Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163TD03

Protein Details
Accession A0A163TD03    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
907-933FFEKYIRESNRNRNKNRIVKNLLKAEQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 11, nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MHDAFQVTTVVDKVARIESIFAHGDRLLIGTGIGHLLEYDIKEPLVADENEVPEVTLVNTHKTFAKRPIEQLDIIKEIDVLVSLSDGLISLHDLRTFELRMALGKTKGANLFTIQTMVEMTQEQIPQLVTRLAVAVRKKLVVFVWKDTEFSETKEWPLPDRVKTMAWVGSTKICLGLATEYALMEVEDGQWTELFGPMADGSSSLMNGSSHHGGGTSISSGAASGAMSTLNSLYNMSIGFRGGKPMVTKIPNNEMLLARDHVSIFLGLDGTPTRKVGIEWSGTPEQMGYSYPYVIAILPRHVEVRNIQSLALVQQIDVSNAKFLNQGKLVYVATSSQIWRLTPFSFSSQIDQLVEKHAYEEAVSLLEQINAALVENKEEKLRMIRTAYAHDLFLHGEYDTSLGLFQELDTPAANVIELYPSMISGRLAKEQEHIEGDANDDDSLLATTAPPRKNGNGASDENQEYLRPDSRTSNYSKANTILSNHSSSRLSAVVHQHQAHQQKELVPLTGIHLHDAITYLIRFLTDKRQKLSKQMATSHIVSAPTNGASISGINTTASSSSASSLSPSSSSAVTTMTNITPQDILEQATLVDTTLLKSYMLTNDALVGPLLRVQNHCDVEECEAILMEKKKYKELVDLYNCKELHSNALDLLSKLGQQSDGPLRGVIPTIRYLQRLGLDHFDLVLLYSRWVLETDPVHGMEIFIDDLAEVESFPRNRVLHHLASISDNLTIQYLEYIMDELHDQTPEFHNRLAIAYLDKIKADHVPDDDKNTTRSKLLHFLAESTHYRAEKILSRLPMDDLFEERAVLLSRIGQHDQALDIYVYKLKNYSMAEEYCTKIYREDPQKGAKIYLTLLRVYLKPSSTSAKGQPLLKPALDLLAHHGSHVDASEVLAILPLTTPIQGLFPFFEKYIRESNRNRNKNRIVKNLLKAEQFQVEEQVSYYQSRAVKITEDRMCPQCNKRIGNSVFAVFPNGAVVHYSCKEKIEQTQWKLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.2
7 0.23
8 0.2
9 0.2
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.13
15 0.1
16 0.09
17 0.07
18 0.07
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.15
41 0.16
42 0.12
43 0.14
44 0.14
45 0.19
46 0.19
47 0.21
48 0.26
49 0.3
50 0.35
51 0.39
52 0.47
53 0.46
54 0.53
55 0.58
56 0.58
57 0.57
58 0.57
59 0.53
60 0.46
61 0.41
62 0.34
63 0.27
64 0.22
65 0.18
66 0.14
67 0.08
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.07
77 0.08
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.22
89 0.25
90 0.22
91 0.24
92 0.25
93 0.27
94 0.3
95 0.28
96 0.26
97 0.23
98 0.25
99 0.22
100 0.23
101 0.17
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.17
121 0.19
122 0.23
123 0.24
124 0.26
125 0.26
126 0.27
127 0.28
128 0.32
129 0.33
130 0.33
131 0.38
132 0.36
133 0.37
134 0.35
135 0.37
136 0.29
137 0.29
138 0.29
139 0.23
140 0.25
141 0.3
142 0.31
143 0.3
144 0.38
145 0.4
146 0.38
147 0.4
148 0.4
149 0.35
150 0.36
151 0.35
152 0.3
153 0.26
154 0.23
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.14
229 0.13
230 0.16
231 0.16
232 0.2
233 0.26
234 0.28
235 0.3
236 0.31
237 0.38
238 0.4
239 0.39
240 0.38
241 0.33
242 0.3
243 0.3
244 0.27
245 0.21
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.18
266 0.18
267 0.24
268 0.25
269 0.25
270 0.24
271 0.2
272 0.16
273 0.13
274 0.13
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.14
289 0.16
290 0.17
291 0.21
292 0.24
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.13
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.19
316 0.19
317 0.15
318 0.15
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.15
328 0.14
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.2
333 0.2
334 0.22
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.19
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.21
372 0.22
373 0.26
374 0.29
375 0.24
376 0.23
377 0.2
378 0.19
379 0.16
380 0.14
381 0.11
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.09
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.16
417 0.17
418 0.18
419 0.17
420 0.16
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.07
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.19
439 0.2
440 0.24
441 0.27
442 0.27
443 0.26
444 0.27
445 0.28
446 0.3
447 0.29
448 0.26
449 0.24
450 0.19
451 0.15
452 0.15
453 0.16
454 0.13
455 0.14
456 0.17
457 0.19
458 0.23
459 0.26
460 0.29
461 0.3
462 0.31
463 0.31
464 0.28
465 0.28
466 0.25
467 0.23
468 0.21
469 0.19
470 0.2
471 0.19
472 0.2
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.14
477 0.12
478 0.13
479 0.18
480 0.2
481 0.23
482 0.24
483 0.24
484 0.28
485 0.34
486 0.31
487 0.28
488 0.25
489 0.24
490 0.28
491 0.27
492 0.22
493 0.16
494 0.15
495 0.15
496 0.18
497 0.15
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.09
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.17
512 0.23
513 0.26
514 0.29
515 0.36
516 0.37
517 0.45
518 0.53
519 0.48
520 0.46
521 0.47
522 0.48
523 0.45
524 0.45
525 0.38
526 0.3
527 0.25
528 0.2
529 0.17
530 0.13
531 0.1
532 0.09
533 0.07
534 0.06
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.08
564 0.1
565 0.09
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.08
571 0.09
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.05
584 0.06
585 0.07
586 0.08
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.08
594 0.07
595 0.05
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.13
601 0.2
602 0.21
603 0.21
604 0.19
605 0.19
606 0.22
607 0.21
608 0.18
609 0.11
610 0.1
611 0.1
612 0.12
613 0.14
614 0.13
615 0.17
616 0.18
617 0.21
618 0.24
619 0.25
620 0.29
621 0.31
622 0.38
623 0.42
624 0.48
625 0.48
626 0.52
627 0.5
628 0.43
629 0.41
630 0.31
631 0.28
632 0.23
633 0.21
634 0.15
635 0.17
636 0.17
637 0.15
638 0.16
639 0.11
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.07
645 0.11
646 0.15
647 0.17
648 0.17
649 0.16
650 0.16
651 0.16
652 0.18
653 0.14
654 0.11
655 0.11
656 0.15
657 0.17
658 0.18
659 0.19
660 0.2
661 0.23
662 0.23
663 0.23
664 0.22
665 0.21
666 0.2
667 0.19
668 0.17
669 0.12
670 0.1
671 0.1
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.08
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.15
683 0.15
684 0.15
685 0.15
686 0.14
687 0.1
688 0.1
689 0.08
690 0.05
691 0.05
692 0.04
693 0.04
694 0.05
695 0.05
696 0.04
697 0.05
698 0.09
699 0.1
700 0.11
701 0.16
702 0.16
703 0.17
704 0.24
705 0.29
706 0.28
707 0.3
708 0.3
709 0.26
710 0.27
711 0.27
712 0.2
713 0.15
714 0.13
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.07
719 0.06
720 0.06
721 0.05
722 0.05
723 0.06
724 0.05
725 0.06
726 0.06
727 0.08
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.11
732 0.16
733 0.2
734 0.22
735 0.2
736 0.2
737 0.2
738 0.21
739 0.2
740 0.15
741 0.12
742 0.14
743 0.17
744 0.17
745 0.16
746 0.16
747 0.16
748 0.19
749 0.19
750 0.19
751 0.19
752 0.25
753 0.26
754 0.33
755 0.35
756 0.33
757 0.34
758 0.35
759 0.33
760 0.29
761 0.31
762 0.28
763 0.33
764 0.33
765 0.35
766 0.32
767 0.31
768 0.3
769 0.32
770 0.3
771 0.26
772 0.29
773 0.24
774 0.24
775 0.24
776 0.25
777 0.27
778 0.3
779 0.32
780 0.31
781 0.32
782 0.33
783 0.35
784 0.33
785 0.29
786 0.24
787 0.21
788 0.21
789 0.19
790 0.18
791 0.16
792 0.15
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.14
798 0.18
799 0.19
800 0.19
801 0.18
802 0.19
803 0.19
804 0.17
805 0.15
806 0.11
807 0.1
808 0.11
809 0.14
810 0.13
811 0.13
812 0.14
813 0.13
814 0.18
815 0.19
816 0.22
817 0.23
818 0.24
819 0.27
820 0.29
821 0.31
822 0.29
823 0.29
824 0.25
825 0.22
826 0.25
827 0.31
828 0.37
829 0.42
830 0.45
831 0.52
832 0.57
833 0.57
834 0.56
835 0.47
836 0.4
837 0.35
838 0.33
839 0.28
840 0.22
841 0.22
842 0.22
843 0.22
844 0.23
845 0.25
846 0.21
847 0.21
848 0.24
849 0.28
850 0.29
851 0.33
852 0.36
853 0.41
854 0.44
855 0.46
856 0.47
857 0.47
858 0.48
859 0.43
860 0.38
861 0.3
862 0.29
863 0.25
864 0.22
865 0.22
866 0.25
867 0.24
868 0.23
869 0.23
870 0.19
871 0.19
872 0.19
873 0.13
874 0.07
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.06
882 0.06
883 0.07
884 0.06
885 0.06
886 0.07
887 0.07
888 0.09
889 0.09
890 0.11
891 0.12
892 0.14
893 0.16
894 0.16
895 0.19
896 0.19
897 0.23
898 0.31
899 0.35
900 0.42
901 0.48
902 0.59
903 0.67
904 0.76
905 0.77
906 0.78
907 0.83
908 0.84
909 0.85
910 0.85
911 0.83
912 0.82
913 0.85
914 0.83
915 0.78
916 0.72
917 0.65
918 0.58
919 0.55
920 0.47
921 0.39
922 0.34
923 0.3
924 0.26
925 0.25
926 0.23
927 0.19
928 0.18
929 0.18
930 0.18
931 0.2
932 0.21
933 0.22
934 0.21
935 0.26
936 0.29
937 0.38
938 0.4
939 0.43
940 0.47
941 0.51
942 0.55
943 0.56
944 0.59
945 0.58
946 0.6
947 0.6
948 0.6
949 0.64
950 0.61
951 0.61
952 0.57
953 0.5
954 0.44
955 0.39
956 0.37
957 0.26
958 0.24
959 0.19
960 0.15
961 0.13
962 0.13
963 0.13
964 0.16
965 0.19
966 0.24
967 0.23
968 0.25
969 0.28
970 0.31
971 0.39
972 0.44
973 0.51