FuNGI

C1GC36

Protein Details

Accession

C1GC36

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-156	KGGKSVSTSKPKRERENKQALVQ	Hydrophilic
628-649	ENAQVVKRRHEKEEKSRNHDEE	Basic
668-693	SSRFNSNTPRGTKRKRVESDGQGNEN	Hydrophilic
710-730	QIAKRNRIIAKNRMLRRNRKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-148	PRHRKVDEKGGKSVSTSKPKRER
551-560	KLRKSKGKGI
712-730	AKRNRIIAKNRMLRRNRKD

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbn:PADG_04558 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MTDTRNRRGLSDSGSVQEDGRVPATDQQTEALPDVDAALSPIKAKNRRTLFVRSLPLSATTESLTDYFSQSYPLKHATVVLDPQTKQSKGYGFVTFADSEDVARALEEFNGSVFDGKKLKIEVAEPRHRKVDEKGGKSVSTSKPKRERENKQALVQPPKLIIRNLPWSIAEPEQLEVLFRSFGKVKYAVIPKKGNKHSGFGFVVLRGRKNAEKALEAVNGKEVDGRTLAVDWAAEKNVWDELQNHTDGVKDNGTEKEDNKSGEEDEETKNQDDDVAMGEVDDEDEGEDVDDDDDDDDDEEVHAEVEDDRNASTVFIRNLPFTATDESLYEHFVQFGPLRYARVVFDPETDRPRGTAFVCFWDKKNANSCLRDAPKRTDLPRAEDAKAKTSTIKYSVLEDEKKDPSGRYTMDGRVLQLSPAVSKSQAVKLEAEGSSRRETRDKDKRRLFLLSEGTIPSTSALYKQLSPSEIAMREASAKQRQKLIKSNPVLHLSLTRLSVRNLPRNIDSKALKALAREAVVGFAKDVKSGLREPLSREELQRSNEDMKEAEKLRKSKGKGIIRQAKVVFEGKEGSKIDEKSGAGRSRGYGFIEYYSHRSALMGLRWLNGHVVAGPDGKKKRLIVEFAIENAQVVKRRHEKEEKSRNHDEEGQKQHKWASRNGVSHQRNSSRFNSNTPRGTKRKRVESDGQGNENMTRASKPNDSKPEKDNQIAKRNRIIAKNRMLRRNRKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.37
3	0.32
4	0.31
5	0.27
6	0.22
7	0.21
8	0.19
9	0.18
10	0.24
11	0.28
12	0.27
13	0.25
14	0.24
15	0.24
16	0.25
17	0.25
18	0.19
19	0.14
20	0.12
21	0.13
22	0.12
23	0.09
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.11
28	0.16
29	0.23
30	0.31
31	0.36
32	0.44
33	0.5
34	0.56
35	0.59
36	0.64
37	0.64
38	0.65
39	0.68
40	0.61
41	0.55
42	0.5
43	0.47
44	0.41
45	0.33
46	0.26
47	0.19
48	0.17
49	0.17
50	0.16
51	0.14
52	0.13
53	0.14
54	0.14
55	0.13
56	0.18
57	0.19
58	0.2
59	0.24
60	0.26
61	0.25
62	0.24
63	0.27
64	0.24
65	0.27
66	0.3
67	0.32
68	0.34
69	0.33
70	0.4
71	0.44
72	0.42
73	0.38
74	0.38
75	0.36
76	0.34
77	0.38
78	0.35
79	0.3
80	0.3
81	0.33
82	0.28
83	0.25
84	0.22
85	0.18
86	0.15
87	0.14
88	0.13
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.07
93	0.08
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.11
100	0.11
101	0.14
102	0.16
103	0.17
104	0.2
105	0.2
106	0.22
107	0.21
108	0.24
109	0.3
110	0.37
111	0.47
112	0.49
113	0.51
114	0.56
115	0.54
116	0.54
117	0.5
118	0.51
119	0.5
120	0.51
121	0.54
122	0.52
123	0.51
124	0.49
125	0.52
126	0.49
127	0.51
128	0.51
129	0.54
130	0.61
131	0.69
132	0.78
133	0.8
134	0.81
135	0.81
136	0.87
137	0.83
138	0.79
139	0.78
140	0.75
141	0.73
142	0.66
143	0.57
144	0.49
145	0.48
146	0.44
147	0.38
148	0.34
149	0.31
150	0.37
151	0.36
152	0.33
153	0.3
154	0.3
155	0.32
156	0.3
157	0.26
158	0.18
159	0.18
160	0.17
161	0.16
162	0.14
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.11
168	0.13
169	0.14
170	0.18
171	0.18
172	0.19
173	0.25
174	0.35
175	0.37
176	0.42
177	0.49
178	0.51
179	0.6
180	0.64
181	0.66
182	0.58
183	0.58
184	0.53
185	0.51
186	0.47
187	0.39
188	0.34
189	0.27
190	0.3
191	0.27
192	0.26
193	0.21
194	0.23
195	0.24
196	0.26
197	0.29
198	0.26
199	0.26
200	0.27
201	0.29
202	0.3
203	0.28
204	0.25
205	0.24
206	0.21
207	0.19
208	0.2
209	0.16
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.14
229	0.17
230	0.17
231	0.16
232	0.15
233	0.16
234	0.16
235	0.17
236	0.14
237	0.11
238	0.13
239	0.15
240	0.18
241	0.19
242	0.19
243	0.22
244	0.23
245	0.23
246	0.22
247	0.22
248	0.19
249	0.18
250	0.19
251	0.17
252	0.17
253	0.2
254	0.21
255	0.2
256	0.19
257	0.18
258	0.17
259	0.13
260	0.11
261	0.09
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.07
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.1
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.13
309	0.15
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.13
316	0.12
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.1
321	0.09
322	0.11
323	0.12
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.14
328	0.13
329	0.14
330	0.15
331	0.12
332	0.14
333	0.16
334	0.19
335	0.22
336	0.22
337	0.2
338	0.18
339	0.19
340	0.18
341	0.15
342	0.16
343	0.13
344	0.18
345	0.22
346	0.22
347	0.23
348	0.29
349	0.29
350	0.29
351	0.35
352	0.37
353	0.39
354	0.4
355	0.4
356	0.4
357	0.44
358	0.45
359	0.41
360	0.39
361	0.4
362	0.42
363	0.42
364	0.43
365	0.4
366	0.42
367	0.46
368	0.45
369	0.4
370	0.4
371	0.4
372	0.36
373	0.35
374	0.3
375	0.25
376	0.23
377	0.23
378	0.21
379	0.23
380	0.18
381	0.19
382	0.23
383	0.24
384	0.25
385	0.24
386	0.26
387	0.25
388	0.26
389	0.24
390	0.21
391	0.19
392	0.21
393	0.2
394	0.18
395	0.2
396	0.2
397	0.24
398	0.24
399	0.23
400	0.21
401	0.2
402	0.17
403	0.15
404	0.13
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.08
409	0.09
410	0.11
411	0.14
412	0.16
413	0.17
414	0.16
415	0.17
416	0.2
417	0.19
418	0.19
419	0.16
420	0.17
421	0.2
422	0.2
423	0.22
424	0.23
425	0.26
426	0.34
427	0.44
428	0.5
429	0.57
430	0.63
431	0.66
432	0.65
433	0.65
434	0.57
435	0.53
436	0.48
437	0.39
438	0.33
439	0.29
440	0.26
441	0.22
442	0.2
443	0.13
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.14
451	0.15
452	0.16
453	0.17
454	0.17
455	0.19
456	0.18
457	0.18
458	0.16
459	0.15
460	0.16
461	0.17
462	0.21
463	0.25
464	0.29
465	0.29
466	0.37
467	0.41
468	0.44
469	0.52
470	0.55
471	0.56
472	0.58
473	0.62
474	0.59
475	0.59
476	0.53
477	0.44
478	0.38
479	0.31
480	0.27
481	0.23
482	0.2
483	0.18
484	0.18
485	0.25
486	0.29
487	0.35
488	0.35
489	0.36
490	0.38
491	0.41
492	0.42
493	0.42
494	0.37
495	0.3
496	0.32
497	0.32
498	0.28
499	0.24
500	0.26
501	0.22
502	0.21
503	0.19
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.09
514	0.12
515	0.14
516	0.18
517	0.21
518	0.22
519	0.26
520	0.33
521	0.38
522	0.36
523	0.37
524	0.39
525	0.39
526	0.4
527	0.39
528	0.36
529	0.35
530	0.34
531	0.33
532	0.27
533	0.24
534	0.27
535	0.27
536	0.3
537	0.31
538	0.34
539	0.4
540	0.47
541	0.49
542	0.51
543	0.58
544	0.61
545	0.63
546	0.7
547	0.73
548	0.68
549	0.72
550	0.64
551	0.56
552	0.49
553	0.45
554	0.35
555	0.26
556	0.28
557	0.21
558	0.26
559	0.26
560	0.26
561	0.27
562	0.27
563	0.28
564	0.29
565	0.28
566	0.26
567	0.33
568	0.34
569	0.29
570	0.3
571	0.3
572	0.29
573	0.3
574	0.28
575	0.23
576	0.2
577	0.21
578	0.22
579	0.22
580	0.24
581	0.24
582	0.22
583	0.2
584	0.19
585	0.2
586	0.22
587	0.22
588	0.23
589	0.22
590	0.23
591	0.23
592	0.24
593	0.22
594	0.17
595	0.15
596	0.1
597	0.1
598	0.11
599	0.14
600	0.16
601	0.23
602	0.26
603	0.29
604	0.32
605	0.32
606	0.38
607	0.41
608	0.43
609	0.39
610	0.43
611	0.42
612	0.4
613	0.4
614	0.32
615	0.26
616	0.23
617	0.22
618	0.21
619	0.21
620	0.28
621	0.36
622	0.4
623	0.49
624	0.58
625	0.65
626	0.7
627	0.79
628	0.8
629	0.8
630	0.85
631	0.79
632	0.74
633	0.73
634	0.69
635	0.67
636	0.68
637	0.67
638	0.59
639	0.58
640	0.59
641	0.55
642	0.52
643	0.49
644	0.49
645	0.5
646	0.54
647	0.58
648	0.63
649	0.63
650	0.65
651	0.68
652	0.66
653	0.63
654	0.63
655	0.63
656	0.61
657	0.59
658	0.61
659	0.62
660	0.61
661	0.65
662	0.66
663	0.7
664	0.7
665	0.78
666	0.79
667	0.79
668	0.82
669	0.8
670	0.82
671	0.82
672	0.82
673	0.83
674	0.8
675	0.74
676	0.65
677	0.59
678	0.51
679	0.43
680	0.34
681	0.25
682	0.2
683	0.19
684	0.23
685	0.31
686	0.37
687	0.45
688	0.55
689	0.61
690	0.63
691	0.65
692	0.71
693	0.69
694	0.7
695	0.69
696	0.68
697	0.71
698	0.74
699	0.74
700	0.73
701	0.74
702	0.73
703	0.74
704	0.72
705	0.72
706	0.74
707	0.78
708	0.78
709	0.8
710	0.83

C1GC36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer