Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168M3T6

Protein Details
Accession A0A168M3T6    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-282EGETAPKQPKRRARKNKNKKSSQVADHydrophilic
331-357SDASSSRAPRRPRRKNKKAKNPDAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-276PKQPKRRARKNKNKK
337-366RAPRRPRRKNKKAKNPDAAAAIAERRRIKK
474-563PVKKEEAAPVKKEEPVKKEAAVPAKKEEPVKKEEPVKKEEPVKKEEPVKKEEPVPAKKEEPVPAKKEEPVPAKKEGPAPVKKEEPVAKKQ
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 12, mito 8.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51808  CHCH  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKNKGVSLLAKGVATCPGQASAYGKCIAVNYKDAHKDMCVKEFQAFKQCVEKVKDTNFCVLACAVDYTFVEYTRSSFASSTFRPICPVNMSTDQKPAAAPSAIKQVSAQEETVTVVTTTTAAAASTTTATATTTTTEQVTAPVTSVKSDVVVKEGETVEDDSHKVFVGNLSFQTKEEGLVEFFETSGKVLEAKIITIRPHYRRRSAGYGFVTFATLEDALKAAKDLNKKELDGREINVEVARPKPVVVKPAVNSESEGETAPKQPKRRARKNKNKKSSQVADETAQENDGVTKKETTRETTAAVNGKKDKNATSGEEETQTSQSDNASVASDASSSRAPRRPRRKNKKAKNPDAAAAIAERRRIKKELTEPSQTTLFVANIPYSSTDETLQEVFKNYKVASAHVARMRNGRSKGYGFVDMESHDEQVKALENIKDVELEGRTIYLKVALSERPREIEETADAKKEDVKKETAEPVKKEEAAPVKKEEPVKKEAAVPAKKEEPVKKEEPVKKEEPVKKEEPVKKEEPVPAKKEEPVPAKKEEPVPAKKEGPAPVKKEEPVAKKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.18
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.19
13 0.21
14 0.24
15 0.25
16 0.28
17 0.27
18 0.34
19 0.39
20 0.4
21 0.4
22 0.39
23 0.44
24 0.42
25 0.45
26 0.41
27 0.37
28 0.41
29 0.45
30 0.45
31 0.45
32 0.44
33 0.39
34 0.45
35 0.46
36 0.49
37 0.5
38 0.52
39 0.49
40 0.56
41 0.61
42 0.55
43 0.58
44 0.52
45 0.45
46 0.41
47 0.34
48 0.26
49 0.19
50 0.18
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.15
60 0.17
61 0.18
62 0.15
63 0.15
64 0.17
65 0.23
66 0.24
67 0.31
68 0.31
69 0.31
70 0.32
71 0.33
72 0.34
73 0.32
74 0.32
75 0.29
76 0.35
77 0.39
78 0.38
79 0.43
80 0.4
81 0.36
82 0.35
83 0.29
84 0.24
85 0.21
86 0.2
87 0.16
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.24
92 0.24
93 0.27
94 0.28
95 0.26
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.14
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.13
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.19
184 0.26
185 0.31
186 0.4
187 0.45
188 0.49
189 0.52
190 0.57
191 0.6
192 0.55
193 0.55
194 0.49
195 0.45
196 0.4
197 0.35
198 0.29
199 0.21
200 0.19
201 0.12
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.1
211 0.16
212 0.18
213 0.24
214 0.26
215 0.27
216 0.32
217 0.33
218 0.35
219 0.31
220 0.3
221 0.26
222 0.24
223 0.24
224 0.19
225 0.17
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.15
232 0.16
233 0.2
234 0.21
235 0.24
236 0.23
237 0.31
238 0.31
239 0.26
240 0.26
241 0.22
242 0.21
243 0.18
244 0.17
245 0.11
246 0.1
247 0.15
248 0.2
249 0.23
250 0.26
251 0.33
252 0.42
253 0.51
254 0.62
255 0.69
256 0.74
257 0.82
258 0.89
259 0.93
260 0.94
261 0.92
262 0.87
263 0.85
264 0.8
265 0.73
266 0.66
267 0.57
268 0.48
269 0.42
270 0.36
271 0.27
272 0.2
273 0.16
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.17
282 0.19
283 0.22
284 0.24
285 0.24
286 0.25
287 0.24
288 0.27
289 0.28
290 0.27
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.27
295 0.28
296 0.25
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.25
301 0.26
302 0.25
303 0.25
304 0.24
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.12
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.15
324 0.21
325 0.28
326 0.38
327 0.5
328 0.6
329 0.69
330 0.8
331 0.86
332 0.91
333 0.94
334 0.96
335 0.96
336 0.95
337 0.93
338 0.85
339 0.76
340 0.67
341 0.56
342 0.45
343 0.35
344 0.28
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.26
350 0.28
351 0.29
352 0.34
353 0.42
354 0.48
355 0.5
356 0.54
357 0.52
358 0.52
359 0.52
360 0.43
361 0.35
362 0.26
363 0.2
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.16
383 0.15
384 0.17
385 0.17
386 0.18
387 0.21
388 0.23
389 0.28
390 0.3
391 0.32
392 0.31
393 0.36
394 0.39
395 0.41
396 0.41
397 0.38
398 0.38
399 0.37
400 0.39
401 0.37
402 0.37
403 0.3
404 0.29
405 0.27
406 0.23
407 0.25
408 0.21
409 0.19
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.14
415 0.11
416 0.14
417 0.15
418 0.15
419 0.17
420 0.17
421 0.16
422 0.14
423 0.16
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.14
435 0.18
436 0.23
437 0.28
438 0.29
439 0.29
440 0.3
441 0.31
442 0.29
443 0.27
444 0.26
445 0.25
446 0.26
447 0.26
448 0.25
449 0.23
450 0.28
451 0.33
452 0.34
453 0.33
454 0.35
455 0.35
456 0.4
457 0.48
458 0.52
459 0.52
460 0.5
461 0.52
462 0.53
463 0.52
464 0.48
465 0.46
466 0.47
467 0.46
468 0.47
469 0.46
470 0.44
471 0.47
472 0.55
473 0.54
474 0.5
475 0.5
476 0.5
477 0.46
478 0.48
479 0.5
480 0.52
481 0.51
482 0.49
483 0.49
484 0.5
485 0.52
486 0.55
487 0.56
488 0.52
489 0.53
490 0.55
491 0.55
492 0.6
493 0.65
494 0.63
495 0.64
496 0.63
497 0.62
498 0.67
499 0.68
500 0.65
501 0.65
502 0.63
503 0.62
504 0.67
505 0.68
506 0.65
507 0.65
508 0.63
509 0.6
510 0.62
511 0.63
512 0.62
513 0.64
514 0.62
515 0.6
516 0.59
517 0.6
518 0.6
519 0.6
520 0.6
521 0.6
522 0.6
523 0.6
524 0.6
525 0.6
526 0.6
527 0.6
528 0.6
529 0.6
530 0.6
531 0.6
532 0.6
533 0.6
534 0.6
535 0.6
536 0.6
537 0.59
538 0.6
539 0.6
540 0.63
541 0.6
542 0.62
543 0.62