FuNGI

A0A168RIW2

Protein Details

Accession

A0A168RIW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-75	VVAQLQQQRKRRRLLKDTDVIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.5, cyto 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036047 F-box-like_dom_sf IPR001810 F-box_dom IPR032675 LRR_dom_sf IPR007198 Ssl1-like IPR012170 TFIIH_SSL1/p44 IPR002035 VWF_A IPR036465 vWFA_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF12937 F-box-like PF04056 Ssl1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50181 FBOX PS50234 VWFA
CDD	cd01453 vWA_transcription_factor_IIH_type

Amino Acid Sequences

MSRRPVDDEYIDIDDTLDNNQDDDTGKGGYSWEEEYKRSWDVLQEDAEGRLSSVVAQLQQQRKRRRLLKDTDVIQRGIIRHVFLILDLSEAMNEKDLRPSRVELTLLYAQQFINEFFDQNPISQLGIIVTRDGIAEKLTELGGNPSDHTKALQSKKNVETSGEPSLQNALQLARASMVGVPSHGSKEILLVFGALTTCDPGDIHETIDLLQRDMVRVNIVGLAAEVQICRSLSRATKGSYGVILNEAHYKDLLFEAIPPPAVSSNKNTANLVTMGFPKRLMEDHATMCVCHPSKLTLGGYICPRCKSKVCDLPSDCDVCGLTLVSSPHLARSYHHLFPVDNFEEIRQPGTSILSLPTEVLERILLTNDVWQLATCRQVCSYWRNLIDMPRHWRQICLVDNHHGSSTLEPPWGSTIVNTWSLESFLYLLGPHLLHIQSLTISGVRDSTVRLILDQCTMLEELQIISFNTLSDHALTLRRNLKLRRFLLSGGKDPFFSVDALSLAHFLSQCPFLKELTINQCHLCIHPAIFLDQLGKRQCNLEYLTTLTLSRLQHSWSPHHVGRLLMSCPNLNYNRLTLHTTTSTSSVMA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.17
4	0.16
5	0.12
6	0.13
7	0.13
8	0.13
9	0.14
10	0.14
11	0.14
12	0.11
13	0.11
14	0.11
15	0.12
16	0.12
17	0.13
18	0.16
19	0.21
20	0.23
21	0.25
22	0.28
23	0.31
24	0.32
25	0.31
26	0.28
27	0.27
28	0.27
29	0.3
30	0.29
31	0.28
32	0.27
33	0.27
34	0.27
35	0.21
36	0.19
37	0.14
38	0.12
39	0.09
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.16
44	0.24
45	0.33
46	0.41
47	0.5
48	0.58
49	0.64
50	0.72
51	0.76
52	0.78
53	0.79
54	0.81
55	0.82
56	0.81
57	0.8
58	0.79
59	0.74
60	0.64
61	0.55
62	0.49
63	0.4
64	0.36
65	0.31
66	0.22
67	0.19
68	0.2
69	0.18
70	0.15
71	0.16
72	0.1
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.11
80	0.12
81	0.11
82	0.2
83	0.24
84	0.27
85	0.29
86	0.32
87	0.31
88	0.34
89	0.34
90	0.25
91	0.28
92	0.3
93	0.27
94	0.25
95	0.24
96	0.2
97	0.2
98	0.21
99	0.15
100	0.16
101	0.15
102	0.15
103	0.14
104	0.19
105	0.18
106	0.17
107	0.18
108	0.14
109	0.14
110	0.13
111	0.13
112	0.09
113	0.11
114	0.11
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.09
129	0.11
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.17
137	0.23
138	0.3
139	0.36
140	0.39
141	0.46
142	0.51
143	0.55
144	0.52
145	0.45
146	0.42
147	0.4
148	0.42
149	0.37
150	0.31
151	0.26
152	0.28
153	0.26
154	0.21
155	0.17
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.09
163	0.08
164	0.09
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.08
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.08
173	0.1
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.16
195	0.15
196	0.11
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.13
201	0.12
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.09
219	0.11
220	0.15
221	0.18
222	0.19
223	0.22
224	0.23
225	0.22
226	0.21
227	0.19
228	0.16
229	0.15
230	0.13
231	0.11
232	0.14
233	0.13
234	0.12
235	0.11
236	0.11
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.14
251	0.2
252	0.23
253	0.24
254	0.24
255	0.22
256	0.22
257	0.22
258	0.18
259	0.13
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.12
265	0.13
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.15
270	0.16
271	0.19
272	0.19
273	0.18
274	0.17
275	0.19
276	0.16
277	0.14
278	0.13
279	0.12
280	0.13
281	0.16
282	0.16
283	0.14
284	0.14
285	0.16
286	0.2
287	0.22
288	0.22
289	0.22
290	0.23
291	0.22
292	0.26
293	0.28
294	0.33
295	0.38
296	0.4
297	0.47
298	0.47
299	0.48
300	0.47
301	0.44
302	0.35
303	0.27
304	0.23
305	0.14
306	0.12
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.18
319	0.23
320	0.23
321	0.25
322	0.24
323	0.22
324	0.24
325	0.31
326	0.24
327	0.19
328	0.17
329	0.17
330	0.18
331	0.18
332	0.18
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.08
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.1
359	0.1
360	0.17
361	0.15
362	0.15
363	0.16
364	0.18
365	0.21
366	0.24
367	0.29
368	0.29
369	0.29
370	0.31
371	0.31
372	0.36
373	0.38
374	0.39
375	0.4
376	0.39
377	0.44
378	0.42
379	0.41
380	0.38
381	0.39
382	0.38
383	0.37
384	0.35
385	0.36
386	0.37
387	0.37
388	0.35
389	0.28
390	0.24
391	0.2
392	0.2
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.13
400	0.1
401	0.11
402	0.13
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.12
410	0.1
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.09
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.14
438	0.15
439	0.16
440	0.16
441	0.13
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.1
446	0.09
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.1
460	0.15
461	0.16
462	0.22
463	0.28
464	0.31
465	0.37
466	0.44
467	0.51
468	0.56
469	0.58
470	0.57
471	0.54
472	0.53
473	0.56
474	0.54
475	0.52
476	0.47
477	0.45
478	0.39
479	0.37
480	0.35
481	0.26
482	0.21
483	0.15
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.1
494	0.15
495	0.17
496	0.19
497	0.2
498	0.19
499	0.22
500	0.24
501	0.29
502	0.34
503	0.37
504	0.36
505	0.36
506	0.37
507	0.35
508	0.34
509	0.29
510	0.21
511	0.17
512	0.18
513	0.19
514	0.19
515	0.18
516	0.18
517	0.2
518	0.2
519	0.25
520	0.28
521	0.29
522	0.28
523	0.31
524	0.31
525	0.32
526	0.33
527	0.31
528	0.27
529	0.29
530	0.3
531	0.28
532	0.27
533	0.22
534	0.24
535	0.22
536	0.22
537	0.2
538	0.22
539	0.25
540	0.3
541	0.35
542	0.37
543	0.44
544	0.44
545	0.47
546	0.46
547	0.43
548	0.43
549	0.41
550	0.37
551	0.32
552	0.32
553	0.29
554	0.28
555	0.35
556	0.33
557	0.31
558	0.31
559	0.31
560	0.32
561	0.33
562	0.36
563	0.3
564	0.33
565	0.33
566	0.33
567	0.32
568	0.3

A0A168RIW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer