Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GBN3

Protein Details
Accession C1GBN3    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-37ILSSRRAGRRGSQRRRDSRSSRPAHAHydrophilic
177-201KGSAASKRGRPRRGRNAGRPKPKTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-50RRAGRRGSQRRRDSRSSRPAHAAPVGGVRKFTRHA
170-199PKPVSATKGSAASKRGRPRRGRNAGRPKPK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbn:PADG_05034  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADKLDKSLDDILSSRRAGRRGSQRRRDSRSSRPAHAAPVGGVRKFTRHAKSSSKSIPTGPALGLGESKIIVSGLPSDVNEANIKEYFHKSAGPVKKVMLTYNQNGTSRGIAAITFVRPDTAAKAAKELNGLLIDKRPIKIEVVLDASRAPTVPAVKLLTERVAQPKPQPKPVSATKGSAASKRGRPRRGRNAGRPKPKTVAELDAEMEDYFPANNAAPAAINGTAQPAAAGGEDLGMDEISGFEGKCAKFLESPFVCNFNRVSIYSLLPSFRLGGAFHISEIFEITVHTGSSTPVIISSQIPNIDLFSLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.3
4 0.33
5 0.34
6 0.42
7 0.49
8 0.55
9 0.65
10 0.7
11 0.77
12 0.84
13 0.89
14 0.9
15 0.86
16 0.86
17 0.85
18 0.82
19 0.77
20 0.74
21 0.68
22 0.63
23 0.58
24 0.48
25 0.38
26 0.41
27 0.38
28 0.31
29 0.31
30 0.27
31 0.27
32 0.31
33 0.38
34 0.37
35 0.38
36 0.44
37 0.51
38 0.55
39 0.61
40 0.64
41 0.62
42 0.56
43 0.53
44 0.52
45 0.45
46 0.42
47 0.33
48 0.28
49 0.23
50 0.21
51 0.2
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.1
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.2
77 0.19
78 0.27
79 0.34
80 0.33
81 0.32
82 0.31
83 0.34
84 0.33
85 0.33
86 0.32
87 0.29
88 0.29
89 0.34
90 0.37
91 0.34
92 0.34
93 0.33
94 0.27
95 0.22
96 0.19
97 0.13
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.12
109 0.15
110 0.15
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.14
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.11
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.15
129 0.14
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.19
152 0.24
153 0.32
154 0.33
155 0.41
156 0.41
157 0.37
158 0.41
159 0.46
160 0.47
161 0.41
162 0.4
163 0.33
164 0.37
165 0.37
166 0.34
167 0.31
168 0.29
169 0.33
170 0.41
171 0.48
172 0.51
173 0.59
174 0.67
175 0.74
176 0.8
177 0.82
178 0.84
179 0.87
180 0.88
181 0.89
182 0.84
183 0.77
184 0.71
185 0.64
186 0.56
187 0.48
188 0.43
189 0.34
190 0.31
191 0.27
192 0.22
193 0.21
194 0.17
195 0.14
196 0.09
197 0.07
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.11
233 0.11
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.19
238 0.2
239 0.3
240 0.26
241 0.31
242 0.3
243 0.35
244 0.33
245 0.32
246 0.31
247 0.25
248 0.26
249 0.23
250 0.24
251 0.21
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.2
257 0.2
258 0.17
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.13
263 0.17
264 0.17
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.12
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.19