Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GJH8

Protein Details
Accession C1GJH8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-74VKKSSAPDGPPRKRGRPRKNPNDPPKPVATGPKRGRGRPKKDVSDTPNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-68PKKRGRPPKLDATGAPVKKSSAPDGPPRKRGRPRKNPNDPPKPVATGPKRGRGRPKKD
86-95PPAKRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbn:PADG_07414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MADVAAASPLPKKRGRPPKLDATGAPVKKSSAPDGPPRKRGRPRKNPNDPPKPVATGPKRGRGRPKKDVSDTPNKISRLSTDASAPPAKRGRPRKSDANPSAKAVNGATEDSSDLTLDKIIGIYSLQCSEVEENWPDEAEEMELTITRTSESPLGLIGGFNLGIIEGTMLFAADKPTLDKFRAVMSKSGRAAPVRGEDDAAKSATVKDRRVYFSWRGRSTSEGEIHTEEGTSSQDGYIDFTSNEAVTFHGIAGFPRLGSSCAFKGTKIDNDAADAPQPWTSFSKVAAEQSVANRWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.67
4 0.7
5 0.75
6 0.77
7 0.75
8 0.65
9 0.62
10 0.64
11 0.56
12 0.5
13 0.4
14 0.35
15 0.35
16 0.37
17 0.34
18 0.32
19 0.35
20 0.44
21 0.54
22 0.61
23 0.66
24 0.71
25 0.75
26 0.79
27 0.85
28 0.85
29 0.86
30 0.89
31 0.91
32 0.94
33 0.95
34 0.96
35 0.95
36 0.9
37 0.84
38 0.78
39 0.71
40 0.62
41 0.61
42 0.57
43 0.56
44 0.56
45 0.6
46 0.61
47 0.63
48 0.72
49 0.72
50 0.75
51 0.75
52 0.79
53 0.78
54 0.8
55 0.82
56 0.79
57 0.8
58 0.75
59 0.7
60 0.67
61 0.59
62 0.53
63 0.44
64 0.38
65 0.31
66 0.28
67 0.23
68 0.2
69 0.2
70 0.24
71 0.28
72 0.26
73 0.28
74 0.31
75 0.34
76 0.4
77 0.49
78 0.54
79 0.58
80 0.64
81 0.68
82 0.71
83 0.78
84 0.78
85 0.77
86 0.69
87 0.62
88 0.57
89 0.47
90 0.4
91 0.29
92 0.22
93 0.14
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.18
169 0.23
170 0.23
171 0.25
172 0.27
173 0.32
174 0.32
175 0.34
176 0.31
177 0.27
178 0.27
179 0.24
180 0.26
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.19
192 0.23
193 0.23
194 0.26
195 0.31
196 0.36
197 0.38
198 0.43
199 0.44
200 0.49
201 0.56
202 0.55
203 0.52
204 0.49
205 0.49
206 0.47
207 0.44
208 0.39
209 0.31
210 0.31
211 0.29
212 0.29
213 0.26
214 0.22
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.18
247 0.15
248 0.21
249 0.22
250 0.21
251 0.26
252 0.3
253 0.36
254 0.35
255 0.36
256 0.3
257 0.34
258 0.36
259 0.31
260 0.28
261 0.23
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.21
269 0.22
270 0.26
271 0.26
272 0.29
273 0.29
274 0.27
275 0.28
276 0.31