Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163IT75

Protein Details
Accession A0A163IT75    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-254AETQHHGNRRGDKSKKKKKKVSKKPVECYACGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-246NRRGDKSKKKKKKVSKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 10, cysk 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MDPNQTQQQLAQLTAALAFLMDKERTQHEVREGHFKAPMPGKFNGSRDAIAVENWIGDVDQYFKFTKMPVDKEFDFAILLLEGNAKVWWRRYAMIKKDDAPASWEELQEAIRDYFVPAGAYVQARSRLYYLRQTGSVQSYIEEFQEIRMVVGNVSEPEALDKFVRGLRLPVEEHVRIHNPQTVDRAMELALNYEDARSGVRVPKQTWKQTTYRGPQPMDLDYAETQHHGNRRGDKSKKKKKKVSKKPVECYACGEDHFVKECPLVKGVAESLKGKARSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.08
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.17
12 0.23
13 0.25
14 0.29
15 0.33
16 0.38
17 0.39
18 0.47
19 0.45
20 0.42
21 0.44
22 0.4
23 0.39
24 0.41
25 0.43
26 0.37
27 0.38
28 0.41
29 0.43
30 0.45
31 0.43
32 0.37
33 0.34
34 0.3
35 0.29
36 0.24
37 0.18
38 0.18
39 0.13
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.21
54 0.25
55 0.3
56 0.32
57 0.37
58 0.37
59 0.4
60 0.39
61 0.32
62 0.25
63 0.19
64 0.16
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.17
78 0.26
79 0.35
80 0.42
81 0.47
82 0.48
83 0.47
84 0.51
85 0.49
86 0.41
87 0.35
88 0.28
89 0.26
90 0.24
91 0.22
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.16
116 0.22
117 0.24
118 0.21
119 0.22
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.22
124 0.16
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.2
159 0.2
160 0.21
161 0.23
162 0.24
163 0.22
164 0.23
165 0.24
166 0.2
167 0.21
168 0.24
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.09
186 0.13
187 0.18
188 0.23
189 0.25
190 0.35
191 0.43
192 0.51
193 0.54
194 0.55
195 0.55
196 0.59
197 0.66
198 0.64
199 0.64
200 0.63
201 0.58
202 0.57
203 0.55
204 0.48
205 0.41
206 0.34
207 0.29
208 0.22
209 0.22
210 0.19
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.22
215 0.24
216 0.3
217 0.37
218 0.45
219 0.54
220 0.63
221 0.7
222 0.76
223 0.81
224 0.87
225 0.89
226 0.91
227 0.93
228 0.95
229 0.95
230 0.96
231 0.96
232 0.95
233 0.94
234 0.94
235 0.89
236 0.79
237 0.74
238 0.68
239 0.59
240 0.48
241 0.44
242 0.36
243 0.33
244 0.34
245 0.29
246 0.25
247 0.25
248 0.29
249 0.27
250 0.26
251 0.23
252 0.2
253 0.22
254 0.24
255 0.26
256 0.25
257 0.24
258 0.26
259 0.33