Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A168SHC1

Protein Details
Accession A0A168SHC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-117DMVDQFRIKRPSRKTRPPTPSSNSSSHydrophilic
993-1016DVYLRDVMRSRRKNTNPRTRGDYNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027539  Mdm10  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0070096  P:mitochondrial outer membrane translocase complex assembly  
GO:1990456  P:mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering  
GO:0045040  P:protein insertion into mitochondrial outer membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF12519  MDM10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MYDFMEYCLRCYYRSSGWNEENQYSNLCSWSRTLLDFYTPRGLSLHLAKLPTPQFKPSYTMNALPSLNGSIGYLFTSEALDIGTSGTVDFQDMVDQFRIKRPSRKTRPPTPSSNSSSSSSSKNYLVYGRMFFPGAALETMYVRRLSPQLQYLITAVNHPRDSGLPQMAFQLQYDVGKWCSECSYTTDDGLLGIRALYNFGKPLEEGHGQWSLGTEVYYGTLDKSGGLSTGLRYRTNPSSSSTTTPINVTYTLNPIVGHMTTAYVAQVSENLSMCSRFEFSIYSYESDLAVGFEYQAKNANVTLPKSSSKAVTTGDQRSSIEGNSSTTENDKSTATTTKTLEGLMKVRLGFASGLALMWEGRYKNTLFSVGLTADLTNPSNPIRTMGAEVVKDWYGRLDFGYVLGQIIPAAEGGRKMKXXXXMTSPSPFTFFEFSPCSGCRTDRHPDMFIGRRRTYRTCSVCRLRQTVPAIAPTFDDMVFLSDLPLDATFFSQGTETHFEVDIFMNDDMMDLDDDALVKTIFDTIERQTGGRNFAVEEFQAYARRIHYGSTYEMYLYCQNNDLPDTWAFLWRNWYTHEKWKLWARSTTMEIPSGKSTMLVESHWRVLKRNHLYHHNRPRLDLLCFVIINNYCTDLIHTYQQKVVLRRDLLAWESEFVKEWNALHRRSIDVPRHNYLTNYNQWVCNCPYFYSSRFLLCKHIVRLSGLGFIARHQFFIKRNVQPPFVELREVSIHIQRVQRETRYLRYPTKTTLVSWATIPTSIRSTPPIADKTERMVDSATPPPTPPTPTPSTPLPSTLSIPPPPLPPTPPTPLHSLITSLLHYPTTYNHPTHLTLNTHRPTPSPTLPPXXXXPNTTTTTDNPPFLNNLSPTFSDYLRSPTPFDLQNPSPIAQPDTTTTTTDNSPFLNDLPQSPPTALPNHSPYQPPFRSIDEQTARDMEGMMLEHRRRKRQIAAEQEELQRRMAVLNGRMQEEDLEEERCAARYMQNIPQPQVEVFRNADRDVYLRDVMRSRRKNTNPRTRGDYNPMTENL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.49
4 0.54
5 0.61
6 0.62
7 0.6
8 0.56
9 0.5
10 0.46
11 0.38
12 0.34
13 0.3
14 0.25
15 0.23
16 0.21
17 0.24
18 0.24
19 0.23
20 0.26
21 0.23
22 0.31
23 0.31
24 0.34
25 0.37
26 0.35
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.27
31 0.31
32 0.34
33 0.28
34 0.3
35 0.3
36 0.37
37 0.42
38 0.46
39 0.43
40 0.42
41 0.43
42 0.44
43 0.47
44 0.44
45 0.47
46 0.43
47 0.45
48 0.42
49 0.43
50 0.41
51 0.37
52 0.34
53 0.27
54 0.22
55 0.17
56 0.15
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.1
79 0.11
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.26
85 0.35
86 0.37
87 0.45
88 0.53
89 0.61
90 0.7
91 0.8
92 0.82
93 0.84
94 0.89
95 0.87
96 0.87
97 0.84
98 0.82
99 0.78
100 0.74
101 0.67
102 0.59
103 0.56
104 0.49
105 0.45
106 0.4
107 0.36
108 0.32
109 0.3
110 0.3
111 0.29
112 0.3
113 0.29
114 0.28
115 0.27
116 0.26
117 0.25
118 0.22
119 0.19
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.21
134 0.26
135 0.28
136 0.28
137 0.29
138 0.27
139 0.28
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.26
144 0.25
145 0.24
146 0.25
147 0.23
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.23
152 0.23
153 0.26
154 0.26
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.15
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.14
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.2
220 0.25
221 0.3
222 0.33
223 0.32
224 0.31
225 0.35
226 0.37
227 0.4
228 0.37
229 0.33
230 0.31
231 0.3
232 0.27
233 0.22
234 0.2
235 0.18
236 0.16
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.17
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.2
287 0.2
288 0.21
289 0.24
290 0.21
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.22
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.22
299 0.26
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.29
304 0.29
305 0.28
306 0.23
307 0.19
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.19
329 0.19
330 0.16
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.11
337 0.09
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.14
404 0.19
405 0.23
406 0.26
407 0.31
408 0.31
409 0.34
410 0.35
411 0.33
412 0.29
413 0.25
414 0.25
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.19
419 0.2
420 0.19
421 0.2
422 0.19
423 0.22
424 0.28
425 0.31
426 0.34
427 0.33
428 0.33
429 0.37
430 0.42
431 0.43
432 0.44
433 0.4
434 0.4
435 0.43
436 0.45
437 0.45
438 0.47
439 0.48
440 0.46
441 0.52
442 0.56
443 0.57
444 0.58
445 0.58
446 0.5
447 0.49
448 0.47
449 0.42
450 0.35
451 0.34
452 0.3
453 0.25
454 0.24
455 0.18
456 0.16
457 0.12
458 0.11
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.08
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.07
506 0.07
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.14
512 0.17
513 0.15
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.09
522 0.11
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.13
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.16
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.13
548 0.12
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.22
553 0.2
554 0.21
555 0.22
556 0.26
557 0.24
558 0.33
559 0.4
560 0.35
561 0.39
562 0.46
563 0.48
564 0.47
565 0.47
566 0.42
567 0.37
568 0.4
569 0.39
570 0.33
571 0.31
572 0.27
573 0.26
574 0.23
575 0.21
576 0.17
577 0.13
578 0.12
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.11
583 0.12
584 0.16
585 0.19
586 0.19
587 0.2
588 0.23
589 0.32
590 0.37
591 0.41
592 0.41
593 0.49
594 0.57
595 0.65
596 0.73
597 0.72
598 0.64
599 0.59
600 0.6
601 0.53
602 0.46
603 0.38
604 0.29
605 0.22
606 0.22
607 0.2
608 0.19
609 0.16
610 0.16
611 0.13
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.12
616 0.1
617 0.11
618 0.16
619 0.18
620 0.18
621 0.19
622 0.24
623 0.26
624 0.29
625 0.31
626 0.31
627 0.29
628 0.29
629 0.29
630 0.26
631 0.23
632 0.21
633 0.17
634 0.13
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.17
643 0.21
644 0.22
645 0.24
646 0.26
647 0.27
648 0.31
649 0.38
650 0.38
651 0.42
652 0.46
653 0.47
654 0.48
655 0.46
656 0.42
657 0.39
658 0.37
659 0.33
660 0.34
661 0.32
662 0.32
663 0.32
664 0.36
665 0.34
666 0.31
667 0.27
668 0.21
669 0.23
670 0.23
671 0.25
672 0.25
673 0.23
674 0.25
675 0.26
676 0.26
677 0.29
678 0.3
679 0.33
680 0.32
681 0.34
682 0.3
683 0.3
684 0.31
685 0.25
686 0.23
687 0.18
688 0.16
689 0.13
690 0.13
691 0.18
692 0.16
693 0.17
694 0.15
695 0.19
696 0.22
697 0.3
698 0.37
699 0.38
700 0.44
701 0.47
702 0.5
703 0.46
704 0.46
705 0.44
706 0.37
707 0.32
708 0.25
709 0.24
710 0.23
711 0.24
712 0.22
713 0.19
714 0.21
715 0.23
716 0.27
717 0.26
718 0.3
719 0.32
720 0.33
721 0.37
722 0.39
723 0.41
724 0.45
725 0.49
726 0.5
727 0.52
728 0.52
729 0.49
730 0.5
731 0.45
732 0.38
733 0.4
734 0.34
735 0.3
736 0.27
737 0.25
738 0.21
739 0.21
740 0.21
741 0.14
742 0.16
743 0.16
744 0.16
745 0.17
746 0.19
747 0.2
748 0.26
749 0.27
750 0.28
751 0.3
752 0.31
753 0.33
754 0.37
755 0.34
756 0.29
757 0.26
758 0.24
759 0.25
760 0.29
761 0.26
762 0.21
763 0.21
764 0.24
765 0.25
766 0.29
767 0.26
768 0.27
769 0.32
770 0.33
771 0.37
772 0.38
773 0.4
774 0.36
775 0.37
776 0.33
777 0.29
778 0.3
779 0.3
780 0.31
781 0.28
782 0.3
783 0.29
784 0.29
785 0.31
786 0.3
787 0.29
788 0.28
789 0.32
790 0.35
791 0.38
792 0.37
793 0.39
794 0.4
795 0.38
796 0.35
797 0.31
798 0.27
799 0.24
800 0.22
801 0.18
802 0.15
803 0.14
804 0.14
805 0.12
806 0.13
807 0.19
808 0.23
809 0.22
810 0.24
811 0.27
812 0.29
813 0.31
814 0.34
815 0.32
816 0.33
817 0.42
818 0.42
819 0.42
820 0.4
821 0.39
822 0.39
823 0.4
824 0.41
825 0.39
826 0.44
827 0.51
828 0.53
829 0.56
830 0.55
831 0.53
832 0.5
833 0.47
834 0.45
835 0.39
836 0.46
837 0.44
838 0.42
839 0.37
840 0.35
841 0.33
842 0.29
843 0.3
844 0.23
845 0.23
846 0.24
847 0.24
848 0.25
849 0.25
850 0.24
851 0.21
852 0.2
853 0.24
854 0.25
855 0.26
856 0.26
857 0.26
858 0.3
859 0.3
860 0.32
861 0.34
862 0.31
863 0.36
864 0.37
865 0.35
866 0.34
867 0.33
868 0.33
869 0.26
870 0.26
871 0.22
872 0.25
873 0.26
874 0.24
875 0.24
876 0.23
877 0.25
878 0.25
879 0.23
880 0.18
881 0.18
882 0.18
883 0.18
884 0.2
885 0.19
886 0.2
887 0.22
888 0.24
889 0.23
890 0.23
891 0.25
892 0.23
893 0.27
894 0.26
895 0.28
896 0.32
897 0.34
898 0.36
899 0.39
900 0.4
901 0.46
902 0.46
903 0.43
904 0.4
905 0.43
906 0.45
907 0.43
908 0.5
909 0.46
910 0.45
911 0.45
912 0.43
913 0.38
914 0.32
915 0.3
916 0.19
917 0.14
918 0.14
919 0.13
920 0.19
921 0.23
922 0.31
923 0.38
924 0.47
925 0.51
926 0.57
927 0.64
928 0.67
929 0.72
930 0.75
931 0.75
932 0.73
933 0.74
934 0.74
935 0.71
936 0.62
937 0.53
938 0.42
939 0.35
940 0.29
941 0.27
942 0.26
943 0.23
944 0.29
945 0.32
946 0.33
947 0.33
948 0.33
949 0.29
950 0.25
951 0.26
952 0.21
953 0.2
954 0.18
955 0.19
956 0.2
957 0.19
958 0.19
959 0.16
960 0.17
961 0.21
962 0.27
963 0.33
964 0.39
965 0.43
966 0.44
967 0.46
968 0.44
969 0.4
970 0.41
971 0.35
972 0.33
973 0.32
974 0.35
975 0.35
976 0.34
977 0.34
978 0.29
979 0.29
980 0.28
981 0.29
982 0.27
983 0.26
984 0.29
985 0.35
986 0.43
987 0.51
988 0.56
989 0.57
990 0.64
991 0.73
992 0.8
993 0.84
994 0.86
995 0.83
996 0.81
997 0.84
998 0.79
999 0.77
1000 0.75
1001 0.73
1002 0.66