Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163J078

Protein Details
Accession A0A163J078    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
524-546LHASLPTRQRQHKQQHPEVTHPMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR026960  RVT-Znf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
PF13966  zf-RVT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50878  RT_POL  
CDD cd01650  RT_nLTR_like  
Amino Acid Sequences SLINTDAKIFTKMITIRLNAYMPTMINPYQTGFMPGRLISDNGWVTRATMQHYQQLDEKKRLPAVAACFDQEKAYDRIHPEYLTKTLLHFGLPIQLVKSLHHLFFDTNISLSINGWLGSPFRQLRGLRQGDPLSPLLFNLAFEPFLRTLLATPTLQGIKLDHKQTITRYKQRLMSQPPATAQVTRSTIKLLAYADDLLIFFRDTSEWPAAKSLFDLYSKASNSRVNLQKTYLVSLSGESYAEWINLCNTDQLEWHDHNNANAITYLGYPLTSSPKQLDSFLDGTLDKLRRHVNILKPRHLSVRGASMVANSLLLSRLWHILRVVTVPKNWLQRVRTLIRDFVMPFSPFPSWNTICLKKSNGGLNVVNAHAQQLALQLVYIQRHIRPVSDADFCTPIQQDLLHYYFGSHLPEDVSHHHGAIRRLCKKLPCLVTFCDVLAKLPPMPPATSTLDWTLQVSKNTATKVMDLSPGSFRQTLHPDHHLTLAPLHPPHWIPMGMRLPRPVWQSFWRLPIAHKTTTVWWRLLHASLPTRQRQHKQQHPEVTHPMCLLCNTAVEDDYHFFLGCPVKDHLWLDSWPGPSFPPSQELVWLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.33
4 0.36
5 0.37
6 0.3
7 0.3
8 0.26
9 0.21
10 0.21
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.22
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.22
24 0.21
25 0.22
26 0.18
27 0.24
28 0.25
29 0.23
30 0.24
31 0.21
32 0.21
33 0.24
34 0.25
35 0.22
36 0.27
37 0.28
38 0.35
39 0.36
40 0.37
41 0.39
42 0.47
43 0.49
44 0.49
45 0.52
46 0.5
47 0.51
48 0.49
49 0.46
50 0.42
51 0.42
52 0.41
53 0.38
54 0.34
55 0.32
56 0.32
57 0.3
58 0.26
59 0.23
60 0.2
61 0.2
62 0.24
63 0.26
64 0.3
65 0.32
66 0.32
67 0.31
68 0.32
69 0.32
70 0.3
71 0.27
72 0.23
73 0.24
74 0.22
75 0.2
76 0.17
77 0.14
78 0.18
79 0.18
80 0.18
81 0.16
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.26
86 0.23
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.2
91 0.22
92 0.25
93 0.18
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.25
110 0.25
111 0.32
112 0.41
113 0.45
114 0.41
115 0.46
116 0.46
117 0.41
118 0.44
119 0.38
120 0.29
121 0.24
122 0.21
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.14
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.14
137 0.16
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.18
146 0.24
147 0.25
148 0.24
149 0.25
150 0.28
151 0.34
152 0.43
153 0.46
154 0.49
155 0.52
156 0.55
157 0.6
158 0.63
159 0.66
160 0.63
161 0.63
162 0.58
163 0.55
164 0.51
165 0.49
166 0.44
167 0.36
168 0.3
169 0.26
170 0.25
171 0.23
172 0.22
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.11
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.28
211 0.33
212 0.32
213 0.33
214 0.33
215 0.35
216 0.33
217 0.34
218 0.26
219 0.19
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.11
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.2
243 0.2
244 0.2
245 0.22
246 0.19
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.16
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.13
270 0.13
271 0.17
272 0.19
273 0.15
274 0.16
275 0.19
276 0.18
277 0.23
278 0.28
279 0.32
280 0.39
281 0.45
282 0.49
283 0.49
284 0.5
285 0.49
286 0.44
287 0.37
288 0.28
289 0.28
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.15
294 0.14
295 0.13
296 0.11
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.16
314 0.2
315 0.24
316 0.26
317 0.29
318 0.26
319 0.29
320 0.35
321 0.36
322 0.39
323 0.35
324 0.36
325 0.31
326 0.32
327 0.28
328 0.23
329 0.23
330 0.17
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.2
337 0.18
338 0.21
339 0.26
340 0.29
341 0.3
342 0.32
343 0.33
344 0.29
345 0.32
346 0.33
347 0.3
348 0.3
349 0.28
350 0.27
351 0.26
352 0.24
353 0.21
354 0.15
355 0.14
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.17
373 0.19
374 0.21
375 0.23
376 0.23
377 0.2
378 0.22
379 0.21
380 0.21
381 0.19
382 0.16
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.14
387 0.15
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.13
399 0.15
400 0.19
401 0.17
402 0.18
403 0.2
404 0.23
405 0.27
406 0.32
407 0.38
408 0.39
409 0.42
410 0.45
411 0.48
412 0.49
413 0.53
414 0.53
415 0.48
416 0.46
417 0.46
418 0.45
419 0.41
420 0.36
421 0.31
422 0.23
423 0.19
424 0.17
425 0.16
426 0.14
427 0.16
428 0.19
429 0.18
430 0.19
431 0.19
432 0.22
433 0.26
434 0.25
435 0.25
436 0.25
437 0.24
438 0.24
439 0.24
440 0.25
441 0.22
442 0.22
443 0.22
444 0.22
445 0.24
446 0.24
447 0.26
448 0.22
449 0.2
450 0.22
451 0.22
452 0.23
453 0.21
454 0.22
455 0.23
456 0.24
457 0.25
458 0.24
459 0.23
460 0.25
461 0.3
462 0.33
463 0.33
464 0.38
465 0.38
466 0.38
467 0.4
468 0.35
469 0.31
470 0.29
471 0.27
472 0.25
473 0.22
474 0.21
475 0.22
476 0.21
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.18
481 0.26
482 0.35
483 0.36
484 0.37
485 0.39
486 0.37
487 0.4
488 0.45
489 0.37
490 0.34
491 0.35
492 0.42
493 0.42
494 0.46
495 0.45
496 0.41
497 0.42
498 0.47
499 0.47
500 0.42
501 0.39
502 0.37
503 0.4
504 0.46
505 0.47
506 0.39
507 0.34
508 0.35
509 0.37
510 0.36
511 0.31
512 0.3
513 0.31
514 0.35
515 0.42
516 0.46
517 0.52
518 0.59
519 0.64
520 0.68
521 0.73
522 0.77
523 0.8
524 0.82
525 0.84
526 0.81
527 0.8
528 0.8
529 0.72
530 0.65
531 0.55
532 0.46
533 0.37
534 0.32
535 0.28
536 0.19
537 0.17
538 0.16
539 0.17
540 0.17
541 0.16
542 0.19
543 0.18
544 0.19
545 0.18
546 0.16
547 0.14
548 0.18
549 0.23
550 0.2
551 0.23
552 0.24
553 0.25
554 0.29
555 0.31
556 0.29
557 0.27
558 0.27
559 0.3
560 0.32
561 0.33
562 0.29
563 0.29
564 0.28
565 0.27
566 0.31
567 0.26
568 0.25
569 0.25
570 0.25