Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GJC2

Protein Details
Accession C1GJC2    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-83NSRPDLPLTRHRQRGRNNSEQGHydrophilic
368-388NEPINRRKSRSERRKDPDEEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-381RRKSRSERR
426-437RKTGRPAARRGR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003903  UIM_dom  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_07358  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MTPRRSFRARTTQPSAAMQHTNSSSSSNSFSRAERSTRSNNKIPSPHISANCSQSMDDVEQNSRPDLPLTRHRQRGRNNSEQGNALHAPGAEEYDDEEGDDEEITRCLCGQQDYPGLPLIYQDGGSSGATKLGMKDDLAPGASASAAEDMQSEEPGSLFIQCDSCKVWQHGGCVGIMEEASSPDEYFCEMCRKDLHKIIVASNGQKSSRYLPVVGSSSGSSSRSSSLDSSRNLKDKKGRGSSGPLSTKRRSTMNSRDAAYDEEQLRRAIEESKEDSKSVADDLGSRRGKRSRSDSEANKQTAKRQRTGSLSSSLSKHSNSLSHPLSDEESKPNNVPEGNGSKKTRGVVRNQREREAQAAEKELEKETNEPINRRKSRSERRKDPDEEPTETASPTKTIVNPPIITQSAPDTPSITNEPSNTKPATRKTGRPAARRGRLGRNQYTRDRDSVNGNDMSNNINSPRRGQSRDTGNGDSPTRGHLGANGIYLNGGESGKPSKPRYMNPQRTTMNDMKRRVAAILEFISQLQVEMASSAMQTPLSGAGSATKETGDQGVNGEQTTGSDENTEANGTSPPAKEKDFKDLTSVEMMDVLTRGLLKWQQEFGKYGEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.63
3 0.57
4 0.53
5 0.44
6 0.42
7 0.38
8 0.36
9 0.3
10 0.29
11 0.25
12 0.23
13 0.27
14 0.23
15 0.25
16 0.25
17 0.27
18 0.3
19 0.34
20 0.36
21 0.37
22 0.43
23 0.5
24 0.57
25 0.63
26 0.65
27 0.67
28 0.7
29 0.72
30 0.69
31 0.66
32 0.64
33 0.64
34 0.6
35 0.59
36 0.55
37 0.53
38 0.51
39 0.45
40 0.36
41 0.3
42 0.3
43 0.27
44 0.26
45 0.24
46 0.24
47 0.26
48 0.27
49 0.28
50 0.25
51 0.23
52 0.22
53 0.24
54 0.27
55 0.34
56 0.42
57 0.5
58 0.59
59 0.65
60 0.71
61 0.77
62 0.81
63 0.8
64 0.81
65 0.8
66 0.76
67 0.71
68 0.67
69 0.57
70 0.52
71 0.43
72 0.33
73 0.27
74 0.21
75 0.19
76 0.16
77 0.16
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.18
99 0.23
100 0.24
101 0.25
102 0.27
103 0.25
104 0.22
105 0.21
106 0.17
107 0.12
108 0.12
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.16
152 0.19
153 0.21
154 0.27
155 0.27
156 0.29
157 0.31
158 0.29
159 0.26
160 0.22
161 0.2
162 0.14
163 0.11
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.23
179 0.27
180 0.31
181 0.36
182 0.38
183 0.36
184 0.38
185 0.37
186 0.38
187 0.37
188 0.34
189 0.31
190 0.31
191 0.26
192 0.25
193 0.25
194 0.22
195 0.25
196 0.24
197 0.22
198 0.2
199 0.23
200 0.24
201 0.23
202 0.2
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.18
214 0.22
215 0.23
216 0.28
217 0.3
218 0.38
219 0.37
220 0.4
221 0.43
222 0.45
223 0.52
224 0.54
225 0.51
226 0.46
227 0.53
228 0.53
229 0.53
230 0.53
231 0.5
232 0.49
233 0.5
234 0.5
235 0.45
236 0.43
237 0.38
238 0.4
239 0.44
240 0.46
241 0.47
242 0.45
243 0.44
244 0.41
245 0.41
246 0.34
247 0.28
248 0.22
249 0.19
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.19
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.23
263 0.2
264 0.19
265 0.15
266 0.12
267 0.07
268 0.09
269 0.11
270 0.2
271 0.22
272 0.22
273 0.25
274 0.29
275 0.32
276 0.34
277 0.4
278 0.39
279 0.43
280 0.51
281 0.53
282 0.58
283 0.62
284 0.59
285 0.55
286 0.49
287 0.5
288 0.5
289 0.48
290 0.44
291 0.4
292 0.42
293 0.43
294 0.47
295 0.41
296 0.37
297 0.35
298 0.32
299 0.3
300 0.28
301 0.24
302 0.2
303 0.18
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.21
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.2
325 0.22
326 0.27
327 0.28
328 0.28
329 0.3
330 0.32
331 0.34
332 0.32
333 0.38
334 0.43
335 0.51
336 0.6
337 0.61
338 0.63
339 0.58
340 0.55
341 0.48
342 0.41
343 0.34
344 0.25
345 0.25
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.19
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.15
354 0.2
355 0.21
356 0.24
357 0.3
358 0.39
359 0.44
360 0.46
361 0.52
362 0.56
363 0.65
364 0.72
365 0.76
366 0.76
367 0.79
368 0.85
369 0.82
370 0.76
371 0.75
372 0.69
373 0.63
374 0.54
375 0.5
376 0.41
377 0.36
378 0.31
379 0.22
380 0.17
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.2
386 0.24
387 0.24
388 0.24
389 0.27
390 0.26
391 0.23
392 0.2
393 0.19
394 0.17
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.14
399 0.17
400 0.2
401 0.18
402 0.17
403 0.18
404 0.22
405 0.23
406 0.27
407 0.26
408 0.26
409 0.31
410 0.35
411 0.43
412 0.43
413 0.48
414 0.52
415 0.6
416 0.65
417 0.66
418 0.71
419 0.71
420 0.73
421 0.74
422 0.72
423 0.72
424 0.72
425 0.74
426 0.73
427 0.72
428 0.71
429 0.71
430 0.73
431 0.66
432 0.61
433 0.55
434 0.47
435 0.45
436 0.42
437 0.39
438 0.34
439 0.31
440 0.29
441 0.27
442 0.27
443 0.21
444 0.18
445 0.16
446 0.18
447 0.18
448 0.22
449 0.29
450 0.33
451 0.37
452 0.4
453 0.44
454 0.49
455 0.56
456 0.58
457 0.53
458 0.49
459 0.49
460 0.47
461 0.4
462 0.31
463 0.26
464 0.22
465 0.19
466 0.16
467 0.15
468 0.18
469 0.18
470 0.19
471 0.16
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.07
478 0.06
479 0.08
480 0.12
481 0.16
482 0.23
483 0.26
484 0.33
485 0.38
486 0.45
487 0.54
488 0.62
489 0.69
490 0.67
491 0.73
492 0.67
493 0.66
494 0.68
495 0.65
496 0.64
497 0.61
498 0.61
499 0.56
500 0.55
501 0.52
502 0.44
503 0.38
504 0.29
505 0.26
506 0.24
507 0.21
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.15
512 0.14
513 0.09
514 0.07
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.12
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.17
537 0.13
538 0.12
539 0.14
540 0.17
541 0.18
542 0.17
543 0.17
544 0.13
545 0.13
546 0.18
547 0.16
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.14
552 0.15
553 0.16
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.17
559 0.17
560 0.21
561 0.24
562 0.28
563 0.34
564 0.36
565 0.45
566 0.46
567 0.45
568 0.46
569 0.43
570 0.42
571 0.4
572 0.37
573 0.27
574 0.23
575 0.22
576 0.17
577 0.16
578 0.13
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.12
583 0.16
584 0.19
585 0.23
586 0.3
587 0.34
588 0.37
589 0.39