Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GCH5

Protein Details
Accession C1GCH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21AYPHRGPPPRQYNDQPPPSQHydrophilic
106-127FDKSFPRPPPIQQRPRQPNDGAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006597  Sel1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG pbn:PADG_04697  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08238  Sel1  
Amino Acid Sequences MAYPHRGPPPRQYNDQPPPSQYYGRPGRGRGGYGPGTWNPGYDDSGQYYDERGGYGGGPGGRGQYDHWPPPPNRGRGGPPPNRGGYGDRRPVNGPPPGPGPLPPNFDKSFPRPPPIQQRPRQPNDGAPLSPVKLSFDNPFPAFPRVRRGNSKELDRRMGDLDLNDSSMRPSPEKRPHTSNSTRQPPQRQLDMPQWGGPGPRTLPSLPDSMPLPGPKRSMTMPTNPVPTSPQYPGQPTWQEPPLPRPTTASGTKPDTAPVQNNRAGSIDTNRDLPDDFLDEYFAPNDQTDSDTPNFSVMPGTQDDNIVPFDKPGVDESSTSNSGKGYTAYRPPGGPTPIPNIPMDPPTNQFENAGFHFDLPPLSNKYDQGQPNEYDPSTNGGYPHHPKSRGMPPGPAYHGGGGGSGRGGYDPRPPPNQYGPPGRSTPMSYPDNHTEYQNAPPSNHRAGVTLADPPHQNPDALPKHPVPFRPGLENTAKPPPIRQYDNPPAQVQSQTGLGAPPQLLNDGAGPMPITHEELHRIQQAAKSNPSDHKAQLFLAKKLVEASIYLIDENGRADIKTRNKNRERYIFDAHKIVKKLVSAGYPQAMFYLADCYGEGQLGLEVDPKEAFLLYQSAAKAGHPESAYRLAVCCEMGYEGGGGTKRDPMKAVQWYRRAAALGDTPAMYKMGMILLKGLLGQQKNPREAVSWLKRAAERADESNPHALHELALLYENPNGNDAIIQDEAYSRELLEQAAKLGYKYSQYRLGAAYEHGLLGCPVDPRQSILWYTQAAAQGEHQGELALSGWYLTGAEGILQQSDTEAYLWARKAALAGLAKAEYAMGYFTEVGIGVPANLEDAKRWYWKASSQNFMKARERLEDLKRGGAKMQKTKVSRSAVNSQKDGDCIVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.75
4 0.69
5 0.7
6 0.67
7 0.64
8 0.55
9 0.55
10 0.55
11 0.6
12 0.6
13 0.55
14 0.58
15 0.57
16 0.58
17 0.51
18 0.49
19 0.44
20 0.41
21 0.44
22 0.37
23 0.39
24 0.35
25 0.33
26 0.28
27 0.27
28 0.28
29 0.25
30 0.26
31 0.24
32 0.26
33 0.26
34 0.23
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.17
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.21
52 0.28
53 0.33
54 0.38
55 0.45
56 0.45
57 0.56
58 0.63
59 0.59
60 0.56
61 0.56
62 0.58
63 0.6
64 0.7
65 0.68
66 0.66
67 0.67
68 0.65
69 0.62
70 0.57
71 0.53
72 0.51
73 0.52
74 0.54
75 0.5
76 0.51
77 0.51
78 0.53
79 0.54
80 0.52
81 0.43
82 0.38
83 0.39
84 0.39
85 0.37
86 0.35
87 0.34
88 0.32
89 0.38
90 0.36
91 0.39
92 0.37
93 0.4
94 0.43
95 0.45
96 0.5
97 0.49
98 0.53
99 0.5
100 0.57
101 0.65
102 0.7
103 0.73
104 0.7
105 0.76
106 0.81
107 0.84
108 0.82
109 0.74
110 0.69
111 0.67
112 0.64
113 0.53
114 0.46
115 0.42
116 0.36
117 0.35
118 0.28
119 0.24
120 0.2
121 0.22
122 0.23
123 0.24
124 0.29
125 0.28
126 0.31
127 0.3
128 0.34
129 0.36
130 0.34
131 0.4
132 0.42
133 0.48
134 0.56
135 0.59
136 0.64
137 0.66
138 0.74
139 0.73
140 0.71
141 0.71
142 0.63
143 0.59
144 0.51
145 0.46
146 0.37
147 0.29
148 0.26
149 0.2
150 0.2
151 0.17
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.22
158 0.31
159 0.41
160 0.49
161 0.53
162 0.57
163 0.6
164 0.66
165 0.71
166 0.71
167 0.71
168 0.73
169 0.74
170 0.74
171 0.77
172 0.77
173 0.73
174 0.71
175 0.64
176 0.59
177 0.6
178 0.6
179 0.53
180 0.45
181 0.41
182 0.34
183 0.32
184 0.28
185 0.23
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.21
191 0.22
192 0.24
193 0.21
194 0.22
195 0.2
196 0.19
197 0.22
198 0.23
199 0.24
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.26
204 0.26
205 0.3
206 0.3
207 0.35
208 0.38
209 0.39
210 0.44
211 0.41
212 0.4
213 0.36
214 0.35
215 0.32
216 0.29
217 0.3
218 0.27
219 0.32
220 0.33
221 0.36
222 0.37
223 0.35
224 0.37
225 0.36
226 0.37
227 0.34
228 0.41
229 0.43
230 0.41
231 0.39
232 0.38
233 0.38
234 0.4
235 0.42
236 0.38
237 0.34
238 0.36
239 0.37
240 0.33
241 0.32
242 0.3
243 0.29
244 0.32
245 0.33
246 0.34
247 0.36
248 0.36
249 0.35
250 0.32
251 0.3
252 0.24
253 0.23
254 0.22
255 0.2
256 0.21
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.16
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.1
275 0.1
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.16
280 0.16
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.2
305 0.22
306 0.21
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.15
312 0.13
313 0.14
314 0.2
315 0.22
316 0.24
317 0.23
318 0.25
319 0.28
320 0.28
321 0.26
322 0.23
323 0.26
324 0.27
325 0.28
326 0.26
327 0.23
328 0.21
329 0.23
330 0.22
331 0.18
332 0.19
333 0.2
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.14
348 0.13
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.18
353 0.25
354 0.27
355 0.28
356 0.29
357 0.29
358 0.3
359 0.32
360 0.29
361 0.23
362 0.2
363 0.19
364 0.16
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.17
369 0.21
370 0.27
371 0.29
372 0.3
373 0.3
374 0.35
375 0.42
376 0.45
377 0.42
378 0.4
379 0.37
380 0.4
381 0.42
382 0.37
383 0.3
384 0.22
385 0.21
386 0.16
387 0.14
388 0.09
389 0.07
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.13
397 0.17
398 0.21
399 0.26
400 0.27
401 0.31
402 0.37
403 0.42
404 0.38
405 0.43
406 0.41
407 0.4
408 0.4
409 0.37
410 0.31
411 0.28
412 0.26
413 0.24
414 0.24
415 0.22
416 0.25
417 0.28
418 0.3
419 0.29
420 0.27
421 0.22
422 0.22
423 0.25
424 0.26
425 0.22
426 0.2
427 0.22
428 0.27
429 0.26
430 0.27
431 0.22
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.17
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.16
442 0.15
443 0.14
444 0.11
445 0.2
446 0.22
447 0.23
448 0.26
449 0.24
450 0.27
451 0.3
452 0.31
453 0.27
454 0.28
455 0.28
456 0.3
457 0.29
458 0.3
459 0.32
460 0.32
461 0.3
462 0.31
463 0.32
464 0.26
465 0.27
466 0.29
467 0.3
468 0.34
469 0.33
470 0.36
471 0.44
472 0.5
473 0.5
474 0.44
475 0.4
476 0.36
477 0.35
478 0.26
479 0.18
480 0.13
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.11
504 0.13
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.17
509 0.19
510 0.25
511 0.26
512 0.28
513 0.28
514 0.29
515 0.32
516 0.33
517 0.33
518 0.27
519 0.26
520 0.23
521 0.22
522 0.26
523 0.26
524 0.25
525 0.25
526 0.24
527 0.22
528 0.21
529 0.2
530 0.13
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.07
541 0.06
542 0.05
543 0.07
544 0.14
545 0.22
546 0.32
547 0.39
548 0.49
549 0.56
550 0.65
551 0.71
552 0.73
553 0.72
554 0.68
555 0.69
556 0.64
557 0.58
558 0.57
559 0.52
560 0.48
561 0.43
562 0.37
563 0.3
564 0.26
565 0.26
566 0.22
567 0.21
568 0.18
569 0.18
570 0.2
571 0.18
572 0.18
573 0.16
574 0.14
575 0.11
576 0.1
577 0.11
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.05
598 0.07
599 0.07
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.13
606 0.12
607 0.16
608 0.14
609 0.14
610 0.17
611 0.22
612 0.22
613 0.19
614 0.19
615 0.16
616 0.16
617 0.15
618 0.12
619 0.08
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.06
624 0.05
625 0.07
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.14
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.18
634 0.24
635 0.33
636 0.41
637 0.44
638 0.49
639 0.5
640 0.5
641 0.5
642 0.43
643 0.34
644 0.28
645 0.24
646 0.19
647 0.18
648 0.17
649 0.15
650 0.15
651 0.15
652 0.11
653 0.07
654 0.06
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.08
660 0.09
661 0.09
662 0.1
663 0.12
664 0.13
665 0.18
666 0.25
667 0.31
668 0.34
669 0.35
670 0.34
671 0.31
672 0.33
673 0.39
674 0.4
675 0.39
676 0.38
677 0.41
678 0.42
679 0.42
680 0.41
681 0.37
682 0.32
683 0.3
684 0.34
685 0.33
686 0.35
687 0.39
688 0.37
689 0.31
690 0.29
691 0.25
692 0.19
693 0.18
694 0.15
695 0.08
696 0.09
697 0.09
698 0.09
699 0.12
700 0.13
701 0.12
702 0.13
703 0.12
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.1
709 0.1
710 0.09
711 0.1
712 0.12
713 0.12
714 0.12
715 0.09
716 0.1
717 0.1
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.13
723 0.14
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.18
728 0.21
729 0.24
730 0.3
731 0.3
732 0.33
733 0.33
734 0.33
735 0.28
736 0.26
737 0.24
738 0.16
739 0.16
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.1
744 0.1
745 0.09
746 0.1
747 0.13
748 0.13
749 0.16
750 0.18
751 0.2
752 0.21
753 0.21
754 0.25
755 0.22
756 0.23
757 0.23
758 0.25
759 0.23
760 0.22
761 0.21
762 0.23
763 0.23
764 0.22
765 0.19
766 0.14
767 0.13
768 0.13
769 0.12
770 0.06
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.07
781 0.07
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.07
789 0.09
790 0.09
791 0.14
792 0.15
793 0.16
794 0.15
795 0.15
796 0.15
797 0.14
798 0.19
799 0.17
800 0.17
801 0.18
802 0.18
803 0.18
804 0.17
805 0.16
806 0.1
807 0.08
808 0.08
809 0.05
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.08
814 0.08
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.05
819 0.06
820 0.06
821 0.07
822 0.08
823 0.08
824 0.09
825 0.14
826 0.18
827 0.23
828 0.25
829 0.26
830 0.29
831 0.37
832 0.45
833 0.49
834 0.54
835 0.55
836 0.63
837 0.64
838 0.67
839 0.67
840 0.61
841 0.57
842 0.53
843 0.54
844 0.52
845 0.54
846 0.56
847 0.52
848 0.56
849 0.55
850 0.51
851 0.51
852 0.5
853 0.52
854 0.53
855 0.58
856 0.58
857 0.59
858 0.65
859 0.68
860 0.68
861 0.65
862 0.62
863 0.65
864 0.65
865 0.68
866 0.63
867 0.59
868 0.53
869 0.48