Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163JMX1

Protein Details
Accession A0A163JMX1    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-89SRSGQQQQPHQQQQRPANHPHydrophilic
213-242LDERRANKEMKHKQQQQRQQQQQQQQQEQQHydrophilic
671-694DSASKKAQPSRKGKKAWRKNVDVTHydrophilic
782-810NQLAKRKLKETPKPKVKRAKKTYDMWDESHydrophilic
927-957DANTEKTKTERKTKAQRKKEQRIKEEHTTWEHydrophilic
1050-1100RNIIEPRSPFKKPKRKHALKVYEKRSYKTFDMTEKKKEQYKEIQRRRIRSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
675-689KKAQPSRKGKKAWRK
779-802KKVNQLAKRKLKETPKPKVKRAKK
936-949ERKTKAQRKKEQRI
1055-1071PRSPFKKPKRKHALKVY
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16620  vRING-HC-C4C4_RBBP6  
Amino Acid Sequences MDAEEGPSTPTHDQSKQRPTQGDGRSSQAFRQPNQNFPGNNAMFDPMMAMNMGIMNPIQFQLMMQQAGMSRSGQQQQPHQQQQRPANHPSESQPPPSGYVCYKCGQAGHWIYYCPNVPKGQYVPRHTNALSSSIAPPPPLSEADTIPEELVCTVCKDLFREPSISLCCGKSFCNECITKALNKDQQCPHCAKDAASIQVVPNKTLRKIVDAFLDERRANKEMKHKQQQQRQQQQQQQQQEQQQERPDSSNPTDWTDPSQSNEADRDTTPDDPSRSSNRHMHQKNKQPFDSTDSSREDVNSERKYNTTGMDAMGSEFNNLPPMQPFMANPAMFMGGGNGAMAPPFGLPDMSWMFGGNGTAGGMGAFPPVNGMPTMPPPLFFGSNGGAPIHYPGGFSNKPRTTGGRSTNTQQQKQQPSDRRQNDSDTFDPSSSHNDNNTESKTTTTTTATSDSRSSHRHSYDSTDIDLLPLDRATTIIISGSPENDLALGLAALAIPAVDGAIAVPPVIGNLAGPVAHLLHDVKRTMAMISLIMEKATTTTTTTMTMKTTITITADIETAAIDQDQDLPAAAATDLPVDTGPLQDAAIQTTVTGKAIDIGILVGIDLTETIKNKGHVRFRVHNRNAICGRGLKMIVWVAFWAGYQVGLFTFLNFFNLFSLLSTFRSMVDTVTDSASKKAQPSRKGKKAWRKNVDVTELESGLETLRSEERVRGTIDELPEEDHFTLDVSGDIEVKKQLKKERPLRVDQILSQRSAVPPLAGRHVHALVQPVFGQPSKHQEKKVNQLAKRKLKETPKPKVKRAKKTYDMWDESEETSPRDDYLASTKPSKVKAPITMARIPKVMLHKPAVEVPHGGASYNPTQEEHEALLQKAADVEIAKYKAEKALDEQLSYRKELDALPHELQHLENQDTATITPPTTEDADNDDNDDANTEKTKTERKTKAQRKKEQRIKEEHTTWERKQLEKRLRQEIDNASLTAQELAERELLLDRLAKERIVTKDRKEKEGLSRIGHFHVQEMSMEVQLEDELSETLRQLKPEGSIFKDRFVSIQRRNIIEPRSPFKKPKRKHALKVYEKRSYKTFDMTEKKKEQYKEIQRRRIRSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.59
3 0.63
4 0.69
5 0.68
6 0.67
7 0.7
8 0.69
9 0.68
10 0.6
11 0.58
12 0.57
13 0.54
14 0.53
15 0.51
16 0.49
17 0.44
18 0.52
19 0.5
20 0.52
21 0.56
22 0.59
23 0.51
24 0.5
25 0.58
26 0.47
27 0.44
28 0.37
29 0.33
30 0.26
31 0.25
32 0.23
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.09
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.12
49 0.15
50 0.15
51 0.14
52 0.15
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.15
57 0.15
58 0.2
59 0.26
60 0.29
61 0.32
62 0.4
63 0.5
64 0.6
65 0.67
66 0.7
67 0.7
68 0.74
69 0.8
70 0.8
71 0.76
72 0.73
73 0.68
74 0.62
75 0.59
76 0.55
77 0.54
78 0.49
79 0.47
80 0.44
81 0.4
82 0.41
83 0.4
84 0.39
85 0.35
86 0.35
87 0.34
88 0.32
89 0.32
90 0.29
91 0.29
92 0.26
93 0.31
94 0.31
95 0.33
96 0.33
97 0.32
98 0.32
99 0.34
100 0.37
101 0.32
102 0.31
103 0.29
104 0.28
105 0.33
106 0.38
107 0.43
108 0.48
109 0.52
110 0.56
111 0.56
112 0.61
113 0.55
114 0.53
115 0.46
116 0.41
117 0.34
118 0.28
119 0.28
120 0.26
121 0.27
122 0.23
123 0.21
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.18
129 0.18
130 0.21
131 0.23
132 0.21
133 0.19
134 0.17
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.21
145 0.26
146 0.29
147 0.3
148 0.29
149 0.34
150 0.36
151 0.36
152 0.33
153 0.27
154 0.26
155 0.25
156 0.25
157 0.26
158 0.28
159 0.28
160 0.34
161 0.33
162 0.33
163 0.38
164 0.4
165 0.37
166 0.37
167 0.44
168 0.43
169 0.45
170 0.52
171 0.54
172 0.57
173 0.57
174 0.57
175 0.5
176 0.51
177 0.48
178 0.41
179 0.41
180 0.39
181 0.38
182 0.35
183 0.34
184 0.28
185 0.32
186 0.31
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.25
191 0.3
192 0.29
193 0.3
194 0.32
195 0.33
196 0.34
197 0.34
198 0.35
199 0.34
200 0.39
201 0.33
202 0.33
203 0.35
204 0.3
205 0.29
206 0.32
207 0.38
208 0.43
209 0.53
210 0.62
211 0.68
212 0.75
213 0.83
214 0.88
215 0.88
216 0.89
217 0.89
218 0.88
219 0.86
220 0.86
221 0.85
222 0.84
223 0.8
224 0.76
225 0.72
226 0.71
227 0.67
228 0.63
229 0.61
230 0.55
231 0.49
232 0.46
233 0.42
234 0.39
235 0.38
236 0.4
237 0.35
238 0.36
239 0.36
240 0.33
241 0.36
242 0.34
243 0.32
244 0.29
245 0.31
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.24
250 0.22
251 0.21
252 0.22
253 0.21
254 0.22
255 0.23
256 0.25
257 0.25
258 0.25
259 0.29
260 0.33
261 0.33
262 0.37
263 0.42
264 0.45
265 0.54
266 0.59
267 0.64
268 0.66
269 0.74
270 0.77
271 0.78
272 0.73
273 0.68
274 0.62
275 0.6
276 0.57
277 0.5
278 0.47
279 0.42
280 0.41
281 0.36
282 0.35
283 0.29
284 0.28
285 0.32
286 0.31
287 0.3
288 0.31
289 0.31
290 0.33
291 0.33
292 0.29
293 0.23
294 0.19
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.16
313 0.22
314 0.21
315 0.2
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.11
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.07
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.1
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.13
372 0.1
373 0.09
374 0.11
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.15
380 0.17
381 0.19
382 0.27
383 0.28
384 0.31
385 0.32
386 0.35
387 0.35
388 0.41
389 0.46
390 0.43
391 0.43
392 0.44
393 0.52
394 0.55
395 0.52
396 0.5
397 0.52
398 0.53
399 0.57
400 0.63
401 0.64
402 0.65
403 0.72
404 0.72
405 0.7
406 0.64
407 0.64
408 0.59
409 0.56
410 0.48
411 0.42
412 0.37
413 0.31
414 0.29
415 0.24
416 0.26
417 0.22
418 0.22
419 0.2
420 0.2
421 0.22
422 0.25
423 0.26
424 0.22
425 0.2
426 0.2
427 0.19
428 0.18
429 0.18
430 0.16
431 0.15
432 0.14
433 0.17
434 0.16
435 0.17
436 0.17
437 0.18
438 0.2
439 0.22
440 0.25
441 0.28
442 0.29
443 0.29
444 0.29
445 0.33
446 0.35
447 0.33
448 0.3
449 0.24
450 0.22
451 0.2
452 0.19
453 0.13
454 0.08
455 0.07
456 0.06
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.02
476 0.02
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.01
485 0.01
486 0.02
487 0.02
488 0.02
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.07
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.09
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.03
548 0.03
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.04
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.03
588 0.02
589 0.02
590 0.02
591 0.02
592 0.03
593 0.04
594 0.05
595 0.07
596 0.09
597 0.11
598 0.16
599 0.22
600 0.28
601 0.33
602 0.4
603 0.48
604 0.56
605 0.65
606 0.63
607 0.62
608 0.56
609 0.58
610 0.52
611 0.44
612 0.36
613 0.26
614 0.26
615 0.23
616 0.22
617 0.14
618 0.15
619 0.15
620 0.14
621 0.12
622 0.1
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.03
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.08
645 0.08
646 0.09
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.11
651 0.11
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.12
658 0.11
659 0.12
660 0.14
661 0.14
662 0.16
663 0.23
664 0.28
665 0.36
666 0.47
667 0.56
668 0.63
669 0.71
670 0.76
671 0.8
672 0.84
673 0.86
674 0.84
675 0.81
676 0.79
677 0.76
678 0.72
679 0.62
680 0.54
681 0.45
682 0.36
683 0.29
684 0.21
685 0.16
686 0.1
687 0.1
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.09
692 0.1
693 0.12
694 0.14
695 0.16
696 0.17
697 0.17
698 0.18
699 0.19
700 0.19
701 0.18
702 0.16
703 0.16
704 0.15
705 0.16
706 0.14
707 0.11
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.07
712 0.07
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.07
717 0.07
718 0.1
719 0.14
720 0.16
721 0.2
722 0.29
723 0.36
724 0.46
725 0.55
726 0.62
727 0.66
728 0.7
729 0.71
730 0.68
731 0.62
732 0.57
733 0.57
734 0.49
735 0.42
736 0.37
737 0.32
738 0.27
739 0.27
740 0.22
741 0.13
742 0.14
743 0.15
744 0.2
745 0.19
746 0.19
747 0.2
748 0.21
749 0.21
750 0.19
751 0.23
752 0.18
753 0.19
754 0.19
755 0.16
756 0.17
757 0.16
758 0.17
759 0.14
760 0.23
761 0.3
762 0.34
763 0.39
764 0.46
765 0.52
766 0.61
767 0.69
768 0.68
769 0.65
770 0.7
771 0.75
772 0.77
773 0.75
774 0.67
775 0.65
776 0.66
777 0.71
778 0.71
779 0.72
780 0.73
781 0.76
782 0.82
783 0.86
784 0.86
785 0.87
786 0.87
787 0.86
788 0.83
789 0.83
790 0.83
791 0.83
792 0.77
793 0.68
794 0.62
795 0.54
796 0.47
797 0.43
798 0.34
799 0.25
800 0.22
801 0.19
802 0.16
803 0.14
804 0.13
805 0.11
806 0.16
807 0.2
808 0.21
809 0.24
810 0.28
811 0.31
812 0.34
813 0.37
814 0.36
815 0.36
816 0.41
817 0.46
818 0.47
819 0.49
820 0.53
821 0.52
822 0.48
823 0.44
824 0.37
825 0.33
826 0.35
827 0.34
828 0.32
829 0.33
830 0.32
831 0.33
832 0.36
833 0.34
834 0.28
835 0.24
836 0.2
837 0.21
838 0.2
839 0.18
840 0.14
841 0.17
842 0.19
843 0.2
844 0.19
845 0.16
846 0.18
847 0.19
848 0.21
849 0.18
850 0.19
851 0.19
852 0.19
853 0.2
854 0.18
855 0.17
856 0.15
857 0.13
858 0.1
859 0.08
860 0.09
861 0.13
862 0.15
863 0.15
864 0.15
865 0.16
866 0.19
867 0.19
868 0.19
869 0.18
870 0.27
871 0.28
872 0.29
873 0.3
874 0.33
875 0.34
876 0.34
877 0.3
878 0.21
879 0.21
880 0.21
881 0.25
882 0.24
883 0.29
884 0.29
885 0.29
886 0.3
887 0.29
888 0.28
889 0.26
890 0.24
891 0.19
892 0.19
893 0.18
894 0.18
895 0.18
896 0.18
897 0.16
898 0.14
899 0.12
900 0.11
901 0.11
902 0.13
903 0.15
904 0.15
905 0.13
906 0.19
907 0.22
908 0.22
909 0.23
910 0.21
911 0.19
912 0.18
913 0.19
914 0.13
915 0.11
916 0.13
917 0.12
918 0.14
919 0.18
920 0.26
921 0.32
922 0.42
923 0.49
924 0.57
925 0.68
926 0.77
927 0.84
928 0.87
929 0.91
930 0.91
931 0.93
932 0.93
933 0.92
934 0.91
935 0.9
936 0.87
937 0.87
938 0.81
939 0.78
940 0.78
941 0.75
942 0.67
943 0.67
944 0.63
945 0.6
946 0.63
947 0.64
948 0.66
949 0.67
950 0.73
951 0.74
952 0.73
953 0.69
954 0.68
955 0.64
956 0.6
957 0.53
958 0.46
959 0.35
960 0.32
961 0.31
962 0.23
963 0.17
964 0.11
965 0.09
966 0.11
967 0.11
968 0.11
969 0.11
970 0.11
971 0.12
972 0.11
973 0.14
974 0.14
975 0.18
976 0.19
977 0.19
978 0.19
979 0.25
980 0.32
981 0.37
982 0.43
983 0.47
984 0.57
985 0.61
986 0.66
987 0.64
988 0.62
989 0.64
990 0.67
991 0.64
992 0.59
993 0.6
994 0.56
995 0.55
996 0.52
997 0.42
998 0.34
999 0.3
1000 0.26
1001 0.21
1002 0.21
1003 0.19
1004 0.16
1005 0.16
1006 0.14
1007 0.12
1008 0.11
1009 0.11
1010 0.08
1011 0.07
1012 0.06
1013 0.07
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.15
1017 0.17
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.21
1021 0.24
1022 0.3
1023 0.35
1024 0.35
1025 0.43
1026 0.44
1027 0.46
1028 0.47
1029 0.44
1030 0.41
1031 0.43
1032 0.47
1033 0.45
1034 0.53
1035 0.54
1036 0.55
1037 0.59
1038 0.62
1039 0.6
1040 0.58
1041 0.57
1042 0.56
1043 0.58
1044 0.6
1045 0.66
1046 0.7
1047 0.75
1048 0.76
1049 0.8
1050 0.83
1051 0.86
1052 0.9
1053 0.92
1054 0.92
1055 0.92
1056 0.94
1057 0.92
1058 0.91
1059 0.84
1060 0.78
1061 0.72
1062 0.68
1063 0.61
1064 0.58
1065 0.55
1066 0.55
1067 0.61
1068 0.64
1069 0.69
1070 0.69
1071 0.72
1072 0.71
1073 0.69
1074 0.68
1075 0.68
1076 0.73
1077 0.74
1078 0.78
1079 0.81
1080 0.83