Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163JYU1

Protein Details
Accession A0A163JYU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-166PAAPKKDDKKAEKKDDKKAEKKDDKKTDKKADKKAAABasic
171-194DKKDNAKDGKKKEKKEKKPAAAAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-190PKKDDKKAEKKDDKKAEKKDDKKTDKKADKKAAAPEGADKKDNAKDGKKKEKKEKKPA
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 9.5, E.R. 4, nucl 2.5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MATVLRLNEKSSKDILLLHKYVKSSIPVEDWLAFIVLSLRSAAKKDVIANMEGKLNTHLNFNTFFVANRLTVVDVILFGILHAYTRNMKVASMANVMRWFDLTQELIVKKNGLTDVLALVPLNLDDVPEPAAPKKDDKKAEKKDDKKAEKKDDKKTDKKADKKAAAPEGADKKDNAKDGKKKEKKEKKPAAAAPVESDQSTVSRLDIRVGYIRSCKKHEGADSLYVEEIDLGDGEGEYRTIVSGLVKWYPLEEMQNRWVICLTNLKPASMRGIKSHGMVLCASAADGSKVELLSPVDTSKVKPGDRVYFEGMEGEPEKVLNPKKKYWETVQPDFKTNDDKLAFFQDKPFLIKTASGDQVKCQVATVQGGGIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.4
4 0.41
5 0.4
6 0.41
7 0.41
8 0.42
9 0.38
10 0.35
11 0.29
12 0.29
13 0.28
14 0.27
15 0.29
16 0.27
17 0.25
18 0.21
19 0.19
20 0.15
21 0.12
22 0.12
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.19
32 0.21
33 0.26
34 0.27
35 0.28
36 0.29
37 0.28
38 0.3
39 0.27
40 0.25
41 0.22
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.22
46 0.2
47 0.22
48 0.22
49 0.21
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.1
72 0.11
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.17
77 0.2
78 0.21
79 0.23
80 0.22
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.22
85 0.19
86 0.16
87 0.12
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.15
120 0.21
121 0.27
122 0.32
123 0.41
124 0.48
125 0.58
126 0.65
127 0.75
128 0.78
129 0.8
130 0.82
131 0.84
132 0.85
133 0.84
134 0.83
135 0.83
136 0.83
137 0.84
138 0.84
139 0.84
140 0.84
141 0.84
142 0.84
143 0.84
144 0.83
145 0.84
146 0.83
147 0.81
148 0.76
149 0.72
150 0.69
151 0.63
152 0.55
153 0.46
154 0.43
155 0.4
156 0.37
157 0.33
158 0.27
159 0.25
160 0.27
161 0.3
162 0.28
163 0.29
164 0.35
165 0.43
166 0.54
167 0.58
168 0.63
169 0.7
170 0.77
171 0.8
172 0.84
173 0.85
174 0.81
175 0.83
176 0.78
177 0.74
178 0.65
179 0.55
180 0.46
181 0.37
182 0.3
183 0.21
184 0.18
185 0.11
186 0.09
187 0.1
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.21
199 0.26
200 0.27
201 0.31
202 0.32
203 0.31
204 0.34
205 0.35
206 0.34
207 0.33
208 0.36
209 0.33
210 0.31
211 0.28
212 0.24
213 0.2
214 0.14
215 0.11
216 0.05
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.16
239 0.16
240 0.19
241 0.22
242 0.27
243 0.27
244 0.26
245 0.26
246 0.21
247 0.2
248 0.25
249 0.23
250 0.27
251 0.28
252 0.28
253 0.28
254 0.28
255 0.34
256 0.3
257 0.3
258 0.24
259 0.28
260 0.29
261 0.29
262 0.33
263 0.26
264 0.23
265 0.21
266 0.19
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.15
286 0.2
287 0.26
288 0.25
289 0.29
290 0.35
291 0.41
292 0.45
293 0.48
294 0.45
295 0.4
296 0.4
297 0.37
298 0.3
299 0.25
300 0.22
301 0.18
302 0.13
303 0.12
304 0.13
305 0.18
306 0.26
307 0.31
308 0.36
309 0.42
310 0.52
311 0.58
312 0.63
313 0.64
314 0.67
315 0.67
316 0.72
317 0.75
318 0.68
319 0.67
320 0.63
321 0.57
322 0.54
323 0.46
324 0.44
325 0.36
326 0.33
327 0.31
328 0.38
329 0.39
330 0.33
331 0.37
332 0.34
333 0.34
334 0.37
335 0.37
336 0.29
337 0.28
338 0.29
339 0.29
340 0.3
341 0.35
342 0.36
343 0.35
344 0.36
345 0.42
346 0.42
347 0.37
348 0.31
349 0.26
350 0.24
351 0.27
352 0.25