Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GKD8

Protein Details
Accession C1GKD8    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRAKRSKKYRKLMHQYELTFHydrophilic
238-275RPGPVKGKKAKKVKGPNPLSVKKPKSKIKPTSKDDGREBasic
302-331SNAGGEPTGKTKRKRRHKSRKSDKAGEAGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-225VAGKRKR
237-268DRPGPVKGKKAKKVKGPNPLSVKKPKSKIKPT
310-325GKTKRKRRHKSRKSDK
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 7.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
KEGG pbn:PADG_07724  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
Amino Acid Sequences MRAKRSKKYRKLMHQYELTFGFREPYQVLVDSNLLRAIYSFKMDLVPALERTLQGKVKPFITKCSLAAVMASSPPQPNSRPNTRPPHLPPPTILPLRYCSHNEESKTIDEVDCLLSLLSPSSELKKNKEHYILATADPSPASESTASNNRNQQKWKSAATPAQEAPANYLRRGARQIPGVPIIYVKRSVMILEPLSNSSEGVREGVERGKFKAGVTKIVAGKRKRGDDGDDEEAGGDRPGPVKGKKAKKVKGPNPLSVKKPKSKIKPTSKDDGREGEEDRGVGGVEQHPASDFKGADRMEPSNAGGEPTGKTKRKRRHKSRKSDKAGEAGVTQSDEPCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.79
3 0.74
4 0.67
5 0.58
6 0.48
7 0.38
8 0.32
9 0.23
10 0.24
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.19
16 0.18
17 0.21
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.15
25 0.13
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.16
34 0.14
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.23
40 0.23
41 0.23
42 0.3
43 0.31
44 0.35
45 0.42
46 0.41
47 0.42
48 0.45
49 0.45
50 0.39
51 0.4
52 0.35
53 0.28
54 0.27
55 0.21
56 0.16
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.13
61 0.15
62 0.17
63 0.19
64 0.26
65 0.32
66 0.41
67 0.45
68 0.53
69 0.61
70 0.61
71 0.67
72 0.67
73 0.7
74 0.66
75 0.62
76 0.55
77 0.52
78 0.57
79 0.5
80 0.44
81 0.35
82 0.34
83 0.34
84 0.36
85 0.31
86 0.29
87 0.33
88 0.37
89 0.37
90 0.35
91 0.36
92 0.33
93 0.33
94 0.28
95 0.22
96 0.17
97 0.16
98 0.14
99 0.11
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.1
109 0.17
110 0.19
111 0.24
112 0.31
113 0.36
114 0.4
115 0.44
116 0.41
117 0.36
118 0.39
119 0.37
120 0.29
121 0.27
122 0.22
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.1
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.19
133 0.2
134 0.22
135 0.29
136 0.32
137 0.35
138 0.39
139 0.41
140 0.4
141 0.43
142 0.43
143 0.39
144 0.39
145 0.39
146 0.37
147 0.37
148 0.3
149 0.28
150 0.26
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.23
155 0.19
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.26
160 0.24
161 0.21
162 0.23
163 0.25
164 0.23
165 0.24
166 0.23
167 0.19
168 0.19
169 0.17
170 0.14
171 0.13
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.08
192 0.12
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.25
200 0.22
201 0.24
202 0.24
203 0.28
204 0.3
205 0.34
206 0.41
207 0.36
208 0.43
209 0.43
210 0.45
211 0.42
212 0.4
213 0.4
214 0.39
215 0.43
216 0.4
217 0.35
218 0.31
219 0.28
220 0.26
221 0.22
222 0.15
223 0.09
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.12
228 0.14
229 0.22
230 0.32
231 0.41
232 0.5
233 0.59
234 0.64
235 0.7
236 0.8
237 0.8
238 0.81
239 0.78
240 0.77
241 0.77
242 0.75
243 0.73
244 0.71
245 0.71
246 0.69
247 0.72
248 0.72
249 0.73
250 0.79
251 0.82
252 0.83
253 0.86
254 0.83
255 0.85
256 0.83
257 0.79
258 0.73
259 0.68
260 0.6
261 0.53
262 0.5
263 0.42
264 0.36
265 0.3
266 0.25
267 0.19
268 0.15
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.13
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.25
285 0.26
286 0.25
287 0.26
288 0.25
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.22
296 0.3
297 0.34
298 0.43
299 0.51
300 0.62
301 0.71
302 0.81
303 0.85
304 0.88
305 0.92
306 0.95
307 0.96
308 0.97
309 0.96
310 0.94
311 0.89
312 0.85
313 0.77
314 0.68
315 0.58
316 0.49
317 0.4
318 0.32
319 0.26