Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168RPH4

Protein Details
Accession A0A168RPH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-429FTISVAKSNRRSRKSHNKKSLKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-429SNRRSRKSHNKKSLKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 16, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045124  Su(sable)-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDKAPPSSGPSSLLPHLFSPPYQQEQQHCDRTLTSQLFAPFDTNTDMDTTLKDDYDLDELSALLSRQLLQEVDAEFVPSNNSNAYSLNYTQSESTTAVTAVTGSPWFLDDDEKTNNSQSPSFSDSTAFTLLSPPLSQKQRHQDSNSTNLTFDHNNNGYSSDSTTSSSTVATLATTAAAAAWWDQFGPYGNDSEFDPTLSFYQGEDDGDLCFTATTIAPILNSNNSNTMMSSPSPVDDGSNNTAALTEMMKLFKGLDEKELGETFAAFDYDTERTIEALLSTRAISFTTATTTASTTAMENPYQQSVSTFGAPKKHQVCRHYLAGECYRKHCRFAHDLKVKPCKFWIQGSCLKGDTCEFAHSLDCLKPPSSPDNTTTINSRPPSDQHYREYEEVEHQYHRTPPTMADFTISVAKSNRRSRKSHNKKSLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.31
4 0.29
5 0.27
6 0.3
7 0.32
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.45
12 0.52
13 0.6
14 0.6
15 0.56
16 0.51
17 0.47
18 0.46
19 0.48
20 0.43
21 0.35
22 0.31
23 0.32
24 0.31
25 0.3
26 0.28
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.1
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.16
81 0.16
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.1
96 0.1
97 0.14
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.24
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.21
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.22
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.18
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.17
122 0.23
123 0.25
124 0.3
125 0.41
126 0.48
127 0.54
128 0.57
129 0.58
130 0.58
131 0.64
132 0.62
133 0.52
134 0.44
135 0.38
136 0.36
137 0.3
138 0.26
139 0.25
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.04
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.16
295 0.18
296 0.19
297 0.26
298 0.27
299 0.35
300 0.39
301 0.45
302 0.49
303 0.5
304 0.56
305 0.54
306 0.59
307 0.54
308 0.48
309 0.47
310 0.5
311 0.52
312 0.47
313 0.47
314 0.51
315 0.49
316 0.52
317 0.5
318 0.48
319 0.5
320 0.55
321 0.61
322 0.6
323 0.65
324 0.69
325 0.76
326 0.7
327 0.62
328 0.59
329 0.55
330 0.5
331 0.51
332 0.49
333 0.46
334 0.52
335 0.52
336 0.51
337 0.45
338 0.41
339 0.33
340 0.28
341 0.24
342 0.18
343 0.18
344 0.16
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.19
353 0.2
354 0.23
355 0.3
356 0.33
357 0.34
358 0.35
359 0.37
360 0.4
361 0.4
362 0.4
363 0.36
364 0.37
365 0.36
366 0.36
367 0.33
368 0.34
369 0.4
370 0.45
371 0.47
372 0.46
373 0.52
374 0.54
375 0.53
376 0.53
377 0.47
378 0.45
379 0.44
380 0.41
381 0.37
382 0.32
383 0.34
384 0.37
385 0.37
386 0.33
387 0.29
388 0.29
389 0.34
390 0.36
391 0.33
392 0.3
393 0.27
394 0.26
395 0.32
396 0.29
397 0.23
398 0.24
399 0.31
400 0.38
401 0.48
402 0.56
403 0.57
404 0.64
405 0.72
406 0.79
407 0.83
408 0.85
409 0.86