FuNGI

A0A163JE73

Protein Details

Accession

A0A163JE73

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-100	KLHRKDYYTRTQQQHRPGFD	Hydrophilic
453-472	KKKPLTAKPGLKKGPKKKES	Basic
538-557	DQEHRPTKHHRVSSPRHTPS	Basic
584-611	TMSTKDFLMRFRKRIKRNERNRDVITSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
452-487	LKKKPLTAKPGLKKGPKKKESLSRPIGRPGSPSIKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MGGIFNTGRPQGRGRGRGMPAQRPASMLRQQQQRQQQQPQAIPYNDFQLLSCVRGGSKTNMIDFKDSHRTINMGEFSQPVKLHRKDYYTRTQQQHRPGFDKNGMDSPNPASNDLTSSPSSAKASNSSPSKSDTKGPSTPSQGPPQQQRFDKSQQGPKTGADTSLIAPMGGATKNKQMLFKKRTKQIYLAKEDTRELKEQEHKPWILEDFNGTNSFTGTLEGGQRSDYVLFILTDNGFKVVPLDRWYKFQRKRHIRTLTGDEVEEQLKKERKQTKNEGNRWMMLKRDEEDLGDNYSPQSRLRTVDSGDSRRNGSDDEGGGKRHDSDIDDLDFDDVFQDDEEGGNDHEMEDEDIKDGKERIKKEHKGFSPNEEDAADLDGVKLTSDGKQMRKLVRNLEKNRAYESDEDKDPYATSEEELETDSGDNDENEDGSDKESKDKDKQSQETSKSTPTLKKKPLTAKPGLKKGPKKKESLSRPIGRPGSPSIKREPSSTTPSRGSLSPSRSGSSSPKELSPSPTHSGSASPSSDNGALKKRKSDDQEHRPTKHHRVSSPRHTPSATAPSSSSDDNDLITEEEVVETLRGQTMSTKDFLMRFRKRIKRNERNRDVITSLLKRVARQTVASDSGVKMLELKPELA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.54
3	0.56
4	0.61
5	0.64
6	0.64
7	0.63
8	0.61
9	0.57
10	0.51
11	0.51
12	0.5
13	0.51
14	0.5
15	0.5
16	0.55
17	0.59
18	0.65
19	0.72
20	0.74
21	0.76
22	0.77
23	0.76
24	0.74
25	0.75
26	0.75
27	0.73
28	0.64
29	0.58
30	0.5
31	0.48
32	0.41
33	0.36
34	0.28
35	0.25
36	0.24
37	0.22
38	0.22
39	0.17
40	0.16
41	0.19
42	0.22
43	0.21
44	0.27
45	0.29
46	0.33
47	0.38
48	0.39
49	0.4
50	0.38
51	0.4
52	0.43
53	0.41
54	0.38
55	0.35
56	0.34
57	0.32
58	0.38
59	0.34
60	0.24
61	0.25
62	0.25
63	0.24
64	0.27
65	0.27
66	0.24
67	0.31
68	0.34
69	0.38
70	0.42
71	0.48
72	0.51
73	0.58
74	0.64
75	0.65
76	0.7
77	0.72
78	0.77
79	0.76
80	0.8
81	0.8
82	0.76
83	0.71
84	0.67
85	0.66
86	0.62
87	0.59
88	0.52
89	0.49
90	0.45
91	0.41
92	0.38
93	0.35
94	0.35
95	0.32
96	0.3
97	0.24
98	0.22
99	0.25
100	0.24
101	0.24
102	0.19
103	0.19
104	0.19
105	0.21
106	0.22
107	0.2
108	0.2
109	0.2
110	0.22
111	0.28
112	0.31
113	0.31
114	0.31
115	0.34
116	0.36
117	0.35
118	0.39
119	0.38
120	0.41
121	0.43
122	0.47
123	0.47
124	0.5
125	0.55
126	0.52
127	0.54
128	0.53
129	0.55
130	0.59
131	0.62
132	0.62
133	0.6
134	0.59
135	0.58
136	0.6
137	0.63
138	0.6
139	0.61
140	0.6
141	0.6
142	0.57
143	0.51
144	0.49
145	0.4
146	0.33
147	0.25
148	0.21
149	0.18
150	0.19
151	0.17
152	0.13
153	0.11
154	0.11
155	0.12
156	0.11
157	0.12
158	0.1
159	0.16
160	0.2
161	0.22
162	0.29
163	0.34
164	0.43
165	0.51
166	0.59
167	0.62
168	0.66
169	0.72
170	0.7
171	0.71
172	0.7
173	0.71
174	0.69
175	0.67
176	0.61
177	0.55
178	0.53
179	0.49
180	0.44
181	0.37
182	0.3
183	0.31
184	0.38
185	0.4
186	0.45
187	0.47
188	0.44
189	0.42
190	0.42
191	0.38
192	0.3
193	0.25
194	0.22
195	0.16
196	0.17
197	0.17
198	0.15
199	0.13
200	0.12
201	0.13
202	0.1
203	0.09
204	0.07
205	0.07
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.1
228	0.14
229	0.19
230	0.19
231	0.25
232	0.32
233	0.41
234	0.47
235	0.53
236	0.6
237	0.66
238	0.73
239	0.77
240	0.79
241	0.74
242	0.71
243	0.71
244	0.65
245	0.55
246	0.47
247	0.38
248	0.31
249	0.27
250	0.22
251	0.15
252	0.16
253	0.21
254	0.22
255	0.3
256	0.38
257	0.44
258	0.52
259	0.62
260	0.66
261	0.72
262	0.77
263	0.77
264	0.7
265	0.66
266	0.59
267	0.5
268	0.42
269	0.34
270	0.29
271	0.22
272	0.22
273	0.2
274	0.18
275	0.19
276	0.17
277	0.17
278	0.15
279	0.13
280	0.11
281	0.13
282	0.13
283	0.11
284	0.12
285	0.11
286	0.13
287	0.16
288	0.18
289	0.17
290	0.23
291	0.27
292	0.3
293	0.31
294	0.3
295	0.28
296	0.26
297	0.26
298	0.2
299	0.16
300	0.14
301	0.12
302	0.14
303	0.14
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.13
308	0.11
309	0.12
310	0.09
311	0.1
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.09
319	0.07
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.1
342	0.14
343	0.18
344	0.2
345	0.28
346	0.38
347	0.46
348	0.51
349	0.59
350	0.59
351	0.62
352	0.62
353	0.59
354	0.56
355	0.48
356	0.43
357	0.34
358	0.29
359	0.21
360	0.21
361	0.14
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.12
371	0.16
372	0.19
373	0.25
374	0.3
375	0.37
376	0.43
377	0.45
378	0.49
379	0.54
380	0.62
381	0.61
382	0.66
383	0.65
384	0.59
385	0.59
386	0.52
387	0.45
388	0.4
389	0.4
390	0.34
391	0.3
392	0.3
393	0.27
394	0.26
395	0.23
396	0.19
397	0.16
398	0.11
399	0.1
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.09
418	0.13
419	0.12
420	0.17
421	0.2
422	0.25
423	0.31
424	0.38
425	0.45
426	0.51
427	0.57
428	0.6
429	0.66
430	0.66
431	0.65
432	0.61
433	0.56
434	0.5
435	0.49
436	0.48
437	0.48
438	0.53
439	0.55
440	0.57
441	0.61
442	0.68
443	0.71
444	0.72
445	0.72
446	0.73
447	0.73
448	0.78
449	0.77
450	0.76
451	0.78
452	0.8
453	0.81
454	0.78
455	0.76
456	0.75
457	0.77
458	0.78
459	0.78
460	0.78
461	0.75
462	0.72
463	0.74
464	0.69
465	0.6
466	0.53
467	0.49
468	0.49
469	0.46
470	0.46
471	0.46
472	0.5
473	0.5
474	0.49
475	0.5
476	0.46
477	0.5
478	0.5
479	0.48
480	0.43
481	0.43
482	0.43
483	0.38
484	0.38
485	0.36
486	0.37
487	0.38
488	0.37
489	0.37
490	0.35
491	0.38
492	0.38
493	0.37
494	0.38
495	0.34
496	0.34
497	0.37
498	0.38
499	0.42
500	0.41
501	0.41
502	0.39
503	0.39
504	0.37
505	0.33
506	0.33
507	0.29
508	0.28
509	0.24
510	0.2
511	0.19
512	0.21
513	0.24
514	0.24
515	0.24
516	0.29
517	0.34
518	0.36
519	0.43
520	0.44
521	0.49
522	0.54
523	0.61
524	0.63
525	0.67
526	0.76
527	0.78
528	0.77
529	0.77
530	0.78
531	0.78
532	0.75
533	0.72
534	0.68
535	0.69
536	0.75
537	0.79
538	0.82
539	0.76
540	0.72
541	0.66
542	0.6
543	0.57
544	0.57
545	0.48
546	0.39
547	0.34
548	0.33
549	0.35
550	0.34
551	0.28
552	0.21
553	0.2
554	0.19
555	0.19
556	0.16
557	0.14
558	0.13
559	0.12
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.14
571	0.18
572	0.2
573	0.21
574	0.22
575	0.23
576	0.27
577	0.34
578	0.4
579	0.44
580	0.49
581	0.59
582	0.67
583	0.74
584	0.81
585	0.85
586	0.86
587	0.89
588	0.92
589	0.91
590	0.91
591	0.86
592	0.81
593	0.72
594	0.66
595	0.63
596	0.57
597	0.5
598	0.48
599	0.44
600	0.4
601	0.44
602	0.46
603	0.41
604	0.38
605	0.39
606	0.39
607	0.42
608	0.41
609	0.38
610	0.31
611	0.31
612	0.29
613	0.24
614	0.21
615	0.19
616	0.24

A0A163JE73

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer