FuNGI

C1GD74

Protein Details

Accession

C1GD74

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
46-75	VESNNTKGGRGDRKNKRKDLGRKAWSREIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
52-91	KGGRGDRKNKRKDLGRKAWSREITDKRARTEASQEAKRRK
116-120	RRPKR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR041708 PUS1/PUS2-like IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0043231 C:intracellular membrane-bounded organelle GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0031119 P:tRNA pseudouridine synthesis
KEGG	pbn:PADG_05210 -
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1
CDD	cd02568 PseudoU_synth_PUS1_PUS2

Amino Acid Sequences

MDMQQLPPDSTVSSNAAPNQATPNQVPSKDQELSESSPAVNSERNVESNNTKGGRGDRKNKRKDLGRKAWSREITDKRARTEASQEAKRRKLEQGEKALPIYATEFSKEDIEADKRRPKRKVAVLLGYSGSGYHGMQLSQTEKTIEGDLFTAFVAAGAISKANATDPKKSSLVRCARTDKGVHAAGNVVSLKLIVEDSDVVQKINNHLSPQIRVWGIEVTNKSFSSYQLCDSRVYEYLIPTHCFLPPHPSTYLGQKLVEIAEMENDLEGYNQRQAEVATYWEKVDEEYIKPILERMPEATRMRVQQALMVKSNTKSADNSGSHGEQNQPDPAPETNDAPASNNETLNKINENTETKDADPEELQAVTNNEAIRAIRAAYLEAKRAYRIPKERIDRINDALDLYVGTRNFHNYTIQKSFREASAKRHIKSFKISRDPIIINGTEWLSLKVHGQSFMMHQIRKMVAMVAMVVRCGCDIQRIPETYGDQKIAIPKAPGLGLLLERPIFDSYNKRTVAEYGKNPIDFSKYEKEIEEFKQREIYERIFREEEESNSFGNFFNHIDTFPEYAFLFVSSGGIPASKGPPNTPGAQMSGKAALKEVESESEDEVVNGEEEGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.27
4	0.26
5	0.27
6	0.3
7	0.29
8	0.31
9	0.29
10	0.35
11	0.37
12	0.38
13	0.39
14	0.38
15	0.42
16	0.41
17	0.4
18	0.36
19	0.35
20	0.38
21	0.38
22	0.34
23	0.27
24	0.25
25	0.26
26	0.24
27	0.22
28	0.18
29	0.21
30	0.23
31	0.25
32	0.26
33	0.3
34	0.31
35	0.32
36	0.39
37	0.35
38	0.32
39	0.33
40	0.39
41	0.45
42	0.51
43	0.58
44	0.61
45	0.71
46	0.8
47	0.85
48	0.86
49	0.86
50	0.87
51	0.88
52	0.87
53	0.87
54	0.86
55	0.85
56	0.85
57	0.8
58	0.75
59	0.74
60	0.71
61	0.71
62	0.71
63	0.68
64	0.63
65	0.64
66	0.59
67	0.53
68	0.51
69	0.51
70	0.5
71	0.54
72	0.58
73	0.62
74	0.67
75	0.68
76	0.65
77	0.63
78	0.64
79	0.65
80	0.67
81	0.68
82	0.67
83	0.65
84	0.62
85	0.56
86	0.45
87	0.36
88	0.29
89	0.21
90	0.16
91	0.15
92	0.15
93	0.15
94	0.16
95	0.15
96	0.15
97	0.17
98	0.22
99	0.26
100	0.33
101	0.41
102	0.48
103	0.57
104	0.61
105	0.64
106	0.68
107	0.72
108	0.75
109	0.75
110	0.75
111	0.69
112	0.66
113	0.58
114	0.48
115	0.38
116	0.27
117	0.19
118	0.11
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.09
124	0.11
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.13
129	0.13
130	0.14
131	0.16
132	0.13
133	0.12
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.06
150	0.13
151	0.15
152	0.23
153	0.25
154	0.3
155	0.33
156	0.35
157	0.37
158	0.41
159	0.47
160	0.45
161	0.49
162	0.5
163	0.5
164	0.52
165	0.5
166	0.42
167	0.4
168	0.37
169	0.31
170	0.26
171	0.25
172	0.2
173	0.21
174	0.19
175	0.12
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.11
186	0.11
187	0.1
188	0.12
189	0.13
190	0.15
191	0.2
192	0.2
193	0.17
194	0.21
195	0.23
196	0.24
197	0.24
198	0.25
199	0.2
200	0.19
201	0.19
202	0.18
203	0.17
204	0.19
205	0.19
206	0.18
207	0.21
208	0.2
209	0.21
210	0.19
211	0.19
212	0.2
213	0.2
214	0.21
215	0.23
216	0.24
217	0.24
218	0.24
219	0.26
220	0.22
221	0.22
222	0.19
223	0.16
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.19
228	0.18
229	0.17
230	0.17
231	0.17
232	0.21
233	0.2
234	0.22
235	0.21
236	0.23
237	0.22
238	0.28
239	0.32
240	0.25
241	0.24
242	0.21
243	0.21
244	0.19
245	0.18
246	0.12
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.05
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.09
271	0.11
272	0.11
273	0.1
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.11
283	0.13
284	0.18
285	0.19
286	0.2
287	0.21
288	0.22
289	0.23
290	0.21
291	0.19
292	0.17
293	0.21
294	0.21
295	0.2
296	0.2
297	0.2
298	0.18
299	0.21
300	0.19
301	0.16
302	0.14
303	0.14
304	0.21
305	0.2
306	0.21
307	0.21
308	0.21
309	0.2
310	0.2
311	0.21
312	0.15
313	0.16
314	0.17
315	0.14
316	0.13
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.13
323	0.15
324	0.15
325	0.14
326	0.14
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.16
332	0.16
333	0.16
334	0.17
335	0.13
336	0.13
337	0.15
338	0.18
339	0.19
340	0.21
341	0.21
342	0.2
343	0.22
344	0.21
345	0.19
346	0.16
347	0.14
348	0.12
349	0.11
350	0.11
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.12
355	0.1
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.13
366	0.14
367	0.17
368	0.19
369	0.19
370	0.19
371	0.22
372	0.26
373	0.29
374	0.36
375	0.39
376	0.45
377	0.51
378	0.58
379	0.6
380	0.62
381	0.57
382	0.53
383	0.49
384	0.41
385	0.35
386	0.27
387	0.21
388	0.14
389	0.11
390	0.11
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.2
398	0.19
399	0.26
400	0.33
401	0.36
402	0.33
403	0.35
404	0.35
405	0.32
406	0.38
407	0.34
408	0.34
409	0.42
410	0.48
411	0.46
412	0.52
413	0.52
414	0.48
415	0.56
416	0.57
417	0.55
418	0.58
419	0.59
420	0.54
421	0.58
422	0.55
423	0.48
424	0.43
425	0.33
426	0.24
427	0.23
428	0.21
429	0.16
430	0.15
431	0.14
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.15
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.15
440	0.17
441	0.25
442	0.28
443	0.24
444	0.24
445	0.28
446	0.28
447	0.27
448	0.25
449	0.17
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.11
462	0.13
463	0.18
464	0.25
465	0.27
466	0.29
467	0.31
468	0.35
469	0.33
470	0.35
471	0.31
472	0.25
473	0.25
474	0.29
475	0.27
476	0.26
477	0.23
478	0.2
479	0.21
480	0.2
481	0.18
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.13
487	0.12
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.14
492	0.15
493	0.23
494	0.27
495	0.35
496	0.35
497	0.34
498	0.34
499	0.38
500	0.44
501	0.43
502	0.42
503	0.42
504	0.46
505	0.45
506	0.45
507	0.42
508	0.37
509	0.3
510	0.32
511	0.33
512	0.31
513	0.32
514	0.33
515	0.34
516	0.36
517	0.41
518	0.45
519	0.38
520	0.37
521	0.42
522	0.4
523	0.44
524	0.43
525	0.44
526	0.43
527	0.44
528	0.48
529	0.43
530	0.43
531	0.42
532	0.4
533	0.37
534	0.34
535	0.32
536	0.27
537	0.26
538	0.26
539	0.22
540	0.2
541	0.18
542	0.13
543	0.15
544	0.15
545	0.15
546	0.18
547	0.2
548	0.21
549	0.19
550	0.2
551	0.16
552	0.16
553	0.16
554	0.13
555	0.11
556	0.08
557	0.1
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.1
564	0.15
565	0.18
566	0.2
567	0.21
568	0.26
569	0.31
570	0.34
571	0.34
572	0.32
573	0.32
574	0.33
575	0.32
576	0.3
577	0.33
578	0.31
579	0.27
580	0.26
581	0.23
582	0.21
583	0.24
584	0.23
585	0.19
586	0.2
587	0.22
588	0.22
589	0.22
590	0.21
591	0.18
592	0.16
593	0.13
594	0.11

C1GD74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer