Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168NK80

Protein Details
Accession A0A168NK80    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-344GGDNRGRGRGRNHRGFKRQQNGKQSDRAIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-349RRIAKERREKYGGDNRGRGRGRNHRGFKRQQNGKQSDRAIEKRPR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MEQEVLEQLHAIYSKENLEKDNFFREMTQQHPEGLLTDMLAILLLLYQGITLKKLSLIKRFKSLINGDVSILVAAANMAPEKFEINEDQTKLRALSSAESEDTKPAEDERLESVKGYWLTQNQRSIYAKGFPLDPEPTKADLMKFFEEFGRVIHIKYRREDDQTFKGSIFVEFESNEMAASVLEKEHCYEGNDLLVMNKQAYVEMKAKGKYDGESFGTCASDKKMRHYVEFSGPEDLGFSGVKEILSSHDVKVGRFEFVNNQKGVGVVQLWDEMTADQFLATLQDNKLGPLSFRLASDETRSEYRRIAKERREKYGGDNRGRGRGRNHRGFKRQQNGKQSDRAIEKRPRND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.24
4 0.25
5 0.29
6 0.34
7 0.36
8 0.41
9 0.37
10 0.34
11 0.34
12 0.36
13 0.36
14 0.35
15 0.38
16 0.32
17 0.31
18 0.31
19 0.3
20 0.25
21 0.22
22 0.18
23 0.12
24 0.11
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.06
29 0.04
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.03
34 0.03
35 0.05
36 0.06
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.13
41 0.2
42 0.25
43 0.33
44 0.41
45 0.44
46 0.51
47 0.53
48 0.51
49 0.53
50 0.51
51 0.47
52 0.43
53 0.4
54 0.33
55 0.3
56 0.29
57 0.2
58 0.16
59 0.11
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.09
71 0.11
72 0.16
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.23
77 0.24
78 0.23
79 0.2
80 0.17
81 0.13
82 0.14
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.12
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.21
106 0.26
107 0.31
108 0.36
109 0.32
110 0.37
111 0.38
112 0.37
113 0.33
114 0.31
115 0.27
116 0.22
117 0.22
118 0.18
119 0.19
120 0.21
121 0.2
122 0.19
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.12
137 0.14
138 0.12
139 0.12
140 0.17
141 0.22
142 0.24
143 0.26
144 0.31
145 0.28
146 0.34
147 0.36
148 0.37
149 0.39
150 0.39
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.25
155 0.23
156 0.19
157 0.12
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.13
191 0.15
192 0.19
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.21
198 0.2
199 0.2
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.17
210 0.23
211 0.3
212 0.31
213 0.34
214 0.37
215 0.38
216 0.4
217 0.44
218 0.39
219 0.33
220 0.31
221 0.28
222 0.25
223 0.21
224 0.14
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.11
234 0.13
235 0.12
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.24
240 0.22
241 0.21
242 0.19
243 0.2
244 0.24
245 0.31
246 0.38
247 0.32
248 0.31
249 0.3
250 0.3
251 0.29
252 0.21
253 0.13
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.2
279 0.17
280 0.17
281 0.21
282 0.2
283 0.22
284 0.26
285 0.25
286 0.25
287 0.3
288 0.32
289 0.31
290 0.34
291 0.4
292 0.44
293 0.5
294 0.56
295 0.6
296 0.68
297 0.73
298 0.77
299 0.74
300 0.67
301 0.68
302 0.69
303 0.68
304 0.66
305 0.67
306 0.62
307 0.67
308 0.68
309 0.63
310 0.62
311 0.63
312 0.65
313 0.68
314 0.75
315 0.75
316 0.82
317 0.88
318 0.89
319 0.89
320 0.89
321 0.87
322 0.88
323 0.86
324 0.83
325 0.81
326 0.75
327 0.73
328 0.71
329 0.69
330 0.67
331 0.69