FuNGI

A0A168SH20

Protein Details

Accession

A0A168SH20

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
463-483	ENDRKVQRSKNSRPNNAPQSD	Hydrophilic
501-542	NLGERRSKKETKEEKKERKQAIKDAKKNRREEKKSTKAAFKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
505-539	RRSKKETKEEKKERKQAIKDAKKNRREEKKSTKAA

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1 IPR038279 Ndc10_dom2_sf
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPKKNFIDRKSAKHYHVVHRSQKDPLINDAEASARVLQEVVAPNMIKHKTPEELKRLAARPTKLSQDEIDQRVGQAALHGVFFDDAEYDYMQHMKPIGSTDAVFLEAPGSSRKEKGGRRGGDDDNGGLVLREEVEAGLFDRVNDKKNPNLFEMPAGVLPSMIELDKGVMNQQTGLEGGLQPDMDPRLREVLEALEDEEYVENDLEEDFFDDLNDDTAEAYDPEEDEYYDDSDAEYEEYEEYEDDQVNGPIDPENYDWQAAFNKFKKNQGRGGSDDEDYEDDDRQSKGTGFSVSSSAMHRNTQLRTLDDRFDRIEEEYLQDDDDEDDFDEDAEEREDFESILDDFLEKYEVVGNKLATKLEGEDSVQKLDAIRGAFDTLRIVDDEEKREQQQQERRERALVTSKTKEPESLWARPEQRKHQTWDCQSVISTYSNLENHPHLISDRGPKKRISIDPKTGMPILVENDRKVQRSKNSRPNNAPQSDEEDADSDALDSDEEEPVNLGERRSKKETKEEKKERKQAIKDAKKNRREEKKSTKAAFKSEENRQRQTLLQQRKAKAIFLTHGRLFYLVRAALDPPTSLCKKLFPTIDEWHDRLATKYLSPDSNSPIQPTVTADAFVQVSHLQPTCHSQGMCRKLKLRDAILPTHSSSNVCAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.73
3	0.76
4	0.76
5	0.76
6	0.75
7	0.75
8	0.71
9	0.69
10	0.65
11	0.57
12	0.54
13	0.51
14	0.44
15	0.41
16	0.36
17	0.31
18	0.25
19	0.24
20	0.19
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.1
25	0.14
26	0.17
27	0.17
28	0.19
29	0.2
30	0.2
31	0.28
32	0.29
33	0.26
34	0.25
35	0.28
36	0.32
37	0.4
38	0.48
39	0.49
40	0.52
41	0.55
42	0.6
43	0.6
44	0.61
45	0.6
46	0.55
47	0.53
48	0.53
49	0.57
50	0.51
51	0.51
52	0.44
53	0.46
54	0.5
55	0.47
56	0.46
57	0.38
58	0.36
59	0.34
60	0.32
61	0.23
62	0.16
63	0.15
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.06
72	0.06
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.13
78	0.12
79	0.13
80	0.14
81	0.12
82	0.13
83	0.15
84	0.17
85	0.16
86	0.16
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.15
91	0.12
92	0.1
93	0.09
94	0.1
95	0.11
96	0.14
97	0.15
98	0.17
99	0.22
100	0.3
101	0.35
102	0.45
103	0.52
104	0.52
105	0.57
106	0.62
107	0.6
108	0.56
109	0.51
110	0.41
111	0.32
112	0.28
113	0.2
114	0.14
115	0.11
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.07
124	0.08
125	0.07
126	0.08
127	0.13
128	0.16
129	0.2
130	0.25
131	0.27
132	0.33
133	0.39
134	0.42
135	0.42
136	0.44
137	0.41
138	0.37
139	0.36
140	0.3
141	0.24
142	0.22
143	0.16
144	0.12
145	0.1
146	0.09
147	0.08
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.06
152	0.07
153	0.07
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.09
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.16
174	0.16
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.14
179	0.14
180	0.14
181	0.1
182	0.09
183	0.1
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.12
245	0.16
246	0.16
247	0.21
248	0.23
249	0.3
250	0.32
251	0.41
252	0.48
253	0.48
254	0.54
255	0.55
256	0.55
257	0.51
258	0.55
259	0.49
260	0.41
261	0.37
262	0.3
263	0.23
264	0.19
265	0.17
266	0.11
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.1
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.14
285	0.16
286	0.18
287	0.19
288	0.23
289	0.23
290	0.23
291	0.27
292	0.28
293	0.3
294	0.27
295	0.28
296	0.24
297	0.23
298	0.21
299	0.17
300	0.16
301	0.12
302	0.13
303	0.12
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.04
334	0.05
335	0.08
336	0.09
337	0.1
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.13
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.12
354	0.11
355	0.11
356	0.12
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.11
369	0.14
370	0.18
371	0.2
372	0.22
373	0.23
374	0.28
375	0.3
376	0.34
377	0.38
378	0.44
379	0.51
380	0.54
381	0.54
382	0.51
383	0.49
384	0.45
385	0.46
386	0.42
387	0.39
388	0.38
389	0.4
390	0.4
391	0.4
392	0.38
393	0.29
394	0.33
395	0.33
396	0.33
397	0.32
398	0.36
399	0.42
400	0.46
401	0.51
402	0.51
403	0.54
404	0.54
405	0.59
406	0.61
407	0.64
408	0.64
409	0.66
410	0.58
411	0.49
412	0.44
413	0.39
414	0.32
415	0.24
416	0.19
417	0.12
418	0.14
419	0.14
420	0.14
421	0.15
422	0.14
423	0.15
424	0.15
425	0.15
426	0.12
427	0.13
428	0.16
429	0.24
430	0.31
431	0.35
432	0.38
433	0.38
434	0.42
435	0.48
436	0.53
437	0.53
438	0.54
439	0.56
440	0.58
441	0.59
442	0.57
443	0.5
444	0.41
445	0.32
446	0.25
447	0.19
448	0.21
449	0.21
450	0.19
451	0.26
452	0.28
453	0.3
454	0.31
455	0.36
456	0.38
457	0.47
458	0.57
459	0.61
460	0.68
461	0.75
462	0.8
463	0.83
464	0.84
465	0.76
466	0.68
467	0.6
468	0.57
469	0.49
470	0.42
471	0.33
472	0.24
473	0.21
474	0.18
475	0.16
476	0.09
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.18
491	0.23
492	0.3
493	0.38
494	0.44
495	0.45
496	0.55
497	0.66
498	0.69
499	0.75
500	0.8
501	0.83
502	0.88
503	0.93
504	0.91
505	0.9
506	0.86
507	0.85
508	0.85
509	0.85
510	0.84
511	0.85
512	0.86
513	0.85
514	0.87
515	0.87
516	0.87
517	0.84
518	0.85
519	0.85
520	0.85
521	0.87
522	0.84
523	0.83
524	0.76
525	0.75
526	0.7
527	0.66
528	0.63
529	0.64
530	0.67
531	0.65
532	0.65
533	0.6
534	0.57
535	0.52
536	0.54
537	0.54
538	0.54
539	0.57
540	0.61
541	0.62
542	0.68
543	0.66
544	0.59
545	0.52
546	0.46
547	0.42
548	0.4
549	0.45
550	0.38
551	0.38
552	0.35
553	0.33
554	0.29
555	0.25
556	0.23
557	0.17
558	0.16
559	0.16
560	0.17
561	0.18
562	0.19
563	0.18
564	0.14
565	0.21
566	0.22
567	0.23
568	0.23
569	0.26
570	0.3
571	0.36
572	0.39
573	0.34
574	0.39
575	0.45
576	0.52
577	0.53
578	0.5
579	0.46
580	0.44
581	0.41
582	0.37
583	0.35
584	0.28
585	0.24
586	0.28
587	0.3
588	0.31
589	0.33
590	0.35
591	0.35
592	0.41
593	0.41
594	0.38
595	0.36
596	0.33
597	0.31
598	0.3
599	0.29
600	0.21
601	0.21
602	0.18
603	0.18
604	0.17
605	0.16
606	0.15
607	0.12
608	0.12
609	0.16
610	0.17
611	0.15
612	0.17
613	0.23
614	0.26
615	0.3
616	0.29
617	0.31
618	0.4
619	0.5
620	0.57
621	0.57
622	0.59
623	0.61
624	0.69
625	0.7
626	0.67
627	0.65
628	0.63
629	0.64
630	0.62
631	0.59
632	0.53
633	0.49
634	0.44
635	0.37

A0A168SH20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer