FuNGI

A0A168LCY2

Protein Details

Accession

A0A168LCY2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-79	QGNNDKRRQGNYNNKRQRKQHDNDKPVATK	Hydrophilic
102-129	IDNKPNKPSTKSKQNRPSNDKNHSKTSS	Hydrophilic
293-329	RQEKTYLEKQSRKRKDKPASKKATRRRPNSTKTRLSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
211-216	KAAKRK
302-321	QSRKRKDKPASKKATRRRPN

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MNLRSRDNNNNSSKVVSKPATAMVPPSSTPNTRQKRSLGTPIAIPTSDDQGNNDKRRQGNYNNKRQRKQHDNDKPVATKSSLRLQQKKRAATLAPGENPKCIDNKPNKPSTKSKQNRPSNDKNHSKTSSKQDTVTKVTRRSSARNGKTKKTAPLTAPQLDLPSQTSTVVPTQQQPSEQQPPEQQPSEQQPSEQQPSEQQPTQQQPAQQQKKAAKRKGDSDKTQSNTKKTKIELPKLVLPKKHIIREMRPAPSLPEMQAPAALLKGHILCPYCHTDLDLKKSRILTKALDDIQRQEKTYLEKQSRKRKDKPASKKATRRRPNSTKTRLSFCHLHRLELEIKPIGEKEGWPTTIDFDRLKQRIPHFKPDLDSIIANELESSYRLKALAAYKEMGKNKARSTMGVMSRFDLVMPGYYGAKGASVIQKQLSDMYLLSGILTTINTAPQTPMEYLQHVLTPEVGFRLIREDLIKNGTLKKKDPDLDQQILLWICVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.48
3	0.41
4	0.36
5	0.33
6	0.36
7	0.35
8	0.32
9	0.32
10	0.27
11	0.28
12	0.26
13	0.29
14	0.3
15	0.3
16	0.36
17	0.43
18	0.49
19	0.52
20	0.57
21	0.57
22	0.61
23	0.65
24	0.69
25	0.65
26	0.57
27	0.57
28	0.54
29	0.52
30	0.42
31	0.36
32	0.28
33	0.26
34	0.27
35	0.22
36	0.22
37	0.29
38	0.38
39	0.43
40	0.46
41	0.48
42	0.5
43	0.55
44	0.6
45	0.61
46	0.63
47	0.68
48	0.75
49	0.79
50	0.84
51	0.87
52	0.88
53	0.87
54	0.87
55	0.86
56	0.86
57	0.86
58	0.84
59	0.84
60	0.83
61	0.77
62	0.68
63	0.62
64	0.53
65	0.47
66	0.42
67	0.44
68	0.43
69	0.49
70	0.56
71	0.61
72	0.68
73	0.72
74	0.74
75	0.68
76	0.66
77	0.58
78	0.54
79	0.54
80	0.52
81	0.49
82	0.51
83	0.48
84	0.44
85	0.44
86	0.39
87	0.34
88	0.29
89	0.33
90	0.35
91	0.45
92	0.52
93	0.6
94	0.64
95	0.67
96	0.75
97	0.75
98	0.76
99	0.75
100	0.77
101	0.78
102	0.83
103	0.88
104	0.87
105	0.88
106	0.87
107	0.88
108	0.87
109	0.82
110	0.8
111	0.75
112	0.7
113	0.66
114	0.66
115	0.66
116	0.58
117	0.58
118	0.55
119	0.56
120	0.59
121	0.6
122	0.56
123	0.52
124	0.53
125	0.55
126	0.53
127	0.54
128	0.57
129	0.59
130	0.62
131	0.66
132	0.69
133	0.69
134	0.73
135	0.72
136	0.7
137	0.65
138	0.61
139	0.54
140	0.56
141	0.56
142	0.5
143	0.47
144	0.39
145	0.34
146	0.29
147	0.27
148	0.21
149	0.15
150	0.13
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.15
156	0.14
157	0.17
158	0.2
159	0.2
160	0.22
161	0.23
162	0.28
163	0.35
164	0.34
165	0.33
166	0.35
167	0.4
168	0.43
169	0.42
170	0.35
171	0.31
172	0.37
173	0.41
174	0.35
175	0.3
176	0.3
177	0.34
178	0.39
179	0.35
180	0.28
181	0.26
182	0.31
183	0.36
184	0.32
185	0.29
186	0.3
187	0.34
188	0.38
189	0.34
190	0.32
191	0.35
192	0.45
193	0.5
194	0.46
195	0.47
196	0.51
197	0.59
198	0.66
199	0.64
200	0.61
201	0.57
202	0.64
203	0.69
204	0.69
205	0.65
206	0.63
207	0.64
208	0.59
209	0.65
210	0.59
211	0.56
212	0.54
213	0.52
214	0.49
215	0.44
216	0.5
217	0.5
218	0.54
219	0.52
220	0.49
221	0.52
222	0.54
223	0.56
224	0.49
225	0.44
226	0.44
227	0.43
228	0.43
229	0.42
230	0.39
231	0.4
232	0.48
233	0.5
234	0.45
235	0.42
236	0.38
237	0.35
238	0.33
239	0.29
240	0.21
241	0.17
242	0.15
243	0.14
244	0.14
245	0.12
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.13
257	0.18
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.22
262	0.24
263	0.32
264	0.38
265	0.34
266	0.35
267	0.38
268	0.4
269	0.38
270	0.37
271	0.3
272	0.25
273	0.3
274	0.31
275	0.32
276	0.3
277	0.31
278	0.35
279	0.35
280	0.32
281	0.27
282	0.26
283	0.28
284	0.33
285	0.38
286	0.39
287	0.45
288	0.53
289	0.64
290	0.72
291	0.75
292	0.78
293	0.8
294	0.83
295	0.86
296	0.88
297	0.88
298	0.88
299	0.89
300	0.9
301	0.89
302	0.9
303	0.89
304	0.85
305	0.85
306	0.84
307	0.84
308	0.85
309	0.85
310	0.83
311	0.77
312	0.76
313	0.68
314	0.63
315	0.62
316	0.53
317	0.55
318	0.45
319	0.43
320	0.37
321	0.39
322	0.39
323	0.32
324	0.33
325	0.23
326	0.23
327	0.22
328	0.21
329	0.19
330	0.14
331	0.13
332	0.15
333	0.18
334	0.19
335	0.19
336	0.19
337	0.21
338	0.22
339	0.25
340	0.2
341	0.19
342	0.28
343	0.28
344	0.32
345	0.34
346	0.4
347	0.48
348	0.53
349	0.6
350	0.56
351	0.58
352	0.57
353	0.55
354	0.5
355	0.41
356	0.36
357	0.27
358	0.25
359	0.21
360	0.19
361	0.14
362	0.11
363	0.1
364	0.11
365	0.12
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.14
371	0.19
372	0.24
373	0.24
374	0.26
375	0.29
376	0.35
377	0.39
378	0.4
379	0.41
380	0.41
381	0.41
382	0.47
383	0.44
384	0.39
385	0.43
386	0.45
387	0.46
388	0.46
389	0.44
390	0.37
391	0.37
392	0.35
393	0.28
394	0.2
395	0.14
396	0.1
397	0.11
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.11
406	0.17
407	0.18
408	0.2
409	0.22
410	0.23
411	0.23
412	0.24
413	0.22
414	0.16
415	0.14
416	0.13
417	0.12
418	0.11
419	0.11
420	0.09
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.16
432	0.16
433	0.19
434	0.2
435	0.22
436	0.23
437	0.23
438	0.24
439	0.21
440	0.2
441	0.18
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.15
446	0.12
447	0.12
448	0.17
449	0.15
450	0.17
451	0.2
452	0.2
453	0.23
454	0.28
455	0.3
456	0.28
457	0.36
458	0.42
459	0.44
460	0.47
461	0.5
462	0.55
463	0.58
464	0.61
465	0.63
466	0.64
467	0.64
468	0.6
469	0.53
470	0.49
471	0.44

A0A168LCY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer