0.11
221	0.11
222	0.11
223	0.13
224	0.13
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.13
280	0.16
281	0.17
282	0.19
283	0.21
284	0.2
285	0.21
286	0.21
287	0.21
288	0.24
289	0.23
290	0.21
291	0.19
292	0.19
293	0.2
294	0.2
295	0.17
296	0.11
297	0.1
298	0.14
299	0.14
300	0.16
301	0.22
302	0.21
303	0.23
304	0.24
305	0.25
306	0.26
307	0.28
308	0.28
309	0.22
310	0.24
311	0.23
312	0.21
313	0.2
314	0.15
315	0.13
316	0.11
317	0.09
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.09
335	0.1
336	0.13
337	0.18
338	0.18
339	0.17
340	0.17
341	0.19
342	0.17
343	0.17
344	0.17
345	0.11
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.08
371	0.07
372	0.05
373	0.06
374	0.1
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.09
383	0.09
384	0.13
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.17
390	0.16
391	0.16
392	0.12
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.09
407	0.1
408	0.16
409	0.18
410	0.22
411	0.29
412	0.29
413	0.28
414	0.29
415	0.3
416	0.26
417	0.28
418	0.26
419	0.19
420	0.19
421	0.18
422	0.16
423	0.14
424	0.13
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.13
429	0.13
430	0.16
431	0.16
432	0.2
433	0.22
434	0.21
435	0.21
436	0.19
437	0.19
438	0.17
439	0.16
440	0.12
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.11
450	0.14
451	0.14
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.1
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.1
462	0.11
463	0.11
464	0.16
465	0.17
466	0.21
467	0.2
468	0.2
469	0.18
470	0.21
471	0.22
472	0.18
473	0.16
474	0.14
475	0.15
476	0.14
477	0.13
478	0.1
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.11
483	0.12
484	0.14
485	0.14
486	0.15
487	0.17
488	0.19
489	0.18
490	0.17
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.16
495	0.15
496	0.13
497	0.13
498	0.13
499	0.11
500	0.12
501	0.14
502	0.15
503	0.14
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.14
509	0.14
510	0.12
511	0.1
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.07
522	0.08
523	0.1
524	0.12
525	0.18
526	0.21
527	0.23
528	0.26
529	0.31
530	0.34
531	0.35
532	0.35
533	0.35
534	0.38
535	0.42
536	0.48
537	0.46
538	0.46
539	0.53
540	0.58
541	0.6
542	0.63
543	0.65
544	0.66
545	0.72
546	0.77
547	0.77
548	0.79
549	0.77
550	0.76
551	0.77
552	0.69
553	0.59
554	0.51
555	0.47
556	0.4
557	0.43
558	0.42
559	0.38
560	0.4
561	0.38
562	0.37
563	0.32
564	0.29
565	0.2
566	0.14
567	0.11
568	0.07
569	0.07
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.09
581	0.1
582	0.14
583	0.15
584	0.15
585	0.19
586	0.22
587	0.24
588	0.29
589	0.3
590	0.28
591	0.28
592	0.29
593	0.3
594	0.28
595	0.28
596	0.28
597	0.26
598	0.29
599	0.27
600	0.27
601	0.23
602	0.22
603	0.22
604	0.19
605	0.21
606	0.21
607	0.23
608	0.26
609	0.27
610	0.27
611	0.27
612	0.24
613	0.22
614	0.22
615	0.28
616	0.25
617	0.26
618	0.27
619	0.27
620	0.3
621	0.35
622	0.38
623	0.36
624	0.37

A0A168Q8Y0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer