Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163JT52

Protein Details
Accession A0A163JT52    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40FDQPKASSSKRTKTQHDQRPDATHydrophilic
253-277KVPVWKQKLLAKKNKNKKPVPVLDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-270AKKNKNKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Amino Acid Sequences MSGYKRSNKVSFGKDGYFDQPKASSSKRTKTQHDQRPDATDFEIDHDVSLEPAKQRRGAVAKDAYVSDDEEVGGAAFSSDSEDDSDDTKKPGNKADDEDFDMFSSEAVDDTPSKGKKKQLGMDDIEGQEMQSRNVESDEEDDDDNKGNKLTAFNMKEEMEQGNFDAQGNYTRNEKDPEAFHDKWMEGISKKEMAKAKQAQLDRDRAEQVKEASRQSKLPQTQAEVYRVLVEYLLPGESVKDALTSLGSAGGAKVPVWKQKLLAKKNKNKKPVPVLDEQQVADRQEKVEAITGLADQLMALGHFGVYDDTLETMVRYLRSKCEVDETWVPQSAHRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.5
4 0.49
5 0.43
6 0.38
7 0.34
8 0.33
9 0.36
10 0.37
11 0.4
12 0.42
13 0.51
14 0.57
15 0.63
16 0.7
17 0.75
18 0.82
19 0.82
20 0.84
21 0.82
22 0.77
23 0.76
24 0.7
25 0.61
26 0.52
27 0.43
28 0.34
29 0.3
30 0.28
31 0.2
32 0.18
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.15
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.32
44 0.37
45 0.37
46 0.41
47 0.42
48 0.4
49 0.38
50 0.38
51 0.32
52 0.27
53 0.25
54 0.17
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.03
64 0.03
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.13
73 0.12
74 0.14
75 0.17
76 0.2
77 0.22
78 0.28
79 0.31
80 0.33
81 0.37
82 0.41
83 0.4
84 0.41
85 0.4
86 0.34
87 0.29
88 0.26
89 0.2
90 0.15
91 0.12
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.15
99 0.17
100 0.2
101 0.24
102 0.3
103 0.36
104 0.43
105 0.47
106 0.47
107 0.51
108 0.52
109 0.51
110 0.49
111 0.42
112 0.36
113 0.29
114 0.22
115 0.18
116 0.15
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.22
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.17
163 0.17
164 0.22
165 0.29
166 0.28
167 0.27
168 0.27
169 0.26
170 0.25
171 0.24
172 0.2
173 0.12
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.34
182 0.38
183 0.41
184 0.41
185 0.43
186 0.45
187 0.45
188 0.5
189 0.43
190 0.39
191 0.38
192 0.33
193 0.33
194 0.29
195 0.27
196 0.27
197 0.28
198 0.3
199 0.29
200 0.3
201 0.31
202 0.31
203 0.37
204 0.34
205 0.36
206 0.34
207 0.35
208 0.39
209 0.4
210 0.4
211 0.32
212 0.29
213 0.26
214 0.23
215 0.19
216 0.13
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.11
241 0.13
242 0.2
243 0.23
244 0.24
245 0.27
246 0.33
247 0.43
248 0.48
249 0.56
250 0.61
251 0.68
252 0.78
253 0.83
254 0.87
255 0.84
256 0.83
257 0.84
258 0.82
259 0.78
260 0.75
261 0.71
262 0.65
263 0.62
264 0.53
265 0.46
266 0.4
267 0.35
268 0.29
269 0.27
270 0.22
271 0.2
272 0.21
273 0.18
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.12
302 0.16
303 0.18
304 0.23
305 0.29
306 0.31
307 0.32
308 0.37
309 0.37
310 0.41
311 0.46
312 0.45
313 0.44
314 0.49
315 0.47