Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168SHC1

Protein Details
Accession A0A168SHC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-117DMVDQFRIKRPSRKTRPPTPSSNSSSHydrophilic
993-1016DVYLRDVMRSRRKNTNPRTRGDYNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027539  Mdm10  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0070096  P:mitochondrial outer membrane translocase complex assembly  
GO:1990456  P:mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering  
GO:0045040  P:protein insertion into mitochondrial outer membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF12519  MDM10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MYDFMEYCLRCYYRSSGWNEENQYSNLCSWSRTLLDFYTPRGLSLHLAKLPTPQFKPSYTMNALPSLNGSIGYLFTSEALDIGTSGTVDFQDMVDQFRIKRPSRKTRPPTPSSNSSSSSSSKNYLVYGRMFFPGAALETMYVRRLSPQLQYLITAVNHPRDSGLPQMAFQLQYDVGKWCSECSYTTDDGLLGIRALYNFGKPLEEGHGQWSLGTEVYYGTLDKSGGLSTGLRYRTNPSSSSTTTPINVTYTLNPIVGHMTTAYVAQVSENLSMCSRFEFSIYSYESDLAVGFEYQAKNANVTLPKSSSKAVTTGDQRSSIEGNSSTTENDKSTATTTKTLEGLMKVRLGFASGLALMWEGRYKNTLFSVGLTADLTNPSNPIRTMGAEVVKDWYGRLDFGYVLGQIIPAAEGGRKMKXXXXMTSPSPFTFFEFSPCSGCRTDRHPDMFIGRRRTYRTCSVCRLRQTVPAIAPTFDDMVFLSDLPLDATFFSQGTETHFEVDIFMNDDMMDLDDDALVKTIFDTIERQTGGRNFAVEEFQAYARRIHYGSTYEMYLYCQNNDLPDTWAFLWRNWYTHEKWKLWARSTTMEIPSGKSTMLVESHWRVLKRNHLYHHNRPRLDLLCFVIINNYCTDLIHTYQQKVVLRRDLLAWESEFVKEWNALHRRSIDVPRHNYLTNYNQWVCNCPYFYSSRFLLCKHIVRLSGLGFIARHQFFIKRNVQPPFVELREVSIHIQRVQRETRYLRYPTKTTLVSWATIPTSIRSTPPIADKTERMVDSATPPPTPPTPTPSTPLPSTLSIPPPPLPPTPPTPLHSLITSLLHYPTTYNHPTHLTLNTHRPTPSPTLPPXXXXPNTTTTTDNPPFLNNLSPTFSDYLRSPTPFDLQNPSPIAQPDTTTTTTDNSPFLNDLPQSPPTALPNHSPYQPPFRSIDEQTARDMEGMMLEHRRRKRQIAAEQEELQRRMAVLNGRMQEEDLEEERCAARYMQNIPQPQVEVFRNADRDVYLRDVMRSRRKNTNPRTRGDYNPMTENL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.49
4 0.54
5 0.61
6 0.62
7 0.6
8 0.56
9 0.5
10 0.46
11 0.38
12 0.34
13 0.3
14 0.25
15 0.23
16 0.21
17 0.24
18 0.24
19 0.23
20 0.26
21 0.23
22 0.31
23 0.31
24 0.34
25 0.37
26 0.35
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.27
31 0.31
32 0.34
33 0.28
34 0.3
35 0.3
36 0.37
37 0.42
38 0.46
39 0.43
40 0.42
41 0.43
42 0.44
43 0.47
44 0.44
45 0.47
46 0.43
47 0.45
48 0.42
49 0.43
50 0.41
51 0.37
52 0.34
53 0.27
54 0.22
55 0.17
56 0.15
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.1
79 0.11
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.26
85 0.35
86 0.37
87 0.45
88 0.53
89 0.61
90 0.7
91 0.8
92 0.82
93 0.84
94 0.89
95 0.87
96 0.87
97 0.84
98 0.82
99 0.78
100 0.74
101 0.67
102 0.59
103 0.56
104 0.49
105 0.45
106 0.4
107 0.36
108 0.32
109 0.3
110 0.3
111 0.29
112 0.3
113 0.29
114 0.28
115 0.27
116 0.26
117 0.25
118 0.22
119 0.19
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.21
134 0.26
135 0.28
136 0.28
137 0.29
138 0.27
139 0.28
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.26
144 0.25
145 0.24
146 0.25
147 0.23
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.23
152 0.23
153 0.26
154 0.26
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.15
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.14
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.2
220 0.25
221 0.3
222 0.33
223 0.32
224 0.31
225 0.35
226 0.37
227 0.4
228 0.37
229 0.33
230 0.31
231 0.3
232 0.27
233 0.22
234 0.2
235 0.18
236 0.16
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.17
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.2
287 0.2
288 0.21
289 0.24
290 0.21
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.22
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.22
299 0.26
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.29
304 0.29
305 0.28
306 0.23
307 0.19
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.19
329 0.19
330 0.16
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.11
337 0.09
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.14
404 0.19
405 0.23
406 0.26
407 0.31
408 0.31
409 0.34
410 0.35
411 0.33
412 0.29
413 0.25
414 0.25
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.19
419 0.2
420 0.19
421 0.2
422 0.19
423 0.22
424 0.28
425 0.31
426 0.34
427 0.33
428 0.33
429 0.37
430 0.42
431 0.43
432 0.44
433 0.4
434 0.4
435 0.43
436 0.45
437 0.45
438 0.47
439 0.48
440 0.46
441 0.52
442 0.56
443 0.57
444 0.58
445 0.58
446 0.5
447 0.49
448 0.47
449 0.42
450 0.35
451 0.34
452 0.3
453 0.25
454 0.24
455 0.18
456 0.16
457 0.12
458 0.11
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.08
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.07
506 0.07
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.14
512 0.17
513 0.15
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.09
522 0.11
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.13
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.16
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.13
548 0.12
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.22
553 0.2
554 0.21
555 0.22
556 0.26
557 0.24
558 0.33
559 0.4
560 0.35
561 0.39
562 0.46
563 0.48
564 0.47
565 0.47
566 0.42
567 0.37
568 0.4
569 0.39
570 0.33
571 0.31
572 0.27
573 0.26
574 0.23
575 0.21
576 0.17
577 0.13
578 0.12
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.11
583 0.12
584 0.16
585 0.19
586 0.19
587 0.2
588 0.23
589 0.32
590 0.37
591 0.41
592 0.41
593 0.49
594 0.57
595 0.65
596 0.73
597 0.72
598 0.64
599 0.59
600 0.6
601 0.53
602 0.46
603 0.38
604 0.29
605 0.22
606 0.22
607 0.2
608 0.19
609 0.16
610 0.16
611 0.13
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.12
616 0.1
617 0.11
618 0.16
619 0.18
620 0.18
621 0.19
622 0.24
623 0.26
624 0.29
625 0.31
626 0.31
627 0.29
628 0.29
629 0.29
630 0.26
631 0.23
632 0.21
633 0.17
634 0.13
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.17
643 0.21
644 0.22
645 0.24
646 0.26
647 0.27
648 0.31
649 0.38
650 0.38
651 0.42
652 0.46
653 0.47
654 0.48
655 0.46
656 0.42
657 0.39
658 0.37
659 0.33
660 0.34
661 0.32
662 0.32
663 0.32
664 0.36
665 0.34
666 0.31
667 0.27
668 0.21
669 0.23
670 0.23
671 0.25
672 0.25
673 0.23
674 0.25
675 0.26
676 0.26
677 0.29
678 0.3
679 0.33
680 0.32
681 0.34
682 0.3
683 0.3
684 0.31
685 0.25
686 0.23
687 0.18
688 0.16
689 0.13
690 0.13
691 0.18
692 0.16
693 0.17
694 0.15
695 0.19
696 0.22
697 0.3
698 0.37
699 0.38
700 0.44
701 0.47
702 0.5
703 0.46
704 0.46
705 0.44
706 0.37
707 0.32
708 0.25
709 0.24
710 0.23
711 0.24
712 0.22
713 0.19
714 0.21
715 0.23
716 0.27
717 0.26
718 0.3
719 0.32
720 0.33
721 0.37
722 0.39
723 0.41
724 0.45
725 0.49
726 0.5
727 0.52
728 0.52
729 0.49
730 0.5
731 0.45
732 0.38
733 0.4
734 0.34
735 0.3
736 0.27
737 0.25
738 0.21
739 0.21
740 0.21
741 0.14
742 0.16
743 0.16
744 0.16
745 0.17
746 0.19
747 0.2
748 0.26
749 0.27
750 0.28
751 0.3
752 0.31
753 0.33
754 0.37
755 0.34
756 0.29
757 0.26
758 0.24
759 0.25
760 0.29
761 0.26
762 0.21
763 0.21
764 0.24
765 0.25
766 0.29
767 0.26
768 0.27
769 0.32
770 0.33
771 0.37
772 0.38
773 0.4
774 0.36
775 0.37
776 0.33
777 0.29
778 0.3
779 0.3
780 0.31
781 0.28
782 0.3
783 0.29
784 0.29
785 0.31
786 0.3
787 0.29
788 0.28
789 0.32
790 0.35
791 0.38
792 0.37
793 0.39
794 0.4
795 0.38
796 0.35
797 0.31
798 0.27
799 0.24
800 0.22
801 0.18
802 0.15
803 0.14
804 0.14
805 0.12
806 0.13
807 0.19
808 0.23
809 0.22
810 0.24
811 0.27
812 0.29
813 0.31
814 0.34
815 0.32
816 0.33
817 0.42
818 0.42
819 0.42
820 0.4
821 0.39
822 0.39
823 0.4
824 0.41
825 0.39
826 0.44
827 0.51
828 0.53
829 0.56
830 0.55
831 0.53
832 0.5
833 0.47
834 0.45
835 0.39
836 0.46
837 0.44
838 0.42
839 0.37
840 0.35
841 0.33
842 0.29
843 0.3
844 0.23
845 0.23
846 0.24
847 0.24
848 0.25
849 0.25
850 0.24
851 0.21
852 0.2
853 0.24
854 0.25
855 0.26
856 0.26
857 0.26
858 0.3
859 0.3
860 0.32
861 0.34
862 0.31
863 0.36
864 0.37
865 0.35
866 0.34
867 0.33
868 0.33
869 0.26
870 0.26
871 0.22
872 0.25
873 0.26
874 0.24
875 0.24
876 0.23
877 0.25
878 0.25
879 0.23
880 0.18
881 0.18
882 0.18
883 0.18
884 0.2
885 0.19
886 0.2
887 0.22
888 0.24
889 0.23
890 0.23
891 0.25
892 0.23
893 0.27
894 0.26
895 0.28
896 0.32
897 0.34
898 0.36
899 0.39
900 0.4
901 0.46
902 0.46
903 0.43
904 0.4
905 0.43
906 0.45
907 0.43
908 0.5
909 0.46
910 0.45
911 0.45
912 0.43
913 0.38
914 0.32
915 0.3
916 0.19
917 0.14
918 0.14
919 0.13
920 0.19
921 0.23
922 0.31
923 0.38
924 0.47
925 0.51
926 0.57
927 0.64
928 0.67
929 0.72
930 0.75
931 0.75
932 0.73
933 0.74
934 0.74
935 0.71
936 0.62
937 0.53
938 0.42
939 0.35
940 0.29
941 0.27
942 0.26
943 0.23
944 0.29
945 0.32
946 0.33
947 0.33
948 0.33
949 0.29
950 0.25
951 0.26
952 0.21
953 0.2
954 0.18
955 0.19
956 0.2
957 0.19
958 0.19
959 0.16
960 0.17
961 0.21
962 0.27
963 0.33
964 0.39
965 0.43
966 0.44
967 0.46
968 0.44
969 0.4
970 0.41
971 0.35
972 0.33
973 0.32
974 0.35
975 0.35
976 0.34
977 0.34
978 0.29
979 0.29
980 0.28
981 0.29
982 0.27
983 0.26
984 0.29
985 0.35
986 0.43
987 0.51
988 0.56
989 0.57
990 0.64
991 0.73
992 0.8
993 0.84
994 0.86
995 0.83
996 0.81
997 0.84
998 0.79
999 0.77
1000 0.75
1001 0.73
1002 0.66