Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDT2

Protein Details
Accession C1GDT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-437KEGAVRRALEKKKREVERKKVSAAGBasic
476-496RQGSGQQKPGSRRSRKAKTETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-432AVRRALEKKKREVERKK
487-491RRSRK
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 3, extr 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR002347  SDR_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG pbn:PADG_05418  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00106  adh_short  
Amino Acid Sequences MPVPLLAHGVVDGISTIPYAVPILKTSPWIVLVALLKRYFGGARNTSDRRMHSKVVMITGGTSGIGASIAQRLASQGAQIILLTQHAPSDPFLIDYVEDLRNSTGNQLVYAEQVDLSSLYSVRTFATKWVDNAPPRRLDMIILCANIMKPSRAKPRTTIDSLDEEWQVNYLANYHLLSILSPALRAQPPDRDVRVIFGTCSSYIGATLDFKRLEDSTMRPAAAKPFSASKPATNMSSNSTTKPSNSSNRTTAHTTEAAQSSMYATSKLALMIFAKSFQSHLSAFQRPDKQPCNTRVLVVDPGFSRTPGTRRWLTAGSLFGLIIYLITWPIWWLVLKSPQQGAQSFLTAAMDAVFGAPAANIGRVGVGAGAGIAGGMLIKECRERDVLRKEVVDEHVGKQLWEFSSWQIELREKEGAVRRALEKKKREVERKKVSAAGSTTAADAAASTTTTTSATSAAAAAGVNGDGDGDTDSSQRQGSGQQKPGSRRSRKAKTET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.05
5 0.06
6 0.07
7 0.08
8 0.09
9 0.11
10 0.14
11 0.15
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.19
17 0.17
18 0.19
19 0.22
20 0.23
21 0.27
22 0.25
23 0.24
24 0.24
25 0.25
26 0.23
27 0.23
28 0.28
29 0.27
30 0.33
31 0.42
32 0.46
33 0.5
34 0.54
35 0.54
36 0.54
37 0.54
38 0.52
39 0.47
40 0.5
41 0.47
42 0.45
43 0.41
44 0.33
45 0.28
46 0.24
47 0.21
48 0.14
49 0.1
50 0.07
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.13
113 0.19
114 0.21
115 0.22
116 0.27
117 0.33
118 0.39
119 0.45
120 0.46
121 0.42
122 0.42
123 0.42
124 0.37
125 0.32
126 0.27
127 0.26
128 0.24
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.14
136 0.14
137 0.21
138 0.32
139 0.36
140 0.39
141 0.42
142 0.49
143 0.54
144 0.55
145 0.51
146 0.43
147 0.43
148 0.42
149 0.39
150 0.31
151 0.25
152 0.21
153 0.18
154 0.15
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.18
175 0.21
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.26
180 0.27
181 0.28
182 0.22
183 0.19
184 0.15
185 0.16
186 0.13
187 0.14
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.23
209 0.22
210 0.2
211 0.15
212 0.18
213 0.18
214 0.23
215 0.23
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.24
220 0.2
221 0.2
222 0.19
223 0.25
224 0.24
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.21
229 0.24
230 0.25
231 0.27
232 0.31
233 0.34
234 0.35
235 0.37
236 0.39
237 0.38
238 0.34
239 0.29
240 0.26
241 0.23
242 0.22
243 0.2
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.09
267 0.13
268 0.17
269 0.21
270 0.23
271 0.29
272 0.36
273 0.36
274 0.42
275 0.44
276 0.44
277 0.47
278 0.5
279 0.51
280 0.44
281 0.43
282 0.37
283 0.34
284 0.34
285 0.27
286 0.24
287 0.17
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.14
293 0.17
294 0.18
295 0.24
296 0.24
297 0.25
298 0.28
299 0.29
300 0.28
301 0.28
302 0.25
303 0.2
304 0.18
305 0.16
306 0.12
307 0.1
308 0.08
309 0.06
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.09
321 0.17
322 0.2
323 0.22
324 0.24
325 0.27
326 0.3
327 0.29
328 0.3
329 0.23
330 0.22
331 0.19
332 0.18
333 0.14
334 0.11
335 0.1
336 0.07
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.03
365 0.04
366 0.07
367 0.08
368 0.11
369 0.15
370 0.18
371 0.27
372 0.36
373 0.4
374 0.41
375 0.42
376 0.42
377 0.42
378 0.42
379 0.39
380 0.33
381 0.29
382 0.32
383 0.3
384 0.28
385 0.24
386 0.26
387 0.21
388 0.2
389 0.2
390 0.16
391 0.21
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.26
396 0.26
397 0.27
398 0.28
399 0.22
400 0.28
401 0.34
402 0.36
403 0.33
404 0.36
405 0.38
406 0.45
407 0.54
408 0.57
409 0.57
410 0.62
411 0.7
412 0.76
413 0.82
414 0.83
415 0.85
416 0.87
417 0.86
418 0.81
419 0.77
420 0.68
421 0.63
422 0.55
423 0.47
424 0.38
425 0.31
426 0.27
427 0.21
428 0.2
429 0.13
430 0.1
431 0.08
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.19
465 0.28
466 0.36
467 0.44
468 0.49
469 0.55
470 0.62
471 0.71
472 0.74
473 0.74
474 0.75
475 0.77
476 0.82