FuNGI

A0A168RPC4

Protein Details

Accession

A0A168RPC4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
279-299	TDEKKHHYNPRQQRRLYRRLL	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 9.5, cyto_mito 7, plas 5, nucl 4, cyto 3.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046896 Cup1-like_N IPR038279 Ndc10_dom2_sf IPR031872 NDC10_II
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF20263 LYRM2-like PF16787 NDC10_II
CDD	cd20273 Complex1_LYR_unchar

Amino Acid Sequences

MFTPTPQHSLYIRALYKRILTEAGHFFDDRARTFVVNRARKLFKEYKTCQDESRIKNKLLEARKRLHRLEKANQGDQKSALKILEAAYGKTGKTKHRLMHPYLYEHYPADMEKPAPLIPHIPHTAPPPPLCNPLQAVVTKHLHKKLEPELPTSPYKPLHRGRQANLLWKWRSYLISHLTVPLPFEIVCELELKAGATPSHPCFAGLQLKGGPRWDDMYTRSDTDLAHLDPTSLSLVPPAKLIRQIPLQRSPFARASSVYAVSTLIDMSPAPTIPSGEETDEKKHHYNPRQQRRLYRRLLQDIPLLSPLPLPTSLYDPCINYDVSESQWDFHGGGLSEFLTQVPGIVGTQFEIKIKPARQAQEWSYFFHQKKNGRTLSFPGITSNKKTHISCGSSARTVGIVCANEDEIRRQGRWNNTTMNGAHLSSFPREMMRLMAVFPSNGRYFYLARTALDPPTRLCKKLFPAIDEWHDRLAAKKLRPDKNNPIKPTVAANAFVQVIMVLRKTFIQDSVLMMEPRPCHPIWQRSIFFDPAYLSFKRDLLQIEAQEHDPAHTLLQQCVPMHSRFQTPIGYKGIHSGPLNIPTILTLVGFENGIRKIVSQWSTNSATKIVGAPIPQAAALTLKAKLMGFFLPLSVFLTLFLPLPPLFSTETMNTGSNIINTHVNTLSRTHIPTHITDITITSENSKWTTVATKFYPTNFSMFNLRQFKSHNHSGNFLVDHCGCPKGFFFSARPLFAPSSPRHYFFASHCHSLYSTTTHERTNERTNERTNERTNGYDDDDDDRDDDDAIHGSTTALCRPKRPF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.4
3	0.43
4	0.4
5	0.38
6	0.33
7	0.3
8	0.33
9	0.36
10	0.37
11	0.35
12	0.32
13	0.3
14	0.32
15	0.35
16	0.29
17	0.26
18	0.24
19	0.23
20	0.25
21	0.32
22	0.37
23	0.41
24	0.44
25	0.49
26	0.53
27	0.53
28	0.61
29	0.63
30	0.61
31	0.63
32	0.64
33	0.67
34	0.7
35	0.71
36	0.65
37	0.66
38	0.67
39	0.64
40	0.69
41	0.65
42	0.59
43	0.61
44	0.63
45	0.62
46	0.63
47	0.65
48	0.63
49	0.66
50	0.73
51	0.77
52	0.78
53	0.79
54	0.77
55	0.76
56	0.77
57	0.79
58	0.77
59	0.77
60	0.75
61	0.68
62	0.62
63	0.56
64	0.51
65	0.42
66	0.37
67	0.29
68	0.24
69	0.23
70	0.21
71	0.25
72	0.21
73	0.2
74	0.21
75	0.23
76	0.22
77	0.25
78	0.29
79	0.29
80	0.36
81	0.43
82	0.45
83	0.54
84	0.62
85	0.64
86	0.7
87	0.67
88	0.65
89	0.62
90	0.59
91	0.5
92	0.42
93	0.36
94	0.28
95	0.24
96	0.2
97	0.19
98	0.17
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.17
103	0.18
104	0.2
105	0.18
106	0.24
107	0.26
108	0.25
109	0.27
110	0.3
111	0.35
112	0.35
113	0.36
114	0.34
115	0.35
116	0.4
117	0.38
118	0.37
119	0.33
120	0.31
121	0.32
122	0.29
123	0.29
124	0.29
125	0.34
126	0.36
127	0.4
128	0.44
129	0.43
130	0.43
131	0.47
132	0.49
133	0.52
134	0.49
135	0.48
136	0.46
137	0.47
138	0.51
139	0.46
140	0.42
141	0.39
142	0.41
143	0.44
144	0.48
145	0.54
146	0.59
147	0.65
148	0.63
149	0.68
150	0.67
151	0.68
152	0.66
153	0.65
154	0.57
155	0.5
156	0.49
157	0.41
158	0.39
159	0.31
160	0.32
161	0.29
162	0.31
163	0.31
164	0.31
165	0.3
166	0.28
167	0.27
168	0.2
169	0.16
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.08
183	0.09
184	0.13
185	0.15
186	0.17
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.21
191	0.27
192	0.23
193	0.23
194	0.24
195	0.27
196	0.27
197	0.28
198	0.25
199	0.19
200	0.21
201	0.21
202	0.2
203	0.2
204	0.24
205	0.24
206	0.24
207	0.24
208	0.22
209	0.2
210	0.2
211	0.2
212	0.16
213	0.15
214	0.14
215	0.14
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.09
220	0.08
221	0.1
222	0.12
223	0.12
224	0.14
225	0.15
226	0.14
227	0.19
228	0.2
229	0.2
230	0.27
231	0.33
232	0.36
233	0.44
234	0.45
235	0.44
236	0.46
237	0.47
238	0.42
239	0.38
240	0.33
241	0.25
242	0.27
243	0.26
244	0.25
245	0.2
246	0.17
247	0.15
248	0.14
249	0.13
250	0.09
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.15
265	0.16
266	0.22
267	0.24
268	0.27
269	0.27
270	0.32
271	0.4
272	0.45
273	0.53
274	0.59
275	0.68
276	0.74
277	0.76
278	0.8
279	0.8
280	0.81
281	0.78
282	0.75
283	0.71
284	0.69
285	0.67
286	0.59
287	0.54
288	0.45
289	0.39
290	0.32
291	0.25
292	0.18
293	0.16
294	0.13
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.12
300	0.12
301	0.15
302	0.16
303	0.15
304	0.16
305	0.17
306	0.16
307	0.12
308	0.14
309	0.12
310	0.11
311	0.14
312	0.13
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.11
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.14
341	0.15
342	0.2
343	0.24
344	0.26
345	0.28
346	0.32
347	0.34
348	0.39
349	0.38
350	0.36
351	0.36
352	0.41
353	0.38
354	0.39
355	0.42
356	0.38
357	0.44
358	0.49
359	0.5
360	0.44
361	0.45
362	0.44
363	0.44
364	0.4
365	0.34
366	0.28
367	0.27
368	0.27
369	0.28
370	0.26
371	0.24
372	0.26
373	0.26
374	0.27
375	0.29
376	0.3
377	0.3
378	0.33
379	0.32
380	0.29
381	0.28
382	0.25
383	0.19
384	0.16
385	0.14
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.1
394	0.11
395	0.13
396	0.13
397	0.15
398	0.19
399	0.26
400	0.29
401	0.31
402	0.31
403	0.3
404	0.33
405	0.31
406	0.28
407	0.21
408	0.18
409	0.16
410	0.13
411	0.14
412	0.12
413	0.12
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.18
434	0.15
435	0.15
436	0.17
437	0.18
438	0.19
439	0.2
440	0.2
441	0.16
442	0.25
443	0.26
444	0.25
445	0.25
446	0.26
447	0.29
448	0.36
449	0.36
450	0.29
451	0.33
452	0.35
453	0.38
454	0.37
455	0.34
456	0.28
457	0.26
458	0.23
459	0.2
460	0.25
461	0.25
462	0.24
463	0.29
464	0.38
465	0.45
466	0.51
467	0.57
468	0.61
469	0.66
470	0.72
471	0.69
472	0.64
473	0.57
474	0.53
475	0.48
476	0.4
477	0.3
478	0.23
479	0.2
480	0.17
481	0.16
482	0.15
483	0.12
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.08
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.14
498	0.15
499	0.14
500	0.14
501	0.17
502	0.16
503	0.17
504	0.2
505	0.17
506	0.2
507	0.27
508	0.35
509	0.38
510	0.45
511	0.45
512	0.45
513	0.49
514	0.45
515	0.38
516	0.31
517	0.26
518	0.19
519	0.22
520	0.18
521	0.17
522	0.17
523	0.17
524	0.17
525	0.18
526	0.17
527	0.18
528	0.22
529	0.21
530	0.22
531	0.23
532	0.23
533	0.22
534	0.2
535	0.16
536	0.13
537	0.11
538	0.1
539	0.12
540	0.13
541	0.13
542	0.15
543	0.18
544	0.16
545	0.19
546	0.21
547	0.19
548	0.21
549	0.22
550	0.23
551	0.22
552	0.24
553	0.27
554	0.26
555	0.29
556	0.3
557	0.28
558	0.25
559	0.28
560	0.27
561	0.25
562	0.24
563	0.23
564	0.22
565	0.25
566	0.27
567	0.22
568	0.21
569	0.17
570	0.17
571	0.13
572	0.1
573	0.07
574	0.06
575	0.07
576	0.07
577	0.06
578	0.09
579	0.09
580	0.1
581	0.1
582	0.09
583	0.11
584	0.18
585	0.21
586	0.2
587	0.22
588	0.27
589	0.32
590	0.33
591	0.32
592	0.27
593	0.24
594	0.22
595	0.22
596	0.17
597	0.14
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.12
602	0.11
603	0.1
604	0.09
605	0.08
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.12
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.1
619	0.1
620	0.11
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.09
627	0.08
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.1
632	0.12
633	0.13
634	0.14
635	0.17
636	0.15
637	0.18
638	0.19
639	0.19
640	0.18
641	0.17
642	0.17
643	0.15
644	0.15
645	0.14
646	0.15
647	0.15
648	0.18
649	0.18
650	0.18
651	0.19
652	0.19
653	0.22
654	0.22
655	0.24
656	0.23
657	0.25
658	0.28
659	0.28
660	0.33
661	0.31
662	0.28
663	0.26
664	0.25
665	0.24
666	0.23
667	0.21
668	0.18
669	0.17
670	0.19
671	0.2
672	0.19
673	0.16
674	0.16
675	0.22
676	0.21
677	0.26
678	0.26
679	0.31
680	0.33
681	0.35
682	0.39
683	0.33
684	0.34
685	0.29
686	0.29
687	0.31
688	0.31
689	0.38
690	0.4
691	0.39
692	0.39
693	0.42
694	0.47
695	0.47
696	0.54
697	0.53
698	0.48
699	0.51
700	0.51
701	0.51
702	0.46
703	0.38
704	0.34
705	0.27
706	0.27
707	0.25
708	0.25
709	0.2
710	0.21
711	0.21
712	0.22
713	0.23
714	0.25
715	0.27
716	0.34
717	0.39
718	0.4
719	0.4
720	0.37
721	0.37
722	0.37
723	0.4
724	0.34
725	0.38
726	0.39
727	0.41
728	0.4
729	0.4
730	0.41
731	0.36
732	0.43
733	0.4
734	0.41
735	0.38
736	0.38
737	0.36
738	0.35
739	0.34
740	0.28
741	0.28
742	0.31
743	0.33
744	0.34
745	0.38
746	0.4
747	0.44
748	0.49
749	0.53
750	0.52
751	0.57
752	0.61
753	0.66
754	0.68
755	0.69
756	0.65
757	0.63
758	0.6
759	0.57
760	0.53
761	0.48
762	0.46
763	0.4
764	0.36
765	0.35
766	0.32
767	0.3
768	0.27
769	0.24
770	0.19
771	0.18
772	0.16
773	0.12
774	0.12
775	0.12
776	0.11
777	0.1
778	0.1
779	0.12
780	0.14
781	0.19
782	0.25
783	0.26

A0A168RPC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer