Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2X5I3

Protein Details
Accession G2X5I3    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKTDKKDKKGKKVAAPAAPPAHydrophilic
40-69HVAFKKQHGKKSSKSKHATKKHRHNLVSVFHydrophilic
232-254KAAKAKAKAKRGKKTTKKAESSDBasic
417-444LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13KKDKKGKK
44-62KKQHGKKSSKSKHATKKHR
193-198RPTAKK
232-249KAAKAKAKAKRGKKTTKK
423-436KGFTKEKNKKKKGS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG vda:VDAG_05488  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKTDKKDKKGKKVAAPAAPPAELMDLVENFLSEHAPSAHVAFKKQHGKKSSKSKHATKKHRHNLVSVFQTWETSLSTPEGEPVTITETVVQNVSSSSGESESESGSSSSSDSSSEEDVDMADAAAAESSSDSSSDSDSSSSDSDSGSESNDEPAPRIAVPVVNLKRKAPASDSSDSSDSDSSDSDSESDKKRPTAKKLKTAKAASSSESSDSSSSSGSDSSSDSDSENEGKAAKAKAKAKRGKKTTKKAESSDESSSSSSESSDSDSSSSDSDSDSDSDSDSSDSSSDDGSAAAKVPLPESDSDSSSSSSSSSDSDSSDDEAATKKEKTKAKKAAVEDAPSDSSVTLDNKTSPDFQAPPLPPDPSTLNNRGRGNMNNQKGRNVPFSRIKESTYVDPRFASNDYVPNDYSDRAHADLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDIGGRGGVKFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.86
3 0.8
4 0.76
5 0.69
6 0.6
7 0.49
8 0.4
9 0.32
10 0.23
11 0.19
12 0.16
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.07
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.13
26 0.19
27 0.19
28 0.23
29 0.25
30 0.33
31 0.43
32 0.49
33 0.55
34 0.58
35 0.64
36 0.7
37 0.77
38 0.79
39 0.79
40 0.82
41 0.84
42 0.86
43 0.89
44 0.91
45 0.9
46 0.92
47 0.91
48 0.92
49 0.84
50 0.8
51 0.77
52 0.74
53 0.69
54 0.6
55 0.53
56 0.43
57 0.41
58 0.35
59 0.28
60 0.22
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.15
67 0.14
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.11
148 0.19
149 0.24
150 0.28
151 0.29
152 0.29
153 0.34
154 0.34
155 0.34
156 0.29
157 0.29
158 0.31
159 0.33
160 0.34
161 0.32
162 0.32
163 0.31
164 0.29
165 0.23
166 0.17
167 0.14
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.13
175 0.16
176 0.2
177 0.21
178 0.25
179 0.33
180 0.38
181 0.46
182 0.54
183 0.58
184 0.63
185 0.71
186 0.74
187 0.74
188 0.71
189 0.65
190 0.61
191 0.55
192 0.47
193 0.39
194 0.33
195 0.26
196 0.23
197 0.21
198 0.14
199 0.13
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.14
222 0.18
223 0.25
224 0.32
225 0.41
226 0.49
227 0.56
228 0.64
229 0.7
230 0.75
231 0.79
232 0.83
233 0.83
234 0.85
235 0.82
236 0.76
237 0.74
238 0.68
239 0.62
240 0.55
241 0.45
242 0.37
243 0.31
244 0.28
245 0.21
246 0.16
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.14
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.18
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.26
315 0.33
316 0.4
317 0.49
318 0.58
319 0.63
320 0.68
321 0.67
322 0.69
323 0.68
324 0.63
325 0.54
326 0.47
327 0.39
328 0.32
329 0.29
330 0.19
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.19
340 0.19
341 0.22
342 0.22
343 0.23
344 0.3
345 0.3
346 0.33
347 0.33
348 0.34
349 0.29
350 0.31
351 0.32
352 0.28
353 0.34
354 0.38
355 0.42
356 0.47
357 0.48
358 0.48
359 0.48
360 0.48
361 0.51
362 0.51
363 0.54
364 0.56
365 0.56
366 0.58
367 0.59
368 0.58
369 0.58
370 0.52
371 0.5
372 0.51
373 0.56
374 0.59
375 0.56
376 0.53
377 0.49
378 0.49
379 0.51
380 0.51
381 0.47
382 0.41
383 0.4
384 0.39
385 0.37
386 0.35
387 0.31
388 0.24
389 0.29
390 0.3
391 0.32
392 0.32
393 0.31
394 0.32
395 0.29
396 0.27
397 0.23
398 0.24
399 0.22
400 0.22
401 0.19
402 0.19
403 0.22
404 0.24
405 0.26
406 0.22
407 0.21
408 0.24
409 0.26
410 0.32
411 0.32
412 0.39
413 0.46
414 0.56
415 0.67
416 0.75
417 0.82
418 0.84
419 0.9
420 0.91
421 0.91
422 0.91
423 0.89
424 0.87
425 0.84
426 0.78
427 0.67
428 0.57
429 0.5
430 0.39
431 0.31
432 0.21
433 0.15
434 0.11