FuNGI

A0A168NSB3

Protein Details

Accession

A0A168NSB3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
428-452	AKLISTKKPPTERKKQKIPAGKVIR	Hydrophilic
613-632	ETAYRQKKFSLRLHRKSSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
308-311	KPRK
434-452	KKPPTERKKQKIPAGKVIR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042065 E3_ELL-like IPR019464 ELL_N IPR036390 WH_DNA-bd_sf IPR039715 ZCCHC10
Gene Ontology	GO:0008023 C:transcription elongation factor complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10390 ELL

Amino Acid Sequences

MTNKKQVFSVRLNRDAYNLIMHQSQPMRLEIGDSSSFMFIGDRPFDLNLKREQSTIHVYEKDKLTRLDDDNRIRFVGNVTHAGHMKQVLSEEDKKRVRSITEQTEKEKNARSIELLDAPRIPTPTKLYNNSNTSPTTTVTTKMPSPSIKRNKLLSPSTNRPSPSSSSSSKLKASVNTTTPSPSGATTSTPNGSSSAAAVASRLEGAALAGLRERLIHLLALDHRPTEQLMQMLKVASVDLLPLLKKVAVLQKSVWCLRPEIFKDIRIWDWTRYDDKERATVRKKAELAYDHLDLPRNAPERANLIQRKPRKPSPKQLIPPPSQHTPILGNGGSNSNTPTKAGTNTPSVIHTSSSTTTSNSSNHSNTKRARADVDQVGKLPGIIKKRKGETTPISRSTEPTPSTIPATKQTSSSSSSSSSPSSSSTTPAKLISTKKPPTERKKQKIPAGKVIRTKALSSKLTRSATITVGQRLGTTDATQPTRYGGTDNEISSTDIEEDDDHDGISNKRSRMDDKLYVPPTIQTQMDFDRLCREHQHTQQAYIRFKKTFSQKHPIFIQALAAVNEKDKTEFVRKLKAYYQSKGGDMDNWRHLMQLSRQFNGTHAKINMMWTTIETAYRQKKFSLRLHRKSSSSSSAASSASSSSPPIPSSSSSVSAPYNKYTRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.52
3	0.44
4	0.39
5	0.31
6	0.26
7	0.25
8	0.24
9	0.28
10	0.28
11	0.3
12	0.26
13	0.27
14	0.26
15	0.23
16	0.25
17	0.2
18	0.22
19	0.2
20	0.18
21	0.18
22	0.17
23	0.17
24	0.14
25	0.14
26	0.1
27	0.15
28	0.16
29	0.15
30	0.17
31	0.19
32	0.22
33	0.25
34	0.28
35	0.3
36	0.34
37	0.34
38	0.33
39	0.33
40	0.35
41	0.4
42	0.4
43	0.38
44	0.39
45	0.4
46	0.46
47	0.51
48	0.51
49	0.47
50	0.45
51	0.43
52	0.43
53	0.47
54	0.49
55	0.52
56	0.57
57	0.57
58	0.57
59	0.54
60	0.47
61	0.42
62	0.36
63	0.33
64	0.26
65	0.28
66	0.27
67	0.3
68	0.3
69	0.3
70	0.29
71	0.25
72	0.22
73	0.17
74	0.17
75	0.17
76	0.23
77	0.31
78	0.33
79	0.41
80	0.45
81	0.46
82	0.49
83	0.49
84	0.46
85	0.46
86	0.51
87	0.52
88	0.57
89	0.59
90	0.61
91	0.65
92	0.63
93	0.6
94	0.59
95	0.52
96	0.47
97	0.44
98	0.41
99	0.36
100	0.37
101	0.38
102	0.32
103	0.29
104	0.27
105	0.26
106	0.26
107	0.26
108	0.23
109	0.19
110	0.24
111	0.31
112	0.36
113	0.41
114	0.46
115	0.52
116	0.57
117	0.56
118	0.54
119	0.47
120	0.43
121	0.38
122	0.33
123	0.29
124	0.24
125	0.23
126	0.22
127	0.24
128	0.23
129	0.24
130	0.27
131	0.29
132	0.34
133	0.43
134	0.51
135	0.56
136	0.59
137	0.61
138	0.63
139	0.65
140	0.66
141	0.64
142	0.62
143	0.64
144	0.64
145	0.63
146	0.58
147	0.53
148	0.5
149	0.46
150	0.42
151	0.39
152	0.37
153	0.37
154	0.4
155	0.41
156	0.39
157	0.38
158	0.35
159	0.34
160	0.36
161	0.37
162	0.36
163	0.34
164	0.33
165	0.31
166	0.28
167	0.25
168	0.21
169	0.16
170	0.14
171	0.13
172	0.14
173	0.14
174	0.17
175	0.17
176	0.17
177	0.17
178	0.16
179	0.16
180	0.14
181	0.12
182	0.1
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.06
205	0.09
206	0.12
207	0.15
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.15
212	0.15
213	0.14
214	0.12
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.14
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.1
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.09
234	0.15
235	0.16
236	0.18
237	0.2
238	0.24
239	0.28
240	0.3
241	0.31
242	0.25
243	0.25
244	0.25
245	0.31
246	0.29
247	0.32
248	0.32
249	0.31
250	0.32
251	0.33
252	0.33
253	0.3
254	0.29
255	0.24
256	0.25
257	0.26
258	0.27
259	0.28
260	0.31
261	0.31
262	0.3
263	0.34
264	0.35
265	0.41
266	0.42
267	0.46
268	0.44
269	0.46
270	0.46
271	0.41
272	0.42
273	0.36
274	0.35
275	0.33
276	0.31
277	0.25
278	0.25
279	0.25
280	0.2
281	0.19
282	0.2
283	0.19
284	0.18
285	0.17
286	0.17
287	0.2
288	0.22
289	0.29
290	0.27
291	0.3
292	0.38
293	0.46
294	0.51
295	0.54
296	0.6
297	0.62
298	0.66
299	0.71
300	0.74
301	0.75
302	0.74
303	0.77
304	0.77
305	0.7
306	0.68
307	0.62
308	0.55
309	0.47
310	0.41
311	0.34
312	0.27
313	0.24
314	0.21
315	0.16
316	0.13
317	0.11
318	0.13
319	0.12
320	0.1
321	0.11
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.16
331	0.17
332	0.17
333	0.17
334	0.17
335	0.16
336	0.15
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.14
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.19
348	0.19
349	0.25
350	0.27
351	0.32
352	0.33
353	0.41
354	0.41
355	0.39
356	0.39
357	0.35
358	0.38
359	0.37
360	0.39
361	0.31
362	0.28
363	0.28
364	0.24
365	0.22
366	0.18
367	0.15
368	0.19
369	0.23
370	0.29
371	0.34
372	0.38
373	0.42
374	0.42
375	0.47
376	0.47
377	0.52
378	0.54
379	0.54
380	0.53
381	0.49
382	0.5
383	0.44
384	0.43
385	0.34
386	0.28
387	0.25
388	0.22
389	0.25
390	0.25
391	0.24
392	0.24
393	0.27
394	0.25
395	0.25
396	0.26
397	0.25
398	0.27
399	0.26
400	0.22
401	0.2
402	0.21
403	0.21
404	0.2
405	0.18
406	0.15
407	0.16
408	0.17
409	0.16
410	0.18
411	0.19
412	0.19
413	0.2
414	0.2
415	0.19
416	0.21
417	0.26
418	0.3
419	0.37
420	0.41
421	0.46
422	0.55
423	0.64
424	0.68
425	0.75
426	0.78
427	0.78
428	0.83
429	0.85
430	0.84
431	0.84
432	0.81
433	0.81
434	0.79
435	0.75
436	0.71
437	0.66
438	0.62
439	0.53
440	0.49
441	0.43
442	0.41
443	0.4
444	0.37
445	0.4
446	0.43
447	0.43
448	0.42
449	0.39
450	0.34
451	0.31
452	0.32
453	0.29
454	0.23
455	0.23
456	0.22
457	0.2
458	0.19
459	0.19
460	0.15
461	0.14
462	0.15
463	0.18
464	0.21
465	0.21
466	0.2
467	0.2
468	0.2
469	0.19
470	0.17
471	0.13
472	0.15
473	0.18
474	0.18
475	0.18
476	0.18
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.13
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.09
485	0.11
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.11
490	0.12
491	0.18
492	0.22
493	0.21
494	0.25
495	0.28
496	0.31
497	0.37
498	0.43
499	0.44
500	0.44
501	0.53
502	0.51
503	0.49
504	0.45
505	0.39
506	0.35
507	0.3
508	0.26
509	0.17
510	0.18
511	0.2
512	0.26
513	0.25
514	0.22
515	0.28
516	0.28
517	0.3
518	0.32
519	0.36
520	0.39
521	0.46
522	0.56
523	0.49
524	0.54
525	0.58
526	0.6
527	0.61
528	0.6
529	0.58
530	0.48
531	0.48
532	0.49
533	0.53
534	0.56
535	0.57
536	0.61
537	0.59
538	0.64
539	0.66
540	0.64
541	0.55
542	0.45
543	0.39
544	0.3
545	0.29
546	0.23
547	0.22
548	0.17
549	0.17
550	0.18
551	0.16
552	0.15
553	0.14
554	0.18
555	0.24
556	0.32
557	0.34
558	0.43
559	0.44
560	0.48
561	0.53
562	0.58
563	0.56
564	0.53
565	0.57
566	0.49
567	0.5
568	0.48
569	0.43
570	0.39
571	0.37
572	0.4
573	0.37
574	0.37
575	0.35
576	0.33
577	0.33
578	0.33
579	0.35
580	0.39
581	0.38
582	0.37
583	0.39
584	0.38
585	0.4
586	0.43
587	0.37
588	0.34
589	0.3
590	0.32
591	0.31
592	0.35
593	0.33
594	0.26
595	0.24
596	0.18
597	0.22
598	0.19
599	0.19
600	0.18
601	0.25
602	0.33
603	0.38
604	0.38
605	0.39
606	0.45
607	0.53
608	0.6
609	0.63
610	0.65
611	0.7
612	0.78
613	0.8
614	0.77
615	0.75
616	0.72
617	0.69
618	0.61
619	0.53
620	0.46
621	0.42
622	0.39
623	0.33
624	0.26
625	0.2
626	0.18
627	0.17
628	0.16
629	0.16
630	0.18
631	0.19
632	0.2
633	0.21
634	0.22
635	0.27
636	0.29
637	0.3
638	0.28
639	0.3
640	0.32
641	0.36
642	0.37
643	0.38

A0A168NSB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer