Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GHX1

Protein Details
Accession C1GHX1    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
742-772KTMRPENKWNKPPTKDKRKRAPRRNRPVAGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
745-785RPENKWNKPPTKDKRKRAPRRNRPVAGAATRSRSKALASKR
969-976PSKKSKGG
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, plas 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042403  Spt21/Ams2  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbn:PADG_06857  -  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSAENGISVRQMRLKVLYTFDSENKTNCLARWPHLIDIQTAFIDEETQVGIIELKTCIQAIVSASPELVAKLGRDYTIYAYDYSEYETPLVGQGMLSWVLASASPTPDAPAHQSKTMVTGRVCKNVFGLFSQGSQETLEVKLRLVPVPTVFQNEYLNNMHKYRESGNIQGFDAQSWTNFVQANPGLLAAGCNRSASAPSDRVASPMDRSGIERMHQMLSEGSTPRDFSNITAAESYHADSPAYSTHAAPSRASTPGLTRPSSQHQKRVTAEAFRPSSRESGYDPDSRHQPAPYMGRRNSTFSGYGSGDEATEPPAPKRAKLMRADLQDKPNMNIERQPGSLRVAASTAASVRIHRPMPLNPATARSQGSNDDPVRPPTPIPRGNAGTARFNRPAQSNLRRESSSGTHVSYSSQYTPTLETAATSPEDVRYGSAIDTPFNMPSSPPTMECIYPQTSSPLLPPLPDHDSGFMSGSLDSILDDHCIRNTLDDLGTSTAEVSQTTNDSEKSKTELPAHNIPQPLKTQNNSFPMSDSVVDTSNNDPANTLPLPPRRPTASRPSSRASVRQPTKPLAPAPISQSEAERLSRQAIPGSDPVRPTPNPKQHYQPWNCPMSDFPISTTPAPMASDDGKVRSGAGGRRTKQVQARLEQCIREGTVPPYCENCGAIETPTWRRAWSKVIQGNGEDANSNRNDPTMLFWRPEEVADDGSVISYKQFKKSLADDDKDFVQLLLCNPCGLWLHKFKTMRPENKWNKPPTKDKRKRAPRRNRPVAGAATRSRSKALASKRNASSPGPIEASSPPGEDPTTPADNANDTGNDENAPPSRSAGRRANSEEPPRSSDKCEIRWREEDAMKALHRAIQSSPAGNMEKSTLPFMETNLTPNPIRRSLFPLSREGDTMKTLSDSSINVIRRSPRAASKQSNMTPAKENTPCTSLNDGLDDLFGGDAENDPLPFPGSPTPKQNRRRVILTPSKKSKGGKGLGNSPNGPNAGEGTIFSPSRLTAEELKRASHEGSGLTPRAYRINNLLKDDALQVSSLQESPQLQHFQSIGGLVLDIFDSDEDSVAQTDSFYPFVPAECQVSSNWADWAAESSISPKTLGYMGTITQQERSGLTESTTKSLNADHTSTLKDTFLLPVDPDDAEFSRLLSGDSSSNLDGNLDNPSTLAGSNIFDRSIAEAGLLNLEPKGDADVGGLDPAVVSAIMQEITNDKTKVDVDSAPLNAQEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.36
4 0.35
5 0.35
6 0.38
7 0.39
8 0.41
9 0.39
10 0.38
11 0.37
12 0.37
13 0.35
14 0.31
15 0.36
16 0.34
17 0.36
18 0.44
19 0.43
20 0.43
21 0.46
22 0.46
23 0.4
24 0.39
25 0.37
26 0.27
27 0.24
28 0.2
29 0.15
30 0.15
31 0.12
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.09
38 0.08
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.14
55 0.13
56 0.1
57 0.09
58 0.12
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.19
64 0.22
65 0.23
66 0.2
67 0.2
68 0.21
69 0.2
70 0.22
71 0.19
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.22
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.33
101 0.32
102 0.38
103 0.39
104 0.37
105 0.31
106 0.37
107 0.39
108 0.47
109 0.47
110 0.4
111 0.39
112 0.37
113 0.36
114 0.28
115 0.28
116 0.21
117 0.21
118 0.23
119 0.21
120 0.19
121 0.18
122 0.17
123 0.14
124 0.15
125 0.18
126 0.16
127 0.16
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.2
134 0.24
135 0.25
136 0.28
137 0.26
138 0.27
139 0.29
140 0.27
141 0.29
142 0.29
143 0.32
144 0.3
145 0.3
146 0.3
147 0.28
148 0.31
149 0.29
150 0.34
151 0.34
152 0.37
153 0.42
154 0.42
155 0.41
156 0.41
157 0.38
158 0.3
159 0.27
160 0.2
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.2
168 0.2
169 0.21
170 0.18
171 0.17
172 0.14
173 0.13
174 0.15
175 0.1
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.16
183 0.21
184 0.2
185 0.21
186 0.25
187 0.24
188 0.25
189 0.26
190 0.24
191 0.21
192 0.21
193 0.22
194 0.19
195 0.22
196 0.24
197 0.24
198 0.23
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.2
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.18
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.14
215 0.21
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.19
221 0.2
222 0.21
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.17
233 0.22
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.25
240 0.21
241 0.2
242 0.26
243 0.31
244 0.3
245 0.29
246 0.32
247 0.41
248 0.51
249 0.52
250 0.53
251 0.54
252 0.6
253 0.6
254 0.64
255 0.58
256 0.54
257 0.53
258 0.53
259 0.51
260 0.43
261 0.43
262 0.37
263 0.36
264 0.3
265 0.28
266 0.23
267 0.25
268 0.29
269 0.32
270 0.32
271 0.33
272 0.37
273 0.39
274 0.38
275 0.33
276 0.3
277 0.31
278 0.38
279 0.42
280 0.46
281 0.45
282 0.49
283 0.5
284 0.53
285 0.49
286 0.44
287 0.37
288 0.29
289 0.31
290 0.25
291 0.24
292 0.19
293 0.17
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.21
302 0.22
303 0.22
304 0.31
305 0.35
306 0.4
307 0.44
308 0.52
309 0.51
310 0.58
311 0.62
312 0.59
313 0.57
314 0.54
315 0.5
316 0.43
317 0.44
318 0.38
319 0.34
320 0.33
321 0.32
322 0.3
323 0.3
324 0.3
325 0.24
326 0.25
327 0.26
328 0.22
329 0.19
330 0.16
331 0.15
332 0.13
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.17
340 0.17
341 0.19
342 0.22
343 0.23
344 0.31
345 0.33
346 0.34
347 0.3
348 0.34
349 0.34
350 0.33
351 0.31
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.24
356 0.28
357 0.26
358 0.29
359 0.29
360 0.32
361 0.32
362 0.3
363 0.29
364 0.28
365 0.36
366 0.35
367 0.36
368 0.38
369 0.39
370 0.41
371 0.44
372 0.39
373 0.39
374 0.38
375 0.41
376 0.38
377 0.36
378 0.36
379 0.34
380 0.37
381 0.37
382 0.43
383 0.45
384 0.45
385 0.49
386 0.46
387 0.44
388 0.44
389 0.38
390 0.33
391 0.28
392 0.26
393 0.22
394 0.22
395 0.23
396 0.2
397 0.2
398 0.17
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.15
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.09
428 0.11
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.16
433 0.17
434 0.17
435 0.18
436 0.21
437 0.19
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.16
442 0.17
443 0.16
444 0.16
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.16
449 0.19
450 0.19
451 0.19
452 0.16
453 0.17
454 0.17
455 0.18
456 0.13
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.13
493 0.16
494 0.18
495 0.2
496 0.25
497 0.28
498 0.32
499 0.38
500 0.4
501 0.4
502 0.41
503 0.38
504 0.35
505 0.33
506 0.32
507 0.28
508 0.27
509 0.28
510 0.31
511 0.36
512 0.36
513 0.33
514 0.29
515 0.27
516 0.27
517 0.23
518 0.17
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.13
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.15
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.21
534 0.24
535 0.25
536 0.28
537 0.28
538 0.31
539 0.34
540 0.39
541 0.43
542 0.45
543 0.48
544 0.49
545 0.5
546 0.49
547 0.5
548 0.45
549 0.45
550 0.45
551 0.45
552 0.45
553 0.43
554 0.44
555 0.41
556 0.36
557 0.3
558 0.28
559 0.25
560 0.25
561 0.25
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.19
566 0.18
567 0.17
568 0.14
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.13
575 0.14
576 0.18
577 0.19
578 0.18
579 0.18
580 0.19
581 0.21
582 0.21
583 0.26
584 0.31
585 0.38
586 0.4
587 0.41
588 0.47
589 0.5
590 0.6
591 0.59
592 0.58
593 0.55
594 0.55
595 0.53
596 0.46
597 0.39
598 0.33
599 0.3
600 0.22
601 0.17
602 0.17
603 0.18
604 0.18
605 0.18
606 0.13
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.08
611 0.08
612 0.1
613 0.1
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.1
619 0.11
620 0.12
621 0.2
622 0.26
623 0.27
624 0.32
625 0.33
626 0.37
627 0.39
628 0.44
629 0.4
630 0.39
631 0.42
632 0.43
633 0.44
634 0.4
635 0.36
636 0.29
637 0.25
638 0.2
639 0.18
640 0.15
641 0.16
642 0.16
643 0.17
644 0.17
645 0.17
646 0.16
647 0.15
648 0.13
649 0.11
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.12
654 0.15
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.18
659 0.19
660 0.24
661 0.25
662 0.31
663 0.31
664 0.34
665 0.34
666 0.33
667 0.33
668 0.27
669 0.23
670 0.14
671 0.11
672 0.12
673 0.12
674 0.12
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.09
679 0.13
680 0.15
681 0.16
682 0.17
683 0.17
684 0.18
685 0.18
686 0.18
687 0.16
688 0.12
689 0.11
690 0.1
691 0.1
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.06
696 0.05
697 0.11
698 0.12
699 0.16
700 0.18
701 0.19
702 0.23
703 0.26
704 0.36
705 0.37
706 0.38
707 0.36
708 0.35
709 0.35
710 0.32
711 0.29
712 0.18
713 0.12
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.11
718 0.1
719 0.1
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.16
724 0.2
725 0.23
726 0.29
727 0.31
728 0.31
729 0.4
730 0.47
731 0.51
732 0.51
733 0.6
734 0.63
735 0.72
736 0.79
737 0.77
738 0.76
739 0.75
740 0.78
741 0.78
742 0.8
743 0.81
744 0.82
745 0.85
746 0.88
747 0.92
748 0.93
749 0.93
750 0.93
751 0.94
752 0.94
753 0.87
754 0.8
755 0.74
756 0.69
757 0.61
758 0.56
759 0.46
760 0.41
761 0.39
762 0.36
763 0.31
764 0.26
765 0.24
766 0.25
767 0.32
768 0.36
769 0.39
770 0.46
771 0.47
772 0.5
773 0.51
774 0.46
775 0.41
776 0.34
777 0.32
778 0.26
779 0.24
780 0.22
781 0.2
782 0.22
783 0.18
784 0.16
785 0.13
786 0.13
787 0.13
788 0.11
789 0.13
790 0.15
791 0.16
792 0.16
793 0.16
794 0.16
795 0.16
796 0.17
797 0.16
798 0.11
799 0.1
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.11
805 0.12
806 0.13
807 0.12
808 0.13
809 0.18
810 0.19
811 0.26
812 0.31
813 0.33
814 0.37
815 0.43
816 0.48
817 0.5
818 0.56
819 0.55
820 0.51
821 0.52
822 0.51
823 0.47
824 0.44
825 0.45
826 0.43
827 0.46
828 0.52
829 0.53
830 0.55
831 0.56
832 0.57
833 0.56
834 0.52
835 0.46
836 0.39
837 0.38
838 0.32
839 0.3
840 0.26
841 0.22
842 0.2
843 0.19
844 0.17
845 0.19
846 0.2
847 0.2
848 0.2
849 0.2
850 0.21
851 0.2
852 0.19
853 0.15
854 0.16
855 0.16
856 0.17
857 0.13
858 0.14
859 0.15
860 0.15
861 0.17
862 0.15
863 0.17
864 0.17
865 0.2
866 0.19
867 0.23
868 0.26
869 0.27
870 0.28
871 0.27
872 0.32
873 0.36
874 0.41
875 0.4
876 0.41
877 0.39
878 0.39
879 0.39
880 0.33
881 0.28
882 0.24
883 0.22
884 0.16
885 0.14
886 0.13
887 0.12
888 0.12
889 0.1
890 0.12
891 0.17
892 0.19
893 0.19
894 0.22
895 0.25
896 0.26
897 0.29
898 0.3
899 0.32
900 0.39
901 0.47
902 0.5
903 0.52
904 0.59
905 0.58
906 0.64
907 0.58
908 0.52
909 0.5
910 0.46
911 0.47
912 0.42
913 0.42
914 0.35
915 0.37
916 0.35
917 0.32
918 0.35
919 0.29
920 0.26
921 0.25
922 0.23
923 0.19
924 0.18
925 0.14
926 0.09
927 0.07
928 0.06
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.06
933 0.06
934 0.06
935 0.07
936 0.07
937 0.09
938 0.08
939 0.1
940 0.16
941 0.21
942 0.24
943 0.34
944 0.44
945 0.52
946 0.62
947 0.69
948 0.71
949 0.71
950 0.73
951 0.69
952 0.7
953 0.71
954 0.71
955 0.72
956 0.72
957 0.7
958 0.7
959 0.66
960 0.64
961 0.62
962 0.59
963 0.55
964 0.51
965 0.58
966 0.59
967 0.61
968 0.55
969 0.47
970 0.43
971 0.38
972 0.33
973 0.23
974 0.19
975 0.15
976 0.13
977 0.12
978 0.1
979 0.14
980 0.13
981 0.13
982 0.12
983 0.11
984 0.12
985 0.13
986 0.15
987 0.2
988 0.25
989 0.33
990 0.34
991 0.35
992 0.35
993 0.35
994 0.33
995 0.26
996 0.22
997 0.16
998 0.19
999 0.23
1000 0.23
1001 0.22
1002 0.22
1003 0.22
1004 0.26
1005 0.26
1006 0.24
1007 0.28
1008 0.36
1009 0.4
1010 0.43
1011 0.43
1012 0.38
1013 0.38
1014 0.38
1015 0.31
1016 0.21
1017 0.17
1018 0.12
1019 0.12
1020 0.13
1021 0.12
1022 0.1
1023 0.12
1024 0.12
1025 0.14
1026 0.2
1027 0.23
1028 0.21
1029 0.24
1030 0.24
1031 0.22
1032 0.21
1033 0.2
1034 0.14
1035 0.1
1036 0.1
1037 0.06
1038 0.07
1039 0.06
1040 0.05
1041 0.05
1042 0.04
1043 0.05
1044 0.05
1045 0.06
1046 0.06
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.07
1051 0.07
1052 0.09
1053 0.1
1054 0.11
1055 0.1
1056 0.12
1057 0.12
1058 0.13
1059 0.15
1060 0.15
1061 0.16
1062 0.16
1063 0.17
1064 0.15
1065 0.2
1066 0.21
1067 0.19
1068 0.18
1069 0.16
1070 0.15
1071 0.14
1072 0.18
1073 0.14
1074 0.12
1075 0.11
1076 0.13
1077 0.15
1078 0.15
1079 0.15
1080 0.12
1081 0.12
1082 0.13
1083 0.14
1084 0.14
1085 0.13
1086 0.13
1087 0.18
1088 0.22
1089 0.21
1090 0.21
1091 0.22
1092 0.21
1093 0.2
1094 0.22
1095 0.19
1096 0.17
1097 0.18
1098 0.22
1099 0.23
1100 0.24
1101 0.25
1102 0.22
1103 0.2
1104 0.23
1105 0.26
1106 0.24
1107 0.25
1108 0.25
1109 0.27
1110 0.3
1111 0.3
1112 0.29
1113 0.24
1114 0.2
1115 0.19
1116 0.19
1117 0.19
1118 0.17
1119 0.16
1120 0.16
1121 0.18
1122 0.17
1123 0.17
1124 0.18
1125 0.16
1126 0.17
1127 0.16
1128 0.15
1129 0.15
1130 0.15
1131 0.15
1132 0.11
1133 0.12
1134 0.11
1135 0.13
1136 0.16
1137 0.15
1138 0.16
1139 0.15
1140 0.15
1141 0.14
1142 0.13
1143 0.16
1144 0.14
1145 0.13
1146 0.12
1147 0.13
1148 0.13
1149 0.12
1150 0.13
1151 0.09
1152 0.1
1153 0.13
1154 0.15
1155 0.14
1156 0.13
1157 0.14
1158 0.16
1159 0.16
1160 0.14
1161 0.11
1162 0.11
1163 0.12
1164 0.14
1165 0.14
1166 0.11
1167 0.1
1168 0.1
1169 0.1
1170 0.09
1171 0.12
1172 0.09
1173 0.09
1174 0.09
1175 0.11
1176 0.12
1177 0.12
1178 0.11
1179 0.08
1180 0.08
1181 0.07
1182 0.07
1183 0.04
1184 0.04
1185 0.04
1186 0.05
1187 0.06
1188 0.06
1189 0.07
1190 0.09
1191 0.13
1192 0.19
1193 0.19
1194 0.18
1195 0.2
1196 0.21
1197 0.24
1198 0.25
1199 0.24
1200 0.22
1201 0.27
1202 0.29
1203 0.28
1204 0.27