FuNGI

C1G066

Protein Details

Accession

C1G066

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-54	GPFIKIRRRNADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGG	Hydrophilic
530-553	SGTDTSRKKPKSKHDAQPGSRPIS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-81	HPPPPGPNGPFIKIRRRNADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGGQAANGTAAPRPRPPLAVPRPKPLAKPK
424-432	FGKRVRKAL
474-481	RTKKERAK
501-503	PKH
506-521	PLNKKGAASHSTRKRP
536-550	RKKPKSKHDAQPGSR
570-577	QPGRKRAR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pbn:PADG_00256 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSATPPNPPTPARHPPPPGPNGPFIKIRRRNADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGGQAANGTAAPRPRPPLAVPRPKPLAKPKPINPSADDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLITTKRAWREGLKHHIARFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRTLNTGPATEKEGQVPRKQSELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSAATVPKKANAPKQRTQQVFKSEMTPEEMARARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETHAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFITKNPFRTLSIEEAEKHMAKKNKDPRWFIEKEQVRIQKKALEQYAKQSRLFTGKREGFLGAGDGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGMFDEDEDVKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQEKKEKEELKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDEESSDDSETERLKEEQRKLEERTKKERAKESDKNSGVSTKGTNTPSGRPKHTDPLNKKGAASHSTRKRPGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHDAQPGSRPISPGPAAALQTQRKQGPDQPGRKRARNGPGSGSDGERAAGSGAEMSDGTTAVASKKLKLNPPAVKSRAGTPHGSRAGSPAVPAPTTRPSTPVPAPVGMPSNLTFPTASEIHSAIPAMGIASGELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDRLLRPGVLKEGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.67
3	0.75
4	0.75
5	0.74
6	0.69
7	0.71
8	0.67
9	0.64
10	0.64
11	0.6
12	0.63
13	0.64
14	0.68
15	0.68
16	0.69
17	0.74
18	0.75
19	0.79
20	0.78
21	0.8
22	0.82
23	0.82
24	0.78
25	0.8
26	0.81
27	0.8
28	0.81
29	0.81
30	0.8
31	0.81
32	0.88
33	0.86
34	0.86
35	0.82
36	0.77
37	0.67
38	0.62
39	0.56
40	0.47
41	0.39
42	0.29
43	0.23
44	0.19
45	0.18
46	0.14
47	0.13
48	0.16
49	0.19
50	0.23
51	0.28
52	0.28
53	0.31
54	0.35
55	0.43
56	0.5
57	0.58
58	0.59
59	0.62
60	0.68
61	0.68
62	0.71
63	0.71
64	0.71
65	0.7
66	0.76
67	0.75
68	0.78
69	0.8
70	0.77
71	0.68
72	0.65
73	0.57
74	0.5
75	0.42
76	0.32
77	0.3
78	0.25
79	0.23
80	0.15
81	0.12
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.1
90	0.12
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.15
96	0.16
97	0.16
98	0.17
99	0.24
100	0.32
101	0.37
102	0.39
103	0.41
104	0.48
105	0.56
106	0.64
107	0.65
108	0.62
109	0.59
110	0.62
111	0.56
112	0.55
113	0.53
114	0.5
115	0.5
116	0.49
117	0.54
118	0.58
119	0.65
120	0.61
121	0.6
122	0.57
123	0.58
124	0.58
125	0.54
126	0.49
127	0.49
128	0.46
129	0.46
130	0.45
131	0.45
132	0.52
133	0.57
134	0.62
135	0.65
136	0.73
137	0.76
138	0.75
139	0.72
140	0.69
141	0.64
142	0.6
143	0.53
144	0.47
145	0.39
146	0.37
147	0.36
148	0.3
149	0.28
150	0.28
151	0.32
152	0.34
153	0.38
154	0.43
155	0.39
156	0.43
157	0.44
158	0.39
159	0.41
160	0.42
161	0.42
162	0.41
163	0.4
164	0.36
165	0.34
166	0.35
167	0.27
168	0.22
169	0.18
170	0.17
171	0.17
172	0.2
173	0.25
174	0.29
175	0.34
176	0.39
177	0.42
178	0.48
179	0.54
180	0.52
181	0.49
182	0.48
183	0.42
184	0.39
185	0.34
186	0.24
187	0.18
188	0.15
189	0.13
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.11
194	0.12
195	0.15
196	0.21
197	0.26
198	0.34
199	0.42
200	0.49
201	0.56
202	0.63
203	0.69
204	0.7
205	0.7
206	0.67
207	0.65
208	0.61
209	0.54
210	0.49
211	0.41
212	0.37
213	0.36
214	0.3
215	0.22
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.22
220	0.21
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.16
225	0.17
226	0.19
227	0.19
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.22
232	0.21
233	0.18
234	0.15
235	0.16
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.09
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.11
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.11
267	0.13
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.28
272	0.3
273	0.32
274	0.33
275	0.34
276	0.39
277	0.44
278	0.43
279	0.5
280	0.52
281	0.53
282	0.5
283	0.51
284	0.47
285	0.4
286	0.33
287	0.28
288	0.24
289	0.22
290	0.23
291	0.21
292	0.19
293	0.2
294	0.24
295	0.24
296	0.33
297	0.41
298	0.47
299	0.54
300	0.57
301	0.57
302	0.61
303	0.61
304	0.54
305	0.54
306	0.5
307	0.46
308	0.49
309	0.52
310	0.46
311	0.45
312	0.44
313	0.39
314	0.37
315	0.39
316	0.36
317	0.33
318	0.31
319	0.38
320	0.47
321	0.44
322	0.43
323	0.37
324	0.34
325	0.37
326	0.38
327	0.31
328	0.32
329	0.31
330	0.31
331	0.32
332	0.3
333	0.22
334	0.21
335	0.2
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.02
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.09
372	0.11
373	0.12
374	0.16
375	0.19
376	0.28
377	0.32
378	0.38
379	0.43
380	0.48
381	0.48
382	0.46
383	0.43
384	0.38
385	0.33
386	0.28
387	0.23
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.13
392	0.11
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.2
398	0.21
399	0.21
400	0.26
401	0.25
402	0.25
403	0.31
404	0.35
405	0.35
406	0.42
407	0.48
408	0.51
409	0.58
410	0.58
411	0.57
412	0.58
413	0.54
414	0.54
415	0.55
416	0.56
417	0.58
418	0.68
419	0.72
420	0.74
421	0.78
422	0.78
423	0.73
424	0.7
425	0.61
426	0.53
427	0.48
428	0.4
429	0.36
430	0.3
431	0.27
432	0.23
433	0.21
434	0.19
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.12
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.19
452	0.26
453	0.32
454	0.38
455	0.44
456	0.48
457	0.52
458	0.59
459	0.62
460	0.61
461	0.65
462	0.67
463	0.67
464	0.69
465	0.72
466	0.71
467	0.72
468	0.74
469	0.71
470	0.71
471	0.67
472	0.62
473	0.54
474	0.48
475	0.39
476	0.32
477	0.27
478	0.19
479	0.24
480	0.23
481	0.27
482	0.26
483	0.33
484	0.39
485	0.43
486	0.44
487	0.43
488	0.46
489	0.51
490	0.57
491	0.6
492	0.58
493	0.62
494	0.66
495	0.62
496	0.58
497	0.52
498	0.49
499	0.43
500	0.43
501	0.43
502	0.45
503	0.52
504	0.57
505	0.57
506	0.6
507	0.63
508	0.66
509	0.66
510	0.61
511	0.58
512	0.54
513	0.52
514	0.44
515	0.37
516	0.33
517	0.26
518	0.22
519	0.22
520	0.24
521	0.27
522	0.36
523	0.42
524	0.44
525	0.5
526	0.61
527	0.66
528	0.73
529	0.78
530	0.81
531	0.85
532	0.83
533	0.84
534	0.8
535	0.74
536	0.65
537	0.56
538	0.46
539	0.41
540	0.37
541	0.27
542	0.23
543	0.21
544	0.21
545	0.23
546	0.29
547	0.28
548	0.31
549	0.36
550	0.36
551	0.35
552	0.37
553	0.41
554	0.44
555	0.5
556	0.56
557	0.61
558	0.69
559	0.74
560	0.78
561	0.78
562	0.76
563	0.76
564	0.74
565	0.68
566	0.65
567	0.61
568	0.59
569	0.54
570	0.46
571	0.37
572	0.29
573	0.25
574	0.18
575	0.14
576	0.1
577	0.08
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.12
591	0.13
592	0.16
593	0.23
594	0.29
595	0.36
596	0.43
597	0.52
598	0.55
599	0.61
600	0.66
601	0.63
602	0.62
603	0.56
604	0.56
605	0.55
606	0.5
607	0.5
608	0.44
609	0.51
610	0.5
611	0.5
612	0.42
613	0.38
614	0.38
615	0.33
616	0.3
617	0.24
618	0.22
619	0.22
620	0.22
621	0.23
622	0.26
623	0.3
624	0.3
625	0.29
626	0.29
627	0.36
628	0.38
629	0.41
630	0.38
631	0.35
632	0.35
633	0.34
634	0.36
635	0.29
636	0.28
637	0.22
638	0.21
639	0.2
640	0.2
641	0.17
642	0.14
643	0.18
644	0.16
645	0.17
646	0.16
647	0.17
648	0.16
649	0.17
650	0.17
651	0.12
652	0.11
653	0.1
654	0.07
655	0.07
656	0.06
657	0.05
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.08
664	0.13
665	0.15
666	0.16
667	0.2
668	0.24
669	0.33
670	0.4
671	0.45
672	0.46
673	0.56
674	0.65
675	0.64
676	0.63
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.48
681	0.46
682	0.4
683	0.39
684	0.38
685	0.39
686	0.38
687	0.37
688	0.3
689	0.24
690	0.21
691	0.21
692	0.21
693	0.25
694	0.27
695	0.3
696	0.31
697	0.3
698	0.33
699	0.34

C1G066

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer