Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163MSW0

Protein Details
Accession A0A163MSW0    Localization Confidence High Confidence Score 23.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-278FMTRIKRRIKFQTPPHHQVFHydrophilic
460-482LSPIKHAVKKGRKPNPRPIPKMPBasic
564-589DINFSRVRLNKKKPNKAKKLQQQLAPHydrophilic
1118-1159DPTCSREKTARMKKQTQHQLEKLKKMTERRRQRQLSKTAALAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
466-478AVKKGRKPNPRPI
573-582NKKKPNKAKK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, golg 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR009067  TAF_II_230-bd  
IPR036741  TAFII-230_TBP-bd_sf  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF09247  TBP-binding  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MSLAGYLFGNVDEQGRLDNDLDEDLKQTLQHVDADVFSRIFNPDTFGIHTSNNTNPDEEEDEEDDNDEQEDSDHRTSVYQRQRTQHEATIQHAAGAIDYSDFDETVPDETATRGPTHLNYHHRLFGSASKPPLRTGSIPEIPKMPVKRMQPSTTPARSLLSKRYHIEEDDDYDTSNDIDFINSRNRNSSSSNDSGTRPHDYSTASVHWHHHQISTPTPLSSSEAVSSSSASPSPYAMVDITQLFPAFKHGKMLNFSDLFMTRIKRRIKFQTPPHHQVFLNDGFQYETALDQRHMFLHQPLKRRKLLTTTNEIDHHYEDDTMQQQSSMEYSSTAHDSPYQNYHSDDKDYLYHSVMLEPWENHILWDELDPKEGPGHYGYAAPALAPSISKTNNPIKETILNGDLDSGDWLDMVIWDDDTSRKRSGCARIPLNPDSIKVILDLNDPHMLFDAESMQESQQQLSPIKHAVKKGRKPNPRPIPKMPLIYTSDPDSRSKLPQSRFNISNDRHYDMNFAVVRVRQTHGQLVVQHSVPALQLHRSLYKTKLSKAELRSFHRQLFQWPHNTDINFSRVRLNKKKPNKAKKLQQQLAPGNASSLNGTGDNDGILRTTKDLSLKDTCSFVLMEYSEEHPPIISNIGMGTLIVNYYRKTDPKDDYVPNMDLGEPFVLEVEDTSPFMTFGNVEPGQTISVMYNNMVRAPLFRHQVKSTDFLLVRSTHHGQSRYYLREIPAIFVMGQTYPVQEVPGPQSRRVTTTVKNRLQIVAYRLIAKHPQQRLKMSKLASRFPEYQDIQVRQRLKEFLEFNRHSKDKGGGYWKVRAPKGATERRLPGEDQLRQMCTPEMVCLYESMLVGERHLLDLGYSNVNDDTADQDESNTSQLETEQQLAPWFATRNFINACQGKAMLKLSGEGDPTGCGEGFSFIRVSMKDIFLRAGESAEKKLGKIKGIERNSYSYQFGHIAQIKSRPKSAHRYNVAEQQQVYREEIERIWSTQWNSLSQTEEPDYSPQEVLDESSADEREMDQMNSPMTPENTEWRHQRRYDRATSEGIYDDMTDDNLSVAESYNSQAQHRNRELRISRHMRDDTGEIRIVVEVVKDPAVIKAYLAQRQLIMENAANLEAIDPTCSREKTARMKKQTQHQLEKLKKMTERRRQRQLSKTAALAENPVLGLMRGKREGAMRRCGNCGQLGHMKTNKSCPNFPGDKEKNNSKPVGNEGALLDDLDDGTPTPFSSFTPPPTSSYTFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.17
8 0.18
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.21
22 0.21
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.18
30 0.17
31 0.2
32 0.23
33 0.24
34 0.24
35 0.24
36 0.27
37 0.26
38 0.3
39 0.33
40 0.3
41 0.29
42 0.27
43 0.31
44 0.32
45 0.3
46 0.3
47 0.27
48 0.27
49 0.26
50 0.27
51 0.23
52 0.19
53 0.17
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.2
63 0.24
64 0.33
65 0.41
66 0.44
67 0.5
68 0.57
69 0.63
70 0.67
71 0.69
72 0.66
73 0.64
74 0.58
75 0.55
76 0.55
77 0.48
78 0.41
79 0.37
80 0.3
81 0.21
82 0.19
83 0.15
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.12
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.19
103 0.27
104 0.33
105 0.39
106 0.43
107 0.46
108 0.5
109 0.48
110 0.46
111 0.41
112 0.41
113 0.38
114 0.37
115 0.4
116 0.41
117 0.41
118 0.42
119 0.43
120 0.4
121 0.37
122 0.39
123 0.42
124 0.43
125 0.44
126 0.43
127 0.42
128 0.39
129 0.44
130 0.4
131 0.36
132 0.35
133 0.4
134 0.48
135 0.52
136 0.55
137 0.54
138 0.57
139 0.62
140 0.6
141 0.56
142 0.48
143 0.44
144 0.44
145 0.43
146 0.46
147 0.44
148 0.46
149 0.46
150 0.5
151 0.5
152 0.46
153 0.47
154 0.41
155 0.38
156 0.36
157 0.33
158 0.28
159 0.25
160 0.24
161 0.19
162 0.16
163 0.11
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.11
168 0.21
169 0.24
170 0.25
171 0.31
172 0.33
173 0.35
174 0.38
175 0.4
176 0.39
177 0.39
178 0.42
179 0.39
180 0.38
181 0.38
182 0.38
183 0.39
184 0.32
185 0.29
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.28
190 0.27
191 0.24
192 0.26
193 0.29
194 0.3
195 0.34
196 0.34
197 0.3
198 0.33
199 0.33
200 0.36
201 0.39
202 0.36
203 0.31
204 0.3
205 0.29
206 0.27
207 0.25
208 0.22
209 0.16
210 0.15
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.17
233 0.18
234 0.16
235 0.22
236 0.23
237 0.28
238 0.32
239 0.35
240 0.35
241 0.33
242 0.33
243 0.3
244 0.28
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.22
249 0.29
250 0.36
251 0.38
252 0.45
253 0.54
254 0.61
255 0.66
256 0.73
257 0.76
258 0.78
259 0.81
260 0.78
261 0.72
262 0.63
263 0.55
264 0.51
265 0.44
266 0.37
267 0.29
268 0.25
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.13
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.19
283 0.27
284 0.31
285 0.4
286 0.47
287 0.53
288 0.57
289 0.58
290 0.56
291 0.55
292 0.6
293 0.57
294 0.58
295 0.55
296 0.53
297 0.53
298 0.51
299 0.44
300 0.36
301 0.3
302 0.22
303 0.18
304 0.14
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.1
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.1
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.16
322 0.18
323 0.2
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.27
328 0.3
329 0.26
330 0.28
331 0.26
332 0.23
333 0.23
334 0.24
335 0.23
336 0.21
337 0.2
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.13
352 0.15
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.12
361 0.13
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.17
377 0.25
378 0.31
379 0.33
380 0.33
381 0.32
382 0.34
383 0.35
384 0.32
385 0.25
386 0.2
387 0.18
388 0.17
389 0.14
390 0.11
391 0.1
392 0.08
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.1
404 0.12
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.19
409 0.26
410 0.33
411 0.39
412 0.45
413 0.46
414 0.5
415 0.56
416 0.57
417 0.55
418 0.47
419 0.4
420 0.34
421 0.29
422 0.22
423 0.17
424 0.15
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.13
434 0.11
435 0.11
436 0.1
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.14
446 0.16
447 0.16
448 0.18
449 0.2
450 0.25
451 0.27
452 0.31
453 0.38
454 0.46
455 0.53
456 0.62
457 0.67
458 0.72
459 0.76
460 0.82
461 0.83
462 0.83
463 0.83
464 0.79
465 0.78
466 0.73
467 0.71
468 0.61
469 0.55
470 0.5
471 0.44
472 0.38
473 0.33
474 0.32
475 0.28
476 0.28
477 0.26
478 0.23
479 0.25
480 0.3
481 0.33
482 0.34
483 0.41
484 0.46
485 0.49
486 0.49
487 0.5
488 0.53
489 0.47
490 0.52
491 0.47
492 0.43
493 0.37
494 0.35
495 0.33
496 0.24
497 0.28
498 0.19
499 0.16
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.18
505 0.14
506 0.15
507 0.18
508 0.18
509 0.18
510 0.2
511 0.21
512 0.22
513 0.19
514 0.18
515 0.15
516 0.14
517 0.12
518 0.11
519 0.09
520 0.08
521 0.1
522 0.11
523 0.14
524 0.16
525 0.18
526 0.19
527 0.26
528 0.27
529 0.29
530 0.34
531 0.35
532 0.4
533 0.44
534 0.49
535 0.48
536 0.52
537 0.56
538 0.53
539 0.52
540 0.48
541 0.43
542 0.41
543 0.43
544 0.41
545 0.41
546 0.39
547 0.4
548 0.39
549 0.39
550 0.34
551 0.28
552 0.28
553 0.21
554 0.21
555 0.24
556 0.26
557 0.34
558 0.42
559 0.48
560 0.53
561 0.63
562 0.73
563 0.77
564 0.83
565 0.85
566 0.85
567 0.87
568 0.86
569 0.87
570 0.82
571 0.76
572 0.74
573 0.66
574 0.61
575 0.51
576 0.42
577 0.31
578 0.26
579 0.21
580 0.13
581 0.1
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.1
597 0.11
598 0.15
599 0.18
600 0.2
601 0.2
602 0.2
603 0.19
604 0.17
605 0.16
606 0.12
607 0.1
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.11
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.08
632 0.1
633 0.12
634 0.16
635 0.21
636 0.24
637 0.29
638 0.35
639 0.34
640 0.35
641 0.37
642 0.34
643 0.29
644 0.26
645 0.2
646 0.14
647 0.13
648 0.1
649 0.06
650 0.05
651 0.05
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.11
684 0.15
685 0.19
686 0.21
687 0.24
688 0.25
689 0.3
690 0.31
691 0.31
692 0.28
693 0.28
694 0.26
695 0.23
696 0.25
697 0.21
698 0.2
699 0.21
700 0.23
701 0.2
702 0.24
703 0.25
704 0.23
705 0.28
706 0.33
707 0.32
708 0.31
709 0.3
710 0.27
711 0.3
712 0.3
713 0.26
714 0.19
715 0.17
716 0.15
717 0.13
718 0.12
719 0.07
720 0.08
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.12
729 0.2
730 0.22
731 0.23
732 0.27
733 0.27
734 0.3
735 0.33
736 0.32
737 0.31
738 0.4
739 0.49
740 0.49
741 0.51
742 0.49
743 0.46
744 0.43
745 0.39
746 0.33
747 0.28
748 0.24
749 0.24
750 0.23
751 0.23
752 0.26
753 0.28
754 0.32
755 0.34
756 0.4
757 0.42
758 0.5
759 0.55
760 0.56
761 0.57
762 0.51
763 0.48
764 0.45
765 0.46
766 0.42
767 0.41
768 0.38
769 0.35
770 0.4
771 0.37
772 0.38
773 0.4
774 0.4
775 0.37
776 0.4
777 0.41
778 0.34
779 0.36
780 0.32
781 0.28
782 0.3
783 0.31
784 0.31
785 0.39
786 0.4
787 0.41
788 0.46
789 0.45
790 0.39
791 0.38
792 0.37
793 0.29
794 0.32
795 0.36
796 0.34
797 0.37
798 0.43
799 0.44
800 0.46
801 0.44
802 0.42
803 0.37
804 0.39
805 0.46
806 0.48
807 0.48
808 0.47
809 0.5
810 0.5
811 0.5
812 0.42
813 0.38
814 0.38
815 0.37
816 0.38
817 0.36
818 0.35
819 0.33
820 0.33
821 0.28
822 0.21
823 0.17
824 0.14
825 0.12
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.1
830 0.11
831 0.1
832 0.09
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.12
837 0.11
838 0.1
839 0.1
840 0.09
841 0.06
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.09
846 0.1
847 0.09
848 0.1
849 0.1
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.1
854 0.09
855 0.1
856 0.1
857 0.11
858 0.12
859 0.1
860 0.08
861 0.07
862 0.08
863 0.1
864 0.11
865 0.13
866 0.12
867 0.13
868 0.14
869 0.14
870 0.14
871 0.13
872 0.13
873 0.11
874 0.15
875 0.14
876 0.17
877 0.19
878 0.2
879 0.25
880 0.26
881 0.26
882 0.23
883 0.24
884 0.2
885 0.21
886 0.21
887 0.15
888 0.13
889 0.14
890 0.14
891 0.15
892 0.15
893 0.13
894 0.12
895 0.11
896 0.12
897 0.11
898 0.1
899 0.08
900 0.07
901 0.09
902 0.09
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.11
907 0.11
908 0.14
909 0.14
910 0.17
911 0.17
912 0.18
913 0.18
914 0.16
915 0.18
916 0.15
917 0.13
918 0.14
919 0.15
920 0.16
921 0.2
922 0.2
923 0.19
924 0.26
925 0.27
926 0.27
927 0.31
928 0.37
929 0.42
930 0.47
931 0.52
932 0.48
933 0.52
934 0.52
935 0.49
936 0.43
937 0.33
938 0.3
939 0.27
940 0.25
941 0.26
942 0.28
943 0.27
944 0.27
945 0.36
946 0.4
947 0.4
948 0.44
949 0.41
950 0.42
951 0.51
952 0.58
953 0.59
954 0.6
955 0.64
956 0.64
957 0.69
958 0.67
959 0.6
960 0.52
961 0.46
962 0.43
963 0.37
964 0.35
965 0.28
966 0.25
967 0.23
968 0.23
969 0.24
970 0.21
971 0.21
972 0.22
973 0.23
974 0.24
975 0.27
976 0.29
977 0.26
978 0.28
979 0.28
980 0.29
981 0.26
982 0.28
983 0.25
984 0.24
985 0.23
986 0.23
987 0.23
988 0.22
989 0.21
990 0.17
991 0.16
992 0.14
993 0.14
994 0.12
995 0.1
996 0.09
997 0.11
998 0.12
999 0.11
1000 0.11
1001 0.1
1002 0.13
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.15
1007 0.16
1008 0.16
1009 0.16
1010 0.15
1011 0.14
1012 0.16
1013 0.16
1014 0.22
1015 0.25
1016 0.31
1017 0.39
1018 0.44
1019 0.52
1020 0.55
1021 0.63
1022 0.65
1023 0.7
1024 0.73
1025 0.7
1026 0.66
1027 0.63
1028 0.58
1029 0.51
1030 0.41
1031 0.33
1032 0.24
1033 0.19
1034 0.16
1035 0.12
1036 0.11
1037 0.09
1038 0.07
1039 0.07
1040 0.07
1041 0.06
1042 0.06
1043 0.06
1044 0.06
1045 0.07
1046 0.08
1047 0.12
1048 0.13
1049 0.15
1050 0.23
1051 0.27
1052 0.37
1053 0.45
1054 0.51
1055 0.49
1056 0.58
1057 0.63
1058 0.63
1059 0.68
1060 0.67
1061 0.62
1062 0.63
1063 0.64
1064 0.55
1065 0.51
1066 0.49
1067 0.41
1068 0.37
1069 0.35
1070 0.26
1071 0.24
1072 0.22
1073 0.2
1074 0.15
1075 0.13
1076 0.1
1077 0.1
1078 0.1
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.12
1082 0.15
1083 0.13
1084 0.12
1085 0.17
1086 0.22
1087 0.27
1088 0.28
1089 0.27
1090 0.26
1091 0.27
1092 0.28
1093 0.23
1094 0.21
1095 0.16
1096 0.16
1097 0.16
1098 0.15
1099 0.13
1100 0.12
1101 0.11
1102 0.09
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.09
1106 0.12
1107 0.18
1108 0.19
1109 0.22
1110 0.25
1111 0.34
1112 0.42
1113 0.53
1114 0.6
1115 0.64
1116 0.74
1117 0.78
1118 0.84
1119 0.86
1120 0.86
1121 0.85
1122 0.83
1123 0.84
1124 0.82
1125 0.85
1126 0.8
1127 0.76
1128 0.71
1129 0.72
1130 0.74
1131 0.74
1132 0.77
1133 0.78
1134 0.83
1135 0.86
1136 0.9
1137 0.89
1138 0.88
1139 0.87
1140 0.8
1141 0.73
1142 0.69
1143 0.61
1144 0.52
1145 0.45
1146 0.36
1147 0.28
1148 0.23
1149 0.2
1150 0.13
1151 0.11
1152 0.15
1153 0.15
1154 0.2
1155 0.21
1156 0.22
1157 0.24
1158 0.31
1159 0.41
1160 0.43
1161 0.5
1162 0.53
1163 0.54
1164 0.59
1165 0.59
1166 0.55
1167 0.5
1168 0.44
1169 0.4
1170 0.41
1171 0.41
1172 0.44
1173 0.46
1174 0.48
1175 0.47
1176 0.55
1177 0.56
1178 0.54
1179 0.55
1180 0.5
1181 0.55
1182 0.56
1183 0.57
1184 0.58
1185 0.58
1186 0.61
1187 0.64
1188 0.71
1189 0.7
1190 0.71
1191 0.72
1192 0.64
1193 0.61
1194 0.59
1195 0.59
1196 0.49
1197 0.43
1198 0.36
1199 0.34
1200 0.31
1201 0.26
1202 0.2
1203 0.12
1204 0.11
1205 0.09
1206 0.09
1207 0.07
1208 0.07
1209 0.08
1210 0.08
1211 0.09
1212 0.09
1213 0.11
1214 0.18
1215 0.22
1216 0.27
1217 0.34
1218 0.35
1219 0.38
1220 0.44
1221 0.47
1222 0.42