Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168LW31

Protein Details
Accession A0A168LW31    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-270AAVRRTSRPNHYQHQRQQPQQPQQQQQRQHGWRRNNKDIRCYACHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MADNYNVDLGQTLQTLMVSTQLLLDERRNSGPQTMVKVPPPPCFCGERNATMVDGWLRSVERYFEFTRLNDDRKVDYAVTLLRDGADVWWRRLETKGEDTVVWEEFKALFRLGFRPVNAHEEARDLLANLRQTDTVRSYVNAFHDVELLLPTVTDDEFKDRFIRGLQPAVRAHVLKEMPKTKDAAEVLALSYEHSMKIAHEVVYCDPRPPQQTNGYYGPQPMDLDYAAVRRTSRPNHYQHQRQQPQQPQQQQQRQHGWRRNNKDIRCYACDKLGHYVKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.17
12 0.18
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.28
18 0.33
19 0.32
20 0.35
21 0.38
22 0.38
23 0.39
24 0.45
25 0.46
26 0.49
27 0.49
28 0.46
29 0.43
30 0.45
31 0.43
32 0.44
33 0.45
34 0.4
35 0.38
36 0.36
37 0.33
38 0.27
39 0.27
40 0.21
41 0.17
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.24
53 0.23
54 0.31
55 0.33
56 0.35
57 0.33
58 0.34
59 0.32
60 0.32
61 0.34
62 0.26
63 0.21
64 0.2
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.14
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.19
77 0.19
78 0.2
79 0.22
80 0.25
81 0.23
82 0.26
83 0.28
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.26
88 0.23
89 0.18
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.12
99 0.15
100 0.17
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.13
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.18
151 0.16
152 0.22
153 0.23
154 0.27
155 0.27
156 0.29
157 0.29
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.22
162 0.2
163 0.26
164 0.3
165 0.3
166 0.32
167 0.32
168 0.27
169 0.32
170 0.29
171 0.23
172 0.18
173 0.17
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.17
190 0.24
191 0.24
192 0.21
193 0.21
194 0.25
195 0.3
196 0.31
197 0.34
198 0.36
199 0.39
200 0.44
201 0.47
202 0.45
203 0.4
204 0.39
205 0.34
206 0.26
207 0.23
208 0.18
209 0.15
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.24
219 0.3
220 0.37
221 0.44
222 0.51
223 0.6
224 0.69
225 0.76
226 0.78
227 0.82
228 0.82
229 0.82
230 0.84
231 0.84
232 0.84
233 0.83
234 0.83
235 0.82
236 0.84
237 0.85
238 0.83
239 0.83
240 0.83
241 0.82
242 0.83
243 0.82
244 0.82
245 0.84
246 0.85
247 0.87
248 0.86
249 0.83
250 0.82
251 0.82
252 0.79
253 0.75
254 0.71
255 0.63
256 0.61
257 0.58
258 0.51
259 0.52